磷酸化是蛋白质最重要的翻译后修饰之一.应用基于多样性增量的二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法对CK2,PKA和PKC三种类型磷酸化位点进行预测,k-fold交叉检验的正确率分别为86%,90%和...磷酸化是蛋白质最重要的翻译后修饰之一.应用基于多样性增量的二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法对CK2,PKA和PKC三种类型磷酸化位点进行预测,k-fold交叉检验的正确率分别为86%,90%和85%,独立测试集检验的正确率分别为86%,88%和84%.所得结果高于包括支持向量机在内的现有预测方法.展开更多
应用多样性增量结合二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法,对大肠杆菌σ70启动子进行识别。使用受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线和精度召回率曲线(Precisio...应用多样性增量结合二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法,对大肠杆菌σ70启动子进行识别。使用受试者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线和精度召回率曲线(Precision Recall Curves,PRC)进行性能评估。10-fold交叉检验给出,在正负集之比为1∶1时,ROC曲线下面积和PRC曲线下面积均为95%。结果表明,IDQD算法有能力应用于原核启动子的识别。识别精度高于现有算法。展开更多
对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标.一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测.应用基于多样性增量的二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法进行蛋白质亚细胞定位预测,对4个植...对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标.一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测.应用基于多样性增量的二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法进行蛋白质亚细胞定位预测,对4个植物定位类型和3个非植物定位类型,5-fold交叉检验的总精度分别为87%和91%,所得结果与已有模型相比,预测结果较好.展开更多
文摘磷酸化是蛋白质最重要的翻译后修饰之一.应用基于多样性增量的二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法对CK2,PKA和PKC三种类型磷酸化位点进行预测,k-fold交叉检验的正确率分别为86%,90%和85%,独立测试集检验的正确率分别为86%,88%和84%.所得结果高于包括支持向量机在内的现有预测方法.
文摘对未知蛋白的功能注释是蛋白质组学的主要目标.一个关键的注释是蛋白质亚细胞定位的预测.应用基于多样性增量的二次判别分析(Increment of Diversity with Quadratic Discriminant analysis,IDQD)方法进行蛋白质亚细胞定位预测,对4个植物定位类型和3个非植物定位类型,5-fold交叉检验的总精度分别为87%和91%,所得结果与已有模型相比,预测结果较好.
