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巴戟天与常见混伪品的rDNA-ITS序列分析及其分子鉴定 被引量：37
1
作者 丁平 方琴 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期908-911,共4页
目的比较巴戟天与常见混伪品之间的rDNA-ITS碱基序列的差异及其规律,同时为巴戟天及混伪品的指纹图谱鉴别提供分子标记.方法对巴戟天及其常见混伪品的rDNA-ITS进行了PCR扩增、测序,并运用CLUSTAL X、MEGA软件对该区进行序列分析.结果测... 目的比较巴戟天与常见混伪品之间的rDNA-ITS碱基序列的差异及其规律,同时为巴戟天及混伪品的指纹图谱鉴别提供分子标记.方法对巴戟天及其常见混伪品的rDNA-ITS进行了PCR扩增、测序,并运用CLUSTAL X、MEGA软件对该区进行序列分析.结果测定了巴戟天及其混伪品的rDNA-ITS区序列,包括ITS1、5.8S和ITS2全长序列以及18S、26S部分序列.巴戟天与假巴戟天、羊角藤在ITS1和ITS2区的差异性分别为2.9%～5.8%和2.9%～4.2%,而与虎刺在ITS1和ITS2区的差异性则为21.2%和18.9%.根据ITS序列特征构建的系统树,混伪品假巴戟天与羊角藤首先聚类,然后与巴戟天聚在一起,而虎刺则单独聚为一支.结论rDNA-ITS序列可作为巴戟天与混伪品的一种较好的分子指纹图谱的标记方法. 展开更多
关键词 rDNA-its序列 巴戟天 混伪品 分子鉴定 分析及 its2区 指纹图谱鉴别 its区序列 its1 PCR扩增 碱基序列 分子标记 序列分析 全长序列 序列特征 标记方法 差异性 羊角藤 18S 系统树 虎刺
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临床相关毛孢子菌生物学特性的研究 被引量：5
2
作者 李厚敏 刘伟 +2 位作者 万哲 王晓红 李若瑜 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期613-616,共4页
目的了解临床常见毛孢子菌的生物学特征,为临床鉴定菌种以及诊治疾病提供依据。方法对临床分离的毛孢子菌以及已知的标准菌株进行形态学以及生理学的分类鉴定;扩增rDNA基因内转录间隔区(ITS1区以及ITS2区),序列测定,鉴定菌种;测定常见... 目的了解临床常见毛孢子菌的生物学特征,为临床鉴定菌种以及诊治疾病提供依据。方法对临床分离的毛孢子菌以及已知的标准菌株进行形态学以及生理学的分类鉴定;扩增rDNA基因内转录间隔区(ITS1区以及ITS2区),序列测定,鉴定菌种;测定常见抗真菌药物对毛孢子菌的最低抑菌浓度,了解毛孢子菌对药物的敏感性。结果16株菌中的6株最终鉴定为阿萨希毛孢子,其余皮瘤毛孢子、皮毛孢子、真皮毛孢子各1株,头状地霉菌5株,另有2株无法鉴定到种。药物敏感性试验结果显示,大部分受试菌株,包括阿萨希毛孢子菌、头状地霉菌、皮毛孢子菌以及皮瘤毛孢子标准株对于伊曲康唑、特比萘芬及两性霉素B均不敏感。结论临床毛孢子菌株以阿萨希毛孢子最为常见。形态学是区别毛孢子菌属的基础;对于临床实验室而言,rDNAITS区序列测定是一种较好的鉴定方法。临床上治疗严重深部毛孢子菌感染患者时,最好采用大剂量联合治疗方案,尤其是联合使用不同作用机制的抗真菌药物,有利于提高患者免疫力。 展开更多
关键词 生物学特性 阿萨希毛孢子菌 抗真菌药物 相关 内转录间隔区 RDNA基因 最低抑菌浓度 联合治疗方案 序列测定 生物学特征 its2区 药物敏感性 两性霉素B 毛孢子菌属 临床实验室 临床常见 临床鉴定 分类鉴定 标准菌株 临床分离
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ITS2区PCR-RFLP鉴别肯尼亚的埃及血吸虫和牛血吸虫
3
作者 章俊华 《国外医学（寄生虫病分册）》 2002年第2期70-71,共2页
寄生于人体的埃及血吸虫和寄生于反刍动物的牛血吸虫有很近的亲缘关系。由于两者寄生于同一种水泡螺,可存在于同一淡水水体内及尾蚴的形态相似等原因,故难以鉴别某一有水泡螺孳生的水体是埃及血吸虫的传染源、还是牛血吸虫的传染源或是... 寄生于人体的埃及血吸虫和寄生于反刍动物的牛血吸虫有很近的亲缘关系。由于两者寄生于同一种水泡螺,可存在于同一淡水水体内及尾蚴的形态相似等原因,故难以鉴别某一有水泡螺孳生的水体是埃及血吸虫的传染源、还是牛血吸虫的传染源或是两者共有的传染源。 展开更多
关键词 血吸虫病 埃及血吸虫 牛血吸虫 PCR-RFLP法 its2区 肯尼亚
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我国赫坎按蚊复合体成员种的rDNA-ITS2区序列差异及系统发育分析 被引量：16
4
作者 马雅军 瞿逢伊 《昆虫知识》 CSCD 北大核心 2002年第3期209-214,共6页
测定了我国赫坎按蚊复合体 9成员种的核糖体DNA第二内转录间隔区 (rDNA ITS2 )序列 ,根据序列差异分析各蚊种间的系统发育关系。结果显示 :( 1 )ITS2区序列最长的是中华按蚊 ( 4 6 8bp) ,最短的是克劳按蚊和赫坎按蚊 ( 4 36bp) ;GC含量... 测定了我国赫坎按蚊复合体 9成员种的核糖体DNA第二内转录间隔区 (rDNA ITS2 )序列 ,根据序列差异分析各蚊种间的系统发育关系。结果显示 :( 1 )ITS2区序列最长的是中华按蚊 ( 4 6 8bp) ,最短的是克劳按蚊和赫坎按蚊 ( 4 36bp) ;GC含量为 4 4 9%～ 4 6 8% ;( 2 )发现该复合体 4成员种的ITS2区序列存在种内个体间差异 ,幅度为 0～ 3 8% ,明显小于种间差异 ;( 3)将各蚊种的ITS2区序列进行同源排序比较 ,发现其变异大多是简单重复单元的拷贝数不同 ;种间差异性最大的是克劳按蚊与嗜人按蚊( 32 3% ) ,最小的是贵阳按蚊与凉山按蚊 ( 9 0 % )平均差异率为 2 2 3% ;( 4 )根据ITS2区序列特征 ,用 3种方法构建的树状图拟合一致。以上结果表明赫坎按蚊复合体各成员种rDNA ITS2序列在种内非常保守 ,以种间序列差异分析为基础的分子鉴别技术是甄别蚊种分类地位混淆和错误的有效方法。 展开更多
关键词 赫坎按蚊复合体 成员种 序列差异 系统发育 中国 rDNA-its2区 蚊虫
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一株产阿魏酸酯酶青霉菌株的筛选、鉴定及生长特征 被引量：9
5
作者 李夏兰 胡雪松 +1 位作者 范韵敏 方柏山 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1588-1593,共6页
从腐烂的木质纤维中筛选了一株产阿魏酸酯酶的菌株HDFE1,根据其形态特征、rDNAITS1-5.8S-ITS2序列及系统发育分析,鉴定菌株HDFE1为青霉属的橘青霉(Penicillium citrinum Thom)。菌株HDFE1最适生长温度为30°C,最适生长pH为6.0。该... 从腐烂的木质纤维中筛选了一株产阿魏酸酯酶的菌株HDFE1,根据其形态特征、rDNAITS1-5.8S-ITS2序列及系统发育分析,鉴定菌株HDFE1为青霉属的橘青霉(Penicillium citrinum Thom)。菌株HDFE1最适生长温度为30°C,最适生长pH为6.0。该菌株在30°C、pH6.0、200r/min培养60h时,阿魏酸酯酶酶活力为最高,达20.75U/L。 展开更多
关键词 RDNA its1-5.8S-its2区 阿魏酸酯酶 鉴定 生长特性
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