杏ISSR反应体系的优化和指纹图谱的构建 被引量：59

1

作者 刘威生 冯晨静 +3 位作者 杨建民 刘冬成 张爱民 李绍华 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期626-629,共4页

以杏品种清密沙为试材,用引物UBC825〔序列为(AC)8T〕研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响。结果表明:Primer、Mg2+、Taq酶浓度对扩增效果有明显影响,而模板DNA和dNTPs含量对扩增结果影响不大。优化的反应体系... 以杏品种清密沙为试材,用引物UBC825〔序列为(AC)8T〕研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响。结果表明:Primer、Mg2+、Taq酶浓度对扩增效果有明显影响,而模板DNA和dNTPs含量对扩增结果影响不大。优化的反应体系为:20μL的反应体系中含10ng模板DNA、0.1mmol/LdNTP、0.25μmol/LPrimer、2.5mmol/LMg2+,0.5UTaqPolymerase。适宜退火温度为50-52.1℃。用引物UBC825和UBC868〔序列为(GAA)5〕在优化的反应条件下建立了5个种12份杏材料的ISSR指纹图谱。 展开更多

关键词 杏 issr(inter—simple sequence repeat) 反应体系 退火温度 优化

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14份杏种质的ISSR分析 被引量：26

2

作者 冯晨静 张元慧 +4 位作者 徐秀英 师国洪 刘威生 孟庆瑞 杨建民 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期52-55,62,共5页

以冀光为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响.同时,从42对ISSR引物中筛选出12对扩增条带清晰、多态性好的引物进行扩增,并运用UPGMA聚类分析法,分析了12份杏种质的亲缘关系及多样性.结果表明:在20 μL... 以冀光为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对杏ISSR扩增结果的影响.同时,从42对ISSR引物中筛选出12对扩增条带清晰、多态性好的引物进行扩增,并运用UPGMA聚类分析法,分析了12份杏种质的亲缘关系及多样性.结果表明:在20 μL的反应体系中,模板DNA含量在10～80 ng均能得到较好的扩增;dNTP用量对扩增无明显影响;而引物、Mg2+的最适浓度分别为0.25 μmol/L、0.25 mmol/L;Taq酶在0.5～4 U均能得到好的扩增条带;退火温度在50～52.1℃范围内均能得到清晰的条带;并在此基础上建立了杏ISSR反应体系.当相似系数在0.444～0.452之间时,将12份杏材料划分为3类:①普通杏(Amentaca vulgaris),西伯利亚杏(A.sibirica),辽杏(A.mandshurica),藏杏(A.holosericea)类型;②仁用杏品种一窝蜂;③紫杏(A. dasycarpa). 展开更多

关键词 杏 issr(inter-simple sequence repeat) 品种鉴定 亲缘关系 反应体系

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茉莉花ISSR-PCR反应体系的建立 被引量：19

3

作者 邱长玉 高国庆 +3 位作者 陈伯伦 周瑞阳 牛英 张加强 《北方园艺》 CAS 北大核心 2008年第2期214-217,共4页

以茉莉花为材料，研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对茉莉花ISSR扩增结果的影响。结果表明：在20μL的反应体中，Mg^2＋的用量为1．2～1．6mmol／L，dNTPs浓度为0．15mmol／L，引物的浓度为0．5μmol／L，TaqDNA聚合酶的用量为1U... 以茉莉花为材料，研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对茉莉花ISSR扩增结果的影响。结果表明：在20μL的反应体中，Mg^2＋的用量为1．2～1．6mmol／L，dNTPs浓度为0．15mmol／L，引物的浓度为0．5μmol／L，TaqDNA聚合酶的用量为1U，模板DNA的用量为40-70ng，在48-50℃的退火温度下40个循环，能得到清晰、多态性高的ISSR带谱。 展开更多

关键词 茉莉花issr反应体系 优化

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苦瓜基因组DNA的提取及ISSR扩增体系的优化 被引量：12

4

作者 田丽波 谷幸幸 +1 位作者 商桑 杨衍 《中国农学通报》 CSCD 2013年第4期88-93,共6页

为了快速获取高质量的苦瓜基因组DNA,以便进行苦瓜白粉病抗性基因分子标记研究,比较了不同的DNA提取方法、不同部位的苦瓜叶片提取基因组DNA的产量和质量,探究了苦瓜基因组DNA提取的最佳方法和叶片的最适部位;研究了ISSR-PCR的退火温度... 为了快速获取高质量的苦瓜基因组DNA,以便进行苦瓜白粉病抗性基因分子标记研究,比较了不同的DNA提取方法、不同部位的苦瓜叶片提取基因组DNA的产量和质量,探究了苦瓜基因组DNA提取的最佳方法和叶片的最适部位;研究了ISSR-PCR的退火温度,并采用正交设计法对影响ISSR-PCR的Mg2+、dNTPs、Taq酶、模板DNA以及引物浓度等5个因素进行了优化。结果表明,采用改良CTAB法从苦瓜顶端嫩叶中提取的基因组DNAOD260/OD280值在1.8～1.9之间,OD260/OD230值为2.0左右,对DNA样品进行琼脂糖凝胶电泳检测,主带清晰,降解较少,产量和纯度均较高,效果较好。优化后的ISSR-PCR反应体系为:2.5μL10×PCRbuffer,2.5mmol/LMgCl2,250μmol/LdNTPs,10ng模板DNA,0.75UTaq酶,引物浓度0.7μmol/L,反应总体积为25μL,引物UBC826最佳退火温度为53℃。该体系在多次重复中均能获得良好的扩增结果。苦瓜基因组DNA提取的最佳方法为改良CTAB法,最适合的部位为顶端嫩叶。 展开更多

关键词 苦瓜 基因组DNA 提取方法 issr 优化体系

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苦瓜ISSR-CR反应体系的建立 被引量：7

5

作者 王绪 邓俭英 +3 位作者 方锋学 张曼 张玲玲 孙德利 《种子》 CSCD 北大核心 2007年第1期15-18,共4页

以苦瓜（Momordica charantia L．）为试材，研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度、循环次数对苦瓜ISSR扩增结果的影响。结果表明：在20μl的反应体系中，Mg^2＋的用量为1．2—1．6mmol／L，dNTPs浓度为0．2mmol／L，引物的浓度为0... 以苦瓜（Momordica charantia L．）为试材，研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度、循环次数对苦瓜ISSR扩增结果的影响。结果表明：在20μl的反应体系中，Mg^2＋的用量为1．2—1．6mmol／L，dNTPs浓度为0．2mmol／L，引物的浓度为0．25μmol／L，Taq DNA聚合酶的用量为1u，模板DNA的用量为30～50ng，在46．4—51.7℃的退火温度下35个循环，能得到清晰、多态性高的ISSR带谱。 展开更多

关键词 苦瓜 issr(inter—simple sequence repeat) 反应体系 优化

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用ISSR分子标记检测不同尾矿废弃地白茅居群的遗传多样性 被引量：8

6

作者 田胜尼 王峥峰 +2 位作者 高三红 郝艳茹 彭少麟 《中山大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期87-92,共6页

采用ISSR技术对安徽4个铜尾矿、1个铅锌尾矿废弃地上自然定居的白茅和非矿区正常生境下1个白茅居群遗传多样性进行了研究。从100条ISSR引物中筛选出10条引物对6个居群180个样品进行PCR扩增,共得到139扩增带,其中多态位点为132条,多态位... 采用ISSR技术对安徽4个铜尾矿、1个铅锌尾矿废弃地上自然定居的白茅和非矿区正常生境下1个白茅居群遗传多样性进行了研究。从100条ISSR引物中筛选出10条引物对6个居群180个样品进行PCR扩增,共得到139扩增带,其中多态位点为132条,多态位点百分率为94.96%。POPGENE分析表明,白茅居群的总遗传多样性为0.3125,非矿区白茅的遗传多样性远高于另外5个矿区居群,铅锌尾矿的遗传多样性最低,6个白茅居群之间出现明显的遗传分化(φst=0.030,P<0.002),各居群的个体各自聚在一起。上述结果可能是在金属尾矿废弃地胁迫下,白茅居群遗传本质上产生了明显的遗传分化。 展开更多

关键词 issr 金属尾矿废弃地 白茅 遗传多样性

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李ISSR反应体系的优化 被引量：7

7

作者 冯晨静 苏智海 +2 位作者 刘威生 孟庆瑞 杨建民 《河北林果研究》 2005年第1期30-33,共4页

以李品种杏梅(hybrid)和斯顿莱(Prunus domestica)为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对李ISSR扩增结果的影响。结果表明:在20μl的反应体系中,模板DNA含量对扩增结果影响不大,在10-80 ng均能得到较好的扩增;dNTP用量对扩增... 以李品种杏梅(hybrid)和斯顿莱(Prunus domestica)为试材,研究了PCR反应体系的主要成分及退火温度对李ISSR扩增结果的影响。结果表明:在20μl的反应体系中,模板DNA含量对扩增结果影响不大,在10-80 ng均能得到较好的扩增;dNTP用量对扩增无明显影响;而Primer、Mg2+的最适浓度分别为0.25/μmol/L、0.25 mmol/L;Taq酶在0.5-1.0 U均能得到好的扩增条带;退火温度在50-52.1℃范围内均能得到清晰的条带。 展开更多

关键词 李 SSR(inter—simple sequence repeat) 反应体系 优化

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棉花黄萎病菌遗传多样性的ISSR分析 被引量：9

8

作者 宋培玲 李子钦 杨家荣 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2011年第1期113-118,125,共7页

【目的】利用ISSR分子标记技术,对不同地理来源的棉花黄萎病菌株进行分子指纹分析,以了解其遗传关系。【方法】选用25条引物,对来自于我国11个省(市、自治区)的28个棉花黄萎病菌株进行分子指纹分析,研究各菌株间的遗传相似性。【结果】... 【目的】利用ISSR分子标记技术,对不同地理来源的棉花黄萎病菌株进行分子指纹分析,以了解其遗传关系。【方法】选用25条引物,对来自于我国11个省(市、自治区)的28个棉花黄萎病菌株进行分子指纹分析,研究各菌株间的遗传相似性。【结果】从25条ISSR随机引物中筛选出9条多态性好、条带稳定的引物,用其对28个棉花黄萎病菌株进行扩增,共获得1 989条谱带,其中1 908条为多态性条带,多态性比率为95.9%,表明ISSR标记对棉花黄萎病菌具有较高的多态性;通过对棉花黄萎病菌ISSR遗传相似系数的统计与分析,得到其相关系数r=0.88,该r值介于0.8和0.9之间,表明进化树符合较好,故将ISSR标记应用于棉花黄萎病菌的遗传多样性分析,具有较高的一致性和可信度。ISSR多态性与棉花黄萎病菌的落叶型有一定的相关性,而与菌落形态类型、地理来源未表现出相关性。【结论】供试的不同地理来源的棉花黄萎病菌株遗传相似性较高,基因多样性较低,且ISSR多态性与地理来源未表现出相关性。 展开更多

关键词 棉花 棉花黄萎病菌 遗传多样性 issr(inter simple sequence repeat)

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板栗ISSR反应体系的优化及河北省板栗生态型的分析 被引量：4

9

作者 韩继成 刘庆香 +2 位作者 王广鹏 张新忠 孔德军 《河北农业科学》 2008年第4期64-65,68,共3页

以早丰和燕明2个板栗品种为试材,应用编号为ISSR52的引物,对ISSR反应体系中的dNTPs、Taq DNA聚合酶、引物、模板和甲酰胺等主要影响因子进行了优化筛选。结果表明:20μL ISSR反应体系各组分的最适浓度分别为1×Buffer(含2.0 mmol/L... 以早丰和燕明2个板栗品种为试材,应用编号为ISSR52的引物,对ISSR反应体系中的dNTPs、Taq DNA聚合酶、引物、模板和甲酰胺等主要影响因子进行了优化筛选。结果表明:20μL ISSR反应体系各组分的最适浓度分别为1×Buffer(含2.0 mmol/L的Mg2+),dNTPs 0.2 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U,引物0.2μmol/L,模板25 ng。加人2.0%的甲酰胺有利于减轻背景的干扰。利用该体系对9个河北省板栗品种(系)和1个山东省板栗品种进行了分析,以明确河北省板栗居群的遗传多样性。通过对53个ISSR引物的重复筛选,获得了19个稳定的ISSR引物,在10个品种(系)中共产生93条带,33.3%为多态性条带。通过聚类分析进一步明确河北省板栗可分为燕山和太行山2个生态型,并且太行山地区的板栗具有较高的遗传多样性。 展开更多

关键词 板栗 简单重复序列区间 反应体系 遗传多样性

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豇豆与饭豆种间杂种的获得及其鉴定 被引量：3

10

作者 戴希刚 郭瑞 +2 位作者 潘磊 曾长立 陈禅友 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期519-524,共6页

对豇豆和饭豆进行种间杂交试验,30个正反交组合中有3个杂交组合获得种子,它们分别是豇豆A65×饭豆B24、豇豆A27×饭豆D1、豇豆A136×饭豆A163。对获得的种间杂种及其双亲进行表型性状、生理指标及分子标记鉴定分析结果表明... 对豇豆和饭豆进行种间杂交试验,30个正反交组合中有3个杂交组合获得种子,它们分别是豇豆A65×饭豆B24、豇豆A27×饭豆D1、豇豆A136×饭豆A163。对获得的种间杂种及其双亲进行表型性状、生理指标及分子标记鉴定分析结果表明,豇豆A136×饭豆A163杂交组合所获杂种为假杂种,其他2个杂交组合所获杂种为真杂种。利用豇豆与饭豆种间杂交将饭豆的有利性状基因导入豇豆中,拓宽豇豆的遗传背景,为豇豆种质资源的创新与新品种选育提供基础。 展开更多

关键词 豇豆 饭豆 种间杂交 杂种鉴定 issr

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山核桃ISSR反应体系的优化 被引量：2

11

作者 吕岩桢 王雷 +1 位作者 张兴旺 郭传友 《安徽农学通报》 2011年第7期30-31,35,共3页

采用改良的CTAB法提取山核桃基因组DNA,该方法提取的DNA纯度与含量较高。以宁国山核桃居群为试材,用引物UBC810[序列为(GA)8T]研究了PCR反应体系的5种主要组分对山核桃ISSR扩增结果的影响。结果显示:除模板DNA含量外,其它因素均对扩增... 采用改良的CTAB法提取山核桃基因组DNA,该方法提取的DNA纯度与含量较高。以宁国山核桃居群为试材,用引物UBC810[序列为(GA)8T]研究了PCR反应体系的5种主要组分对山核桃ISSR扩增结果的影响。结果显示:除模板DNA含量外,其它因素均对扩增效果有明显影响。建立的反应体系为:20μL反应体系中DNA模板量30ng、引物浓度0.3μmol/L、dNTPs浓度0.3mmol/L、Mg2+浓度2.0mmol/L、TaqDNA聚合酶用量1U。 展开更多

关键词 山核桃 issr 反应体系 优化

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广西桑树品种遗传多样性ISSR分析 被引量：1

12

作者 刘玲 沈曦彤 +5 位作者 朱方容 邱长玉 范小敏 陈祥平 柯皓天 陈仁芳 《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期30-35,共6页

利用ISSR(inter-simple sequence repeat)分析了广西桑树品种的亲缘关系.刘圩7号、灵太3号、恭同5号、大寺12号、池塘1号、刘圩2号、那学8号、那陈2号、那学14号、小董1号、板朝1号、冯屋1号、邕新3号、邕新11号、恭同9号、太平2号、沙... 利用ISSR(inter-simple sequence repeat)分析了广西桑树品种的亲缘关系.刘圩7号、灵太3号、恭同5号、大寺12号、池塘1号、刘圩2号、那学8号、那陈2号、那学14号、小董1号、板朝1号、冯屋1号、邕新3号、邕新11号、恭同9号、太平2号、沙油4号、板屯车2号有较近的亲缘关系;大寺特号、冯屋5号、池塘4号、太平新1号、恭城4号有较近的亲缘关系;大寺5号、灵太1号、恭江1号、涠盛4号、灵太2号、板罗1号、那楼14号、恭同4号有较近的亲缘关系;钦州桑、大新白桑、广西鸡桑、全州长穗桑、环江1号、钦州长果桑、桂772、涠州岛白桑、邕新荆桑12号、隆林鬼桑、隆林蒙桑有较近的亲缘关系.白桑种遗传变异大;广东桑种亲缘关系靠近白桑,支持中国植物志、GenBank将广东桑置于白桑的变种.野生桑种与栽培桑种遗传背景明显不同.钦州桑、桂772、邕新荆桑12号遗传背景倾向野生桑,在抗性、速生方面有独特优点,在今后杂交育种中应注意利用. 展开更多

关键词 广西 桑树品种 issr(inter-simple sequence repeat) 亲缘关系

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福建主栽非洲菊品种遗传多样性ISSR分析 被引量：1

13

作者 夏朝水 江斌 +2 位作者 邓永生 陈玮婷 曹奕鸯 《福建农业科技》 CAS 2021年第1期9-14,共6页

利用ISSR技术对35份福建主栽非洲菊资源进行遗传多样性分析。从100条ISSR引物中筛选出多态性好的15条随机引物,分别对35份非洲菊资源基因组DNA进行扩增,共扩增得到78条清晰可辨条带,其中多态性条带70条,多态位点百分比达89.7%。利用DPS... 利用ISSR技术对35份福建主栽非洲菊资源进行遗传多样性分析。从100条ISSR引物中筛选出多态性好的15条随机引物,分别对35份非洲菊资源基因组DNA进行扩增,共扩增得到78条清晰可辨条带,其中多态性条带70条,多态位点百分比达89.7%。利用DPS软件统计分析,结果表明,各品种间的遗传相似系数介于0.2968~0.7500,当阈值为0.4200时,可将35个非洲菊分成4类。当遗传相似系数为0.4914时,第I类非洲菊又可分为4个亚类。聚类结果表明,花心颜色和重瓣类型可以作为非洲菊亲缘关系分类的一种依据,同一搜集来源的品种有聚类到一起的趋势,这与农艺性状的聚类结果有一定的对应关系。 展开更多

关键词 非洲菊 种质资源 简单重复序列间扩增 遗传多样性

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云南省苹果棉蚜种群遗传多样性的ISSR分析 被引量：3

14

作者 刘佳妮 李正跃 +3 位作者 桂富荣 陈斌 于亮 李世吉 《西南大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期136-140,共5页

苹果棉蚜是世界性检疫害虫,在云南省苹果主要产区造成严重的危害.从100条ISSR(Inter-si mple Sequence Repeat)引物中共筛选出4条多态性和重复性好的引物,研究了云南省昆明市、丽江市、昭通市3个苹果主产区共57个采样点的苹果棉蚜种群... 苹果棉蚜是世界性检疫害虫,在云南省苹果主要产区造成严重的危害.从100条ISSR(Inter-si mple Sequence Repeat)引物中共筛选出4条多态性和重复性好的引物,研究了云南省昆明市、丽江市、昭通市3个苹果主产区共57个采样点的苹果棉蚜种群间及种群内的遗传多样性.4条引物在苹果棉蚜DNA中共扩增出49个位点,多态位点百分率为75.51%.由Shannon信息指数和Nei s指数估算的种群间遗传分化系数为42.48%和17.53%,种群内遗传分化系数分别为57.52%和83.17%,表明苹果棉蚜大部分遗传变异主要存在于种群内部.各种群的遗传距离聚类分析表明,昆明种群与昭通种群的亲缘关系较丽江种群为近.研究结果为我国苹果棉蚜的遗传防治研究提供了分子依据,为进一步研究苹果棉蚜的分子进化提供了背景资料. 展开更多

关键词 苹果棉蚜 issr(inter-simple sequence repeat)标记 遗传多样性

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非洲黑麦染色体特异性标记的建立与应用 被引量：3

15

作者 曾雪 杨足君 +4 位作者 李光蓉 雷孟平 刘成 贾举庆 任正隆 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1056-1062,共7页

以非洲黑麦、小麦-非洲黑麦双二倍体、安岳排灯麦等为材料筛选100条ISSR引物。其中,引物UBC815可在非洲黑麦中扩增出1条长561bp的特异性片段(命名为pSaUBC815561),而小麦对照均未扩出该片段。引物UBC815同样能在黑麦属的瓦维洛夫黑麦(Se... 以非洲黑麦、小麦-非洲黑麦双二倍体、安岳排灯麦等为材料筛选100条ISSR引物。其中,引物UBC815可在非洲黑麦中扩增出1条长561bp的特异性片段(命名为pSaUBC815561),而小麦对照均未扩出该片段。引物UBC815同样能在黑麦属的瓦维洛夫黑麦(Secale vavilovii Grossh.)、森林黑麦(Secale sylvestre Host.)等5个种扩增出pSaUBC815561。根据pSaUBC815561设计特异PCR引物U815-F、U815-R,对小麦族多物种进行扩增,表明pSaUBC815561为黑麦属特有。进而利用一套中国春-Imperial黑麦二体附加系及小麦-黑麦异源材料进行扩增,结果显示,pSaUBC815561分布在黑麦整套染色体上,并且所有后代材料都能扩增出pSaUBC815561,表明pSaUBC815561可作为特异性标记用来检测小麦背景中的黑麦染色质。 展开更多

关键词 非洲黑麦 issr分子标记 特异PCR

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大薯ISSR-PCR反应体系的优化 被引量：1

16

作者 程文杰 罗欣 +2 位作者 周鑫 黄小龙 黄东益 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期129-133,153,共6页

以大薯为材料,通过试验优化了ISSR-PCR反应体系中的主要成分用量及浓度、退火温度对大薯ISSR扩增结果的影响。试验表明:在20μL的反应体系中,Mg2+的浓度为1.875 mmol/L,dNTPs浓度为0.500 mmol/L,引物的浓度为1.0μmol/L,TaqDNA聚合酶的... 以大薯为材料,通过试验优化了ISSR-PCR反应体系中的主要成分用量及浓度、退火温度对大薯ISSR扩增结果的影响。试验表明:在20μL的反应体系中,Mg2+的浓度为1.875 mmol/L,dNTPs浓度为0.500 mmol/L,引物的浓度为1.0μmol/L,TaqDNA聚合酶的用量为1U,模板DNA的用量为60 ng,在48℃的退火温度下45个循环,能得到清晰、多态性高的ISSR带谱。 展开更多

关键词 大薯 issr 反应体系 优化

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