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草鱼(Ctenopharyngodon idella)长链非编码RNA ISG152-L2激活IRF3和ISG152的表达
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作者 胡霁欢 胡美玲 +4 位作者 史骁 周鹏程 常凯乐 向阳 徐小文 《南昌大学学报（理科版）》 CAS 北大核心 2023年第3期272-282,共11页
长链非编码RNA(lncRNA,非编码RNA≥200 bp)以前被认为是转录中的“噪音”。然而,近年来已经发现了相当多的具有重要功能的lncRNA。LncRNA在疾病、发育、细胞分化和先天免疫反应中起着至关重要的作用。本研究通过使用TopHat2软件和Cuffli... 长链非编码RNA(lncRNA,非编码RNA≥200 bp)以前被认为是转录中的“噪音”。然而,近年来已经发现了相当多的具有重要功能的lncRNA。LncRNA在疾病、发育、细胞分化和先天免疫反应中起着至关重要的作用。本研究通过使用TopHat2软件和Cufflinks软件分析草鱼的转录组数据,鉴定了与免疫相关的长链非编码RNA。筛选出一个lncRNA序列,命名为ISG152-L2,它位于草鱼ISG152的上游。使用综合基因组学查看器(IGV)测定ISG152-L2和草鱼ISG152的同步表达。研究了ISG152-L2的共表达,并确定了包括草鱼ISG152在内的相关基因网络,功能富集分析表明,这些基因在免疫相关过程中功能富集。用poly(I:C)刺激时,ISG152-L2在被测组织(脑,眼,肠,鳃,心脏,肝胰腺,脾脏和肾脏)中上调。同时,ISG152-L2和ISG152在CIK细胞受到poly(I:C)刺激后均上调。双荧光素酶基因检测发现,CIK细胞中的ISG152-L2显著增强了ISG152启动子活性,并且这种增强取决于ISG152-L2的特定620~1 190 bp区域。免疫共沉淀试验表明,草鱼ISG152可以在体外IRF3相互作用。此外,isg152-l2过表达增加了CIK细胞中IRF3的蛋白质水平,而ISG152-L2的干扰则产生了相反的结果。总之,我们筛选了一个免疫相关的lncRNA,即ISG152-L2,它位于ISG152的上游,并通过诱导其启动子的活性,上调IRF3的蛋白表达水平来增强ISG152的表达。 展开更多
关键词 长链非编码RNA isg152-L2 isg152 IRF3 先天免疫 鱼类
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