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西班牙根结线虫rDNA特性及其检测方法 被引量：7
1
作者 胡永坚 王暄 李红梅 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期62-65,共4页
通过对rDNA的ITS区和IGS2区进行PCR扩增并对产物测序,比较分析了西班牙根结线虫与中国4种常见的南方根结线虫、爪哇根结线虫、花生根结线虫和北方根结线虫群体rDNA的ITS区和IGS2区的序列差异,选择限制性内切酶TaqⅠ对IGS2区的PCR扩增产... 通过对rDNA的ITS区和IGS2区进行PCR扩增并对产物测序,比较分析了西班牙根结线虫与中国4种常见的南方根结线虫、爪哇根结线虫、花生根结线虫和北方根结线虫群体rDNA的ITS区和IGS2区的序列差异,选择限制性内切酶TaqⅠ对IGS2区的PCR扩增产物进行酶切,获得了西班牙根结线虫的554 bp的特异性条带。表明用此方法可以明显将西班牙根结线虫与其他4种常见的根结线虫群体区分开,其灵敏度可达到单条根结线虫二龄幼虫。 展开更多
关键词 西班牙根结线虫 RDNA ITS igs2 RFLP
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美人鱼发光杆菌杀鱼亚种LAMP快速检测方法的建立与应用 被引量：1
2
作者 姚学良 蔡琰 +2 位作者 徐晓丽 钟文慧 包海岩 《山东农业大学学报（自然科学版）》 北大核心 2021年第1期7-12,共6页
建立了美人鱼发光杆菌杀鱼亚种的环介导等温扩增技术(Loop-Mediated Isothermal Amplification,LAMP)。针对IGS2基因保守序列的6个区域设计2对特异引物,利用链置换DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)在恒温65℃下保温40 min。采用钙黄绿素... 建立了美人鱼发光杆菌杀鱼亚种的环介导等温扩增技术(Loop-Mediated Isothermal Amplification,LAMP)。针对IGS2基因保守序列的6个区域设计2对特异引物,利用链置换DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)在恒温65℃下保温40 min。采用钙黄绿素作为显色剂,FTA卡采集病样肝组织中病原菌核酸。结果显示:以IGS2基因建立的LAMP方法能够特异性检测美人鱼发光杆菌杀鱼亚种,检测灵敏度为2.6×102 cfu/mL。针对美人鱼发光杆菌杀鱼亚种IGS2基因建立的LAMP检测方法具有较好的特异性和稳定性,可用于美人鱼发光杆菌杀鱼亚种的野外现场快速检测。 展开更多
关键词 豹纹鳃棘鲈 美人鱼发光杆菌杀鱼亚种 igs2 LAMP
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新生隐球菌ITS与IGS2基因的分类比较研究
3
作者 康颖倩 王和 《贵州医药》 CAS 2009年第11期973-975,共3页
目的探讨ITS及IGS2基因片段对新生隐球菌各变种及基因型分类与鉴定的应用价值。方法根据本课题前期研究结果及GenBank发表的基因序列资料,研究新生隐球菌3个变种的ITS和IGS2基因片段信息,用CLUSTERW软件构建以上两种基因的系统发育进化... 目的探讨ITS及IGS2基因片段对新生隐球菌各变种及基因型分类与鉴定的应用价值。方法根据本课题前期研究结果及GenBank发表的基因序列资料,研究新生隐球菌3个变种的ITS和IGS2基因片段信息,用CLUSTERW软件构建以上两种基因的系统发育进化树并进行分析,了解其亲缘关系。结果对新生隐球菌各菌株ITS基因型的IGS2区域片段分析结果显示,IGS2基因片断具有丰富的变异和信息位点。同ITS基因序列比较显示,IGS2基因在亚种内也具有同步进化和变异的特征。结论IGS2基因序列分析可作为新生隐球菌种间及种内基因分类鉴定有效的分子生物学方法;多种基因分类鉴定方法的联合应用,可更有效和准确地鉴定新生隐球菌并揭示其种内不同基因亚型间的遗传进化关系。 展开更多
关键词 新生隐球菌 基因分类 igs2 ITS
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河南省白灵侧耳菌株遗传多样性分析
4
作者 孔维威 袁瑞奇 +4 位作者 康源春 张玉亭 周舒浩 常晓超 刘洋洋 《食药用菌》 2022年第1期48-52,共5页
采用拮抗反应和基因间隔区2(intergenic spacer 2,IGS2)分析方法对河南省32个白灵侧耳(Pleurotus tuoliensis)菌株的遗传多样性进行分析。结果:除菌株Pt1、Pt5和Pt22外,绝大多数菌株间存在拮抗反应;应用Hpa Ⅱ、Rsa Ⅰ和Hae Ⅲ等3个限... 采用拮抗反应和基因间隔区2(intergenic spacer 2,IGS2)分析方法对河南省32个白灵侧耳(Pleurotus tuoliensis)菌株的遗传多样性进行分析。结果:除菌株Pt1、Pt5和Pt22外,绝大多数菌株间存在拮抗反应;应用Hpa Ⅱ、Rsa Ⅰ和Hae Ⅲ等3个限制性内切酶,对IGS2扩增产物进行酶切和电泳分析,不同菌株电泳后产生多样性丰富的图谱。根据聚类分析结果将所有菌株分为3个大类,3个大类遗传关系相对较远,最终将32个菌株鉴定为3组,可为今后白灵侧耳新品种杂交选育亲本的选择提供参考。 展开更多
关键词 白灵侧耳 基因间隔区2 限制性内切酶 遗传多样性 拮抗反应
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中国栽培白灵侧耳的RAPD和IGS分析 被引量：42
5
作者 张金霞 黄晨阳 +1 位作者 张瑞颖 管桂萍 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期514-519,共6页
以RAPD和IGS为分子标记,研究了中国栽培白灵侧耳Pleurotus nebrodensis菌株的遗传多样性,RAPD结果表明,供试菌株间存在多态性;对供试菌株的IGS分析表明,白灵侧耳P. nebrodensis的IGS1区域较保守,菌株间没有多态性;IGS2区域进化较快,菌... 以RAPD和IGS为分子标记,研究了中国栽培白灵侧耳Pleurotus nebrodensis菌株的遗传多样性,RAPD结果表明,供试菌株间存在多态性;对供试菌株的IGS分析表明,白灵侧耳P. nebrodensis的IGS1区域较保守,菌株间没有多态性;IGS2区域进化较快,菌株间具丰富的多态性。IGS2-RFLP可应用于白灵侧耳的菌株鉴定鉴别,较RAPD更稳定,更具可操作性。 展开更多
关键词 白灵侧耳 RAPD 供试菌株 栽培 分子标记 遗传多样性 多态性 菌株鉴定 鉴别 分析
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象耳豆根结线虫的PCR鉴定和检测方法(英文) 被引量：30
6
作者 龙海 刘昊 徐建华 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期109-115,共7页
象耳豆根结线虫是一种在中国具有潜在经济重要性的农作物病原物。为提供有助于控制象耳豆根结线虫传播扩散的方法,研制了该线虫的快速PCR鉴定和检测法。该方法PCR引物的扩增目标为rDNA-IGS2区域,其设计依据象耳豆根结线虫与南方、爪哇... 象耳豆根结线虫是一种在中国具有潜在经济重要性的农作物病原物。为提供有助于控制象耳豆根结线虫传播扩散的方法,研制了该线虫的快速PCR鉴定和检测法。该方法PCR引物的扩增目标为rDNA-IGS2区域,其设计依据象耳豆根结线虫与南方、爪哇、花生和北方根结线虫在该区域核酸序列的差异。通过对6种近似根结线虫的不同地理群体及自然土壤线虫群体的测试,验证了设计的PCR引物针对象耳豆根结线虫的特异性和可靠性。本方法具有快速灵敏的特点,可用于象耳豆根结线虫单条线虫的直接鉴定以及混合土壤线虫群体中象耳豆根结线虫的检测。 展开更多
关键词 象耳豆根结线虫 igs2序列 PCR鉴定和检测法
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斑玉蕈菌株的IGS2序列和RAPD分析 被引量：1
7
作者 潘越 陈辉 +3 位作者 冯志勇 陈明杰 汪虹 张津京 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2013年第22期165-168,173,共5页
采用转录单位间隔区2（IGS2）和随机扩增多态性DNA（RAPD）技术分析了斑玉蕈不同菌株的遗传差异。结果显示，20个不同斑玉蕈菌株的IGS2序列大小不一致，长度在1150—1203bp之间，序列相似度约在95％以上。在100个随机引物中筛选出11个... 采用转录单位间隔区2（IGS2）和随机扩增多态性DNA（RAPD）技术分析了斑玉蕈不同菌株的遗传差异。结果显示，20个不同斑玉蕈菌株的IGS2序列大小不一致，长度在1150—1203bp之间，序列相似度约在95％以上。在100个随机引物中筛选出11个能够扩增出稳定带型且菌株之间带型差异明显的RAPD引物，共扩增出142条条带，特异性条带134条，多态性比例较高，表明RAPD技术对斑玉蕈菌株的扩增具有丰富的多态性，能够在DNA水平上鉴别不同菌株是否存在差异。 展开更多
关键词 斑玉蕈 转录单位间隔区2(igs2) 随机扩增多态性DNA(RAPD)
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