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基于肿瘤免疫微环境鉴定IDH突变型弥漫性胶质瘤的预后标志物
被引量：
1
1
作者
张娇
黄纯海
王钊
《生物信息学》
2022年第2期141-148,共8页
异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变存在于大多数低级别胶质细胞瘤中,免疫逃逸是肿瘤标志性特征之一,免疫治疗在胶质瘤的治疗中的作用越来越重要。利用生信手段分析TCGA、CGGA、GEO数据集中IDH突变胶质瘤的770个免疫相关基因及其临床相关数据,从...
异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变存在于大多数低级别胶质细胞瘤中,免疫逃逸是肿瘤标志性特征之一,免疫治疗在胶质瘤的治疗中的作用越来越重要。利用生信手段分析TCGA、CGGA、GEO数据集中IDH突变胶质瘤的770个免疫相关基因及其临床相关数据,从而获得每个患者的免疫风险评分(IMRS);结合IMRS和临床信息,筛选出6个差异表达基因(TRAF3、ATG10、BID、TAB1、MAP3K1、RPS6)组成IMRS模型并生成诺莫图对患者预后进行评估,发现低风险组患者的总生存期(OS)较高风险组均明显延长。此外,签名相关免疫细胞浸润分析发现肿瘤相关巨噬细胞浸润评分(TAM)与肿瘤相关T细胞浸润评分(TIS)呈明显的负相关,表明高IMRS富集了促肿瘤免疫浸润,而低IMRS则富集了相对较多的抗肿瘤免疫浸润。
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关键词
免疫微环境
idh
突变型
弥漫性
胶质
细胞
瘤
总生存期
免疫浸润评分模型
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职称材料
题名
基于肿瘤免疫微环境鉴定IDH突变型弥漫性胶质瘤的预后标志物
被引量：
1
1
作者
张娇
黄纯海
王钊
机构
吉首大学医学院
吉首大学第一附属医院/湘西自治州人民医院神经外科
吉首大学临床转化医学研究中心
出处
《生物信息学》
2022年第2期141-148,共8页
基金
国家自然科学基金项目(No.81560414)。
文摘
异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变存在于大多数低级别胶质细胞瘤中,免疫逃逸是肿瘤标志性特征之一,免疫治疗在胶质瘤的治疗中的作用越来越重要。利用生信手段分析TCGA、CGGA、GEO数据集中IDH突变胶质瘤的770个免疫相关基因及其临床相关数据,从而获得每个患者的免疫风险评分(IMRS);结合IMRS和临床信息,筛选出6个差异表达基因(TRAF3、ATG10、BID、TAB1、MAP3K1、RPS6)组成IMRS模型并生成诺莫图对患者预后进行评估,发现低风险组患者的总生存期(OS)较高风险组均明显延长。此外,签名相关免疫细胞浸润分析发现肿瘤相关巨噬细胞浸润评分(TAM)与肿瘤相关T细胞浸润评分(TIS)呈明显的负相关,表明高IMRS富集了促肿瘤免疫浸润,而低IMRS则富集了相对较多的抗肿瘤免疫浸润。
关键词
免疫微环境
idh
突变型
弥漫性
胶质
细胞
瘤
总生存期
免疫浸润评分模型
Keywords
Immune microenvironment
idh
mutant diffuse glioma
Overall survival
IMRS model
分类号
R605 [医药卫生—外科学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于肿瘤免疫微环境鉴定IDH突变型弥漫性胶质瘤的预后标志物
张娇
黄纯海
王钊
《生物信息学》
2022
1
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