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叶酸缺乏影响胚胎干细胞H3K9巴豆酰化和神经发育相关基因表达
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作者 陈晨 何学佳 王珊 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第14期1666-1675,共10页
目的采用染色质免疫共沉淀测序技术(chromatin immunoprecipitation sequencing,ChIP-seq)分析叶酸正常小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells,mESCs)与叶酸缺乏mESCs组蛋白H3K9巴豆酰化(H3K9cr)修饰的全基因图谱,以期探究叶酸缺... 目的采用染色质免疫共沉淀测序技术(chromatin immunoprecipitation sequencing,ChIP-seq)分析叶酸正常小鼠胚胎干细胞(mouse embryonic stem cells,mESCs)与叶酸缺乏mESCs组蛋白H3K9巴豆酰化(H3K9cr)修饰的全基因图谱,以期探究叶酸缺乏条件下mESCs中H3K9cr全基因组状态变化以及受到调控的通路基因。方法mESCs分为叶酸正常组(FA=4 mg/L,FA4)和叶酸缺乏组(FA=0 mg/L,FA0),利用Western blot和免疫组织化学染色分别检测叶酸缺乏mESCs和神经管畸形(neural tube defects,NTDs)小鼠胚脑组织中H3K9cr蛋白表达水平;利用ChIP-seq技术对获得的特异性结合的DNA片段展开序列鉴定,对差异表达基因进行基因本体论(gene ontology,GO)以及京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析并可视化,分析叶酸缺乏条件下mESCs全基因组并对受调控基因进行验证。结果叶酸缺乏mESCs和NTDs小鼠胚脑组织中整体H3K9cr水平降低(P<0.05),叶酸缺乏mESCs中Bdnf、Pax6、App等神经发育相关基因下调(P<0.05),FA4与FA0两组差异富集基因的KEGG通路富集于轴突引导、神经活性配体-受体相互作用、谷氨酸能突触等与神经系统相关的通路。结论胚胎干细胞中叶酸缺乏通过H3K9cr修饰参与调控神经发育相关基因,提示组蛋白巴豆酰化修饰可能参与叶酸缺乏引起的神经发育类疾病。 展开更多
关键词 叶酸缺乏 组蛋白巴豆酰化 CHIP-SEQ 神经发育
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染色域Y样蛋白介导的组蛋白巴豆酰化与抑郁小鼠模型中NGF和炎症因子水平及神经功能紊乱的关系 被引量:2
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作者 张欢 郭改艳 +3 位作者 黄娜 马新欣 朱梅 刘亚楠 《现代生物医学进展》 CAS 2022年第13期2422-2426,共5页
目的:探究染色域Y样蛋白介导的组蛋白巴豆酰化与抑郁小鼠模型中神经生长因子(Nerve growth factor,NGF)和炎症因子水平及神经功能紊乱的关系。方法:32只成年雄性C57BL/6小鼠分为4组:对照组、模型组、CDYL过表达组、CDYL敲低组,各8只。... 目的:探究染色域Y样蛋白介导的组蛋白巴豆酰化与抑郁小鼠模型中神经生长因子(Nerve growth factor,NGF)和炎症因子水平及神经功能紊乱的关系。方法:32只成年雄性C57BL/6小鼠分为4组:对照组、模型组、CDYL过表达组、CDYL敲低组,各8只。通过慢性束缚应激诱导抑郁模型,通过旷场试验记录中心时间和中心距离,通过强迫游泳测试记录不动时间。通过RT-qPCR和蛋白质免疫印迹检测CDYL m RNA和蛋白质表达水平。通过ChIP-seq检测组蛋白赖氨酸巴豆酰化。通过ELISA检测TNF-α,IL-1β和IL-6表达水平。通过RT-qPCR检测检测海马组织5-HT和IDO m RNA表达水平。通过蛋免疫组织化学染色检测检测海马组织NGF、BDNF和突触素(Synaptophysin,SYP)表达水平。通过BrdU免疫荧光染色检测神经系统的发育以及识别大脑中的神经发生。结果:模型组中心时间和中心距离较对照组降低,不动时间较对照组升高(P<0.05)。CDYL过表达组中心时间和中心距离较模型组降低,不动时间较模型组升高(P<0.05)。CDYL敲低组中心时间和中心距离较模型组升高,不动时间较模型组降低(P<0.05)。模型组CDYL m RNA和蛋白质表达水平较对照组升高(P<0.05)。CDYL过表达组CDYL m RNA和蛋白质表达水平较模型组升高(P<0.05)。CDYL敲低组TCDYL m RNA和蛋白质表达水平较模型组降低(P<0.05)。模型组组蛋白巴豆酰化水平较对照组降低(P<0.05)。CDYL过表达组组蛋白巴豆酰化水平较模型组降低(P<0.05)。CDYL敲低组组蛋白巴豆酰化较模型组升高(P<0.05)。模型组TNF-α,IL-1β和IL-6表达水平较对照组升高(P<0.05)。CDYL过表达组TNF-α,IL-1β和IL-6表达水平较模型组升高(P<0.05)。CDYL敲低组TNF-α,IL-1β和IL-6表达水平较模型组降低(P<0.05)。模型组5-HT m RNA表达水平较对照组降低,IDO m RNA表达水平较对照组升高(P<0.05)。CDYL过表达组5-HT m RNA表达水平较模型组降低,IDO m RNA表达水平较模型组升� 展开更多
关键词 染色域Y样蛋白 组蛋白巴豆酰化 抑郁 神经生长因子 炎症因子
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溴结构域蛋白4抑制剂对前列腺癌细胞组蛋白巴豆酰化修饰以及增殖、迁移的影响 被引量:1
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作者 洪西 刘利杰 +2 位作者 黄先玉 罗静 俞建军 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期721-729,共9页
目的·探讨溴结构域蛋白4(bromodomain-containing protein4,BRD4)抑制剂I-BET762对前列腺癌细胞组蛋白巴豆酰化修饰以及前列腺癌细胞增殖、迁移的影响。方法·选取3种人前列腺癌细胞系LNCaP、C4-2B和PC-3,分别以各自的半数抑... 目的·探讨溴结构域蛋白4(bromodomain-containing protein4,BRD4)抑制剂I-BET762对前列腺癌细胞组蛋白巴豆酰化修饰以及前列腺癌细胞增殖、迁移的影响。方法·选取3种人前列腺癌细胞系LNCaP、C4-2B和PC-3,分别以各自的半数抑制浓度的I-BET762处理,Western blotting检测组蛋白上巴豆酰化修饰以及乙酰化酶的表达。CCK-8、Transwell迁移实验和划痕实验分别测定I-BET762对于LNCaP、C4-2B和PC-3细胞的增殖、迁移的影响。结果·I-BET762可以抑制组蛋白乙酰化酶P300和GCN5的表达,降低组蛋白巴豆酰化修饰表达。Transwell迁移实验和划痕实验结果表明,I-BET762可以抑制前列腺癌细胞系LNCaP、C4-2B和PC-3的迁移能力(均P<0.01);CCK-8实验结果表明,I-BET762处理后,3种前列腺癌细胞系的增殖能力被抑制。结论·前列腺癌细胞中I-BET762能够降低组蛋白巴豆酰化修饰水平,抑制细胞增殖和迁移。 展开更多
关键词 组蛋白巴豆酰化修饰 前列腺癌 溴结构域蛋白4 抑制剂 增殖 迁移
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非组蛋白巴豆酰化修饰的生物学功能研究进展
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作者 庞攀攀 杨铁花 +1 位作者 郑永唐 郑昌博 《生命科学》 CSCD 北大核心 2023年第2期123-131,共9页
赖氨酸巴豆酰化是一种新近发现的蛋白质翻译后修饰类型,在基因表达、细胞代谢及疾病治疗等许多病理生理过程中都具有重要的调节意义,可能是潜在的药物新靶标。目前研究多关注于组蛋白巴豆酰化修饰,而非组蛋白巴豆酰化修饰的研究逐渐被... 赖氨酸巴豆酰化是一种新近发现的蛋白质翻译后修饰类型,在基因表达、细胞代谢及疾病治疗等许多病理生理过程中都具有重要的调节意义,可能是潜在的药物新靶标。目前研究多关注于组蛋白巴豆酰化修饰,而非组蛋白巴豆酰化修饰的研究逐渐被重视。本文简要介绍非组蛋白巴豆酰化修饰的生物学功能及其在疾病中的作用,将有助于了解非组蛋白巴豆酰化修饰的功能和机制。 展开更多
关键词 非组蛋白巴豆酰化 翻译后修饰 生物学功能 疾病
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组蛋白赖氨酸巴豆酰化修饰的研究进展 被引量:1
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作者 杨强震 李培飞 李新红 《生命科学》 CSCD 2017年第11期1126-1132,共7页
组蛋白赖氨酸巴豆酰化修饰是2011年新发现的一种酰化修饰,对基因表达、细胞发育以及疾病治疗等生物过程具有重要的生物学意义。近两年内,巴豆酰化修饰生化相关研究取得突破性进展,尤其是在蛋白巴豆酰化修饰的生理功能以及与发育、遗传... 组蛋白赖氨酸巴豆酰化修饰是2011年新发现的一种酰化修饰,对基因表达、细胞发育以及疾病治疗等生物过程具有重要的生物学意义。近两年内,巴豆酰化修饰生化相关研究取得突破性进展,尤其是在蛋白巴豆酰化修饰的生理功能以及与发育、遗传、疾病相关性等领域逐渐受到关注。现对蛋白巴豆酰化做一简要回顾,总结组蛋白巴豆酰化修饰鉴定、相关酶系统、识别结构域及生物学功能等,这些信息为将来进一步探索蛋白巴豆酰化的功能提供理论基础。 展开更多
关键词 蛋白质翻译后修饰 组蛋白赖氨酸巴豆酰化 赖氨酸巴豆酰化酶 生物学功能
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