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抗菌肽HBβ-C在全雄和杂交黄颡鱼对多子小瓜虫抗性差异中的作用
被引量：
5
1
作者
熊阳
王帅
+2 位作者
丹成
张义兵
梅洁
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期975-985,共11页
为研究全雄黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、瓦式黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli)和杂交黄颡鱼(黄颡鱼P.fulvidraco♀×瓦氏黄颡鱼P.vachelli♂)对多子小瓜虫(Ichthyophthirius multifiliis)的抗性差异,通过生物信息学分析黄颡鱼...
为研究全雄黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、瓦式黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli)和杂交黄颡鱼(黄颡鱼P.fulvidraco♀×瓦氏黄颡鱼P.vachelli♂)对多子小瓜虫(Ichthyophthirius multifiliis)的抗性差异,通过生物信息学分析黄颡鱼皮肤黏液蛋白质组,发现其血红蛋白源抗菌肽(HBβ-C)位于血红蛋白β链HBβ的碳端,共33个氨基酸。利用化学合成的不同浓度的HBβ-C肽段进行体外抗虫实验,研究发现其能有效杀死滋养体、包囊体和掠食体阶段的多子小瓜虫,其中15μg/mL的HBβ-C能在3min内杀死所有滋养体。基因表达量分析显示,在杂交黄颡鱼的鳃和皮肤组织中,HBβ的mRNA表达量高于全雄黄颡鱼;但在应对小瓜虫感染的过程中,全雄黄颡鱼的HBβmRNA转录水平快速提升,其表达水平和上升倍率显著高于杂交黄颡鱼。蛋白表达量分析显示,HBβ在全雄黄颡鱼鳃组织中的蛋白表达量明显高于杂交黄颡鱼。免疫荧光定位结果显示,抗菌肽HBβ-C特异地在红细胞中表达,可以分泌并附着在滋养体上。综上所述,相对于杂交黄颡鱼,全雄黄颡鱼中HBβ具有更高的翻译效率,可以更高效地应对多子小瓜虫的感染。
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关键词
多子小瓜虫
全雄黄颡鱼
杂交黄颡鱼
血红蛋白
β
链
抗菌肽
体外抗虫实验
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职称材料
斜带石斑β-珠蛋白cDNA的克隆和序列分析
被引量：
2
2
作者
殷志新
何建国
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第1期58-61,共4页
从斜带石斑Epinepheluscoioides白细胞cDNA文库随机挑取噬菌斑 ,做为模板 ,用λTriplEx 5 3 长距离插入子筛选引物 ,进行插入片断的PCR扩增 ,并进行表达序列探针 (ESTs)测定。从中克隆到了血红蛋白 β亚基cDNA。cDNA包含长达 44 4bp的...
从斜带石斑Epinepheluscoioides白细胞cDNA文库随机挑取噬菌斑 ,做为模板 ,用λTriplEx 5 3 长距离插入子筛选引物 ,进行插入片断的PCR扩增 ,并进行表达序列探针 (ESTs)测定。从中克隆到了血红蛋白 β亚基cDNA。cDNA包含长达 44 4bp的开放阅读框 ,编码 147个氨基酸的多肽。用www expasy ch网站的computepI MW程序计算其可能的相对分子质量为 16 5 44 ,等电点为 6 95。其氨基酸序列与草鱼 β_珠蛋白Ⅲ的同源性最高 ,为73 0 %。在远端和近端的与血红素结合的组氨酸都是保守的。另外 ,与其它鱼类及蛙、鸡和人的 β_珠蛋白比较 ,在血红素结合区及亚基结合区的氨基酸残基均是高度保守的。
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关键词
斜带石斑
EpinephelusCoioides
血红蛋白
β
亚基
表达序列探针
ESTS
CDNA文库
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职称材料
人血红蛋白β链氨基酸对的变异模式(英文)
3
作者
严少敏
吴光
《广西科学院学报》
2011年第1期29-33,共5页
根据氨基酸对可预测性分析人血红蛋白β链的244个变异,以确定哪些氨基酸对对变异更敏感。结果发现4种变异模式:(1)85.66%的变异发生在不可预测的氨基酸对,(2)绝大多数被替换掉的氨基酸对中包含一个或两个氨基酸对它们的实际频率大于预...
根据氨基酸对可预测性分析人血红蛋白β链的244个变异,以确定哪些氨基酸对对变异更敏感。结果发现4种变异模式:(1)85.66%的变异发生在不可预测的氨基酸对,(2)绝大多数被替换掉的氨基酸对中包含一个或两个氨基酸对它们的实际频率大于预测频率,(3)79.51%的变异中被替换出的氨基酸对包含一个或两个在正常人β血红蛋白中不存在的氨基酸对,(4)大多数变异缩小了氨基酸对实际频率与预测频率之差。说明变异通常导致人血红蛋白β链的构成更随机、更稳定。
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关键词
氨基酸对可预测性
血红蛋白
β
链
变异
模式
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职称材料
题名
抗菌肽HBβ-C在全雄和杂交黄颡鱼对多子小瓜虫抗性差异中的作用
被引量：
5
1
作者
熊阳
王帅
丹成
张义兵
梅洁
机构
华中农业大学水产学院
中国科学院水生生物研究所
出处
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期975-985,共11页
基金
国家现代农业产业技术体系资助(CARS-46)
国家重点研发计划(2018YFD0901201和2018YFD0900302)资助。
文摘
为研究全雄黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、瓦式黄颡鱼(Pelteobagrus vachelli)和杂交黄颡鱼(黄颡鱼P.fulvidraco♀×瓦氏黄颡鱼P.vachelli♂)对多子小瓜虫(Ichthyophthirius multifiliis)的抗性差异,通过生物信息学分析黄颡鱼皮肤黏液蛋白质组,发现其血红蛋白源抗菌肽(HBβ-C)位于血红蛋白β链HBβ的碳端,共33个氨基酸。利用化学合成的不同浓度的HBβ-C肽段进行体外抗虫实验,研究发现其能有效杀死滋养体、包囊体和掠食体阶段的多子小瓜虫,其中15μg/mL的HBβ-C能在3min内杀死所有滋养体。基因表达量分析显示,在杂交黄颡鱼的鳃和皮肤组织中,HBβ的mRNA表达量高于全雄黄颡鱼;但在应对小瓜虫感染的过程中,全雄黄颡鱼的HBβmRNA转录水平快速提升,其表达水平和上升倍率显著高于杂交黄颡鱼。蛋白表达量分析显示,HBβ在全雄黄颡鱼鳃组织中的蛋白表达量明显高于杂交黄颡鱼。免疫荧光定位结果显示,抗菌肽HBβ-C特异地在红细胞中表达,可以分泌并附着在滋养体上。综上所述,相对于杂交黄颡鱼,全雄黄颡鱼中HBβ具有更高的翻译效率,可以更高效地应对多子小瓜虫的感染。
关键词
多子小瓜虫
全雄黄颡鱼
杂交黄颡鱼
血红蛋白
β
链
抗菌肽
体外抗虫实验
Keywords
Ichthyophthirius multifiliis
All-male yellow catfish
Hybrid yellow catfish
hemoglobin
β
chain
Antimicrobial peptide
Anti-parasitic test in vitro
分类号
S943 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
斜带石斑β-珠蛋白cDNA的克隆和序列分析
被引量：
2
2
作者
殷志新
何建国
机构
中山大学生命科学学院
出处
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第1期58-61,共4页
基金
国家高技术研究发展计划 ( 86 3计划 )资助项目 ( 2 0 0 1AA6 2 10 10 )
国家自然科学基金资助项目( 30 2 710 30 )
广东省自然科学基金团队研究资助项目 ( 2 0 0 2 30 0 2 )
文摘
从斜带石斑Epinepheluscoioides白细胞cDNA文库随机挑取噬菌斑 ,做为模板 ,用λTriplEx 5 3 长距离插入子筛选引物 ,进行插入片断的PCR扩增 ,并进行表达序列探针 (ESTs)测定。从中克隆到了血红蛋白 β亚基cDNA。cDNA包含长达 44 4bp的开放阅读框 ,编码 147个氨基酸的多肽。用www expasy ch网站的computepI MW程序计算其可能的相对分子质量为 16 5 44 ,等电点为 6 95。其氨基酸序列与草鱼 β_珠蛋白Ⅲ的同源性最高 ,为73 0 %。在远端和近端的与血红素结合的组氨酸都是保守的。另外 ,与其它鱼类及蛙、鸡和人的 β_珠蛋白比较 ,在血红素结合区及亚基结合区的氨基酸残基均是高度保守的。
关键词
斜带石斑
EpinephelusCoioides
血红蛋白
β
亚基
表达序列探针
ESTS
CDNA文库
Keywords
orange-spotted grouper
hemoglobin
β
-
chain
expression sequence tags (ESTs)
cDNA library
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
人血红蛋白β链氨基酸对的变异模式(英文)
3
作者
严少敏
吴光
机构
广西科学院非粮生物质酶解国家重点实验室
深圳市追梦科技咨询有限公司
出处
《广西科学院学报》
2011年第1期29-33,共5页
基金
supported by Guangxi Science Foundation(10-046-06,2010GXNSFA013046 and 2010GXNSFF013003 and Guangxi Academy of Sciences(08 YJ6SW06)
文摘
根据氨基酸对可预测性分析人血红蛋白β链的244个变异,以确定哪些氨基酸对对变异更敏感。结果发现4种变异模式:(1)85.66%的变异发生在不可预测的氨基酸对,(2)绝大多数被替换掉的氨基酸对中包含一个或两个氨基酸对它们的实际频率大于预测频率,(3)79.51%的变异中被替换出的氨基酸对包含一个或两个在正常人β血红蛋白中不存在的氨基酸对,(4)大多数变异缩小了氨基酸对实际频率与预测频率之差。说明变异通常导致人血红蛋白β链的构成更随机、更稳定。
关键词
氨基酸对可预测性
血红蛋白
β
链
变异
模式
Keywords
amino-acid pair predictability
hemoglobin
β
-
chain
mutation
pattern
分类号
R556.61 [医药卫生—血液循环系统疾病]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
抗菌肽HBβ-C在全雄和杂交黄颡鱼对多子小瓜虫抗性差异中的作用
熊阳
王帅
丹成
张义兵
梅洁
《水生生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
5
下载PDF
职称材料
2
斜带石斑β-珠蛋白cDNA的克隆和序列分析
殷志新
何建国
《中山大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2003
2
下载PDF
职称材料
3
人血红蛋白β链氨基酸对的变异模式(英文)
严少敏
吴光
《广西科学院学报》
2011
0
下载PDF
职称材料
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