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大麦HhH-DGS全基因组鉴定及表达分析
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作者 王容 蔡海亚 +5 位作者 焦春海 安兵壮 王红盼 李博 杨彩仙 徐延浩 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第23期7657-7670,共14页
螺旋-发夹-螺旋DNA糖基化酶超基因家族(helix-hairpin-helix DNA glycosylases superfamily,HhH-DGS)是DNA碱基切除修复(base excision repair, BER)的关键酶之一,在保持基因组的稳定中发挥着重要作用。本研究分析了大麦(Hordeum vulgar... 螺旋-发夹-螺旋DNA糖基化酶超基因家族(helix-hairpin-helix DNA glycosylases superfamily,HhH-DGS)是DNA碱基切除修复(base excision repair, BER)的关键酶之一,在保持基因组的稳定中发挥着重要作用。本研究分析了大麦(Hordeum vulgare L.) HhH-DGS基因家族的分子特征、系统发育、组织表达模式并探究了该基因家族对辐射的响应规律。在大麦基因组的6条染色体上共鉴定到15个HhH-DGS基因,系统发育将其分为9个亚群。不同亚族间HhH-DGS基因外显子数量变异很大,为2~12个。种间与种内共线性分析表明,该基因家族存在于单子叶与双子叶分化前,在大麦基因组内没有发生大规模扩增。HhH-DGS基因启动子含有大量的光调节因子。大麦萌发期的茎基部及花前期的顶端组织中HhH-DGS基因表达量显著高于其他组织器官;HhH-DGS基因HORVU.MOREX.r3.7HG0667530、HORVU.MOREX.r3.3HG0221280、HORVU.MOREX.r3.3HG0223220和HORVU.MOREX.r3.6HG0561680在大麦不同的器官中稳定表达,并在4种辐射处理后表达都上调。HORVU.MOREX.r3.5HG0469860、HORVU.MOREX.r3.7HG0634400和HORVU.MOREX.r3.1HG0074440表现出特异辐射方式响应模式。本研究在解析大麦HhH-DGS基因家族的特征、进化与功能的基础上,为大麦辐射育种提供了参考。 展开更多
关键词 大麦 HhH-DGS家族 碱基切除修复 表达模式 辐射应答
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