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红麻亚硝酸还原酶基因HcNiR的克隆与表达分析 被引量：2
1
作者 张超 邓勇 +4 位作者 黄思齐 伍应保 张高阳 满百膺 李德芳 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期600-608,共9页
【目的】了解红麻亚硝酸还原酶基因HcNiR生物信息学特性及组织表达特异性,为培育红麻氮高效利用品种提供理论依据。【方法】以红麻材料349叶片的cDNA为模板,利用PCR扩增HcNiR基因的CDS序列,采用生物信息学方法分析HcNiR的氨基酸组成、... 【目的】了解红麻亚硝酸还原酶基因HcNiR生物信息学特性及组织表达特异性,为培育红麻氮高效利用品种提供理论依据。【方法】以红麻材料349叶片的cDNA为模板,利用PCR扩增HcNiR基因的CDS序列,采用生物信息学方法分析HcNiR的氨基酸组成、蛋白质跨膜结构、信号肽、高级结构以及蛋白的同源进化树;采用实时荧光定量PCR检测HcNiR基因在红麻不同组织的表达情况。【结果】HcNiR基因cDNA全长1395 bp,编码蛋白含有464个氨基酸,包含2个保守的亚硝酸和亚硫酸还原酶4Fe-4S结构域及铁氧蛋白部分结构域。HcNiR蛋白是一个不含跨膜转运结构与信号肽的亲水稳定性蛋白质,该蛋白质等电点是5.49,分子量51.68 kDa;具有26处潜在磷酸化位点。在其蛋白二级结构中,α-螺旋和无规则卷曲所占比例超过70%。通过氨基酸序列同源性分析发现,红麻HcNiR氨基酸序列与木槿HsNiR氨基酸序列相似性较高,达到97.37%,都含有铁-硫/铁血红素结合位点。进化树分析结果表明,红麻HcNiR基因与木槿HsNiR基因亲缘关系较近。组织特异性表达结果显示,红麻HcNiR基因在叶中的表达量高于根。【结论】HcNiR基因编码蛋白含亚硝酸和亚硫酸还原酶4Fe-4S结构域及铁氧蛋白部分结构域;HcNiR基因具有组织表达特异性,在红麻叶片中表达较高,推测其主要在初级氮的同化过程中发挥重要调控作用。 展开更多
关键词 红麻 亚硝酸还原酶 hcnir基因 基因克隆 表达分析
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