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人Ⅱ型胶原的HLA-A~*0201限制性CTL表位的预测及初步鉴定 被引量:6
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作者 陈晓玲 方勇飞 +4 位作者 尚小云 王书峰 高乐女 王莉 吴玉章 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期755-758,763,共5页
目的预测和初步鉴定类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)主要自身抗原Ⅱ型胶原(CollagenⅡ,CⅡ)的HLA-A*0201限制性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocytes,CTL)表位,为基于CⅡ抗原表位的特异性免疫治疗奠定基础。方法选取BIMAS... 目的预测和初步鉴定类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)主要自身抗原Ⅱ型胶原(CollagenⅡ,CⅡ)的HLA-A*0201限制性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocytes,CTL)表位,为基于CⅡ抗原表位的特异性免疫治疗奠定基础。方法选取BIMAS、SYFTEPITHI、IEDB、SVMHC、AntiJen预测工具预测该抗原HLA-A*0201限制性结合肽;人工合成待测表位肽,利用T2细胞株通过直接免疫荧光法测定各肽与HLA-A*0201分子的结合力。利用酶联免疫斑点检测(enzyme-linked immunospotassay,ELISPOT)方法检测候选肽刺激关节滑液单个核细胞(synovial fluid mononuclear cell,SFMC)分泌IFN-γ的能力。结果综合BIMAS、SYFTEPITHI、IEDB、SVMHC、AntiJen预测结果筛选出来可能与HLA-A*0201结合的5条肽。MHC亲和力实验表明,在候选的5条肽中,P1261、P1365及P1399具有与HLA-A*0201分子结合的能力,平均荧光强度分别为:1.35、2.53、1.78。ELISPOT试验结果表明,P1365具有刺激SFMC分泌IFN-γ的能力。结论表位预测结果与初步鉴定结果具有一致性,两者联合应用初步认为P1365是HLA-A*0201限制性CTL表位的可能性最大,为下一步表位鉴定及基于人CⅡ抗原表位的特异性免疫治疗奠定理论基础。 展开更多
关键词 HLA-A*0201 CTL 结合肽 表位 限制性
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HLA-A*0201-BSP融合基因的构建与原核表达 被引量:1
2
作者 孙万军 杜建芳 +6 位作者 徐东刚 邹民吉 王金凤 蔡欣 王颖 王嘉玺 艾辉胜 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2006年第5期976-980,共5页
克隆表达可生物素化的HLA-A*0201的重链胞外区是制备HLA-A*0201-肽四聚体的先决条件。本研究构建重组HLA-A*0201-BSP融合基因的表达载体,以制备HLA-A2四聚体。根据已报道的序列设计特异引物,利用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法从已鉴定... 克隆表达可生物素化的HLA-A*0201的重链胞外区是制备HLA-A*0201-肽四聚体的先决条件。本研究构建重组HLA-A*0201-BSP融合基因的表达载体,以制备HLA-A2四聚体。根据已报道的序列设计特异引物,利用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法从已鉴定为HLA-A*0201基因型的健康人白细胞中克隆HLA-A*0201重链胞外区的基因,拼接上依赖生物素-蛋白连接酶(biotin-proteinligase,BirA)的可生物素化序列(BirAsubstratepep-tide,BSP),构建HLA-A*0201-BSP的原核表达载体,在大肠杆菌DH5α中进行表达。结果表明:成功扩增出HLA-A*0201-BSP融合基因并测序证实,构建的pBV220-HLA-A*0201-BSP可在大肠杆菌DH5α中高效表达HLA-A*0201-BSP融合蛋白,表达量占菌体总蛋白的28%,以包涵体的形式表达,经洗涤、变性后,以SepharcylS-300HR(S-300)柱层析纯化,纯度可达90%以上。结论:获得了高效表达HLA-A*0201-BSP的大肠杆菌工程菌株,建立了简便有效的包涵体纯化方法,为制备HLA-A*0201-肽四聚体奠定了基础。 展开更多
关键词 HLA—A*0201 HLA—A*0201-BSP融合基因 HLA—A2四聚体 可生物素化序列
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鼠胰岛素B链HLA-A*0201限制性CTL表位拮抗型改造肽的设计与鉴定 被引量:3
3
作者 舒驰 王书峰 +4 位作者 陈晓玲 傅晓岚 姜曼 王莉 吴玉章 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1017-1021,共5页
目的设计并鉴定具有负调致病细胞毒性T细胞(cytotoxic Tlymphocyte,CTL)免疫应答功能的改造肽配体(al-tered peptide ligand,APL),为基于胰岛素自身抗原的I型糖尿病特异性免疫治疗奠定基础。方法利用InSilico技术模拟构建TCR-pMHC(TCR-H... 目的设计并鉴定具有负调致病细胞毒性T细胞(cytotoxic Tlymphocyte,CTL)免疫应答功能的改造肽配体(al-tered peptide ligand,APL),为基于胰岛素自身抗原的I型糖尿病特异性免疫治疗奠定基础。方法利用InSilico技术模拟构建TCR-pMHC(TCR-HLA-A*0201-mInsB5-14)复合物三维结构,根据结构选择改造位点P6;通过保守/不保守单个氨基酸虚拟替换得到若干候选APL;通过自由能变化计算、相对亲和力检测、细胞因子分泌水平检测等体外功能实验,初步鉴定具有拮抗效应的APL。结果筛选得到的APL mInsB5-14H6F(H→F)与天然肽mInsB5-14空间结构相似,能与HLA-A*0201分子结合,其HLA-A*0201分子的相对亲和力与mInsB5-14相近。该APL作用下mInsB5-14刺激CD8+T细胞分泌IFN-γ的水平明显低于天然肽单独刺激下特异性CTL分泌IFN-γ的水平(P<0.05)。结论基于天然自身抗原表位mInsB5-14改造得到的mInsB5-14H6F是HLA-A*0201限制性的APL,该APL通过降低致病CTL特异性分泌IFN-γ的水平,可能诱导HLA-A*0201转基因NOD小鼠的自身耐受,从而为I型糖尿病治疗性疫苗的研发奠定了基础。 展开更多
关键词 I型糖尿病 改造肽配体 mInsB5-14 HLA-A*0201
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氨基酸非键作用指数用于HLA-A*0201限制性CTL表位定量预测研究 被引量:2
4
作者 张梦军 周鹏 +2 位作者 李声时 肖正华 邓金 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期440-444,448,共6页
目的预测SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位。方法从分子的三维空间结构出发,基于静电、立体、疏水这三类与生物活性直接相关的非键作用方式,经主成分分析技术(PCA)得到了一种新的分子结构表达方法——氨基酸非键作用指数。利用该... 目的预测SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位。方法从分子的三维空间结构出发,基于静电、立体、疏水这三类与生物活性直接相关的非键作用方式,经主成分分析技术(PCA)得到了一种新的分子结构表达方法——氨基酸非键作用指数。利用该指数结合偏最小二乘(PLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行了定量构效关系(QSAR)建模,再使用该模型对SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位进行预测。结果预测出8个活性值大于7的九肽表位。结论通过对SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位的预测,从而为SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位的实验探测和鉴定打下了基础。 展开更多
关键词 SSX-1 SSX-4 氨基酸非键作用指数 HLA-A*0201 CTL表位 定量构效关系
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Frequencies and Characterization of HBV-specific Cytotoxic T Lymphocytes in Self-limited and Chronic Hepatitis B Viral Infection in China 被引量:2
5
作者 杨新星 郝友华 +5 位作者 刘贽 陈玲 丁红晖 赵西平 陆蒙吉 杨东亮 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2009年第5期567-574,共8页
Hepatitis B virus (HBV)-specific cytotoxic T lymphocytes (CTLs) are believed to play a major role in viral clearance and disease pathogenesis during HBV infection. To clarify the differences in host immune respons... Hepatitis B virus (HBV)-specific cytotoxic T lymphocytes (CTLs) are believed to play a major role in viral clearance and disease pathogenesis during HBV infection. To clarify the differences in host immune responses between self-limited and chronic HBV infections, we constructed three HLA-A*0201/HBV tetramers with immunodominant epitopes of core18-27, polymerase 575-583 and envelope 335-343, and analyzed the HBV-specific CTLs in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from patients infected with HBV. The frequencies and expansion ability of HBV-specific CD8+T cells in most self-limited HBV infected individuals were higher than those in chronic HBV-infected patients. HBV-specific CD8+T cells could be induced by in vitro peptide stimulation from chronic patients with a low level of serum HBV-DNA but not from those with a high level of serum HBV-DNA. In chronic infection, no significant correlation was found either between the frequencies of HBV-specific CD8^+ T cells and the viral load, or between the frequencies and the levels of alanine transaminase. Our results suggested that the frequencies of HBV-specific CTLs are not the main determinant of immune-mediated protection in chronic HBV infection and immunotherapeutic approaches should be aimed at not only boosting a HBV-specific CD8^+T response but also improving its function. 展开更多
关键词 hepatitis B virus cytotoxic T lymphocyte HLA-A*0201
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整合法预测HBV相关抗原的HLA-A* 0201限制性结合肽 被引量:2
6
作者 王书峰 尚小云 +1 位作者 巩沅鑫 吴玉章 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期465-468,共4页
目的预测HBV的相关抗原HBsAg、HBcAg、DNA polymerase新的HLA-A*0201限制性结合肽。方法选取SYFPEITHI、BIMAS、SVMHC、IEDB、EpiJen预测工具以及整合法预测抗原对应蛋白序列P03146,P03138,P03156的HLA-A*0201限制性结合肽,并与现有表... 目的预测HBV的相关抗原HBsAg、HBcAg、DNA polymerase新的HLA-A*0201限制性结合肽。方法选取SYFPEITHI、BIMAS、SVMHC、IEDB、EpiJen预测工具以及整合法预测抗原对应蛋白序列P03146,P03138,P03156的HLA-A*0201限制性结合肽,并与现有表位数据库中的结合肽比较。结果整合法与单个预测算法相比提高了预测的灵敏度和特异性,对3种抗原的预测准确性均有提高,MR(misclassification rate)值分别降为1.14%、3.41%、1.46%;利用此方法发现3种抗原尚未得到实验验证的HLA-A*0201结合肽,分别为,HBcAg:ELMTLATWV(64-72)、LMTLATWVGV(65-74);HBsAg:LMT-LATWVGV(246-254)、IIFLFILLL(244-252)、FLFILLLCLI(246-255)、SLYSILSPFL(367-375)以及LLCLIFLLVL(251-260);DNA polymerase:SLFTAVTNFL(513-522)、GLLGFAAPFT(554-563);在HBsAg蛋白序列中发现了31个氨基酸的免疫热点区域FIIFLFILLLCLIFLLVLLDYQGMLPVCPLI(243-273)。结论整合法比单个预测算法性能更好,能够更准确地预测抗原的HLA限制性结合肽,采用该方法所发现的9条可能表位和1个免疫热点区域为后续HBV新表位的鉴定及其功能研究提供了有价值的线索。 展开更多
关键词 MHC HLA-A* 0201 预测算法 整合法 结合肽
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人锌转运蛋白8的HLA-A~*0201限制性CTL表位的预测及初步验证 被引量:2
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作者 李树法 张敏 陈兵 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期880-883,共4页
目的预测和初步鉴定1型糖尿病(T1DM)主要自身抗原锌转运蛋白8(ZnT8)的HLA-A*0201限制性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocytes,CTL)表位,为基于ZnT8抗原表位的特异性免疫治疗奠定基础。方法选取BIMAS预测工具预测该抗原HLA-A*0201... 目的预测和初步鉴定1型糖尿病(T1DM)主要自身抗原锌转运蛋白8(ZnT8)的HLA-A*0201限制性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocytes,CTL)表位,为基于ZnT8抗原表位的特异性免疫治疗奠定基础。方法选取BIMAS预测工具预测该抗原HLA-A*0201限制性结合肽,人工合成待测表位肽,利用T2细胞株测定各肽与HLA-A*0201分子的结合力。利用酶联免疫斑点检测(enzyme-linked immunospotassay,ELISPOT)方法检测候选肽刺激T1DM患者外周血单个核细胞分泌IFN-γ和IL-2的能力,利用标准51Cr释放试验检测特异性CTL诱导活性。结果在所筛选的5个候选CTL表位中,ZnT8(107-115)、ZnT8(115-123)及ZnT8(145-153)与HLA-A*0201分子具有较高的结合荧光强度,可在体外有效诱导抗原特异性CTL的产生,刺激T1DM患者PBMC分泌IFN-γ和IL-2,并对抗原肽负载的T2细胞具有明显的杀伤效应。结论 ZnT8(107-115)、ZnT8(115-123)及ZnT8(145-153)可能是HLA-A*0201限制性CTL表位,为基于人ZnT8抗原表位的特异性免疫治疗奠定理论基础。 展开更多
关键词 HLA-A*0201 CTL 结合肽 表位 限制性
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Prediction of HLA-A2-restricted CTL epitope specific to HCC by SYFPEITHI combined with polynomial method 被引量:2
8
作者 Hal-LongDong Yan-FangSui 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第2期208-211,共4页
AIM: To predict the HLA-A2-restricted CTL epitopes of tumor antigens associated with hepatocellular carcinoma (HCC).METHODS: MAGE-1, MAGE-3, MAGE-8, P53 and AFP were selected as objective antigens in this study for th... AIM: To predict the HLA-A2-restricted CTL epitopes of tumor antigens associated with hepatocellular carcinoma (HCC).METHODS: MAGE-1, MAGE-3, MAGE-8, P53 and AFP were selected as objective antigens in this study for the close association with HCC. The HLA-A*0201 restricted CTL epitopes of objective tumor antigens were predicted by SYFPEITHI prediction method combined with the polynomial quantitative motifs method. The threshold of polynomial scores was set to -24.RESULTS: The SYFPEITHI prediction values of all possible nonamers of a given protein sequence were added together and the ten high-scoring peptides of each protein were chosen for further analysis in primary prediction. Thirtyfive candidates of CTL epitopes (nonamers) derived from the primary prediction results were selected by analyzing with the polynomial method and compared with reported CTL epitopes.CONCLUSION: The combination of SYFPEITHI prediction method and polynomial method can improve the prediction efficiency and accuracy. These nonamers may be useful in the design of therapeutic peptide vaccine for HCC and as immunotherapeutic strategies against HCC after identified by immunology experiment. 展开更多
关键词 Hepatocellular carcinoma HLA-A*0201 Cytotoxic T Lymphocyte EPITOPE
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淋巴瘤相关抗原肽刺激所获细胞毒性T细胞克隆的特征 被引量:3
9
作者 郭晓玲 朱平 +3 位作者 朱霞 刘静 欧媛 杜金伟 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第21期1476-1480,共5页
目的研究抗肿瘤细胞毒性T淋巴细胞(CTL)克隆识别靶细胞的肽特异性和人类白细胞抗原(HLA)限制性,以及其赖以识别抗原肽的T细胞受体(TCR)基因表达序列的分子特征。方法利用体外CTL刺激扩增体系,应用免疫球蛋白重链可变区(IgHV)框架区上的... 目的研究抗肿瘤细胞毒性T淋巴细胞(CTL)克隆识别靶细胞的肽特异性和人类白细胞抗原(HLA)限制性,以及其赖以识别抗原肽的T细胞受体(TCR)基因表达序列的分子特征。方法利用体外CTL刺激扩增体系,应用免疫球蛋白重链可变区(IgHV)框架区上的B淋巴瘤相关抗原九肽(IgHV1QLVQSGAEV和IgHV3SLYLQMNSL)负荷的抗原递呈细胞(APC),刺激正常HLAA0201供者的外周血单个核细胞(PBMC),每周1次共4次,用流式细胞仪检测体外培养细胞的免疫表型的变化,并用肽/主要组织相容性基因复合体(MHC)四聚体方法检测肽特异性的CTL增殖情况。应用酶联免疫吸附实验(ELISA)检测CTL与不同的靶细胞共同孵育时释放干扰素γ(IFNγ)的能力。应用逆转录多聚酶链反应(RTPCR)和T细胞受体(TCR)基因指纹谱型图方法检测培养前后的淋巴细胞的克隆变化,并用直接测序的方法得到CTL克隆的TCR基因序列。结果B淋巴瘤相关抗原肽4次刺激体外培养的PBMC后CD8+CTL大量增殖,CD4/CD8明显下降(0.10vs1.43,P<0.05)。IgHV1QLVQSGAEV/HLAA0201四聚体和CD8双阳性的肽特异性CTL数量(49.38%)比刺激前(0.04%)明显上升。ELISA检测IFNγ的分泌表明其识别靶细胞是肽特异性和HLA限制性的。TCR基因指纹谱型图显示抗原肽反复刺激获得的CTL的TCR表达集中于个别基因家族,呈克隆性增殖。结论应用IgHV基因框架区来源的B淋巴瘤相关抗原九肽可以使特异性CTL克隆增殖,这些克隆以肽特异性和HLA限制性的方式识别靶细胞。了解这些CTL的作用和TCR识别相关抗原肽的分子结构,将有助于确定体内T细胞和B细胞相互调节的机制。 展开更多
关键词 抗原肽 T细胞克隆 HLA-A*0201 人类白细胞抗原(HLA) 免疫球蛋白重链可变区 逆转录-多聚酶链反应 细胞毒性T淋巴细胞 外周血单个核细胞 酶联免疫吸附实验 CD8^+CTL 流式细胞仪检测 主要组织相容性 CD4/CD8 ELISA检测 T细胞受体
原文传递
氨基酸广义疏水标度(GH-scale)用于HLA-A*0201限制性CTL表位定量预测 被引量:3
10
作者 周鹏 李志良 +1 位作者 田菲菲 张梦军 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第11期1259-1263,共5页
将天然氨基酸149个疏水性质经主成分分析得到了一种新氨基酸描述子——氨基酸广义疏水标度(GH-scale).用GH—scale结合遗传偏最小二乘(GPLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行定量构效关(QSAR)研究.所建模型拟合及交叉检验复相... 将天然氨基酸149个疏水性质经主成分分析得到了一种新氨基酸描述子——氨基酸广义疏水标度(GH-scale).用GH—scale结合遗传偏最小二乘(GPLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行定量构效关(QSAR)研究.所建模型拟合及交叉检验复相关系数分别为Rcum2=0.813和Q2=0.725.研究表明,疏水作用在CTL表位与HLA-A*0201结合过程中扮演极其重要角色,而锚定残基是该类作用发生最显著的部位. 展开更多
关键词 广义疏水标度 HLA-A*0201 CTL表位 定量构效关系 遗传偏最小二乘
原文传递
基于SCORE函数估算HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性 被引量:1
11
作者 朱波 林治华 +1 位作者 陈正堂 吴玉章 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期177-181,共5页
目的建立HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性的定量预测方法。方法基于SCORE打分函数,运用定量构效关系的理论和方法研究了HLA-A*0201限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的定量关系,并建立了SCORE得分与亲和性的定量关系模型,并用外部样本(5个... 目的建立HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性的定量预测方法。方法基于SCORE打分函数,运用定量构效关系的理论和方法研究了HLA-A*0201限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的定量关系,并建立了SCORE得分与亲和性的定量关系模型,并用外部样本(5个HLA-A*0201限制性CTL表位九肽)作为预测集用于检验模型的预测能力。结果基于SCORE打分函数建立的定量模型具有较好的相关性(r=0.9165,RMS=0.38)和对外部样本的预测能力(rpred=0.9847,RMS=0.135)。结论基于SCORE打分函数,运用定量构效关系研究的理论和方法建立了HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性的定量预测方法,为实验鉴定高亲和性HLA-A*0201限制性CTL表位提供了理论依据。 展开更多
关键词 SCORE函数 HLA-A*0201 CTL表位 亲和性
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轮状病毒结构蛋白VP6 HLA-A*0201限制性CTL表位的初步鉴定
12
作者 魏静 李晋涛 +4 位作者 支轶 唐艳 张小萍 王靖雪 吴玉章 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期499-502,共4页
目的预测并初步鉴定轮状病毒W a株结构蛋白VP6 HLA-A*0201限制性CTL表位,为轮状病毒免疫保护机制研究及疫苗的研制奠定基础。方法应用表位亲和力预测软件SYFPEITH I及蛋白酶切位点预测软件PAProc和Fragpred ict相结合预测VP6 HLA-A*020... 目的预测并初步鉴定轮状病毒W a株结构蛋白VP6 HLA-A*0201限制性CTL表位,为轮状病毒免疫保护机制研究及疫苗的研制奠定基础。方法应用表位亲和力预测软件SYFPEITH I及蛋白酶切位点预测软件PAProc和Fragpred ict相结合预测VP6 HLA-A*0201限制性CTL表位;用分子模拟对候选肽作进一步筛选;标准Fmoc方案合成候选肽,RP-HPLC纯化、分析,质谱进行鉴定;最后用T2细胞株测定候选肽与HLA-A*0201分子的亲和力及稳定性。结果结合SYFPEITH I、蛋白酶切位点预测结果及分子模建结果,选择分值最高同时在C末-端含有蛋白酶切位点的4条肽作为候选表位肽;标准Fmoc方案合成的各肽纯度均大于95%,质谱检测结果表明,各肽的相对分子质量与理论值基本一致;在候选的4条表位肽中,TLLANVTAV(340-348)和VLADANETL(333-341)与HLA-A*0201呈高亲和力结合,荧光系数(flu-rorescene index,FI)分别为2.66和2.64,同时肽-HLA-A*0201复合物半数解离时间(d issoc iation comp lex50,DC50)均大于8 h。结论TLLANVTAV(340-348)和VLADANETL(333-341)为潜在的HLA-A*0201限制性CTL表位。 展开更多
关键词 轮状病毒 VP6 HLA-A*0201 CTL 表位 结构蛋白 分子质量
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登革病毒HLA-A*0201限制性T细胞表位诱导免疫反应的研究
13
作者 段志良 李德周 +4 位作者 徐娟娟 贾庆军 刘慧芳 陈柏坤 文金生 《温州医科大学学报》 CAS 2016年第6期397-403,共7页
目的:探讨登革病毒(DENV)HLA-A*0201限制性T细胞表位诱导DENV血清型间交叉反应性T细胞的效应。方法:基于已鉴定DENV-1中HLA-A*0201限制性CD8+T细胞表位(NS4b40-48TLYAVATTI)序列,合成在其他血清型中相似的候选表位,采用MHC-肽复合物稳... 目的:探讨登革病毒(DENV)HLA-A*0201限制性T细胞表位诱导DENV血清型间交叉反应性T细胞的效应。方法:基于已鉴定DENV-1中HLA-A*0201限制性CD8+T细胞表位(NS4b40-48TLYAVATTI)序列,合成在其他血清型中相似的候选表位,采用MHC-肽复合物稳定性实验检测候选表位与HLA-A*0201结合力。采用酶联免疫斑点(ELISPOT)实验研究已鉴定表位及候选表位免疫HLA-A*0201转基因小鼠产生的CD8+T细胞识别相同及相似表位能力;采用ELISPOT实验研究不同DENV血清型感染HLA-A*0201转基因小鼠是否产生能识别已鉴定表位及候选表位的T细胞反应。结果:DENV-3中NS4b39-47TLYAVATTV与HLA-A*0201具高结合力,但DENV-2中NS4b39-47TLYAVATTF与HLA-A*0201结合力弱。DENV-1-NS4b40-48和DENV-3-NS4b39-47免疫的转基因小鼠脾、淋巴结和外周血中存在可识别DENV-1-NS4b40-48、DENV-2-NS4b39-47和DENV-3-NS4b39-47的交叉反应性CD8+T细胞。在DENV-1,-2,-3感染的转基因小鼠体内也存在类似的T细胞反应。结论:DENV-3中NS4b39-47TLYAVATTV为新的CD8+T细胞表位,该表位及已报道表位NS4b40-48TLYAVATTI均可诱导DENV血清型间交叉反应性CD8+T细胞反应,二者有助于我们研究DENV血清型间交叉反应性CD8+T细胞的功能以及用于评估DENV候选疫苗的T细胞免疫效应。 展开更多
关键词 登革病毒 HLA-A*0201 交叉反应性 CD8+T细胞
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基于环境的编码方法在预测HLA-A*0201结合多肽中的应用
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作者 赵璞 李通化 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第7期1309-1313,共5页
T淋巴细胞对抗原的识别是产生与调节有效免疫应答的关键,T细胞只识别主要组织相容性复合物(MHC)呈递上来的抗原,因此MHC与抗原多肽的结合就成为一系列免疫应答过程中基础的一环.为了辅助疫苗设计,多种机器学习技术已被普遍应用于MHC结... T淋巴细胞对抗原的识别是产生与调节有效免疫应答的关键,T细胞只识别主要组织相容性复合物(MHC)呈递上来的抗原,因此MHC与抗原多肽的结合就成为一系列免疫应答过程中基础的一环.为了辅助疫苗设计,多种机器学习技术已被普遍应用于MHC结合多肽的预报领域中.本文以支持向量机(SVM)为手段,以HLA-A*0201的实验数据集为对象,对多种肽段编码方法形成的模型进行评价,得到的AUC值的范围在0.932~0.936之间.提出一种新的利用抗原多肽结合环境的编码方法,使预报的AUC值提高到0.953.对独立数据集进行建模预报,同样证明环境编码模型的预报准确率高于传统编码方法的准确率. 展开更多
关键词 HLA—A*0201 结合多肽预测 支持向量机(SVM) 编码 受试者工作曲线(ROC)
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云南宣威肺腺癌细胞XWLC-05转染HLA-A0201的抗肿瘤研究
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作者 邵文萍 罗劭蕾 +3 位作者 郝萍 马丽菊 唐睿株 闫凤彩 《昆明医科大学学报》 CAS 2015年第4期10-14,共5页
目的在云南宣威肺腺癌细胞XWLC-05中转染并表达外源性云南肺癌患者白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)等位基因高频位点HLA-A*0201基因,以诱导肿瘤抗原特异性的细胞毒作用.方法采用序列特异性引物扩增(PCR-SSP)法对XWLC-05细胞行H... 目的在云南宣威肺腺癌细胞XWLC-05中转染并表达外源性云南肺癌患者白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)等位基因高频位点HLA-A*0201基因,以诱导肿瘤抗原特异性的细胞毒作用.方法采用序列特异性引物扩增(PCR-SSP)法对XWLC-05细胞行HLA-DNA分型,脂质体转染法将真核质粒pcDNA3.1-HLA-A*0201导入XWLC-05细胞并用G418筛选阳性克隆,淋巴细胞分离液提取健康人外周血单个核细胞(PBMNCs)诱导培养为LAK细胞,免疫磁珠分选法提取出CD8+T淋巴细胞(CTLs),MTT法测试肿瘤特异性的细胞毒效应.结果筛选出稳定表达HLA-A*0201基因的阳性克隆,免疫激活并分选出HLA-A*0201阳性的CTLs,该细胞对转染了HLA-A*0201基因的肿瘤细胞有更强的杀伤活性.结论 HLA-A*0201基因低表达或缺失,在导致肿瘤细胞免疫逃逸方面起重要作用,HLA-A*0201基因可诱导出HLA-A*0201限制的肿瘤特异性T淋巴细胞杀伤效应. 展开更多
关键词 HLA-A*0201 基因转染 肿瘤细胞 LAK细胞
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可溶性HLA-A*0201-PR1复合物的构建与鉴定 被引量:1
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作者 孙万军 徐东刚 +6 位作者 胡海兰 邹民吉 杜建芳 王金凤 蔡欣 王嘉玺 艾辉胜 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2007年第2期352-356,共5页
为制备HLA-A*0201-PR1四聚体,本课题构建了可溶性的HLA-A*0201-PR1复合物。以原核表达的HLA-A*0201-BSP融合蛋白为重链,β2-微球蛋白(β2m)为轻链,与人工合成的HLA-A2限制性抗原肽PR1(蛋白酶3的第169-177氨基酸,VLQELNVTV)进行共折叠复... 为制备HLA-A*0201-PR1四聚体,本课题构建了可溶性的HLA-A*0201-PR1复合物。以原核表达的HLA-A*0201-BSP融合蛋白为重链,β2-微球蛋白(β2m)为轻链,与人工合成的HLA-A2限制性抗原肽PR1(蛋白酶3的第169-177氨基酸,VLQELNVTV)进行共折叠复性,以生成可溶性HLA-A*0201-PR1复合物。应用BirA酶对复性混和物进行生物素化,再经阴离子交换柱纯化,得到生物素化的可溶性HLA-A*0201-PR1复合物。应用凝胶过滤高效液相色谱分析可溶性HLA-A*0201-PR1复合物的生成率。利用HLA-A2构象特异性抗体(BB7.2)及链霉亲和素进行Western blot和ELISA分析,对生物素化的可溶性HLA-A*0201-PR1复合物进行鉴定。结果表明:在折叠体系中,主要含有HLA-A*0201-BSP聚合体、HLA-A*0201-PR1复合物及β2m,其中可溶性复合物生成率约18%。获得的HLA-A*0201-PR1复合物可在BirA酶作用下被有效生物素化。结论:成功地获得了生物素化的可溶性HLA-A*0201-PR1复合物,为进一步制备HLA-A*0201-PR1四聚体创立了基础。 展开更多
关键词 HLA.抗原肽复合物 HLA-A*0201-PRl复合物 HLA-A*0201-PRl四聚体
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sHLA-A*0201-抗原肽四聚体的构建与功能检测 被引量:1
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作者 翁秀芳 吴雄文 +4 位作者 梁智辉 蔡蕾 费世江 陈国安 龚非力 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期244-247,251,共5页
目的:构建有功能的sHLA-A*0201-抗原肽四聚体,建立一套HLAⅠ类分子/抗原肽的四聚体制备技术。方法:利用基因工程及体外折叠技术构建sHLA-A*0201-LMP2A426-434复合物分子,并在BirA酶的作用下生物素化,与荧光标记的亲和素衍生物以分子数4... 目的:构建有功能的sHLA-A*0201-抗原肽四聚体,建立一套HLAⅠ类分子/抗原肽的四聚体制备技术。方法:利用基因工程及体外折叠技术构建sHLA-A*0201-LMP2A426-434复合物分子,并在BirA酶的作用下生物素化,与荧光标记的亲和素衍生物以分子数4∶1结合而形成HLA-A*0201-LMP2A426-434四聚体。获得的四聚体对长期混合淋巴细胞培养中增殖的抗原特异性CTL进行检测,同时用细胞毒实验验证。结果:荧光标记的亲和素与生物素化的HLA-A*0201-抗原肽复合物分子正确结合,制备的四聚体能够与长期混合淋巴细胞培养出的特异性T细胞结合。结论:从结构与功能上证实成功地获得有功能的HLA-A*0201-抗原肽复合物四聚体。为进一步研究T细胞识别机制与功能奠定了基础,也为过程复杂的HLA-抗原肽四聚体制备提供了可行的免疫学监控方法。 展开更多
关键词 HLA-A*0201-抗原肽复合物 生物素化 BirA HLA-A*0201-抗原肽四聚体 抗原特异性CTL
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包头汉族人HLA-DQA1基因型与寻常型银屑病的相关性研究 被引量:2
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作者 王步云 闫秀兰 +1 位作者 秦文斌 雎天林 《包头医学院学报》 CAS 2005年第3期212-214,共3页
目的:探讨HLA-DQA1*0201等位基因与包头市汉族寻常型银屑病患者的相关性。方法:采用聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)检测64例寻常型银屑病患者及63名健康对照的HLA-DQA1*0201基因型,记录此等位基因的分布情况。结果:HLA-DQA1... 目的:探讨HLA-DQA1*0201等位基因与包头市汉族寻常型银屑病患者的相关性。方法:采用聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)检测64例寻常型银屑病患者及63名健康对照的HLA-DQA1*0201基因型,记录此等位基因的分布情况。结果:HLA-DQA1*0201与包头市汉族寻常型银屑病患者具有明显的相关性。HLA-DQA1*0201在有家族史及无家族史患者中分布差异无显著性。结论:HLA-DQA1*0201等位基因与包头市汉族寻常型银屑病相关。 展开更多
关键词 银屑病 HLA-DQAl*0201 聚合酶链反应
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CT抗原KM-HN-1 HLA-A*0201限制性表位预测及其与HLA-A*0201结合强度分析 被引量:2
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作者 王昊亮 付晓岚 +3 位作者 姜曼 黎万玲 唐艳 吴玉章 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期593-596,共4页
目的通过对CT抗原(cancer-testis antigen)KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测,并对候选表位肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及复合物稳定性进行分析,为探索基于KM-HN-1的免疫治疗奠定基础。方法利用基于蛋白酶体剪切位点特异性... 目的通过对CT抗原(cancer-testis antigen)KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测,并对候选表位肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及复合物稳定性进行分析,为探索基于KM-HN-1的免疫治疗奠定基础。方法利用基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法PAProc及基于肽MHC-I结合的算法BIMAS和SYFPEITHI对KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测.合成KM-HN-1相关候选表位肽KM-HN-I321-329(KLLPFRETV),KM-HN-I303-211,(FLPTAPPNV),KM-HN-I629-637。(TLLQIIETV),KM-HN-I87-95(ILNKSIIEV),KM-HN-I538-596。(QMMEALDQL)及阳性对照肽HBVcAg18-27(FLPSDFFPSV);对这些合成肽与HIA-A*0201分子结合亲和力及其复合物稳定性根据文献报道的方法进行分析。结果KM-HN-I321-329(KLLPERETV)结合亲和力最低,KM-HN—I203-211(FLPTAPPNV)结合亲和力最高,其余3条肽结合亲和力介于2者之间;稳定性实验(DC50)结果显示:KM-HN-I538—546(QMMEALDQL)DC50小于2h,KM—HN-I321-329(KLLPERETV)的DC50介于2~4h之间,KM-HN-I87-95。(ILNKSIIEV)的DC50介于6~8h之间,KM-HN-I233-211(HLPTAPPNV)及KM-HN-I629—633(TLLQIIETV)的DC50均大于8h。结论基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法及基于肽MHC-I结合的算法对KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测,结合候选表位肽与HLA-A*0201分子结合的亲和力与复合物稳定性实验分析,为该抗原HLA-A*0201限制性表位的鉴定奠定了基础。 展开更多
关键词 CT抗原 KM-HN-1 表位预测 HLA-A*0201限制性 结合亲和力及稳定性
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三种常见HBV抗原肽-HLA-A*0201复合物四聚体的构建及初步检测应用 被引量:2
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作者 杨新星 郝友华 +4 位作者 丁红晖 宋娜 刘贽 陈玲 杨东亮 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期146-149,共4页
目的体外构建三种常见HBV抗原肽-HLA-A*0201复合物四聚体,并初步用该三种四聚体对抗原肽特异性的细胞毒性T细胞(CTL)进行了初步检测。方法原核高效表达的HLA-A*0201-BSP和β2m蛋白,分别和三种HBV抗原肽(HBVCore18-27,Env335-343,Pol575-... 目的体外构建三种常见HBV抗原肽-HLA-A*0201复合物四聚体,并初步用该三种四聚体对抗原肽特异性的细胞毒性T细胞(CTL)进行了初步检测。方法原核高效表达的HLA-A*0201-BSP和β2m蛋白,分别和三种HBV抗原肽(HBVCore18-27,Env335-343,Pol575-583)体外复性折叠成可溶性的HLA-A*0201抗原肽复合物单体,经BirA酶作用并通过凝胶过滤层析法纯化复合物单体,分别将复合物单体与藻红蛋白标记的链霉亲和素按一定比例耦合构建成相应的三种抗原肽四聚体。最后进行流式细胞仪检测。结果Dot-ELISA和ELISA检测显示获得了三种具有天然构象的生物素化的HBV抗原肽-HLA-A*0201复合物单体。构建的三种四聚体均可以检测到相应特异性的CTL,在自限性感染患者体内针对乙肝核心抗原(core18-27)的CTL细胞频数(0.18%)高于针对聚合酶抗原(pol575-583)(0.08%)和包膜抗原(env335-343)(0.06%)。结论成功构建了三种具有完整构象的生物素化HBV抗原肽-HLA-A*0201复合物单体,所构建的三种四聚体都可以检测到抗原特异性的CTL。 展开更多
关键词 HBV抗原肽-HLA-A*0201单体 T淋巴细胞 四聚体
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