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乳腺浸润性导管癌17号染色体拷贝数变异与临床病理特征相关性分析 被引量:4
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作者 杨亮 赵倩 +7 位作者 王斌 吴涛 迪力夏提.金斯汗 许文婷 李双健 杜露 王波 朱丽萍 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2017年第12期823-828,共6页
目的乳腺癌是影响妇女健康的主要癌症之一,且发病率呈现明显上升趋势。DNA拷贝数变化(copy number variation,CNV)能够影响基因表达,从而引起肿瘤发生,研究CNV对探索肿瘤的发病机制有很大帮助。本研究探讨乳腺癌17号染色体拷贝数变异和... 目的乳腺癌是影响妇女健康的主要癌症之一,且发病率呈现明显上升趋势。DNA拷贝数变化(copy number variation,CNV)能够影响基因表达,从而引起肿瘤发生,研究CNV对探索肿瘤的发病机制有很大帮助。本研究探讨乳腺癌17号染色体拷贝数变异和临床病理特征关系。方法应用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)法检测2010-01-01-2011-01-01新疆医科大学附属肿瘤医院乳腺润性导管癌标本283例,观察17号染色体拷贝数情况及人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)基因扩增情况,并用免疫组织化学法检测HER2受体蛋白的表达水平。结果 283例乳腺癌中17号染色体拷贝数多倍体为43例(15.19%),双倍体为226例(79.86%),单倍体为14例(4.95%),乳腺癌17号染色体多倍体HER2基因阳性率为53.49%(23/43)。283例乳腺癌中HER2基因表达阳性为84例,阳性率为29.68%(84/283);17号染色体拷贝数不同在HER2基因是否扩增方面差异有统计学意义,χ~2=9.564,P=0.007;乳腺癌17号染色体拷贝数变异在p53基因表达(χ~2=8.181,P=0.017)、病理组织学分级(χ~2=11.203,P=0.019)方面差异有统计学意义,与年龄、肿瘤大小和淋巴结转移等指标差异无统计学意义。17号染色体拷贝数不同组中预后存在差异,差异有统计学意义,χ~2=241.363,P=0.001。结论 17号染色体拷贝数变异和乳腺癌病理特征及预后相关,检测乳腺癌中17号染色体拷贝数变异可作为指导临床治疗和判断预后的参考指标。 展开更多
关键词 乳腺癌 17号染色体 her2基因 拷贝数变异
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乳腺癌组织样本中HER2基因拷贝数的检测分析
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作者 孙亚蒙 马晔 郭润生 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1589-1597,共9页
目的·利用微滴式数字PCR系统(droplet digital PCR system,ddPCR)建立乳腺癌组织福尔马林固定石蜡包埋(formalin-fixed paraffin embedded,FFPE)样本和血浆样本中HER2基因拷贝数检测体系,并对检测体系进行性能评估,为临床辅助诊疗... 目的·利用微滴式数字PCR系统(droplet digital PCR system,ddPCR)建立乳腺癌组织福尔马林固定石蜡包埋(formalin-fixed paraffin embedded,FFPE)样本和血浆样本中HER2基因拷贝数检测体系,并对检测体系进行性能评估,为临床辅助诊疗提供科学依据。方法·收集2020年1月—2021年6月就诊于上海健康医学院附属嘉定区中心医院普外科乳腺癌患者组织样本12例及其中4例配对血浆样本用于检测体系评价,同期收集健康志愿者血浆样本24例及就诊的乳腺癌组织切片样本77例,提取核酸,用于建立检测体系空白检测限及性能评价。设计及筛选检测体系,使用ddPCR检测体系的空白检测限、精密度、灵敏度及线性范围,使用高通量测序(next generation sequencing,NGS)验证ddPCR检测一致性,并与荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,IHC)/免疫组化(immunohistochemistry,FISH)金标准方法比对检测体系准确性。定量资料比较采用χ^(2)检验和配对样本t检验进行分析,使用Poisson概率函数分析体系空白检测限,变异系数(coefficient of variation,CV)评价灵敏度及精密度,线性回归相关系数(R^(2))评价线性范围。结果·使用ddPCR平台建立了乳腺癌患者组织切片DNA中HER^(2)基因拷贝数定量和扩增检测体系,配对样本t检验评价:与NGS方法检测组织核酸和血浆游离核酸样本结果相比,检测拷贝数结果相关系数0.987,扩增判读一致性100%。评估检测体系的批内精密度为6.8%、批间精密度为9.4%,灵敏度为1 ng,线性良好(R^(2)>0.98)。与传统的IHC/FISH方法相比,检测体系的灵敏度和特异度分别为84.6%(95%CI 64.3%~95.0%)和76.5%(95%CI 62.2%~86.8%),Kappa为0.57,一致率为79.2%。结论·使用ddPCR建立乳腺癌患者HER^(2)拷贝数检测体系,临床检测一致性良好,可能为乳腺癌患者的诊疗和预后判断的研究提供辅助手段。 展开更多
关键词 乳腺癌 福尔马林固定石蜡包埋 血浆 微滴式数字PCR her2拷贝
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HER2基因拷贝数增加与结肠腺癌发生的关联性
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作者 马燕凌 孙建海 +2 位作者 刘莉 赵振宇 邓洁 《武汉大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2012年第5期710-713,716,共5页
目的:检测HER2基因拷贝数的增加与结肠腺癌的发生是否存在关联。方法:收集了134例结肠腺癌组织,并以其配对的自身对照正常组织作为对照。运用DNA提取试剂盒提取其组织中DNA,运用PCR和实时定量PCR检测其HER2基因拷贝数及其mRNA的表达水... 目的:检测HER2基因拷贝数的增加与结肠腺癌的发生是否存在关联。方法:收集了134例结肠腺癌组织,并以其配对的自身对照正常组织作为对照。运用DNA提取试剂盒提取其组织中DNA,运用PCR和实时定量PCR检测其HER2基因拷贝数及其mRNA的表达水平。结果:35.1%的结肠腺癌患者组织中HER2基因拷贝数与其正常自身对照相比,其数目明显增加,且有统计学意义,并且,其HER2基因拷贝数随着病程的进展而逐渐增高。而且,HER2基因拷贝数的增加也会上调其组织中mRNA的表达水平。方论:在结肠腺癌中,HER2基因拷贝数的增加可作为一个潜在的检测指标,为临床早期诊断和发现提供一些理论基础。 展开更多
关键词 基因拷贝数变化 her2 结肠腺癌
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HER2基因组DNA标准物质互通性研究 被引量:1
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作者 邢德纯 程波 +5 位作者 王霞 高颖 刘争 孙锁柱 董莲华 杨靖亚 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1104-1110,共7页
采用实验室建立的数字PCR方法 (ddPCR)和荧光定量PCR (qPCR)方法研究HER2基因组DNA标准物质的互通性,评价HER2基因组DNA标准物质与临床样本的互通性,为临床实验室检测提供具有互通性的可溯源标准物质.将研制的5个水平标准物质随机穿插... 采用实验室建立的数字PCR方法 (ddPCR)和荧光定量PCR (qPCR)方法研究HER2基因组DNA标准物质的互通性,评价HER2基因组DNA标准物质与临床样本的互通性,为临床实验室检测提供具有互通性的可溯源标准物质.将研制的5个水平标准物质随机穿插于29例临床样本间,使用ddPCR方法与qPCR方法同时进行检测.参考美国临床实验室标准化协会(CLSI)指南文件EP30和中华人民共和国卫生行业标准基质效应与互通性评估指南WS/T356-2011的推荐,采用Deming回归法评价标准物质的互通性.结果显示,5种标准物质与临床样本之间具有良好的互通性,可以用于临床实验室对HER2基因拷贝数变异检测方法的方法验证和质量控制. 展开更多
关键词 乳腺癌基因检测 数字PCR her2基因组DNA标准物质 拷贝数变异
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运用数字PCR检测乳腺癌组织FFPE样品中人表皮生长因子受体2拷贝数的变化 被引量:1
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作者 董周寰 张晶 +5 位作者 王哲 许程程 王芳 宋海峰 付洁 石怀银 《生物技术通讯》 CAS 2018年第3期409-414,共6页
目的:建立数字PCR(dd PCR)法检测乳腺癌福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)切片样品中人表皮生长因子受体2(HER2)的拷贝数变化(CNV),并与免疫组化(IHC)、荧光原位杂交(FISH)结果比较,以寻求更客观、准确、通量的肿瘤标志物检测方法。方法:以细... 目的:建立数字PCR(dd PCR)法检测乳腺癌福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)切片样品中人表皮生长因子受体2(HER2)的拷贝数变化(CNV),并与免疫组化(IHC)、荧光原位杂交(FISH)结果比较,以寻求更客观、准确、通量的肿瘤标志物检测方法。方法:以细胞系293T、HOEC、SKOV3基因组DNA(g DNA)为模板,对靶基因HER2及校正基因CEP-17建立双通道dd PCR检测法,并对21例IHC检测HER2阳性(++/+++)的乳腺癌FFPE样品进行CNV(HER2/CEP-17)检测,与IHC、FISH结果比较。结果:单、双通道法对HER2 CNV检测结果一致;细胞及临床样品检测结果表明,dd PCR检测HER2 CNV的阴性、阳性Cut-off值分别为1.2、2.1,中间值为1.2~2.1。14例FISH阴性标本中,dd PCR的一致性为93%(13/14);3例IHC"+++"的样品中,FISH检测均为阳性,2例dd PCR检测为阳性,1例(17#)检测临界阳性。2例IHC"++"的样品,FISH检测阳性,但dd PCR检测为阴性。结论:dd PCR能检测样本HER2 CNV,且与FISH结果判读部分一致,具有临床应用前景,但仍需大量样品来进行验证及建立结果判断标准。 展开更多
关键词 人表皮生长因子受体2 拷贝数变异 数字PCR 福尔马林固定石蜡包埋样品
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细支气管肺泡癌的分子生物学研究
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作者 缪若羽 李龙芸 +5 位作者 曾瑄 王树兰 武莎雯 周小昀 冉然 王孟昭 《癌症进展》 2011年第1期27-32,共6页
目的细支气管肺泡癌(BAC)发病率呈明显上升趋势,靶向药物已成为BAC治疗热点。本文探索BAC分子生物学特点,包括EGFR-TK结构域的突变、EGFR和HER2的基因拷贝数和蛋白表达,以便探讨它们与BAC的治疗反应及预后关系。方法采用PCR和DNA测序法... 目的细支气管肺泡癌(BAC)发病率呈明显上升趋势,靶向药物已成为BAC治疗热点。本文探索BAC分子生物学特点,包括EGFR-TK结构域的突变、EGFR和HER2的基因拷贝数和蛋白表达,以便探讨它们与BAC的治疗反应及预后关系。方法采用PCR和DNA测序法检测中国人BAC石蜡包埋组织标本EGFR基因突变情况;EGFR试剂盒检测BAC患者外周血EGFR基因突变;荧光原位杂交法(FISH)及免疫组织化学法(IHC)分别检测组织标本中癌细胞的EGFR和HER2基因拷贝数和蛋白表达。结果 BAC组织标本中EGFR基因突变率50%(16/32),其中主要为L858R(50%)及外显子19缺失突变(43.8%)。EGFR基因拷贝数增加的阳性率41.2%(14/34)。EGFR蛋白表达阳性率76.5%(26/34)。HER2基因拷贝数增加/基因扩增阳性率5.7%(2/35)及蛋白表达阳性率6.1%(2/34),其中2例均为EGFR/HER2共表达。8例外周血EGFR检测有5例(62.5%)EGFR基因突变。研究显示仅EGFR基因拷贝数与EGFR基因突变率有非常显著的相关性(P=0.001)。与性别、吸烟情况、BAC病理亚型、EGFR蛋白表达没有显著相关性。结论 BAC具有较高的EGFR基因突变率、EGFR基因拷贝数增加的阳性率和蛋白表达阳性率。少数可能具有EGFR/HER2的共表达。鉴于EGFR突变阳性率高,测定方法便捷,因此是BAC靶向治疗依据的主要检测目标。外周血游离DNA中的EGFR突变检测值得进一步探讨。 展开更多
关键词 细支气管肺泡癌 表皮生长因子受体基因突变 基因拷贝数 蛋白表达 血清游离DNA her2
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