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栽培型与野生型辣椒HAK/KUP/KT基因家族的进化分析
被引量：
5
1
作者
司伟娜
孙毅
李晓玉
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2018年第4期753-761,共9页
HAK/KUP/KT家族是一类重要的钾转运蛋白家族。利用生物信息学手段对栽培型及墨西哥野生型辣椒全基因组范围内的HAK/KUP/KT基因成员进行鉴定及分析,比较两者在数目、复制类型及组织表达模式等方面的差异。发现2种辣椒中HAK/KUP/KT家族成...
HAK/KUP/KT家族是一类重要的钾转运蛋白家族。利用生物信息学手段对栽培型及墨西哥野生型辣椒全基因组范围内的HAK/KUP/KT基因成员进行鉴定及分析,比较两者在数目、复制类型及组织表达模式等方面的差异。发现2种辣椒中HAK/KUP/KT家族成员分别为24和22个,且在染色体上呈不均衡分布。基因复制类型分析发现,HAK/KUP/KT家族成员中存在片段重复和串联重复,且纯化选择是该家族进化的主要动力。组织表达分析显示,辣椒HAK/KUP/KT基因间的表达模式存在差异,暗示辣椒HAK/KUP/KT家族成员在功能上的多样性,并为后续发掘有益的钾转运基因提供了重要的理论依据。
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关键词
辣椒基因组
hak
/
kup
/
kt
钾离子转运蛋白家族
进化分析
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职称材料
题名
栽培型与野生型辣椒HAK/KUP/KT基因家族的进化分析
被引量：
5
1
作者
司伟娜
孙毅
李晓玉
机构
安徽农业大学生命科学学院
安徽农业大学作物抗逆育种与减灾国家地方联合工程实验室
出处
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2018年第4期753-761,共9页
基金
国家重点研发计划(2016YFD0300300)
安徽高校自然科学研究重点项目(KJ2017A147)共同资助
文摘
HAK/KUP/KT家族是一类重要的钾转运蛋白家族。利用生物信息学手段对栽培型及墨西哥野生型辣椒全基因组范围内的HAK/KUP/KT基因成员进行鉴定及分析,比较两者在数目、复制类型及组织表达模式等方面的差异。发现2种辣椒中HAK/KUP/KT家族成员分别为24和22个,且在染色体上呈不均衡分布。基因复制类型分析发现,HAK/KUP/KT家族成员中存在片段重复和串联重复,且纯化选择是该家族进化的主要动力。组织表达分析显示,辣椒HAK/KUP/KT基因间的表达模式存在差异,暗示辣椒HAK/KUP/KT家族成员在功能上的多样性,并为后续发掘有益的钾转运基因提供了重要的理论依据。
关键词
辣椒基因组
hak
/
kup
/
kt
钾离子转运蛋白家族
进化分析
Keywords
capsicum
genome
hak
/
kup
/
kt
potassium
transporters
family
homologous
analysis
分类号
S641.3 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
栽培型与野生型辣椒HAK/KUP/KT基因家族的进化分析
司伟娜
孙毅
李晓玉
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2018
5
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参考文献
引证文献
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