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基于生物信息学数据库的肺腺癌组织中HMGB1表达及相关下游通路分析 被引量:1
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作者 任冰洁 杨媛媛 +3 位作者 卞徐宇 李强 梁容瑞 陶敏 《广西医科大学学报》 CAS 2021年第4期734-740,共7页
目的:通过生物信息技术探讨高迁移率族蛋白B1(HMGB1)促进肺癌进展的潜在关键通路和环节。方法:UALCAN数据库分析HMGB1表达相关的基因和相关基因的生存分析。STRING数据库分析蛋白质-蛋白质相互作用。AnimalTFDB3.0和JASPAR数据库预测转... 目的:通过生物信息技术探讨高迁移率族蛋白B1(HMGB1)促进肺癌进展的潜在关键通路和环节。方法:UALCAN数据库分析HMGB1表达相关的基因和相关基因的生存分析。STRING数据库分析蛋白质-蛋白质相互作用。AnimalTFDB3.0和JASPAR数据库预测转录因子以及结合位点。KEGG数据库分析相关信号通路。结果:生物信息分析结果显示细胞周期蛋白依赖激酶1(CDK1)、H2A组蛋白家族成员Z(H2AFZ)与HMGB1的表达在肺腺癌(LUAD)中呈正相关关系,且CDK1和H2AFZ与LUAD的不良预后有关。预测到SOX2和SP1是CDK1或H2AFZ的转录因子。信号通路分析结果显示Akt和ERK可以调控SOX2的表达。结论:CDK1、H2AFZ可能是HMGB1参与LUAD进展的重要节点,HMGB1-Akt/ERK-SOX2-CDK1/H2AFZ可能是HMGB1促进LUAD进展的关键通路。 展开更多
关键词 高迁移率族蛋白B1 细胞周期蛋白依赖激酶1 h2A组蛋白家族成员Z SOX2 SP1
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血清miR-24-3p、H2AFX与肝癌患者临床病理特征及术后复发的关系研究
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作者 陈红健 张素青 《国际肿瘤学杂志》 CAS 2024年第6期344-349,共6页
目的探讨血清微RNA(miR)-24-3p、H2A组蛋白家族成员X(H2AFX)与肝癌患者临床病理特征及术后复发的关系。方法选取2018年3月至2022年3月南通大学附属肿瘤医院收治的108例肝癌初诊患者为研究对象(肝癌组), 另选取同期于本院就诊的86例肝脏... 目的探讨血清微RNA(miR)-24-3p、H2A组蛋白家族成员X(H2AFX)与肝癌患者临床病理特征及术后复发的关系。方法选取2018年3月至2022年3月南通大学附属肿瘤医院收治的108例肝癌初诊患者为研究对象(肝癌组), 另选取同期于本院就诊的86例肝脏良性病变患者作为良性病变组, 行体检的64例健康者为对照组。采用荧光定量PCR法检测并分析各组受试者血清miR-24-3p、H2AFX水平, 对复发和未复发肝癌患者血清miR-24-3p、H2AFX水平进行比较, 对不同血清miR-24-3p、H2AFX水平肝癌患者临床病理特征进行比较, logistic回归分析肝癌患者术后复发的影响因素。结果至随访结束, 108例肝癌患者46例复发。对照组、良性病变组、肝癌组血清miR-24-3p水平分别为1.01±0.23、0.79±0.21、0.55±0.13, 差异有统计学意义(F=125.86, P<0.001), 良性病变组、肝癌组患者血清miR-24-3p水平均低于对照组(均P<0.05), 肝癌组患者血清miR-24-3p水平低于良性病变组(P<0.05);3组血清H2AFX水平分别为1.02±0.25、1.27±0.31、1.59±0.37, 差异有统计学意义(F=65.40, P<0.001), 良性病变组、肝癌组患者血清H2AFX水平均高于对照组(均P<0.05), 肝癌组患者血清H2AFX水平高于良性病变组(P<0.05)。miR-24-3p、H2AFX高水平与低水平肝癌患者TNM分期(χ^(2)=7.85, P=0.005;χ^(2)=6.32, P=0.012)、分化程度(χ^(2)=11.59, P=0.001;χ^(2)=9.92, P=0.002)差异均有统计学意义。与未复发肝癌患者相比, 复发患者血清miR-24-3p水平明显降低(0.44±0.12比0.64±0.14), H2AFX水平明显升高(1.87±0.42比1.38±0.33), 差异均有统计学意义(t=7.79, P<0.001;t=6.79, P<0.001)。单因素分析显示, TNM分期(OR=1.57, 95%CI为1.05~2.35, P=0.029)、分化程度(OR=2.20, 95%CI为1.20~4.02, P=0.011)、miR-24-3p水平(OR=0.66, 95%CI为0.45~0.95, P=0.026)、H2AFX水平(OR=1.73, 95%CI为1.14~2.60, P=0.009)均是肝癌患者术后复发的影响因素;多因素分析显示, TNM分期(OR=2.10, 95%CI为1.14~3.86, P= 展开更多
关键词 肝肿瘤 血清 复发 微RNA-24-3p h2A组蛋白家族成员X
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肝细胞癌组织H2AFY表达变化及其临床意义
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作者 陈玉涛 张大鹏 +1 位作者 张鹏 宫春雨 《山东医药》 CAS 2023年第16期74-76,共3页
目的探讨肝细胞癌(HCC)组织H2A组蛋白家族成员Y(H2AFY)表达变化及其临床意义。方法选择HCC患者142例,取手术切除的HCC组织及其癌旁正常组织,采用免疫组化法检测H2AFY表达。比较HCC组织与癌旁正常组织H2AFY表达,分析H2AFY表达与HCC患者... 目的探讨肝细胞癌(HCC)组织H2A组蛋白家族成员Y(H2AFY)表达变化及其临床意义。方法选择HCC患者142例,取手术切除的HCC组织及其癌旁正常组织,采用免疫组化法检测H2AFY表达。比较HCC组织与癌旁正常组织H2AFY表达,分析H2AFY表达与HCC患者临床病理特征的关系。术后随访3年,比较不同H2AFY表达者3年累积生存率。结果HCC组织H2AFY高表达84例、低表达58例,癌旁正常组织H2AFY高表达12例、低表达130例。HCC组织H2AFY高表达率显著高于癌旁正常组织(χ^(2)=81.574,P<0.01)。H2AFY表达与年龄、肿瘤最大径、微血管浸润、TNM分期有关(P均<0.05),而与性别、合并肝硬化、HBsAg阳性、肿瘤数目及血清白蛋白、AFP水平无关(P均>0.05)。术后随访3年,H2AFY高表达者与低表达者分别死亡26、9例。H2AFY高表达者与低表达者术后3年累积生存率分别为69.0%、84.5%,H2AFY高表达者术后3年累积生存率显著低于H2AFY低表达者(χ^(2)=4.635,P<0.05)。结论HCC组织H2AFY高表达,其高表达可能参与肿瘤的发生、发展,并与患者预后不良密切相关。 展开更多
关键词 肝细胞癌 h2A组蛋白家族成员Y 临床病理特征 预后
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