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H10亚型禽流感病毒TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法的建立
1
作者
张雅馨
毛秋艳
+7 位作者
刘朔
周婉婷
周淑宁
彭程
李金平
刘华雷
蒋文明
格日勒图
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期893-899,共7页
从NCBI和GISAID数据库中下载H10亚型禽流感病毒的HA基因序列信息,与本实验室保存毒株的序列进行比对、分析、筛选,选择其共同保守区域设计荧光引物和探针,优化反应体系和条件,并验证该方法的特异性、敏感性和重复性。结果显示,该方法具...
从NCBI和GISAID数据库中下载H10亚型禽流感病毒的HA基因序列信息,与本实验室保存毒株的序列进行比对、分析、筛选,选择其共同保守区域设计荧光引物和探针,优化反应体系和条件,并验证该方法的特异性、敏感性和重复性。结果显示,该方法具有高度特异性,与其他几种禽源性病毒均无交叉反应;敏感性可达到1.7×10^(2)拷贝/μL,比普通RT-PCR敏感10倍;批内和批间重复的变异系数(Cv)均小于1.4%,稳定性较好;分别使用鸡胚接种病毒分离法、本研究建立的TaqMan探针实时荧光定量PCR和普通RT-PCR检测鸡感染试验的拭子和组织样品,结果显示病毒分离法与本研究建立的实时荧光定量PCR方法的总符合率为94.44%,而与普通RT-PCR方法的总符合率为90.74%,实时荧光定量PCR的阳性检出率比RT-PCR更高。结果表明,建立的TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法具有较好的特异性、敏感性和稳定性,有助于H10亚型禽流感病毒的临床检测和监测,对其防控具有一定意义。
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关键词
h
10
亚型
禽流感
病毒
TAQMAN探针
实时荧光定量PCR
h
A基因
原文传递
洞庭湖区H10亚型禽流感监测及其遗传进化分析
被引量：
4
2
作者
黄建龙
王昌建
+5 位作者
谭丹
邓国华
范仲鑫
朱春霞
张朝阳
刘道新
《中国农学通报》
CSCD
2014年第32期15-20,共6页
为了解洞庭湖区H10亚型禽流感病毒的流行分布及遗传进化情况,为该地区H10亚型禽流感的防控及该亚型病毒在禽流感病毒进化中所起的作用提供一些参考。在环洞庭湖地区活禽批发市场和水禽场上采集家禽和环境拭子,对其进行病原分离、鉴定和...
为了解洞庭湖区H10亚型禽流感病毒的流行分布及遗传进化情况,为该地区H10亚型禽流感的防控及该亚型病毒在禽流感病毒进化中所起的作用提供一些参考。在环洞庭湖地区活禽批发市场和水禽场上采集家禽和环境拭子,对其进行病原分离、鉴定和测序,应用Mega 5软件包对病毒基因进行多序列比对和进化树的绘制与分析。结果显示:在活禽批发市场上总共分离到11株H10亚型禽流感病毒,分离的H10亚型禽流感阳性样品全来源于鸭拭子;在1个鸭场分离到2株H10亚型禽流感病毒;其中2株分离毒株序列分析显示其HA蛋白的裂解位点为PELMQGR/GLF,属于低致病性病毒,与以往在其他国家(蒙古、瑞典、荷兰、泰国、日本等)野鸟中分离的H10亚型病毒处于同一分支。
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关键词
h
10
亚型
禽流感
病毒
洞庭湖区
监测
遗传进化
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职称材料
题名
H10亚型禽流感病毒TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法的建立
1
作者
张雅馨
毛秋艳
刘朔
周婉婷
周淑宁
彭程
李金平
刘华雷
蒋文明
格日勒图
机构
内蒙古农业大学兽医学院
浙江农林大学动物科技学院/动物医学院
中国动物卫生与流行病学中心
青岛农业大学动物医学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期893-899,共7页
基金
山东省重点研发计划资助项目(2022CXGC010606)。
文摘
从NCBI和GISAID数据库中下载H10亚型禽流感病毒的HA基因序列信息,与本实验室保存毒株的序列进行比对、分析、筛选,选择其共同保守区域设计荧光引物和探针,优化反应体系和条件,并验证该方法的特异性、敏感性和重复性。结果显示,该方法具有高度特异性,与其他几种禽源性病毒均无交叉反应;敏感性可达到1.7×10^(2)拷贝/μL,比普通RT-PCR敏感10倍;批内和批间重复的变异系数(Cv)均小于1.4%,稳定性较好;分别使用鸡胚接种病毒分离法、本研究建立的TaqMan探针实时荧光定量PCR和普通RT-PCR检测鸡感染试验的拭子和组织样品,结果显示病毒分离法与本研究建立的实时荧光定量PCR方法的总符合率为94.44%,而与普通RT-PCR方法的总符合率为90.74%,实时荧光定量PCR的阳性检出率比RT-PCR更高。结果表明,建立的TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法具有较好的特异性、敏感性和稳定性,有助于H10亚型禽流感病毒的临床检测和监测,对其防控具有一定意义。
关键词
h
10
亚型
禽流感
病毒
TAQMAN探针
实时荧光定量PCR
h
A基因
Keywords
h
lo subtype avian influenza virus
TaqMan probe
real-time fluorescence quantitative PCR
h
A gene
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
洞庭湖区H10亚型禽流感监测及其遗传进化分析
被引量：
4
2
作者
黄建龙
王昌建
谭丹
邓国华
范仲鑫
朱春霞
张朝阳
刘道新
机构
湖南省动物疫病预防控制中心
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所农业部动物流感重点开放实验室/兽医生物技术国家重点实验室
出处
《中国农学通报》
CSCD
2014年第32期15-20,共6页
基金
国家"973"自然科学基金项目(2011CB505001)
文摘
为了解洞庭湖区H10亚型禽流感病毒的流行分布及遗传进化情况,为该地区H10亚型禽流感的防控及该亚型病毒在禽流感病毒进化中所起的作用提供一些参考。在环洞庭湖地区活禽批发市场和水禽场上采集家禽和环境拭子,对其进行病原分离、鉴定和测序,应用Mega 5软件包对病毒基因进行多序列比对和进化树的绘制与分析。结果显示:在活禽批发市场上总共分离到11株H10亚型禽流感病毒,分离的H10亚型禽流感阳性样品全来源于鸭拭子;在1个鸭场分离到2株H10亚型禽流感病毒;其中2株分离毒株序列分析显示其HA蛋白的裂解位点为PELMQGR/GLF,属于低致病性病毒,与以往在其他国家(蒙古、瑞典、荷兰、泰国、日本等)野鸟中分离的H10亚型病毒处于同一分支。
关键词
h
10
亚型
禽流感
病毒
洞庭湖区
监测
遗传进化
Keywords
h
10
Subtype Avian Influenza Virus
Dongting Lake Region
surveillance
genetic Evolution
分类号
S854.4 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
H10亚型禽流感病毒TaqMan探针实时荧光定量PCR检测方法的建立
张雅馨
毛秋艳
刘朔
周婉婷
周淑宁
彭程
李金平
刘华雷
蒋文明
格日勒图
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
2
洞庭湖区H10亚型禽流感监测及其遗传进化分析
黄建龙
王昌建
谭丹
邓国华
范仲鑫
朱春霞
张朝阳
刘道新
《中国农学通报》
CSCD
2014
4
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