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贵州汉族人群21个非CODIS STR基因座的遗传多态性分析
被引量:
2
1
作者
张红玲
蔡鹏
+7 位作者
熊玲
罗文钰
杨美庆
徐荣兰
王启燕
任峥
季晶焱
黄江
《贵州医科大学学报》
CAS
2021年第2期159-164,共6页
目的调查贵州汉族人群21个非DNA检索系统(CODIS)的短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,并评估其在法医学上的应用价值。方法选取301例贵州汉族无关个体血样,采用AGCU21+1荧光标记复合扩增系统对样本进行聚合酶链式反应(PCR),3500型...
目的调查贵州汉族人群21个非DNA检索系统(CODIS)的短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,并评估其在法医学上的应用价值。方法选取301例贵州汉族无关个体血样,采用AGCU21+1荧光标记复合扩增系统对样本进行聚合酶链式反应(PCR),3500型全自动遗传分析仪对PCR扩增产物进行电泳分离,Gene Mapper ID-X 1.3软件进行STR基因分型,Modified-Powerstates软件包获得各基因座的等位基因频率、杂合度(H)、匹配概率(PM)、个体识别率(DP)、非父排除率(PE)、多态信息含量(PIC)、累积个体识别能力(TDP)、累积非父排除率(CPE)及各基因座的Hardy-Weinberg平衡检验,采用Genepop软件对两两基因座进行连锁不平衡分析;同时选择已报道的7个地区汉族人群作为参考,对8个汉族人群基因频率进行主成分分析(PCA),应用MEGA 7.0软件通过Neighbor-Joining(N-J)法构建8个地区汉族人群的系统发育树。结果 21个STR基因座共检测出了157个等位基因,436种基因型,基因频率介于0.001 7~0.584 7,PM介于0.052 6(D19S433)~0.226 8(D1S1627),DP介于0.773 2(D1S1627)~0.947 4(D19S433),PE介于0.272 9(D1S1627)~0.586 7(D22S1045),PIC介于0.533 2(D1S1627)~0.803 0(D19S433);TDP为1-4.645 5×10-20,CPE为0.999 998 822;与已报道的7个汉族群体比较,贵州和湖南汉族人群遗传关系最近,与宁夏汉族份遗传关系最远。结论 21个非CODIS STR在贵州汉族人群具有较好的多态性及个体识别能力,可作为法医学亲权鉴定和个人识别的有效补充。
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关键词
法医遗传学
非DNA检索系统
贵州汉族
遗传多态性
短串联重复序列
亲权鉴定
个体识别
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题名
贵州汉族人群21个非CODIS STR基因座的遗传多态性分析
被引量:
2
1
作者
张红玲
蔡鹏
熊玲
罗文钰
杨美庆
徐荣兰
王启燕
任峥
季晶焱
黄江
机构
贵州医科大学法医学院
出处
《贵州医科大学学报》
CAS
2021年第2期159-164,共6页
基金
贵州省高层次“百”层次创新型人才项目[黔科合平台人才(2020)6012]
贵州省高技术产业化示范工程项目[黔发改高技(2016)1345]
+3 种基金
贵州省科技计划项目[黔科合支撑(2019)2825,黔科合支撑(2020)4Y057]
贵州省科技计划基金项目[黔科合(2020)1Y353]
大学生创新创业训练项目(DC201710660026,DC20195200903)
贵州医科大学一流课程项目(YLKC2019007)。
文摘
目的调查贵州汉族人群21个非DNA检索系统(CODIS)的短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性,并评估其在法医学上的应用价值。方法选取301例贵州汉族无关个体血样,采用AGCU21+1荧光标记复合扩增系统对样本进行聚合酶链式反应(PCR),3500型全自动遗传分析仪对PCR扩增产物进行电泳分离,Gene Mapper ID-X 1.3软件进行STR基因分型,Modified-Powerstates软件包获得各基因座的等位基因频率、杂合度(H)、匹配概率(PM)、个体识别率(DP)、非父排除率(PE)、多态信息含量(PIC)、累积个体识别能力(TDP)、累积非父排除率(CPE)及各基因座的Hardy-Weinberg平衡检验,采用Genepop软件对两两基因座进行连锁不平衡分析;同时选择已报道的7个地区汉族人群作为参考,对8个汉族人群基因频率进行主成分分析(PCA),应用MEGA 7.0软件通过Neighbor-Joining(N-J)法构建8个地区汉族人群的系统发育树。结果 21个STR基因座共检测出了157个等位基因,436种基因型,基因频率介于0.001 7~0.584 7,PM介于0.052 6(D19S433)~0.226 8(D1S1627),DP介于0.773 2(D1S1627)~0.947 4(D19S433),PE介于0.272 9(D1S1627)~0.586 7(D22S1045),PIC介于0.533 2(D1S1627)~0.803 0(D19S433);TDP为1-4.645 5×10-20,CPE为0.999 998 822;与已报道的7个汉族群体比较,贵州和湖南汉族人群遗传关系最近,与宁夏汉族份遗传关系最远。结论 21个非CODIS STR在贵州汉族人群具有较好的多态性及个体识别能力,可作为法医学亲权鉴定和个人识别的有效补充。
关键词
法医遗传学
非DNA检索系统
贵州汉族
遗传多态性
短串联重复序列
亲权鉴定
个体识别
Keywords
forensic
genetics
non-combined
DNA
index
system(non-CODIS)
guizhou
han
people
polymorphism
short
tandem
repeat(STR)
paternity
test
personal
identification
分类号
R89 [医药卫生—法医学]
DF795.1 [医药卫生—临床医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
贵州汉族人群21个非CODIS STR基因座的遗传多态性分析
张红玲
蔡鹏
熊玲
罗文钰
杨美庆
徐荣兰
王启燕
任峥
季晶焱
黄江
《贵州医科大学学报》
CAS
2021
2
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