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基于细胞色素b和内转录间隔区基因序列的4个棕脊足螨地理种群遗传变异分析 被引量：1
1
作者 陶香林 马飞 +3 位作者 李政 阚心蕊 叶长江 孙恩涛 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期22-28,共7页
目的分析不同地理种群棕脊足螨(Gohieria fusca)遗传多样性和遗传分化。方法自安徽省芜湖市(WH)、蚌埠市(BB)、亳州市(BZ)和浙江省嘉兴市(JX)等4个地区采集螨虫标本并筛选出棕脊足螨,采用PCR技术扩增棕脊足螨线粒体细胞色素b(cytochrome... 目的分析不同地理种群棕脊足螨(Gohieria fusca)遗传多样性和遗传分化。方法自安徽省芜湖市(WH)、蚌埠市(BB)、亳州市(BZ)和浙江省嘉兴市(JX)等4个地区采集螨虫标本并筛选出棕脊足螨,采用PCR技术扩增棕脊足螨线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cytb)和核糖体DNA内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)基因并对扩增产物测序。采用Chromas 2和DNASTAR 1.00软件进行序列校对和拼接,采用DnaSP 5.10.00软件计算各种群单倍型多样性(Hd)、核苷酸多态性(Pi),应用MEGA 10.2软件包计算遗传分化指数(F_(st))和基因流(N_(m))。采用Arlequin 3.1软件计算Tajima’s D和Fu’s FS值,并进行中性检验和分子方差分析;采用Network 10.2软件基于Median-joining法构建单倍型网络图。结果棕脊足螨样本Cytb基因序列长度为372 bp、ITS基因序列长度为1301~1320 bp。基于线粒体Cytb基因和核糖体ITS基因序列分析发现,4个棕脊足螨地理种群均表现出较高遗传多样性(Hd=0.804,Pi=0.00691)。分子方差分析发现,4个棕脊足螨地理种群间存在遗传分化(F_(st)=0.20240,P<0.05),且遗传变异主要来自种群内(79.76%)。基因流分析发现,4个棕脊足螨地理种群间局部存在高水平基因流(N_(m)>1)。基于Cytb基因的中性检验发现,棕脊足螨WH种群Tajima’sD值和Fu’s FS值分别为-1.79631和-3.29398(P均<0.05),表明WH种群可能发生过历史扩张。单倍型网络图和系统发育树分析结果一致,均表明不同棕脊足螨地理种群无明显地理分布格局。基于ITS基因序列分析发现,4个棕脊足螨地理种群Hd与Pi均较高,整体值分别为0.985和0.01197,具有较高遗传多样性。分子方差分析发现,棕脊足螨Fst值为0.10462(P<0.05),种群间存在中等程度遗传分化。基于ITS基因的中性检验发现,棕脊足螨整体Tajima’s D值和Fu’s FS值分别为-6.08820和-1.93599(P均>0.05),无明显历史扩张。结论4个棕脊足螨地理种群遗传多样性较高,� 展开更多
关键词 棕脊足螨 细胞色素B 内转录间隔区 种群多样性 遗传分化 基因流
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空调器隔尘网灰尘中发现棕脊足螨 被引量：1
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作者 柴强 湛孝东 +1 位作者 郭伟 李朝品 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期612-614,共3页
目的了解芜湖地区不同场所空调器隔尘网中棕脊足螨的污染情况。方法于2013年6-9月采集芜湖市食堂、商场、酒店和家庭的空调器隔尘网灰尘,检获其中的棕脊足螨。结果共收集430份空调器隔尘网积尘样本,其中阳性标本98份,阳性率22.79%,不同... 目的了解芜湖地区不同场所空调器隔尘网中棕脊足螨的污染情况。方法于2013年6-9月采集芜湖市食堂、商场、酒店和家庭的空调器隔尘网灰尘,检获其中的棕脊足螨。结果共收集430份空调器隔尘网积尘样本,其中阳性标本98份,阳性率22.79%,不同场所的空调器隔尘网中棕脊足螨的孳生率差异有统计学意义(χ2=18.294,P<0.05);样本总重量为510.5 g,共检出棕脊足螨783只,平均孳生密度为1.53只/g。结论芜湖地区空调器隔尘网中有棕脊足螨孳生,且孳生情况较严重。 展开更多
关键词 棕脊足螨 空调器隔尘网 孳生 过敏
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