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生防细菌NCD-2中抑菌功能相关基因的定位及克隆 被引量：10
1
作者 郭庆港 李社增 +1 位作者 鹿秀云 马平 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2007年第6期190-194,共5页
枯草芽孢杆菌NCD-2菌株是一株有效防治棉花黄萎病的细菌,它通过产生抑菌物质达到对大丽轮枝菌的抑制作用。以该菌株作为有效成分的微生物农药已通过国家农药登记。通过原生质体转化法将含有转座子mini-Tn10的质粒pHV1249转入枯草芽孢杆... 枯草芽孢杆菌NCD-2菌株是一株有效防治棉花黄萎病的细菌,它通过产生抑菌物质达到对大丽轮枝菌的抑制作用。以该菌株作为有效成分的微生物农药已通过国家农药登记。通过原生质体转化法将含有转座子mini-Tn10的质粒pHV1249转入枯草芽孢杆菌NCD-2中,获得转化子。对转化子通过高温诱导转座子转座,获得4 000个NCD-2菌株的突变子。对这些突变子进行对大丽轮枝菌的抑菌作用测定,筛选到2株抑菌作用增强的突变子和4株抑菌作用降低的突变子。采用染色体步移技术对此6个突变子中转座子插入位点基因的侧翼序列进行克隆和测序,结合枯草芽孢杆菌168菌株的全基因组序列对测序结果进行序列同源性和基因定位分析,结果表明:抑菌作用增强的2个突变子中,转座子插入到一个功能未知的基因内部,此基因与枯草芽孢杆菌168菌株中的yvoA基因的同源性为98%;抑菌作用降低的4个突变子中,转座子插入位点对应于枯草芽孢杆菌168菌株中的phoP基因内部,插入位点的侧翼序列与枯草芽孢杆菌168菌株中的phoP基因的同源性达到98%。 展开更多
关键词 枯草芽孢杆菌 转座子mini-Tn10 染色体步移法 大丽轮枝菌 双调控系统
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2种PCR方法扩增盐藻肌动蛋白基因3’旁侧序列比较 被引量：6
2
作者 姜国忠 谢华 +2 位作者 郭玉忠 范天黎 薛乐勋 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2004年第1期41-44,共4页
目的 :比较扩增盐藻肌动蛋白基因 3’旁侧序列的 2种PCR方法。方法 :用pvuⅡ、EcoRⅤ和StuⅠ 3种限制性内切酶消化盐藻基因组DNA后 ,供 2种PCR用 ,一种是连接介导法PCR(LMPCR) ,与用人工合成的适配子相连并用适配子引物和盐藻肌动蛋白... 目的 :比较扩增盐藻肌动蛋白基因 3’旁侧序列的 2种PCR方法。方法 :用pvuⅡ、EcoRⅤ和StuⅠ 3种限制性内切酶消化盐藻基因组DNA后 ,供 2种PCR用 ,一种是连接介导法PCR(LMPCR) ,与用人工合成的适配子相连并用适配子引物和盐藻肌动蛋白基因特异引物扩增未知序列 ;另一种是反向PCR(IPCR) ,酶切后的DNA自身环化做模板 ,用 2对基因特异引物反向扩增。结果 :2轮PCR后 ,LMPCR中得到大量的非特异扩增产物 ,测序结果发现许多产物是由适配子引物AP2单独扩增引起。而反向PCR在得到pvuⅡ和StuⅠ消化的自连文库中扩增得到 2 .5kb特异产物 ,经测序发现 ,片段两侧为基因特异引物 ,部分序列与已知序列相一致。Southern也进一步证实了IPCR扩增片段来源于盐藻基因组DNA。结论 :IPCR技术在克隆基因旁侧序列时优于LMPCR方法。 展开更多
关键词 反向PCR 连接介导法PCR 盐藻 肌动蛋白 旁侧序列cDNA 简并引物
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长穗偃麦草DREB类基因EeAP2.2的克隆与序列分析 被引量：9
3
作者 默韶京 刘桂茹 郎明林 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期764-769,共6页
结合RACE和Genome Walking技术从十倍体长穗偃麦草中克隆了AP2家族的一个全长cDNA序列,命名为Ee-AP2.2。序列分析表明,该基因具有一个837bp的开放阅读框,编码279个氨基酸残基,含有一个保守的AP2结构域,是AP2大家族的一个新成员。该基因... 结合RACE和Genome Walking技术从十倍体长穗偃麦草中克隆了AP2家族的一个全长cDNA序列,命名为Ee-AP2.2。序列分析表明,该基因具有一个837bp的开放阅读框,编码279个氨基酸残基,含有一个保守的AP2结构域,是AP2大家族的一个新成员。该基因编码的氨基酸序列与GenBank已有的普通小麦AP2家族两个同源基因编码蛋白TaDREB1和TaDREBW50(登录号分别为:AAL01124.1和AAY44605.1)具有98%的氨基酸序列一致性,与大麦AP2蛋白HvDREB1-a(登录号AAY25517.1)、高羊茅AP2蛋白FaDREB2A(登录号CAG30547.1)及水稻OsDREB2.2(登录号AY064403)的氨基酸序列一致性分别为93%、86%和69%。说明该基因与小麦AP2家族基因的同源性最高。本研究除获得了长穗偃麦草一个重要抗逆转录因子基因EeAP2.2的全长cDNA序列外,也提供了一种快速、有效克隆功能基因的方法。 展开更多
关键词 长穗偃麦草 DREB RACE genome walking 基因克隆
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花生β-1,3-葡聚糖酶基因启动子的克隆及功能分析 被引量：10
4
作者 王合春 陈新利 +3 位作者 隋炯明 毕英娜 王晶珊 乔利仙 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期864-870,共7页
植物β-1,3-葡聚糖酶属于一种重要的植物病程相关蛋白(PR蛋白),容易受到激发子的诱导而积累。用1.5 mmol/L水杨酸(SA)对花生品种花育20号幼苗进行诱导处理0.5、12、24、36、48和72 h后,提取RNA进行荧光定量检测β-1,3-葡聚糖酶基因(Ah-G... 植物β-1,3-葡聚糖酶属于一种重要的植物病程相关蛋白(PR蛋白),容易受到激发子的诱导而积累。用1.5 mmol/L水杨酸(SA)对花生品种花育20号幼苗进行诱导处理0.5、12、24、36、48和72 h后,提取RNA进行荧光定量检测β-1,3-葡聚糖酶基因(Ah-Glu)的表达量。结果表明,经诱导24 h后β-1,3-葡聚糖酶基因的表达量达到最高,是未经SA诱导的1.8倍。根据前期已克隆的花生β-1,3-葡聚糖酶基因序列(GenBank JQ801335),在其5'端设计3个嵌套的特异性引物扩增其上游启动子序列。以花育20号基因组DNA为模板,利用TAIL-PCR方法,扩增得到973 bp的花生β-1,3-葡聚糖酶基因启动子片段,在NCBI网站注册序列号为GenBank KC290400,并命名为Ah-Glu-Pro。PLACE和PlantCARE在线预测分析表明,Ah-Glu-Pro序列中含有TATA-box和CAAT-box等核心元件,还含有病原菌及水杨酸响应的顺式调控元件。根据Ah-Glu-Pro序列设计上下游引物,采用普通PCR法从花育20号扩增得到931 bp的启动子序列,命名为Ah-Glu-P。将Ah-Glu-P取代pCAMBIA1301质粒中的CaMV35S启动子,构建植物表达载体pCAMBIA1301-Ah-Glu-P。通过农杆菌介导法将pCAMBIA1301-Ah-Glu-P转化洋葱表皮细胞,经5 mmol/L SA诱导处理48 h后进行GUS染色。结果表明:经SA诱导后的洋葱表皮细胞GUS组织化学染色显示为蓝色,未经SA诱导的洋葱表皮细胞GUS组织化学染色未显示蓝色,说明Ah-Glu-P是一个可被诱导的启动子,可能含有对SA响应的顺式调控元件。 展开更多
关键词 花生 β-1 3-葡聚糖酶基因(Ah-Glu) 诱导型启动子 染色体步移 表达载体
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棉铃虫细胞色素P450 CYP9A12基因5′-上游区的克隆及序列分析 被引量：8
5
作者 周颖君 杨亦桦 +1 位作者 武淑文 吴益东 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期120-125,共6页
细胞色素P450基因CYP9A12的过量表达已被证实与棉铃虫Heliocverpa armigera对拟除虫菊酯的抗性相关。为探明棉铃虫CYP9A12基因的表达调控机理,根据棉铃虫CYP9A12基因cDNA全长的5′-末端核苷酸序列,采用基因组步移方法,获得CYP9 A12的5′... 细胞色素P450基因CYP9A12的过量表达已被证实与棉铃虫Heliocverpa armigera对拟除虫菊酯的抗性相关。为探明棉铃虫CYP9A12基因的表达调控机理,根据棉铃虫CYP9A12基因cDNA全长的5′-末端核苷酸序列,采用基因组步移方法,获得CYP9 A12的5′-上游区序列(总长为3575bp)。与cDNA序列进行比对,表明在起始密码子上游3bp处有一长为2124bp的内含子。利用NNPP分析软件预测出转录起始位点,与根据CYP9A12全长cDNA序列推测的结果是一致的。TFSEARCH 1.3软件分析转录因子结合位点的结果显示,该序列不仅包含启动子的核心结构序列——TATA-box和CAAT-box,亦包含多个转录因子结合位点,如GATA-1,CdxA,Dfd等。本研究结果为深入研究棉铃虫CYP9A12的表达调控机制及其参与杀虫剂抗性的分子机理奠定了一定基础。 展开更多
关键词 棉铃虫 细胞色素P450 CYP9A12 基因组步移 5′-上游区
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青枯菌拮抗菌2-Q-9的分子鉴定及抑菌相关基因的克隆 被引量：8
6
作者 张旭 陈武 +2 位作者 杨玉婷 黎定军 黄三文 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期233-236,共4页
通过16SrDNA碱基序列的测定和同源性分析,鉴定青枯菌拮抗菌2-Q-9与桥石短芽孢杆菌(Brevibacillus choshinensis)亲缘关系最近,其16SrDNA序列提交GenBank,登录号为FJ613127.根据已测得的该拮抗菌外泌抗菌肽氨基酸序列中的一段设计简并引... 通过16SrDNA碱基序列的测定和同源性分析,鉴定青枯菌拮抗菌2-Q-9与桥石短芽孢杆菌(Brevibacillus choshinensis)亲缘关系最近,其16SrDNA序列提交GenBank,登录号为FJ613127.根据已测得的该拮抗菌外泌抗菌肽氨基酸序列中的一段设计简并引物,利用染色体步移法得到全长序列780bp,经测序和BLAST比对分析表明,该基因属于CodY家族,与已鉴定的转录因子抑制剂CodY(ZP_01171531)的同源性最高;表现在氨基酸水平的相似性为77%,其序列全长已提交GenBank,登录号为FJ613128. 展开更多
关键词 烟草青枯病 拮抗菌 分子鉴定 染色体步移
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抗除草剂转基因大豆插入拷贝数及其旁侧序列分析 被引量：7
7
作者 仇有文 高学军 +3 位作者 张明辉 敖金霞 袁肖寒 刘营 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期31-35,共5页
目的:确定抗除草剂转基因大豆外源基因拷贝数和其插入位点侧翼序列。方法:采用绝对定量PCR法测定转EPSPS基因大豆中外源基因拷贝数,内参照基因标准曲线选用大豆凝集素(Lectin)基因为标准品,外源基因标准曲线以含EPSPS基因的阳性质粒为... 目的:确定抗除草剂转基因大豆外源基因拷贝数和其插入位点侧翼序列。方法:采用绝对定量PCR法测定转EPSPS基因大豆中外源基因拷贝数,内参照基因标准曲线选用大豆凝集素(Lectin)基因为标准品,外源基因标准曲线以含EPSPS基因的阳性质粒为标准品。采用基因组步移技术和巢式PCR方法确定抗除草剂转基因大豆插入位点旁侧序列。结果:抗除草剂转基因大豆外源基因的拷贝数为1。CaMV35S上游扩增887bp,NOS下游扩增1 340bp。结论:明确了EPSPS外源基因在转基因大豆中为单拷贝,转基因大豆插入位点附近大豆基因组发生了DNA重排。 展开更多
关键词 抗除草剂转基因大豆 旁侧序列 拷贝数 基因组步移 接头PCR
原文传递
坛紫菜胞质型抗坏血酸过氧化物酶基因的克隆及特征分析 被引量：6
8
作者 张晓龙 杨锐 +3 位作者 仪茜茜 孙雪 吴晓微 王亚军 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期165-174,共10页
关键词 抗坏血酸过氧化物酶 坛紫菜 RACE 基因组步移 克隆
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玉米大斑病菌Stga-2及其启动子的克隆与基因表达分析 被引量：5
9
作者 郝志敏 申珅 +1 位作者 李志勇 董金皋 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第18期3705-3712,共8页
【目的】克隆玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)Gα亚基(Heterotrimeric Gproteinalpha subunit)基因及其启动子,并对其进行异源表达,为深入研究Gα基因的表达规律、基因功能和编码蛋白的特性奠定基础。【方法】首先通过简并引物PCR... 【目的】克隆玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)Gα亚基(Heterotrimeric Gproteinalpha subunit)基因及其启动子,并对其进行异源表达,为深入研究Gα基因的表达规律、基因功能和编码蛋白的特性奠定基础。【方法】首先通过简并引物PCR法获得Gα基因的同源片段,再利用Genome walking技术克隆片段的5′端和3′端侧翼序列,最后采用RT-PCR法扩增基因全长,并对基因结构和上游调控元件进行生物信息学分析。同时,利用pET原核表达系统获得基因的编码产物。【结果】获得1个玉米大斑病菌Gα基因—Stga-2的全长序列及其上游部分启动子区,并利用pET原核表达系统对Stga-2成功进行了异源表达。生物信息学分析表明,Stga-2全长1318bp,由4个内含子和5个外显子组成,编码产物包含356个氨基酸残基。在347bp的上游侧翼序列中未发现典型的TATA-box及CAAT-box,但在起始密码子上游30bp处发现了转录起始子特征序列及位于其上游能够起始真菌基因转录的C+T丰富区域,同时还有转录因子Sp1的识别位点、CCA基序(CCAmotif)及CCG重复基序(CCG repeats)等顺式作用元件。【结论】玉米大斑病菌Stga-2及其启动子的成功克隆与表达进一步丰富了植物病原真菌的生物信息学资源,为深入了解植物病原真菌信号转导途径奠定了基础。 展开更多
关键词 玉米大斑病菌 异三聚体G蛋白 genome walking 启动子 原核表达
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甘蓝型油菜BnCOP1基因编码区全长cDNA的克隆与功能研究 被引量：5
10
作者 彭丹 周波 +5 位作者 赵小英 黄星群 贺热情 宋丽丽 唐冬英 刘选明 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期69-77,共9页
通过分析拟南芥、豌豆、番茄和水稻的COP1(constitutively photomorphogenic 1)的cDNA序列,运用RT-PCR和改进的基因组步行(genome walking)技术相结合的方法,首次从甘蓝型油菜中克隆到油菜BnCOP1编码区cDNA的全长序列,其全长2 034 bp,编... 通过分析拟南芥、豌豆、番茄和水稻的COP1(constitutively photomorphogenic 1)的cDNA序列,运用RT-PCR和改进的基因组步行(genome walking)技术相结合的方法,首次从甘蓝型油菜中克隆到油菜BnCOP1编码区cDNA的全长序列,其全长2 034 bp,编码677个氨基酸.同源性分析表明,其编码的氨基酸序列与拟南芥的同源性高达94%.对BnCOP1编码序列(cDNA)演绎出的氨基酸序列分析表明,其编码的蛋白包含有N端的环形锌指结合域(ring finger zinc bindingdomain,RING)、中间的卷曲螺旋形结构域(coiled-coil domain,coiled-coil),7个C端的WD-40重复序列(WD-40 repeats,WD-40)的功能域.半定量RT-PCR和实时荧光定量PCR分析该基因在油菜中的表达模式,结果显示,BnCOP1在甘蓝型油菜的各个组织器官中均有表达,其中在花中的表达明显高于在根、叶、茎、果荚及子叶和胚轴中,暗示该蛋白可能与开花途径相关.过表达BnCOP1的转基因拟南芥植株在高度、主茎的直径和叶片大小上都呈现出比野生型弱小的表型,表明BnCOP1抑制了拟南芥光形态建成从而影响了植物的生长发育. 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 BnCOP1 RT-PCR 基因组步行 序列分析 转基因
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新疆野扁桃CBF基因启动子克隆及瞬时表达分析 被引量：6
11
作者 余曦瑶 李疆 +4 位作者 姚正培 任艳萍 罗淑萍 张亮 王敏 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期1214-1222,共9页
CBF基因主要功能是调控下游大量抗冷基因的表达。CBF基因是植物抗冷途径的枢纽,对增强植物的抗冷能力极为重要。本研究利用染色体步移法得到了新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schleche)CBF基因家族成员Als CBF翻译起始位点上游的启... CBF基因主要功能是调控下游大量抗冷基因的表达。CBF基因是植物抗冷途径的枢纽,对增强植物的抗冷能力极为重要。本研究利用染色体步移法得到了新疆野扁桃(Amygdalus ledebouriana Schleche)CBF基因家族成员Als CBF翻译起始位点上游的启动子序列,长度为1 391 bp(Gen Bank登录号:KP662710)。对启动子序列进行生物信息学分析表明,该序列存在启动子的基本元件CAAT-box和TATA-box,并且含有多个与植物非生物胁迫有关的响应元件:ABA响应元件、MYB、MYC结合位点、光应答元件和LTRE低温应答元件等。在烟草叶片中进行瞬时表达的结果表明,该启动子序列具备在逆境胁迫下诱导驱动报告GUS基因表达的功能。本研究可为揭示CBF基因在野扁桃抗寒性、抗旱性等抗逆过程中的作用机理,以及为增强野扁桃CBF基因在扁桃的抗逆性遗传改良中的作用奠定一定的基础,同时对野扁桃的繁育和保护也有极为重要的意义。 展开更多
关键词 野扁桃 CBF基因 启动子 染色体步移
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耐热番茄Hsf24基因克隆与分析 被引量：5
12
作者 李振军 李景富 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期29-33,I0001,共6页
通过染色体步移技术克隆耐热番茄Hsf24基因,并对该基因及编码蛋白质进行同源性分析。通过Blast分析结果表明,确定该基因具有Hsf基因家族特性,并预测其编码蛋白三级结构。该基因的克隆与分析为番茄耐热性改造提供了丰富的基因材料,对深... 通过染色体步移技术克隆耐热番茄Hsf24基因,并对该基因及编码蛋白质进行同源性分析。通过Blast分析结果表明,确定该基因具有Hsf基因家族特性,并预测其编码蛋白三级结构。该基因的克隆与分析为番茄耐热性改造提供了丰富的基因材料,对深入研究番茄耐热分子生物学机制具有重要意义。 展开更多
关键词 番茄 Hsf24 染色体步移技术 PCR
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白木香愈创木烯合酶基因(AsSGS)启动子的克隆及功能初步鉴定 被引量：5
13
作者 何访 梅文莉 +3 位作者 李辉亮 郭冬 彭世清 戴好富 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期712-717,共6页
利用染色体步移的方法克隆了一种白木香倍半萜合酶——愈创木烯合酶基因(AsSGS)791 bp的启动子序列,序列分析表明,获得的序列中A/T含量达64.6%,与真核生物启动子序列的特征相符合。该序列除具有启动子核心序列TATA-box和增强子元件CAAT-... 利用染色体步移的方法克隆了一种白木香倍半萜合酶——愈创木烯合酶基因(AsSGS)791 bp的启动子序列,序列分析表明,获得的序列中A/T含量达64.6%,与真核生物启动子序列的特征相符合。该序列除具有启动子核心序列TATA-box和增强子元件CAAT-box等典型的真核生物启动子基本元件外,还含有如赤霉素反应元件GARE-motif、ABA的应答元件G-Box、生长素响应元件TGA-element和脱落酸响应元件ABRE等参与激素调控元件,光应答元件Box I、GA-motif、TCT-motif,热胁迫反应的HSE,厌氧诱导元件ARE和增强诱发厌氧反应的GC-motif等顺式作用元件。利用农杆菌介导的本生烟草瞬时表达系统对所获得的启动子功能进行鉴定,结果表明,所有缺失片段都能驱动β-葡萄糖苷酸酶(GUS)基因表达,GUS活性与启动子片段的长度呈正相关。 展开更多
关键词 白木香 倍半萜合酶 启动子 染色体步移 瞬时表达 β-葡萄糖苷酸酶
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亚心型扁藻叶绿体psbA基因的克隆及序列分析 被引量：5
14
作者 侯士昌 崔玉琳 +2 位作者 温少红 唐志红 秦松 《生物学杂志》 CAS CSCD 2014年第1期1-4,14,共5页
psbA基因是叶绿体基因组中一个重要的光调控基因,编码光和系统Ⅱ反应中心的D1蛋白。根据叶绿体基因组序列高度保守的特性,利用莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)psbA基因的保守序列(基因登录号:HQ667991.1)设计引物,采用PCR步移的方... psbA基因是叶绿体基因组中一个重要的光调控基因,编码光和系统Ⅱ反应中心的D1蛋白。根据叶绿体基因组序列高度保守的特性,利用莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)psbA基因的保守序列(基因登录号:HQ667991.1)设计引物,采用PCR步移的方法从亚心型扁藻(Platymonas subcordiformis)基因组DNA中克隆到psbA基因全长(基因登录号:KF528742)。序列分析表明,亚心型扁藻psbA基因全长1939 bp,编码区长度为1062 bp,推导编码353个氨基酸,包括4个赖氨酸残基。有效密码子数显示psbA基因具有明显的密码子偏好性,并且偏好使用以A/T结尾的密码子。相对同义密码子使用度表明25个密码子在编码使用时具有偏好性,其中20个密码子以A/T碱基结尾,占到80%。其终止密码子使用了TAG。 展开更多
关键词 亚心型扁藻(Platymonas subcordiformis) PCR步移 PSBA基因 序列分析
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树舌灵芝免疫调节蛋白基因克隆,生物信息学分析及真核表达载体构建 被引量：5
15
作者 林景卫 段作文 +6 位作者 关山越 韩笑 范文丽 李浩戈 张丽 陈水森 李天来 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期1-7,共7页
树舌灵芝(Ganoderma applanatum)为灵芝属内独特的一类,克隆树舌灵芝免疫调节蛋白(fungal immunomodulatory protein,FIP)基因,对其进行生物信息学分析并构建真核表达载体,将为高效表达重组树舌灵芝FIP和揭示其生物学功能奠定基础。采... 树舌灵芝(Ganoderma applanatum)为灵芝属内独特的一类,克隆树舌灵芝免疫调节蛋白(fungal immunomodulatory protein,FIP)基因,对其进行生物信息学分析并构建真核表达载体,将为高效表达重组树舌灵芝FIP和揭示其生物学功能奠定基础。采用染色体步移的方法从树舌灵芝菌丝体基因组DNA中扩增得到1个新型真菌免疫调节蛋白基因—FIP-gap,对其核苷酸序列进行生物信息学分析,结果表明,FIP-gap基因属于灵芝属FIP家族,含有342 bp,编码113个氨基酸。对其氨基酸序列分析表明:树舌灵芝免疫调节蛋白FIP-gap分子量为12.7 k D,理论等电点为4.93,富含丝氨酸,缬氨酸和苏氨酸,不含组氨酸和半胱氨酸。另外将FIP-gap与其他灵芝属FIP进行蛋白质序列比对分析,其具有FIP典型的保守序列,并与灵芝(G.lucidum)、松杉灵芝(G.tsugae)、紫灵芝(G.japoncium)、紫芝(G.sinensis)、小孢子灵芝(G.microsporum)和黑灵芝(G.atrum)具有78%、78%、78%、79%、78%和77%的同源性,为一新型的FIP。构建灵芝属真菌免疫调节蛋白系统进化树,结果表明树舌灵芝FIP-gap与其他灵芝属FIP均不聚类,说明其与其他灵芝属FIP的亲缘性相对较远。同时,构建了毕赤酵母重组表达载体p PIC9-FIP-gap,为进一步研究FIP-gap的生物学功能提供基础,为全面了解真菌免疫调节蛋白提供理论依据。 展开更多
关键词 树舌灵芝 真菌免疫调节蛋白 生物信息学分析 染色体步移 基因克隆 真核表达
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草鱼α-淀粉酶基因5'侧翼序列克隆与分析 被引量：3
16
作者 朱书礼 李新辉 +4 位作者 杨计平 李跃飞 李捷 帅方敏 李琳 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期87-93,共7页
应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼（Ctenopharyngodon idellus）α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2 063 bp的5＇侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对,相似度为68%... 应用PCR和Genome Walking技术克隆获得长度为168 bp的草鱼（Ctenopharyngodon idellus）α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列和2 063 bp的5＇侧翼序列。将草鱼α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列与已知几种鱼类α-淀粉酶基因外显子Ⅰ序列比对,相似度为68%～86%。将草鱼α-淀粉酶基因5＇侧翼序列进行生物信息学分析,确定了其转录起始区域及转录起始位点（TSS）;在TSS上游30 bp处有1个TATA-box,-58 bp处有CCAAT-box;在5＇侧翼序列中还发现有GATA-1、OCT-1、GR、HNF-3、AP1和SP1等转录因子结合位点。草鱼α-淀粉酶基因5＇侧翼序列的克隆,为进一步研究不同食性鱼类α-淀粉酶基因侧翼序列的差异、鱼类α-淀粉酶基因的表达、功能及调控机理奠定基础。 展开更多
关键词 草鱼 Α-淀粉酶基因 genome walking 5'侧翼序
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转基因马铃薯外源基因插入位点分析及检测方法的建立 被引量：4
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作者 闫建俊 白云凤 +3 位作者 左静静 李萌 左敏 裴成成 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第16期5361-5366,共6页
09-4为本实验室构建的抗马铃薯PRLV的RNAi基因和特异切割马铃薯PSTVd的核酶基因无标记双价表达载体p CAMBIA3301-DR-IS导入马铃薯中获得的转基因无性系。本研究通过染色体步移获取转基因无性系09-4的插入位点左边界旁侧序列,对获得的左... 09-4为本实验室构建的抗马铃薯PRLV的RNAi基因和特异切割马铃薯PSTVd的核酶基因无标记双价表达载体p CAMBIA3301-DR-IS导入马铃薯中获得的转基因无性系。本研究通过染色体步移获取转基因无性系09-4的插入位点左边界旁侧序列,对获得的左边界序列进行分析,扩增获得片段大小为382 bp,包括转化载体序列119 bp及转基因马铃薯的旁侧序列263 bp;依据转化马铃薯的RNAi基因和左旁侧序列分别设计引物,扩增出大小为300 bp的片段,建立了09-4转基因无性系特异性标识和特异PCR检测方法,为转基因马铃薯的检测和身份识别提供技术基础。 展开更多
关键词 转基因马铃薯 染色体步移 事件特异性检测
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花生蔗糖合成酶基因的克隆及序列分析 被引量：4
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作者 何美敬 刘立峰 +3 位作者 穆国俊 侯名语 陈焕英 崔顺立 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2012年第4期23-28,共6页
蔗糖合成酶(Sucrose Synthase,SuSy)是蔗糖代谢途径中的关键酶,在植物生长、发育和渗透调节过程中起着重要作用。为揭示蔗糖合成酶基因在花生中的抗逆机理,以花生基因组DNA为模板,利用染色体步移技术(GenomeWalking)中的TAIL-PCR技术扩... 蔗糖合成酶(Sucrose Synthase,SuSy)是蔗糖代谢途径中的关键酶,在植物生长、发育和渗透调节过程中起着重要作用。为揭示蔗糖合成酶基因在花生中的抗逆机理,以花生基因组DNA为模板,利用染色体步移技术(GenomeWalking)中的TAIL-PCR技术扩增花生SuSy基因组序列和启动子区域,得到基因组序列6 189 bp,启动子预测分析表明,该序列包含约800 bp的启动子上游调控序列,13个外显子,12个内含子。启动子元件分析显示,该片段含有典型的TATA-box、CAAT-box,并存在低温响应元件LTR、GA响应元件、干旱响应MYB结合位点、厌氧诱导必要的顺式作用元件ARE等调控元件,及G-box、box4等光响应元件,说明花生SuSy基因的表达可能受低温、干旱、缺氧、光照等环境因素以及激素GA的调控。 展开更多
关键词 花生 蔗糖合成酶 基因克隆 启动子 染色体步移
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两种策略分别克隆紫花苜蓿光敏色素A、B基因 被引量：4
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作者 李平 杨玲玲 +4 位作者 陈其新 史莹华 严学兵 陈占宽 王成章 《草业学报》 CSCD 北大核心 2011年第6期85-92,共8页
短日照是苜蓿秋眠性的主要影响因子,故苜蓿秋眠被认为是一种光周期反应。光敏色素是光周期反应的主要受体,因而探究光敏色素与苜蓿秋眠性之间的关系可能是揭示苜蓿秋眠性机理的有效途径之一。紫花苜蓿光敏色素A、B基因尚未被克隆,本研... 短日照是苜蓿秋眠性的主要影响因子,故苜蓿秋眠被认为是一种光周期反应。光敏色素是光周期反应的主要受体,因而探究光敏色素与苜蓿秋眠性之间的关系可能是揭示苜蓿秋眠性机理的有效途径之一。紫花苜蓿光敏色素A、B基因尚未被克隆,本研究采用2种不同的试验策略,分别以mRNA和基因组DNA为起点,根据比较基因组学原理和生物信息学方法,利用RACE和染色体步移等手段,克隆得到了紫花苜蓿光敏色素A全长和光敏色素B近全长基因序列,为进一步探讨两者在苜蓿生长发育,特别是苜蓿秋眠性的光周期调控机制中的作用奠定了基础,并为克隆紫花苜蓿其他未知基因等研究提供思路和参考。 展开更多
关键词 紫花苜蓿 蒺藜苜蓿 光敏色素 基因克隆 RACE 染色体步移
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玫烟色棒束孢几丁质酶(Ifuchit2)结构基因及上游序列的克隆与分析 被引量：3
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作者 孟祥云 谢翎 黄勃 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期582-586,共5页
玫烟色棒束孢作为一类可致昆虫死亡的虫生真菌,是生物防治中极具开发应用潜力的种类。运用PCR技术与DNA步移技术,从玫烟色棒束孢中克隆得到几丁质酶的结构基因及其上游序列。结构基因总长1 425 bp,扩出的结构基因DNA与其cDNA比较含有3... 玫烟色棒束孢作为一类可致昆虫死亡的虫生真菌,是生物防治中极具开发应用潜力的种类。运用PCR技术与DNA步移技术,从玫烟色棒束孢中克隆得到几丁质酶的结构基因及其上游序列。结构基因总长1 425 bp,扩出的结构基因DNA与其cDNA比较含有3个内含子,分别位于距离起始密码子的121碱基至176碱基处,277碱基至331碱基处和380碱基至431碱基处,大小分别为54 bp、53 bp和51 bp。在玫烟色棒束孢几丁质酶Ifuchit2结构基因的基础上,克隆得到了其上游序列。该基因上游序列大小为1 794 bp,其中有209 bp与该基因cDNA序列相互重叠。序列分析表明,玫烟色棒束孢几丁质酶Ifuchit2上游序列中,含有真核生物基因典型的TATA-盒,以及多个高度保守的潜在转录因子结合位点,如Oct1、GATA-1、GATA-2和CdxA等。另外,该上游序列还存在一些特异的应答元件,如热激应答元件(HSE)、胁迫应答元件(STRE)等。 展开更多
关键词 基因步移 上游调控序列 应答元件 结构基因
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