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基于改进遗传算法的智能组卷模型优化 被引量:14
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作者 刘怀兰 牛辉 王佳 《华中科技大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第5期82-85,共4页
建立了一种多目标优化的数学模型,并针对标准遗传算法易早熟收敛和进化缓慢的特点,提出了一种改进的组卷遗传算法对模型进行求解.该算法在编码策略、基因修正和算子概率3个方面对标准遗传算法进行了改进.实例分析及仿真验证表明:提出的... 建立了一种多目标优化的数学模型,并针对标准遗传算法易早熟收敛和进化缓慢的特点,提出了一种改进的组卷遗传算法对模型进行求解.该算法在编码策略、基因修正和算子概率3个方面对标准遗传算法进行了改进.实例分析及仿真验证表明:提出的建模方法将组卷成功率提高到100%,算法运行时间降低到300ms以内,总体上极大地提高了智能组卷任务的执行效率,并能够定量地评估和控制组卷质量. 展开更多
关键词 遗传算法 多目标优化 基因编码 基因修正 遗传算子 智能组卷
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航路时空资源分配的多目标优化方法 被引量:10
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作者 田文 杨帆 +1 位作者 尹嘉男 宋津津 《交通运输工程学报》 EI CSCD 北大核心 2020年第6期218-226,共9页
为了提高航空公司与空管方之间的协同决策程度,降低航班延误水平,以航路飞行的航班为研究对象,研究了航路时空资源的多目标分配;考虑实际运行条件下航班的唯一性约束、时间顺序约束和可行性约束的影响,以航班在流量受限区所分配的飞行... 为了提高航空公司与空管方之间的协同决策程度,降低航班延误水平,以航路飞行的航班为研究对象,研究了航路时空资源的多目标分配;考虑实际运行条件下航班的唯一性约束、时间顺序约束和可行性约束的影响,以航班在流量受限区所分配的飞行航迹和进入时隙为决策变量,以航班总延误成本最小和航空公司延误公平损失偏差系数最小为目标函数,构建了多目标非线性0-1整数规划模型;基于模型特点引用了非支配排序遗传算法(NSGA-Ⅱ),并利用排列编码法设计了一种整数基因编码方式,以最大限度保证基因产生可行解集;为了验证模型与算法的有效性,基于南中国海地区航班运行实例,对算法搜寻最优解的性能进行了研究,并将此算法与传统按时刻表分配(RBS)方法进行了对比。研究结果表明:改进编码方式的NSGA-Ⅱ算法使解集种群在约50代后世代距离从600收敛至30并稳定,具有良好的收敛性;针对实例中的多目标优化模型共生成有6组解的帕累托解集,结果有66.7%的概率完全支配RBS方法,且优化结果中航班平均延误成本比RBS方法降低了8.5%,平均公平损失偏差系数降低了70.6%。可见提出的航路时空资源多目标优化方法的执行效果显著,可在降低总延误成本的基础上兼顾各航空公司的公平性,是解决航路飞行航班航迹与时隙资源分配问题的一种有效方法。 展开更多
关键词 空中交通管理 航路资源分配 多目标遗传算法 协同航迹选择程序 帕累托解 基因编码
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吐鲁番传统聚落景观基因谱系构建
3
作者 冶建明 周海燕 +1 位作者 石燕 李肇旗 《住宅科技》 2024年第11期48-54,共7页
吐鲁番市目前正处于城乡建设与旅游业快速发展的时期,然而部分传统聚落原有风貌损毁、结构遭破坏,聚落景观面临严重的保护压力。景观基因理论从地理环境、历史文化等方面对传统聚落进行解析,为系统保护传统聚落景观提供新的视角。文章... 吐鲁番市目前正处于城乡建设与旅游业快速发展的时期,然而部分传统聚落原有风貌损毁、结构遭破坏,聚落景观面临严重的保护压力。景观基因理论从地理环境、历史文化等方面对传统聚落进行解析,为系统保护传统聚落景观提供新的视角。文章以吐鲁番传统聚落为研究对象,依据景观基因理论,识别吐鲁番传统聚落的环境特征、布局特征、建筑特征和文化特征景观基因。运用景观基因编码技术将景观基因编码,构建传统聚落景观基因编码模型,形成吐鲁番传统聚落景观基因信息库,有利于吐鲁番传统聚落的本土化景观营造与建设,为吐鲁番传统聚落系统化保护与发展提供科学理论指导。 展开更多
关键词 传统聚落 保护与发展 规划建设 景观基因 基因识别 基因编码 基因谱系构建
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嗜热子囊菌原变种Thermoascus aurantiacus var.aurantiacus热稳定几丁质酶的克隆表达及活性研究 被引量:5
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作者 张婕 谢晨 +1 位作者 郭晓红 李多川 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期691-697,共7页
研究通过RT-PCR和Tail-PCR技术从嗜热子囊菌原变种Thermoascus aurantiacus var.aurantiacus中克隆了一个几丁质酶同源基因。该基因全长1,253bp,包含一个由1,197个碱基构成的开放阅读框,编码398个氨基酸。序列比对分析表明,该基因编码... 研究通过RT-PCR和Tail-PCR技术从嗜热子囊菌原变种Thermoascus aurantiacus var.aurantiacus中克隆了一个几丁质酶同源基因。该基因全长1,253bp,包含一个由1,197个碱基构成的开放阅读框,编码398个氨基酸。序列比对分析表明,该基因编码蛋白属于糖苷水解酶18家族的几丁质酶。利用基因重组的方法构建酵母分泌型表达载体,并转化毕赤酵母。在甲醇的诱导下,重组蛋白得到了高效表达,第6天的表达量最高,达到0.433g/L,酶活力为28.96U/mg,同时对表达的几丁质酶进行了纯化,SDS-PAGE检测该蛋白的分子量为43.9kDa。该几丁质酶的最适反应温度为60℃,最适反应pH值为8.0,70℃处理30min仍有45%的相对酶活,具有较好的热稳定性及工业应用价值。 展开更多
关键词 几丁质 嗜热真菌 嗜热酶 编码基因 毕赤酵母
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草菇多酚氧化酶基因的克隆与表达分析 被引量:2
5
作者 刘明 刘海峰 +3 位作者 周慧 何焕清 肖自添 罗学梅 《广东农业科学》 CAS 2021年第9期91-97,共7页
【目的】解析草菇多酚氧化酶基因家族序列信息,明确其特征和表达模式。【方法】通过转录组测序找出含有酪氨酸酶结构域的基因,并根据搜索得到的序列设计引物,以不同发育时期的草菇v26菌株,以及草菇蛋形期外菌膜、菌盖、菌柄等不同组织... 【目的】解析草菇多酚氧化酶基因家族序列信息,明确其特征和表达模式。【方法】通过转录组测序找出含有酪氨酸酶结构域的基因,并根据搜索得到的序列设计引物,以不同发育时期的草菇v26菌株,以及草菇蛋形期外菌膜、菌盖、菌柄等不同组织为材料提取RNA,经反转录为cDNA,扩增获得草菇多酚氧化酶基因序列。采用在线生物信息学网站预测草菇多酚氧化酶的理化性质。采用RT-PCR的方法,检测草菇不同发育时期和不同组织部位多酚氧化酶的表达模式。【结果】获得4个草菇多酚氧化酶基因家族的CDS序列,依次命名为VvPPO1、VvPPO2、VvPPO3、VvPPO4,其中VvPPO1 CDS全长1596 bp、编码531个氨基酸,VvPPO2 CDS全长2685 bp、编码894个氨基酸,VvPPO3 CDS全长1593 bp、编码530个氨基酸,VvPPO4 CDS全长2067 bp、编码688个氨基酸。生物信息学分析表明,4个基因编码的蛋白均含有2个铜离子结合区,为亲水性蛋白;RT-PCR结果显示,4个基因在草菇发育的菌丝期、原基期、蛋形期、成熟期均有表达,VvPPO1、VvPPO3和VvPPO4的表达量在子实体时期高于菌丝期,在蛋形期VvPPO1和VvPPO4在外菌膜的表达量比在菌柄和菌盖中的表达量高。【结论】在草菇中搜索得到4个多酚氧化酶基因,均含有2个铜离子结合区,4个基因在各个发育时期均有表达。 展开更多
关键词 草菇 多酚氧化酶 褐变 表达分析 基因编码
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人脑中脱碘酶相互作用蛋白的筛选与验证 被引量:1
6
作者 张毅哲 刘琼 +1 位作者 田静 邵永红 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS 北大核心 2011年第5期423-429,共7页
阐述人脑内硒蛋白在维护细胞正常功能、抵御氧化损伤和预防脑疾病方面的重要作用,指出脱碘酶3是人脑中一种重要的硒蛋白.克隆了人脱碘酶3的开放读码框,将其编码区中编码硒代半胱氨酸的TGA码突变为编码半胱氨酸的密码,以脱碘酶3突变体为&... 阐述人脑内硒蛋白在维护细胞正常功能、抵御氧化损伤和预防脑疾病方面的重要作用,指出脱碘酶3是人脑中一种重要的硒蛋白.克隆了人脱碘酶3的开放读码框,将其编码区中编码硒代半胱氨酸的TGA码突变为编码半胱氨酸的密码,以脱碘酶3突变体为"诱饵",利用酵母双杂交系统从人胎脑cD-NA文库中筛选一个能与脱碘酶3相互作用的蛋白,即人丝氨酸蛋白酶抑制剂A族蛋白3.采用荧光共振能量转移技术中的敏化发射法和荧光寿命法,验证了人脑中脱碘酶的相互作用. 展开更多
关键词 基因工程 硒蛋白 脱碘酶3 大脑 基因编码 酵母双杂交系统 蛋白质筛选 荧光共振能量转移技术
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具有遗传性疾病和性状的遗传位点分析 被引量:1
7
作者 王宇琛 赵诗瑶 《数学的实践与认识》 北大核心 2017年第14期78-88,共11页
随着信息技术的进步和发展,现代生物学越来越多地将这些技术用于大规模生物数据的收集、分析、挖掘等过程.大量计算机技术,特别是统计方法被用来进行复杂疾病的分析.大量研究表明,人体的许多表型性状差异以及对药物和疾病的易感性等都... 随着信息技术的进步和发展,现代生物学越来越多地将这些技术用于大规模生物数据的收集、分析、挖掘等过程.大量计算机技术,特别是统计方法被用来进行复杂疾病的分析.大量研究表明,人体的许多表型性状差异以及对药物和疾病的易感性等都可能与某些位点相关联,或和包含有多个位点的基因相关联.因此,定位与性状或疾病相关联的位点在染色体或基因中的位置,能帮助研究人员了解性状和一些疾病的遗传机理,也能使人们对致病位点加以干预,防止一些遗传病的发生.利用随机森林方法、Bootstrap重抽样、logistic回归等大数据分析方法,意在解决优化生物学位点关联性分析中单一致病位点识别、多位点相互作用和多性状位点关联性分析等子问题. 展开更多
关键词 基因编码 LOGISTIC回归 多重假设检验 PERMUTATION test
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细胞工厂氧化还原状态的荧光探针检测与调控 被引量:1
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作者 俞杰 秦磊 +2 位作者 许可 冯旭东 李春 《生物加工过程》 CAS 2020年第1期60-69,共10页
氧化还原反应贯穿于细胞的整个生命历程,与细胞的新陈代谢息息相关。细胞的氧化还原平衡对细胞的能量代谢、生长代谢及合成代谢有着重要的影响。因此,细胞氧化还原状态的实时监测以及调控对于细胞工厂的高效生产有着重要意义。由于参与... 氧化还原反应贯穿于细胞的整个生命历程,与细胞的新陈代谢息息相关。细胞的氧化还原平衡对细胞的能量代谢、生长代谢及合成代谢有着重要的影响。因此,细胞氧化还原状态的实时监测以及调控对于细胞工厂的高效生产有着重要意义。由于参与氧化还原反应的物质种类多、活性高、寿命短且相关代谢网络复杂,氧化还原状态的实时监测与调控一直是研究的热点与难点。本文中,笔者通过对影响细胞氧化还原反应的代谢物进行分析,以基因编码的荧光探针为主,介绍了检测细胞氧化还原状态的荧光探针,并阐述了调控氧化还原状态的常用方法及其在细胞工厂中的应用,为更好地实现细胞工厂的高效生物转化奠定基础。 展开更多
关键词 氧化还原状态 荧光探针 基因编码 氧化还原调控 细胞工厂
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利用重组大肠杆菌发酵甘油合成L-丙氨酸
9
作者 周丽 邓璨 +2 位作者 崔文璟 刘中美 周哲敏 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2015年第12期235-241,共7页
本文探究以甘油为唯一碳源发酵合成L-丙氨酸的可行性。以删除了乙酸、甲酸、乙醇、琥珀酸、乳酸代谢产物合成途径的Escherichia coli B0016-050为出发菌株,用λpL启动子及其调控下的嗜热脂肪芽孢杆菌(Geobacillus stearothermophilus)... 本文探究以甘油为唯一碳源发酵合成L-丙氨酸的可行性。以删除了乙酸、甲酸、乙醇、琥珀酸、乳酸代谢产物合成途径的Escherichia coli B0016-050为出发菌株,用λpL启动子及其调控下的嗜热脂肪芽孢杆菌(Geobacillus stearothermophilus)来源的丙氨酸脱氢酶基因(ala D)替换B0016-050菌株染色体上丙氨酸消旋酶基因(dad X),获得温度控制型L-丙氨酸合成菌株B0016-060BC。菌株B0016-060BC以甘油为唯一碳源进行两阶段发酵(包括菌体生长阶段和L-丙氨酸合成阶段),表明在菌体生长至对数后期起始L-丙氨酸合成或者提高L-丙氨酸发酵阶段的通气量可提高L-丙氨酸合成水平。进一步经5 L发酵罐发酵,可合成63.64 g/L L-丙氨酸,整个发酵阶段体积生产强度达到1.91 g/(L·h)、转化率达到62.89 g/100 g甘油,仅合成少量的乙酸(1.73 g/L)等副产物。实现了以甘油为唯一碳源高效合成L-丙氨酸,为工业应用提供了重要参考。 展开更多
关键词 L-丙氨酸 甘油 大肠杆菌 发酵 代谢工程 基因开关
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PSTI1可提高大肠杆菌应答胁迫能力
10
作者 刘士德 陈汗英 +5 位作者 张建华 田生礼 李水明 李慧丽 李明华 邢苗 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS 北大核心 2011年第4期347-355,共9页
指出含典型34肽重复序列结构域(tetratricopeptide repeat,TPR)的胁迫诱导蛋白(stress-in-ducible protein-1,STI1)是真核生物特有的一类与胁迫应答有关的分子伴侣蛋白.作者从多头绒泡菌分离出一个STI1类似蛋白cDNA,因其编码蛋白含有两... 指出含典型34肽重复序列结构域(tetratricopeptide repeat,TPR)的胁迫诱导蛋白(stress-in-ducible protein-1,STI1)是真核生物特有的一类与胁迫应答有关的分子伴侣蛋白.作者从多头绒泡菌分离出一个STI1类似蛋白cDNA,因其编码蛋白含有两个非典型的TPR结构域,命名为PSTI1.为了解PSTI1对原核生物胁迫应答功能的影响,观察表达PSTI1的大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)与原菌株的增殖差异,发现PSTI1表达菌耐受盐、渗透压、重金属离子、氧化、缺氧和酸碱变化胁迫的能力均增强,但对高温敏感.PSTI1保守结构域TPR1能提高E.coli耐受渗透压胁迫的能力,但TPR2会使E.coli对盐和渗透压胁迫敏感,说明TPR1和TPR2在PSTI1调控胁迫应答中可能扮演不同角色.通过pull-down和质谱分析技术检测了与PSTI1作用的E.coli蛋白,发现PSTI1能与E.coli的HtpG(Hsp90)、La蛋白酶和过氧化氢酶HpII等作用,说明PSTI1具有原核生物非典型TPR结构域蛋白的类似功能,是类似STI1的胁迫应答蛋白. 展开更多
关键词 微生物细胞生物学 多头绒泡菌 STI1类似蛋白 CDNA文库 大肠杆菌 胁迫应答 真菌 基因工程 基因编码
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基于基因编码算法的图像边缘提取研究
11
作者 邵明省 《成都大学学报(自然科学版)》 2016年第2期153-155,共3页
为了提高图像边缘检测的质量,采用基因编码算法.首先确定基因头部和尾部的组成,给出了基因表达式树形式,对图像像素进行基因编码,接着图像背景与图像目标之间的灰度差异作为基因表达式树不同的分支,与分支具有同样灰度的像素合并为一类... 为了提高图像边缘检测的质量,采用基因编码算法.首先确定基因头部和尾部的组成,给出了基因表达式树形式,对图像像素进行基因编码,接着图像背景与图像目标之间的灰度差异作为基因表达式树不同的分支,与分支具有同样灰度的像素合并为一类,最后给出了基因编码适应度函数,其选择基于标准误差方法.实验仿真表明,算法提取的灰度图像边缘没有断点,没有伪边缘信息,数据分析较好. 展开更多
关键词 基因编码 像素 边缘提取
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基于概率分布的动态矩阵演化算法
12
作者 谭阳 方颂 陈琳 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期147-154,共8页
传统演化算法通常以宏观层面的种群之间或个体之间的相互作用来进行协同演化,较少考虑个体基因编码在微观层面进行局部优化时的相互作用。针对该情况,提出基于种群基因分布结构的动态矩阵演化算法。利用二进制基因矩阵的方式构建种群个... 传统演化算法通常以宏观层面的种群之间或个体之间的相互作用来进行协同演化,较少考虑个体基因编码在微观层面进行局部优化时的相互作用。针对该情况,提出基于种群基因分布结构的动态矩阵演化算法。利用二进制基因矩阵的方式构建种群个体,结合基因编码差异及适应度评价种群个体,通过对比种群基因列决定个体基因结构调整的位置,并根据优势种群的基因结构产生下一代个体,通过微观层面上基因位之间的协同作用引导种群的演化。实验结果表明,该算法对于中、高维函数均表现出良好的优化性能,同时能较好地平衡宏观全局优化和微观局部优化之间的关系。 展开更多
关键词 演化算法 基因编码 矩阵 概率分布 全局优化
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基于遗传算法的组卷设计与实现
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作者 李晓杰 《现代计算机》 2013年第22期57-60,共4页
遗传算法作为一种基于进化过程中的信息遗传机制和优胜劣汰的自然选择原则的搜索算法,可以为组卷问题的求解提供有效的途径。在充分借鉴背包问题的设计思想基础上,将试题转化为基因编码,通过遗传算法对基因进行编码,将实际问题中的试题... 遗传算法作为一种基于进化过程中的信息遗传机制和优胜劣汰的自然选择原则的搜索算法,可以为组卷问题的求解提供有效的途径。在充分借鉴背包问题的设计思想基础上,将试题转化为基因编码,通过遗传算法对基因进行编码,将实际问题中的试题转化为计算机可以识别的变量,然后采用二进制编码方法设计一套在线考试系统,并通过数值实验说明该系统具有很好的可行性和有效性。 展开更多
关键词 遗传算法 组卷问题 基因编码 二进制编码
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乙型肝炎病毒基因组S区编码产物的检测及临床意义 被引量:61
14
作者 黄学忠 吴祥 +1 位作者 黄秀琴 潘虎 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2002年第1期33-34,共2页
为了进一步明确 HBV基因组 S区编码产物对乙型病毒性肝炎诊断的临床价值,用双抗体夹心 ELISA法检测 90份乙型病毒性肝炎患者血清标本HBsAg·PHSA-Re、Pre-S1和 Pre-S2,并与 HBVM及 HB... 为了进一步明确 HBV基因组 S区编码产物对乙型病毒性肝炎诊断的临床价值,用双抗体夹心 ELISA法检测 90份乙型病毒性肝炎患者血清标本HBsAg·PHSA-Re、Pre-S1和 Pre-S2,并与 HBVM及 HBVDNA PCR进行对比分析。结果以抗 HBc、HBsAg·PHSA-Re、HBVDNA(PCR)及 Pre-S2的阳性检出率为最高,分别为87.8%、73.3%、72.2%和64.4%,以HBVDNA作为HBV感染的金标准,无显著性差异(P>0.05);其中HBsAg·PHSA-Re与 HBVDNA和HBeAg的符合率最高,分别为 76.7 %和 74.7 %;MBsAg·PHSA-Re与 HBVDNA具有高度相关性。HBsAg·PHSA-Re做为早期诊断HBV感染及判断是否具有传染性方面,是一项非常重要的血清学指标,Pre-S2也可作为HBV复制活跃的标志之一,用于急慢性肝炎的预后判断. 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 病毒基因 基因编码产物 诊断
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海参i型溶菌酶基因及其编码产物的结构特点 被引量:18
15
作者 杨西建 丛丽娜 +2 位作者 路美玲 刘恒 朱蓓薇 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期542-547,共6页
通过RT-PCR和RACEPCR技术,从海参(Stichopus japonicus)体壁中克隆得到一种溶菌酶基因(GenBank:EF036468).生物信息软件分析表明,其中全长cDNA为713bp,5′非编码区(UTR)246bp,3′UTR29bp,开放阅读框438bp,编码145个氨基酸,包括溶菌酶成... 通过RT-PCR和RACEPCR技术,从海参(Stichopus japonicus)体壁中克隆得到一种溶菌酶基因(GenBank:EF036468).生物信息软件分析表明,其中全长cDNA为713bp,5′非编码区(UTR)246bp,3′UTR29bp,开放阅读框438bp,编码145个氨基酸,包括溶菌酶成熟肽124个氨基酸和信号肽21个氨基酸.对海参溶菌酶与多种无脊椎动物的c、g和i型溶菌酶进行分析比较,发现它与i型溶菌酶有较高的同源性,并具有i型溶菌酶高度保守的2个活性位点,即Glu34和Ser50.活性位点附近具有i型溶菌酶的一段特有的氨基酸保守序列MDVGSLSCG(P/Y)(Y/F)QIK,所以推断克隆的海参溶菌酶为i型.另外,通过搜索蛋白保守结构域数据库,发现海参溶菌酶与医用水蛭失稳酶相似性最高,并且这2个酶的三级结构模型也极其相似.因此推测,海参i型溶菌酶具有双功能特性,既能作用于细菌细胞壁的糖苷键使细胞裂解,又具有失稳酶的一些生化功能,能够水解纤维蛋白,这些特点在海参自溶过程中发挥重要的作用. 展开更多
关键词 海参 溶菌酶 基因编码产物结构 失稳酶
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编码天麻抗真菌蛋白cDNA的分子克隆 被引量:11
16
作者 舒群芳 孙勇如 徐锦堂 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1995年第9期685-690,共6页
用重组DNA 技术研究了编码天麻抗真菌蛋白(GAFP)的基因,从天麻(Gastrodia elataBl.)块茎中提取Poly(A) m RNA 后合成cDNA,构建成表达型cDNA 文库,用纯化的蛋白质探针通过免疫筛选找... 用重组DNA 技术研究了编码天麻抗真菌蛋白(GAFP)的基因,从天麻(Gastrodia elataBl.)块茎中提取Poly(A) m RNA 后合成cDNA,构建成表达型cDNA 文库,用纯化的蛋白质探针通过免疫筛选找出对应的cDNA 克隆。在进一步证明所选用的cDNA 克隆含有重组的λ-phage DNA 后,提取和纯化含有插入片段重组子的DNA,用Eco RI酶切分析可见插入片段。 展开更多
关键词 天麻 抗真菌蛋白 CDNA 分子克隆 药用植物
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旋毛虫肌幼虫分泌性蛋白P49基因的克隆与表达 被引量:3
17
作者 赵凌 孟宪荣 +5 位作者 栗绍文 石德时 华安龙 孙锡斌 毕丁仁 王桂枝 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2003年第7期7-10,共4页
通过设计、合成引物,以旋毛虫RNA为模板,用RT-PCR法扩增出旋毛虫P49序列,并进行了序列测定。将P49基因亚克隆至表达载体pET-28b中,转化大肠杆菌BL21感受态细胞,经IPTG诱导表达,作SDS-PAGE及Western blot分析。结果表明,PCR法扩增出P49序... 通过设计、合成引物,以旋毛虫RNA为模板,用RT-PCR法扩增出旋毛虫P49序列,并进行了序列测定。将P49基因亚克隆至表达载体pET-28b中,转化大肠杆菌BL21感受态细胞,经IPTG诱导表达,作SDS-PAGE及Western blot分析。结果表明,PCR法扩增出P49序列,其大小约为960bp,将构建的重组质粒pGEM-P49进行序列测定表明其与Genbank中的P49序列具有高度的同源性。成功构建了重组表达载体pET-P49;SDS-PAGR及Western blot分析表明,表达产物分子量约为38kDa,约占菌体总蛋白的7%左右,且能被感染旋毛虫猪阳性血清所识别。 展开更多
关键词 旋毛虫 幼虫 分泌性蛋白 P49基因 基因克隆 基因表达 人畜共患病
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诺卡氏菌株C-14-1中腈水解酶基因的鉴定、测序及分析 被引量:3
18
作者 方萍 徐德强 +4 位作者 张亚雷 曹薇寰 赵建夫 朱颖旻 覃重军 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1414-1417,共4页
从腈纶废水中分离到高效降解多种污染物的诺卡氏菌株C-14-1,并对该菌中腈水解酶的基因进行鉴定和测序.利用红球菌中腈水解酶氨基酸保守区设计核苷酸引物,以菌株C-14-1的总DNA为模板,PCR扩增发现一条预期大小的DNA带.Southern杂交显示基... 从腈纶废水中分离到高效降解多种污染物的诺卡氏菌株C-14-1,并对该菌中腈水解酶的基因进行鉴定和测序.利用红球菌中腈水解酶氨基酸保守区设计核苷酸引物,以菌株C-14-1的总DNA为模板,PCR扩增发现一条预期大小的DNA带.Southern杂交显示基因组中存在一个腈水解酶基因.进一步构建基因文库和菌落原位杂交,克隆到一个约4·5kb的DNA片段.DNA序列测定和分析表明,该DNA片段携带长度为1143bp的腈水解酶基因.比对分析表明,该基因与国际上发表的红球菌和诺卡氏菌中的腈水解酶基因高度相似. 展开更多
关键词 诺卡氏菌 腈水解酶基因 DNA序列测定
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1-甲基环丙烯处理对采后紫背天葵抗氧化系统的影响 被引量:4
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作者 张飞 石洁 +1 位作者 谢意通 姜丽 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第1期164-170,共7页
本实验通过感官品质测定、生化指标分析、抗氧化酶活力测定以及抗氧化相关基因转录水平分析,研究10μL/L 1-甲基环丙烯处理6 h对常温贮藏紫背天葵抗氧化系统的影响。结果表明:1-甲基环丙烯处理提高了紫背天葵的感官品质,抑制了呼吸强度... 本实验通过感官品质测定、生化指标分析、抗氧化酶活力测定以及抗氧化相关基因转录水平分析,研究10μL/L 1-甲基环丙烯处理6 h对常温贮藏紫背天葵抗氧化系统的影响。结果表明:1-甲基环丙烯处理提高了紫背天葵的感官品质,抑制了呼吸强度,减少了超氧阴离子和过氧化氢的积累,保持了抗坏血酸和谷胱甘肽含量,同时在不同的贮藏时间总体上不同程度地上调了抗氧化酶相关基因(GbSOD、GbAPX1、GbCAT、GbGR)的相对表达量并提高了超氧化物歧化酶、抗坏血酸过氧化物酶、过氧化氢酶、谷胱甘肽还原酶的活性,从而提高了抗氧化能力,延缓了采后紫背天葵衰老进程。本研究从抗氧化物质、抗氧化酶活性和相关基因的转录水平角度揭示了1-甲基环丙烯处理对紫背天葵抗氧化系统的影响,为后续进一步研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 1-甲基环丙烯 紫背天葵 抗氧化系统 抗氧化酶相关基因 实时荧光定量多聚核苷酸链式反应
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Extended triplet set C_(343) of DNA sequences and its application to the p53 gene 被引量:2
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作者 闫艳艳 朱平 《Chinese Physics B》 SCIE EI CAS CSCD 2011年第1期689-697,共9页
Recently, much research has indicated that more and more cancers pose a threat to human life. Cancers are caused by oncogenes. Many human oncogenes have been found and most of them are located on chromosomes. The disc... Recently, much research has indicated that more and more cancers pose a threat to human life. Cancers are caused by oncogenes. Many human oncogenes have been found and most of them are located on chromosomes. The discovery of the oncogene plays a significant role in the treatment of cancer. The p53 tumor suppressor gene has received much attention because it frequently mutates or deletes in tumor cells of most people. Thus, the study of oncogenes is significant. In order to establish the Galois field (GF(7)), the indefinite gene is introduced as D and oncogene is introduced as O, and P. Taking the polynomial coefficients a0, a1, a2 ∈ GF(7) and the bijective function f: GF(7) → {D, A, C, O, G, T, P}, where f(0) = D, f(1) = A, f(2) = C, f(3) = O, f(4) = G, f(5) = T, and f(6)= P, the bijective → may be written as φ(a0 +a1x + a2x2). Based on the algebraic structure, we can not only analyse the DNA sequence of oncogenes, but also predict possible new cancers. 展开更多
关键词 ONCOgene gene encoding algebraic POLYNOMIAL p53
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