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栀子炭疽病接种诱导的转录组研究
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作者 罗光明 朱佩 +3 位作者 柴华文 王梦超 龚伟伟 罗扬婧 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期2746-2750,共5页
目的 探讨栀子在炭疽病侵染时的应答机制。方法 选用炭疽病病原菌侵染后3个时间点的栀子叶片,使用高通量Solexa/Illumina转录组测序技术进行转录组测序分析,筛选差异表达基因。结果 借助RNA-seq技术共分别鉴定出19712、18318、17921个... 目的 探讨栀子在炭疽病侵染时的应答机制。方法 选用炭疽病病原菌侵染后3个时间点的栀子叶片,使用高通量Solexa/Illumina转录组测序技术进行转录组测序分析,筛选差异表达基因。结果 借助RNA-seq技术共分别鉴定出19712、18318、17921个差异表达基因。其中29890条All-Unigene在GO分类中得到注释,KEGG代谢通路分析表示1003条参与了169个代谢途径。GO注释显示,这些差异基因主要参与了细胞过程(cellular process)、代谢过程(metabolic process)、单细胞生物过程(single-organism process)、逆境响应(response to stimulus)、生物学调节(biological regulation)等生物过程;所处细胞器(organelle)、细胞(cell)类的基因占大多数;并执行了结合(binding)、催化活性(catalytic activity)、运输活性(transporter activity)等分子功能。qRT-PCR验证结果与转录组测序结果基本一致,说明栀子在遭受炭疽病病原菌胁迫后,大量基因被抑制或诱导转达,转录组特征发生显著变化。结论 研究获得的转录组数据将有助于揭示栀子生长发育以及抗炭疽病胁迫的应答机制和分子基础,及相关抗病基因的挖掘研究。 展开更多
关键词 栀子 炭疽病 转录组
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