-
题名大豆基因组GmGAI同源基因的生物信息学分析
- 1
-
-
作者
宋仙萍
赵琳
张彦威
卢清瑶
谷月娇
李文滨
-
机构
东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室
-
出处
《大豆科学》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第6期869-873,877,共6页
-
基金
国家自然科学基金(31101169,30971810)
转基因生物新品种培育科技重大专项(2011ZX08004-005)
-
文摘
利用Phytozome数据库、NCBI站和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycine max)基因组中GAI(GA insensitive)同源基因进行生物信息学分析,发现大豆GAI基因有7个拷贝,都不含有内含子,分别分布于第4、5、6、8、10、11和18号染色体上,它们都属于GRAS家族,都存在DELLA(34-106)和GRAS(158-513)2个结构域。氨基酸序列比对和系统进化树分析表明,大豆GAI的7个拷贝进化距离并不是最近的,而是分别有与之最近的其他物种,推测大豆GAI的7个拷贝在进化的过程中功能上发生了一些变化,对植物的生长发育可能会产生不同的影响。
-
关键词
大豆
GAI基因
DELLA结构域
gras结构域
-
Keywords
Soybean
GAI
DELLA domain
gras domain
-
分类号
S565.1
[农业科学—作物学]
-
