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5个山羊品种GoLA-DQA1基因的多态性分析 被引量：10
1
作者 李俊营 陈宏 +3 位作者 蓝贤勇 闵令江 雷初朝 胡沈荣 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2008年第1期33-37,共5页
【目的】比较和揭示崂山奶山羊、西农萨能奶山羊、关中奶山羊、板角山羊和贵州白山羊5个地方山羊品种GoLA-DQA1基因的遗传多态性。【方法】采用PCR-RFLP技术对5个山羊品种231个样本的GoLA-DQA1基因部分内含子1、外显子2和部分内含子2的3... 【目的】比较和揭示崂山奶山羊、西农萨能奶山羊、关中奶山羊、板角山羊和贵州白山羊5个地方山羊品种GoLA-DQA1基因的遗传多态性。【方法】采用PCR-RFLP技术对5个山羊品种231个样本的GoLA-DQA1基因部分内含子1、外显子2和部分内含子2的385 bp片段进行了多态性分析,运用Popgen32软件计算了相应的遗传参数。【结果】在TaqⅠ-RFLP位点上,5个山羊品种A、B等位基因频率的平均值分别为0.846和0.154,A为优势等位基因;除了关中奶山羊和崂山奶山羊外,其他品种在该位点上均处于Hardy-Weinberg平衡状态。在HaeⅢ-RFLP位点上,5个山羊品种M、N等位基因频率的平均值分别为0.819和0.181,M为优势等位基因,5个山羊品种在该位点上均处于Hardy-Weinberg平衡状态。经双酶切分析,共发现9种组合基因型,其中AAMM、ABMM和AAMN 3种组合基因型存在于5个品种中。遗传参数分析表明,GoLA-DQA1基因外显子2的2个酶切位点在西农萨能奶山羊表现为中度多态,而在其他品种表现为低度多态。【结论】5个山羊品种GoLA-DQA1基因外显子2在TaqⅠ和HaeⅢ2个酶切位点具有较低的遗传多样性。 展开更多
关键词 山羊 gola-dqa1基因 PCR-RFLP 基因多态性
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贵州白山羊GOLA-DQA1基因多态性及其与血液免疫指标的关联性 被引量：10
2
作者 刘彬 蔡惠芬 +5 位作者 康建兵 钱成 黄兰 孙岩岩 陈祥 罗卫星 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期962-966,共5页
为了解贵州白山羊GOLA-DQA1基因SNPs与血液免疫指标的相关性,本研究采用PCR直接测序技术对122只贵州白山羊周岁羊群体GOLA-DQA1基因Exon1及部分内含子进行多态性的检测,进一步将各突变位点与血液免疫指标进行关联性分析。结果:在试验群... 为了解贵州白山羊GOLA-DQA1基因SNPs与血液免疫指标的相关性,本研究采用PCR直接测序技术对122只贵州白山羊周岁羊群体GOLA-DQA1基因Exon1及部分内含子进行多态性的检测,进一步将各突变位点与血液免疫指标进行关联性分析。结果:在试验群体中共发现7个SNPs位点,其中C+36G、C+48T、A+49G、T+65G位于外显子上;A+122G、T+125C、A+129G位点位于内含子上,属于中度多态性(0.5<PIC<0.25)。存在连锁不平衡现象且各位点均偏离了Hardy-Weinberg平衡,分析发现C+48T、A+49G位点与中间细胞比率具有显著的相关性,其中CT基因型个体的中间细胞比率显著高于CC基因型(p<0.05);AG基因型个体中间细胞比率值显著高于AA基因型。由此推断GOLA-DQA1基因C+48T、A+49G位点与贵州白山羊血液免疫指标具有一定的相关性,为山羊抗病育种的辅助选择标记的选择提供一定的参考。 展开更多
关键词 贵州白山羊 gola-dqa1基因 单核苷酸多态性 血液免疫指标
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河西绒山羊GOLA-DQA1基因第2外显子遗传特征分析 被引量：7
3
作者 柴文琼 王继卿 +3 位作者 胡江 刘秀 李少斌 罗玉柱 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期120-125,共6页
采用PCR-SSCP和测序技术,分析864只河西绒山羊(有流产表型记录)GOLA-DQA1基因的遗传特性及其与山羊流产的关联性。研究结果表明,在河西绒山羊DQA1基因第2外显子上检测到9个等位基因,其中GOLA-DQA1*B、GOLA-DQA1*E和GOLA-DQA1*H3个等位... 采用PCR-SSCP和测序技术,分析864只河西绒山羊(有流产表型记录)GOLA-DQA1基因的遗传特性及其与山羊流产的关联性。研究结果表明,在河西绒山羊DQA1基因第2外显子上检测到9个等位基因,其中GOLA-DQA1*B、GOLA-DQA1*E和GOLA-DQA1*H3个等位基因为本研究首次发现。9个等位基因中存在42个核苷酸多态位点,占分析位点总数的12.65%,包括23个转换位点,13个颠换位点,5个转换和颠换共存位点及1个插入位点。相关性分析结果表明,不同表型间的等位基因分布差异显著(P<0.05),病例组中等位基因GOLA-DQA1*A的频率显著高于正常组(P<0.05),等位基因GOLA-DQA1*H的频率显著低于正常组(P<0.05)。由此推测等位基因GOLA-DQA1*A与山羊流产的易感性相关,GOLA-DQA1*H与流产抗性相关。 展开更多
关键词 gola-dqa1基因 河西绒山羊 遗传特征 PCR-SSCP 流产
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贵州白山羊GOLA-DQA1基因多态性及生物信息学分析 被引量：2
4
作者 刘彬 罗卫星 +3 位作者 蔡惠芬 孙岩岩 康建兵 钱成 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期44-47,共4页
目的:通过筛选贵州白山羊GOLA-DQA1基因SNPs位点,为进一步研究MHC基因多态性与山羊免疫性状的相关性提供依据。方法:选取同一生长环境中的贵州白山羊母羊157只构建品种DNA池并进行测序,结合SNPs位点测序峰高比值估算等位基因频率,利用... 目的:通过筛选贵州白山羊GOLA-DQA1基因SNPs位点,为进一步研究MHC基因多态性与山羊免疫性状的相关性提供依据。方法:选取同一生长环境中的贵州白山羊母羊157只构建品种DNA池并进行测序,结合SNPs位点测序峰高比值估算等位基因频率,利用软件对不同基因型的RNA和蛋白质二级结构进行预测。结果:在贵州白山羊DQA1基因发现6个SNPs位点G+2930A(同义突变)、T+2959C(Asn→Ser)、G+3061A(Pro→Leu)、A+3082G(Me→Thr)、C+3463A(Trp→Cys)、C+3525T(Arg→His)。生物信息学分析发现,C+3463A变异位点使RNA二级结构更加稳定;A+3082G变异导致自由能增加,稳定性降低。蛋白质结构预测发现除A+3082G基因型与原序列具有相同的二级结构外,其他基因型均引起蛋白质二级结构的改变。结论:贵州白山羊GOLA-DQA1基因具有丰富的多态性,但SNPs位点等位基因频率差异较大。 展开更多
关键词 DNA池 gola-dqa1基因 生物信息学
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