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甘蓝型油菜GLK基因家族全基因组鉴定及耐盐抗旱功能分析
1
作者
邹雨婷
刘丹
+5 位作者
王秋艳
夏柔
汪文倩
杨敏
童雅微
危文亮
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1156-1165,共10页
GLK(GOLDEN2-like)转录因子是GARP转录因子超家族的成员,可直接激活大量光合作用相关蛋白的靶基因,包括叶绿素生物合成、光捕获和电子传输相关的靶基因,在植物生理活动过程和非生物胁迫应激反应中发挥关键作用。为解析甘蓝型油菜GLK基...
GLK(GOLDEN2-like)转录因子是GARP转录因子超家族的成员,可直接激活大量光合作用相关蛋白的靶基因,包括叶绿素生物合成、光捕获和电子传输相关的靶基因,在植物生理活动过程和非生物胁迫应激反应中发挥关键作用。为解析甘蓝型油菜GLK基因家族,探究其与油菜响应盐旱胁迫的相关功能,本研究在甘蓝型油菜全基因组水平上鉴定出159个BnaGLK基因,对其进行了基因结构特征、系统进化、启动子顺式作用元件、基因表达模式等分析。结果表明,159个BnaGLK基因不均匀地分布在19条染色体上。它们可被分为9个亚族,每个亚族中BnaGLK基因的外显子和内含子数量和结构都非常相似。启动子分析发现了多种激素和非生物胁迫响应相关的顺式调控元件,特别是干旱响应元件。选择在油菜叶片中高表达的8个BnaGLKs进行了盐旱胁迫下的表达模式分析。结果揭示BnaGLK基因在油菜非生物胁迫响应中发挥重要作用。本研究为进一步解析GLK基因家族在甘蓝型油菜中的生物学功能奠定了基础。
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关键词
油菜
glk
基因家族
全基因组分析
干旱胁迫
盐胁迫
表达模式
下载PDF
职称材料
连翘GLK基因家族鉴定及响应光照表达分析
被引量：
1
2
作者
赵峥畑
张晓璐
+3 位作者
程堂仁
王佳
张启翔
潘会堂
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
2022年第5期759-769,共11页
【目的】探究GLK基因家族在黄叶型连翘叶片呈色及响应光照度中的作用。【方法】通过生物信息学方法鉴定连翘GLK家族成员,分析其系统进化、基因结构和启动子顺式作用元件,结合转录组数据和实时荧光定量PCR技术筛选与连翘叶色相关及响应...
【目的】探究GLK基因家族在黄叶型连翘叶片呈色及响应光照度中的作用。【方法】通过生物信息学方法鉴定连翘GLK家族成员,分析其系统进化、基因结构和启动子顺式作用元件,结合转录组数据和实时荧光定量PCR技术筛选与连翘叶色相关及响应光照度的关键基因。【结果】从连翘基因组中鉴定到44个GLK基因家族成员,命名为FsGLK1~FsGLK44,分为5个亚族,同一亚族具有相似的保守结构域,所有FsGLK基因的启动子区域均具有多个光响应元件。转录组数据表明,5个FsGLK基因在绿叶和黄叶型连翘中差异表达,其中FsGLK9、FsGLK19、FsGLK27在绿叶型连翘中优势表达,FsGLK34、FsGLK41在黄叶型连翘中优势表达。FsGLK19、FsGLK32、FsGLK41在黄叶型连翘全光和遮光处理条件下差异表达。结合实时荧光定量分析发现,FsGLK19明显受黑暗条件诱导表达。【结论】连翘中有44个FsGLK基因,其中FsGLK19可能是黄叶型连翘呈色及响应光照度的关键基因。
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关键词
黄色叶连翘
glk
基因家族
进化分析
基因表达
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职称材料
题名
甘蓝型油菜GLK基因家族全基因组鉴定及耐盐抗旱功能分析
1
作者
邹雨婷
刘丹
王秋艳
夏柔
汪文倩
杨敏
童雅微
危文亮
机构
长江大学农学院/农业农村部长江中游作物绿色高效生产重点实验室
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期1156-1165,共10页
基金
国家自然科学基金(31871661)。
文摘
GLK(GOLDEN2-like)转录因子是GARP转录因子超家族的成员,可直接激活大量光合作用相关蛋白的靶基因,包括叶绿素生物合成、光捕获和电子传输相关的靶基因,在植物生理活动过程和非生物胁迫应激反应中发挥关键作用。为解析甘蓝型油菜GLK基因家族,探究其与油菜响应盐旱胁迫的相关功能,本研究在甘蓝型油菜全基因组水平上鉴定出159个BnaGLK基因,对其进行了基因结构特征、系统进化、启动子顺式作用元件、基因表达模式等分析。结果表明,159个BnaGLK基因不均匀地分布在19条染色体上。它们可被分为9个亚族,每个亚族中BnaGLK基因的外显子和内含子数量和结构都非常相似。启动子分析发现了多种激素和非生物胁迫响应相关的顺式调控元件,特别是干旱响应元件。选择在油菜叶片中高表达的8个BnaGLKs进行了盐旱胁迫下的表达模式分析。结果揭示BnaGLK基因在油菜非生物胁迫响应中发挥重要作用。本研究为进一步解析GLK基因家族在甘蓝型油菜中的生物学功能奠定了基础。
关键词
油菜
glk
基因家族
全基因组分析
干旱胁迫
盐胁迫
表达模式
Keywords
Brassica
napus
glk
gene
family
whole
genome
identification
drought
stress
salt
stress
expression
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
连翘GLK基因家族鉴定及响应光照表达分析
被引量：
1
2
作者
赵峥畑
张晓璐
程堂仁
王佳
张启翔
潘会堂
机构
北京林业大学园林学院/花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室/国家花卉工程技术研究中心/城乡生态环境北京实验室
出处
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
2022年第5期759-769,共11页
基金
北京市科技计划项目(Z181100002418006)
北京林业大学专项资金项目(2019XKJS0323)。
文摘
【目的】探究GLK基因家族在黄叶型连翘叶片呈色及响应光照度中的作用。【方法】通过生物信息学方法鉴定连翘GLK家族成员,分析其系统进化、基因结构和启动子顺式作用元件,结合转录组数据和实时荧光定量PCR技术筛选与连翘叶色相关及响应光照度的关键基因。【结果】从连翘基因组中鉴定到44个GLK基因家族成员,命名为FsGLK1~FsGLK44,分为5个亚族,同一亚族具有相似的保守结构域,所有FsGLK基因的启动子区域均具有多个光响应元件。转录组数据表明,5个FsGLK基因在绿叶和黄叶型连翘中差异表达,其中FsGLK9、FsGLK19、FsGLK27在绿叶型连翘中优势表达,FsGLK34、FsGLK41在黄叶型连翘中优势表达。FsGLK19、FsGLK32、FsGLK41在黄叶型连翘全光和遮光处理条件下差异表达。结合实时荧光定量分析发现,FsGLK19明显受黑暗条件诱导表达。【结论】连翘中有44个FsGLK基因,其中FsGLK19可能是黄叶型连翘呈色及响应光照度的关键基因。
关键词
黄色叶连翘
glk
基因家族
进化分析
基因表达
Keywords
yellow-leafed
Forsythia
Golden2-like
gene
family
phylo
gene
tic
analysis
gene
expression
分类号
S68 [农业科学—观赏园艺]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘蓝型油菜GLK基因家族全基因组鉴定及耐盐抗旱功能分析
邹雨婷
刘丹
王秋艳
夏柔
汪文倩
杨敏
童雅微
危文亮
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
连翘GLK基因家族鉴定及响应光照表达分析
赵峥畑
张晓璐
程堂仁
王佳
张启翔
潘会堂
《河南农业大学学报》
CAS
CSCD
2022
1
下载PDF
职称材料
已选择
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