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软枣猕猴桃GDP-L-半乳糖磷酸酶电子克隆与生物信息学分析 被引量：5
1
作者 张开雪 任伟超 +4 位作者 闫嵩 刘振鹏 徐姣 刘秀波 马伟 《中国药师》 CAS 2016年第11期2066-2069,共4页
目的:通过电子克隆技术对软枣猕猴桃GDP-L-半乳糖磷酸酶(GGP)基因进行预测。方法:以猕猴桃GGP序列为探针,基于NCBI中软枣猕猴桃的EST数据库和CAP3在线软件进行序列拼接,利用生物信息学数据库及相关软件对其结构和功能进行预测分析。结果... 目的:通过电子克隆技术对软枣猕猴桃GDP-L-半乳糖磷酸酶(GGP)基因进行预测。方法:以猕猴桃GGP序列为探针,基于NCBI中软枣猕猴桃的EST数据库和CAP3在线软件进行序列拼接,利用生物信息学数据库及相关软件对其结构和功能进行预测分析。结果:软枣猕猴桃GGP基因全长1866 bp,包含1353 bp的开放阅读框,编码450个氨基酸。结论:本研究为进一步解释基因的分子功能奠定理论及实验基础。 展开更多
关键词 软枣猕猴桃 gdp-l-半乳糖磷酸酶 电子克隆 生物信息学
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刺梨GDP-L–半乳糖磷酸酶基因的表达及其与AsA积累的关系 被引量：4
2
作者 孙雅蕾 杨曼 安华明 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1175-1182,共8页
采用RT-PCR和RACE技术,从刺梨(Rosa roxburghii Tratt)果实中扩增出GDP-L–半乳糖磷酸酶(GDP-L-galactose pyrophosphatase,GGP)基因的全长cDNA序列,并分析其在不同组织和果实不同发育阶段的表达特点及其与AsA积累的关系。结果表明:刺梨... 采用RT-PCR和RACE技术,从刺梨(Rosa roxburghii Tratt)果实中扩增出GDP-L–半乳糖磷酸酶(GDP-L-galactose pyrophosphatase,GGP)基因的全长cDNA序列,并分析其在不同组织和果实不同发育阶段的表达特点及其与AsA积累的关系。结果表明:刺梨GGP基因cDNA(RrGGP,GenBank登录号:HM998753)包含1个长度为1 341 bp的开放阅读框(ORF),编码445个氨基酸;其氨基酸序列与苹果、猕猴桃等的相似性均在80%以上。RT-PCR分析表明,该基因在刺梨不同器官中的表达差异明显:在果实中的表达量最强,叶中次之,而花和茎中只能检测到极微弱的表达。在果实不同发育时期都能检测到RrGGP的表达,在发育初期(花后50 d内)表达较弱,花后60~100 d呈高水平表达,而后随着果实成熟而下调。刺梨中RrGGP的表达特点与AsA积累高度一致,意味着该基因可能是果实发育过程中AsA合成的关键基因。 展开更多
关键词 刺梨 gdp-l–半乳糖磷酸酶 基因表达 ASA
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苹果GMP、GME和GGP基因的克隆与表达分析 被引量：1
3
作者 夏惠 张敏 马锋旺 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2014年第3期191-196,共6页
【目的】克隆苹果GDP-甘露糖焦磷酸化酶(GDP-mannose pyrophosphorylase,GMP)、GDP-甘露糖-3′,5′-表异构酶(GDP-mannose-3′,5′-epimerase,GME)和GDP-1-半乳糖磷酸酶(GDP-L-galactose-1-phosphate phosphorylase,GGP)的基因序列并分... 【目的】克隆苹果GDP-甘露糖焦磷酸化酶(GDP-mannose pyrophosphorylase,GMP)、GDP-甘露糖-3′,5′-表异构酶(GDP-mannose-3′,5′-epimerase,GME)和GDP-1-半乳糖磷酸酶(GDP-L-galactose-1-phosphate phosphorylase,GGP)的基因序列并分析其表达特性,探讨GMP、GME和GGP基因在抗坏血酸(Ascorbic acid,AsA)合成过程中的作用。【方法】以‘嘎啦’苹果幼果为材料,分别运用RT-PCR和PCR法克隆GMP、GME和GGP基因的cDNA和gDNA全长序列,对其序列及编码产物进行生物信息学分析,并采用实时荧光定量PCR,分析以上基因在苹果不同组织(幼叶、成熟叶、衰老叶、花、幼果、成熟果和根)中的表达情况。【结果】RT-PCR法克隆及序列分析显示,GMP基因的cDNA全长为1 280bp,编码361个氨基酸,gDNA序列中含有3个内含子;GME基因的cDNA全长为1 323bp,编码376个氨基酸,gDNA序列中含有5个内含子;GGP基因的cDNA全长为1 677bp,编码446个氨基酸,gDNA序列中含有6个内含子。基因表达的实时荧光定量PCR分析表明,GMP、GME和GGP在苹果不同组织中均有表达,在叶片中的表达量高于其他组织,且表达量随着叶片的生长逐渐升高;在花、幼果和成熟果中,GMP、GME和GGP的表达量差异不明显。【结论】克隆获得了苹果的GMP、GME和GGP基因,其在苹果不同组织的生长过程中有不同的表达特性,但GME的表达水平远远低于GMP和GGP,这在一定程度上表明,在苹果AsA的生物合成过程中,GMP、GGP较GME有更重要的作用。 展开更多
关键词 苹果 gdp-甘露糖焦磷酸化酶 gdp-甘露糖-3′ 5′-表异构酶 gdp-1-半乳糖磷酸酶 抗坏血酸
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