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Rht16矮秆小麦中GA2ox-A9(Rht18)基因的克隆与表达分析
被引量：
1
1
作者
林珊
魏淑红
+3 位作者
杨在君
廖明莉
陈真勇
吴一超
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第9期2796-2805,共10页
赤霉素2-氧化酶(GA2ox)是赤霉素降解途径的一种关键酶,在茎的伸长中起着关键作用。为探讨GA2ox-A9(Rht18)与Rht16矮秆小麦矮化之间的关系,本研究利用同源克隆方法从硬粒小麦株高近等基因系ANW16F(含矮秆基因Rht16)和高秆材料LD222中分...
赤霉素2-氧化酶(GA2ox)是赤霉素降解途径的一种关键酶,在茎的伸长中起着关键作用。为探讨GA2ox-A9(Rht18)与Rht16矮秆小麦矮化之间的关系,本研究利用同源克隆方法从硬粒小麦株高近等基因系ANW16F(含矮秆基因Rht16)和高秆材料LD222中分别分离得到GA2ox-A9-1和GA2ox-A9-2基因,并对其进行生物信息学分析和表达模式分析。结果表明,从矮秆ANW16F和高秆LD222克隆得到的GA2ox-A9-1和GA2ox-A9-2基因是位于A和B基因组的两个拷贝基因,均含有3个外显子和2个内含子,编码347个氨基酸。ANW16F和LD222的GA2ox-A9-1蛋白在第89位氨基酸残基存在差异,GA2ox-A9-2蛋白在第87位存在差异。ANW16F和LD222的GA2oxA9-1蛋白与GA2oxA9-2蛋白在第182、186、251、336位的4个氨基酸残基存在差异。GA2ox-A9为亲水性不稳定酸性蛋白,无跨膜结构,二级结构丰富,三级结构预测显示与拟南芥GA2ox 6ku3.1A蛋白的序列相似度高,GA2ox-A9-1蛋白结构完全相同,GA2ox-A9-2蛋白略有不同。系统进化分析显示,GA2ox-A9与野生二粒同源性最高。RT-qPCR结果显示,在拔节期GA2ox-A9在高秆LD222茎中的表达量显著高于ANW16F中的表达量,在孕穗期和抽穗期GA2ox-A9在矮秆ANW16F中的表达水平明显高于高秆LD222,推测GA2ox-A9(Rht18)基因参与了Rht16矮秆小麦的矮化。本研究为进一步探讨Rht16小麦的矮化机理和育种利用提供了理论依据。
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关键词
Rht16
ga
2
ox
-A
9
基因
矮秆
基因
生物信息学分析
实时荧光定量PCR
原文传递
硬粒小麦赤霉素氧化酶基因GA2ox-A9的克隆及表达分析
被引量：
1
2
作者
张家敏
魏淑红
+1 位作者
龚胤书
杨在君
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第10期3142-3149,共8页
赤霉素2-氧化酶(GA2-oxidase,GA2ox)是赤霉素降解途径的关键酶,在茎的伸长中起着重要的作用。为探讨GA2ox-A9基因与小麦矮化之间的关系,本研究从硬粒小麦ANW16G(携带Reduced height gene18,Rht18)和其株高近等基因系LD222两个材料中克...
赤霉素2-氧化酶(GA2-oxidase,GA2ox)是赤霉素降解途径的关键酶,在茎的伸长中起着重要的作用。为探讨GA2ox-A9基因与小麦矮化之间的关系,本研究从硬粒小麦ANW16G(携带Reduced height gene18,Rht18)和其株高近等基因系LD222两个材料中克隆得到GA2ox-A9基因,分别命名为GA2ox-A9-1和GA2oxA9-2,并对其在不同发育时期的各个茎节进行了表达模式分析。序列分析显示,两个材料的GA2ox-A9基因均含有3个外显子和2个内含子,开放阅读框全长1044 bp,编码347个氨基酸,GA2ox-A9-1蛋白在第89位、275位、279位的氨基酸存在差异,GA2ox-A9-2蛋白在第182位、186位、251位、336位的氨基酸存在差异,编码的蛋白均具有2-酮戊二酸依赖性的双加氧酶典型的保守结构域。系统发育分析表明,硬粒小麦GA2ox-A9与其他物种具有较高的进化保守性,且与乌拉尔图最为接近。Real-time PCR结果显示,GA2ox-A9基因在矮秆小麦ANW16G中表达量最高,尤其是在拔节期茎中的表达量远远高于高秆对照LD222,表明与矮化性状有关。本研究结果为进一步研究GA2ox-A9基因的功能和小麦矮化的分子机制提供了理论依据。
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关键词
硬粒小麦
矮化
ga
2
ox
-A
9
基因
基因
克隆
基因
表达
原文传递
题名
Rht16矮秆小麦中GA2ox-A9(Rht18)基因的克隆与表达分析
被引量：
1
1
作者
林珊
魏淑红
杨在君
廖明莉
陈真勇
吴一超
机构
西华师范大学生命科学学院西南野生动植物资源保护教育部重点实验室
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第9期2796-2805,共10页
基金
西华师范大学国家一般培育项目(19B039)资助。
文摘
赤霉素2-氧化酶(GA2ox)是赤霉素降解途径的一种关键酶,在茎的伸长中起着关键作用。为探讨GA2ox-A9(Rht18)与Rht16矮秆小麦矮化之间的关系,本研究利用同源克隆方法从硬粒小麦株高近等基因系ANW16F(含矮秆基因Rht16)和高秆材料LD222中分别分离得到GA2ox-A9-1和GA2ox-A9-2基因,并对其进行生物信息学分析和表达模式分析。结果表明,从矮秆ANW16F和高秆LD222克隆得到的GA2ox-A9-1和GA2ox-A9-2基因是位于A和B基因组的两个拷贝基因,均含有3个外显子和2个内含子,编码347个氨基酸。ANW16F和LD222的GA2ox-A9-1蛋白在第89位氨基酸残基存在差异,GA2ox-A9-2蛋白在第87位存在差异。ANW16F和LD222的GA2oxA9-1蛋白与GA2oxA9-2蛋白在第182、186、251、336位的4个氨基酸残基存在差异。GA2ox-A9为亲水性不稳定酸性蛋白,无跨膜结构,二级结构丰富,三级结构预测显示与拟南芥GA2ox 6ku3.1A蛋白的序列相似度高,GA2ox-A9-1蛋白结构完全相同,GA2ox-A9-2蛋白略有不同。系统进化分析显示,GA2ox-A9与野生二粒同源性最高。RT-qPCR结果显示,在拔节期GA2ox-A9在高秆LD222茎中的表达量显著高于ANW16F中的表达量,在孕穗期和抽穗期GA2ox-A9在矮秆ANW16F中的表达水平明显高于高秆LD222,推测GA2ox-A9(Rht18)基因参与了Rht16矮秆小麦的矮化。本研究为进一步探讨Rht16小麦的矮化机理和育种利用提供了理论依据。
关键词
Rht16
ga
2
ox
-A
9
基因
矮秆
基因
生物信息学分析
实时荧光定量PCR
Keywords
Rht16
ga
2
ox
-A
9
gene
Dwarf gene
Bioinformatics analysis
RT-qPCR
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
硬粒小麦赤霉素氧化酶基因GA2ox-A9的克隆及表达分析
被引量：
1
2
作者
张家敏
魏淑红
龚胤书
杨在君
机构
西华师范大学生命科学学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第10期3142-3149,共8页
基金
西华师范大学国家一般培育项目(19B039)
西华师范大学英才基金项目(17YC347)共同资助。
文摘
赤霉素2-氧化酶(GA2-oxidase,GA2ox)是赤霉素降解途径的关键酶,在茎的伸长中起着重要的作用。为探讨GA2ox-A9基因与小麦矮化之间的关系,本研究从硬粒小麦ANW16G(携带Reduced height gene18,Rht18)和其株高近等基因系LD222两个材料中克隆得到GA2ox-A9基因,分别命名为GA2ox-A9-1和GA2oxA9-2,并对其在不同发育时期的各个茎节进行了表达模式分析。序列分析显示,两个材料的GA2ox-A9基因均含有3个外显子和2个内含子,开放阅读框全长1044 bp,编码347个氨基酸,GA2ox-A9-1蛋白在第89位、275位、279位的氨基酸存在差异,GA2ox-A9-2蛋白在第182位、186位、251位、336位的氨基酸存在差异,编码的蛋白均具有2-酮戊二酸依赖性的双加氧酶典型的保守结构域。系统发育分析表明,硬粒小麦GA2ox-A9与其他物种具有较高的进化保守性,且与乌拉尔图最为接近。Real-time PCR结果显示,GA2ox-A9基因在矮秆小麦ANW16G中表达量最高,尤其是在拔节期茎中的表达量远远高于高秆对照LD222,表明与矮化性状有关。本研究结果为进一步研究GA2ox-A9基因的功能和小麦矮化的分子机制提供了理论依据。
关键词
硬粒小麦
矮化
ga
2
ox
-A
9
基因
基因
克隆
基因
表达
Keywords
Durum wheat
Dwarf
ga
2
ox
-A
9
gene
Gene cloning
Gene expression
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Rht16矮秆小麦中GA2ox-A9(Rht18)基因的克隆与表达分析
林珊
魏淑红
杨在君
廖明莉
陈真勇
吴一超
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023
1
原文传递
2
硬粒小麦赤霉素氧化酶基因GA2ox-A9的克隆及表达分析
张家敏
魏淑红
龚胤书
杨在君
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021
1
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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