目的:利用网络药理学方法和分子对接技术探讨附子-白芍配伍治疗抑郁症作用机制。方法:通过TCMSP和TCMID数据库筛选出附子和白芍的活性成分及相关靶点,使用DisGeNET、GeneCards等数据库筛选出抑郁症的潜在靶点,得到活性成分与疾病的交集...目的:利用网络药理学方法和分子对接技术探讨附子-白芍配伍治疗抑郁症作用机制。方法:通过TCMSP和TCMID数据库筛选出附子和白芍的活性成分及相关靶点,使用DisGeNET、GeneCards等数据库筛选出抑郁症的潜在靶点,得到活性成分与疾病的交集靶点,以STRING数据库对活性靶点构建蛋白互作网络(PPI),使用R语言中CludterProfiler程序包进行GO功能及KEGG代谢通路分析;采用Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-成分-靶点-通路"的相互作用网络图;通过Discovery Studio 2016软件对核心配体小分子和受体大分子进行分子对接分析。结果:筛选得到附子-白芍相关活性化合物6个,附子-白芍与抑郁症的共同靶点36个,网络图提示附子-白芍治疗抑郁症可能的有效化合物为三角豆素、β-谷甾醇、谷甾醇和Mairin,可能的靶点为PTGS1和PGR。GO功能富集分析筛选得生物学过程、细胞组成、分子功能分别为433条、58条及71条;KEGG富集筛选得神经活性配体-受体相互作用、5-羟色胺能突触、γ-氨基丁酸能突触及雌激素信号途径等67条信号通路;分子对接结果表明PGR与成分Mairin、β-谷甾醇和谷甾醇,PTGS1与三角豆素、β-谷甾醇均具有良好的亲和力。结论:附子-白芍配伍治疗抑郁症具有多靶点、多通路、多分子的特点,主要通过调节脑内神经递质(5-羟色胺、去甲肾上腺素和γ-氨基丁酸)等过程发挥抗抑郁的作用。展开更多
文摘目的:利用网络药理学方法和分子对接技术探讨附子-白芍配伍治疗抑郁症作用机制。方法:通过TCMSP和TCMID数据库筛选出附子和白芍的活性成分及相关靶点,使用DisGeNET、GeneCards等数据库筛选出抑郁症的潜在靶点,得到活性成分与疾病的交集靶点,以STRING数据库对活性靶点构建蛋白互作网络(PPI),使用R语言中CludterProfiler程序包进行GO功能及KEGG代谢通路分析;采用Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-成分-靶点-通路"的相互作用网络图;通过Discovery Studio 2016软件对核心配体小分子和受体大分子进行分子对接分析。结果:筛选得到附子-白芍相关活性化合物6个,附子-白芍与抑郁症的共同靶点36个,网络图提示附子-白芍治疗抑郁症可能的有效化合物为三角豆素、β-谷甾醇、谷甾醇和Mairin,可能的靶点为PTGS1和PGR。GO功能富集分析筛选得生物学过程、细胞组成、分子功能分别为433条、58条及71条;KEGG富集筛选得神经活性配体-受体相互作用、5-羟色胺能突触、γ-氨基丁酸能突触及雌激素信号途径等67条信号通路;分子对接结果表明PGR与成分Mairin、β-谷甾醇和谷甾醇,PTGS1与三角豆素、β-谷甾醇均具有良好的亲和力。结论:附子-白芍配伍治疗抑郁症具有多靶点、多通路、多分子的特点,主要通过调节脑内神经递质(5-羟色胺、去甲肾上腺素和γ-氨基丁酸)等过程发挥抗抑郁的作用。
