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植物基因启动子的克隆及其功能研究进展 被引量：87
1
作者 聂丽娜 夏兰琴 +6 位作者 徐兆师 高东尧 李琳 于卓 陈明 李连城 马有志 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 2008年第3期385-391,共7页
启动子在植物基因表达调控过程中起着重要作用。对于植物基因启动子的克隆及其功能研究有助于了解信号传递途径和基因表达调控模式,为植物转基因工程研究提供理论依据。本文综述了植物基因启动子的基本结构、类型、克隆方法及功能研究进... 启动子在植物基因表达调控过程中起着重要作用。对于植物基因启动子的克隆及其功能研究有助于了解信号传递途径和基因表达调控模式,为植物转基因工程研究提供理论依据。本文综述了植物基因启动子的基本结构、类型、克隆方法及功能研究进展,着重介绍了广泛应用于转基因工程的诱导型启动子及启动子功能分析,展望了今后植物启动子的研究方向。 展开更多
关键词 植物基因启动子 诱导型启动子 克隆 功能分析
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中国乡村治理中的乡贤文化作用分析:历史与现状 被引量：47
2
作者 吕霞 冀满红 《中国行政管理》 CSSCI 北大核心 2019年第6期63-68,共6页
乡贤文化是中国传统乡村治理的重要内容,是中国历朝历代乡贤德行凝结的意识形态的集合。随着时代的发展,乡贤文化成为乡村贤达人士道德品性、知识素养、行为方式和社会影响的综合反映,具有地域性、道德性、知识性和公益性特征。在现代... 乡贤文化是中国传统乡村治理的重要内容,是中国历朝历代乡贤德行凝结的意识形态的集合。随着时代的发展,乡贤文化成为乡村贤达人士道德品性、知识素养、行为方式和社会影响的综合反映,具有地域性、道德性、知识性和公益性特征。在现代乡村治理中提倡乡贤文化,是解决乡村既存问题的需要,也是乡贤实现社会价值与自我价值的需要。在乡村治理过程中,乡贤文化在涵养核心价值观、完善乡村法治、发展乡村经济和倡导乡村公益等方面发挥了重要作用,为破解乡村经济与文化困局、重建乡村秩序与规范提供了重要保障。在发挥作用的同时,乡贤文化要明确自身协同治理的角色以及促进乡村自治的目标,避免"错位"和"越位"现象,促进乡村治理从"人治"到"法治"、从外在权威到内生权威的转变。对乡贤文化在乡村治理中的作用研究,可以挖掘其在促进社会主义新农村建设、促进乡村振兴中的传承价值和创新价值,丰富和优化社会治理经验。 展开更多
关键词 乡村治理 乡贤文化 历史范例 作用分析
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我国求医问药类APP软件功能评价 被引量：42
3
作者 胡长爱 邢美园 +2 位作者 杨春伟 张珉 杨大干 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2014年第2期7-10,共4页
选取"快速问医生"、"掌上淘医"和"春雨掌上医生"等国内10种常见的求医问药类APP,对其医疗咨询、疾病查询和就医信息三大基本功能进行对比分析的。结果显示,求医问药类APP的功能框架已基本形成,能够满足... 选取"快速问医生"、"掌上淘医"和"春雨掌上医生"等国内10种常见的求医问药类APP,对其医疗咨询、疾病查询和就医信息三大基本功能进行对比分析的。结果显示,求医问药类APP的功能框架已基本形成,能够满足人们日常求医问药的需求,但应重视信息的准确性和完整性,创建合适的盈利模式,促进医疗APP的持续发展。 展开更多
关键词 功能分析 移动医疗 医疗咨询 疾病查询 就医信息
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产品模块化设计中的功能模块划分方法研究 被引量：27
4
作者 张宝辉 龚京忠 +2 位作者 李国喜 吴宝中 慈元卓 《组合机床与自动化加工技术》 北大核心 2004年第9期55-57,59,共4页
功能模块划分是模块化设计的前提与基础 ,本文分析、总结了现有模块划分方法 ,建立了产品功能模块划分过程模型 ,阐述了用户需求获取、确定功能等关键过程 ,重点研究了以功能分解为基础、综合考虑功能相关、物理相关、时间相关、装配相... 功能模块划分是模块化设计的前提与基础 ,本文分析、总结了现有模块划分方法 ,建立了产品功能模块划分过程模型 ,阐述了用户需求获取、确定功能等关键过程 ,重点研究了以功能分解为基础、综合考虑功能相关、物理相关、时间相关、装配相关等相关准则的功能模块划分方法。最后对该方法的理论。 展开更多
关键词 模块化 模块化设计 功能分解 功能模块
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全路列车运行图编制系统设计的研究 被引量：16
5
作者 倪少权 吕红霞 杨明伦 《西南交通大学学报》 EI CSCD 北大核心 2003年第3期332-335,共4页
提出全路列车运行图编制系统建设的远期目标和近期目标,设计了包括铁道部和铁路局2级层次的系统总体结构,并对系统的功能和实现技术进行了研究 给出了以铁路局和铁路分局数据库为基础,合并建立全路列车运行图数据库 并以区间作为基本数... 提出全路列车运行图编制系统建设的远期目标和近期目标,设计了包括铁道部和铁路局2级层次的系统总体结构,并对系统的功能和实现技术进行了研究 给出了以铁路局和铁路分局数据库为基础,合并建立全路列车运行图数据库 并以区间作为基本数据描述单元,进行数据库设计和单双线合一的列车运行图编制思想和方法 针对系统研究的技术关键问题,如系统的数据组织及数据结构设计、编图算法求解及系统的人机交互功能设计等进行了介绍和探讨. 展开更多
关键词 全路列车运行图编制系统 系统设计 系统结构 数据库 数据组织 数据结构 人机交互功能
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都市区范围界定方法探讨——以杭州市为例 被引量：21
6
作者 姜世国 《地理与地理信息科学》 CSSCI CSCD 北大核心 2004年第1期67-72,共6页
当前关于都市区范围的界定 ,主要基于“功能主义方法” ,是一种定性分析。根据断裂点公式、距离衰减效应的“简单计算方法”可以定量分析都市区的地域范围。用定性、定量分析方法划分的杭州都市区空间范围基本吻合。根据杭州市与周边县... 当前关于都市区范围的界定 ,主要基于“功能主义方法” ,是一种定性分析。根据断裂点公式、距离衰减效应的“简单计算方法”可以定量分析都市区的地域范围。用定性、定量分析方法划分的杭州都市区空间范围基本吻合。根据杭州市与周边县市的关系以及杭州未来发展的需要 ,针对近期、远期两个发展阶段 ,可以得到杭州都市区范围的两个可行性方案。笔者认为划分都市区范围 ,可以用定量分析来弥补定性分析理论依据不足的缺陷。 展开更多
关键词 都市区 功能分析 断裂点公式 距离衰减效应 杭州市 地域范围 界定方法
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慢性病管理类医疗应用软件的现状与前景 被引量：34
7
作者 曹志 郑小敏 +2 位作者 乔亚楠 查晓丽 徐王权 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2016年第7期27-30,43,共5页
目的:了解国内的慢性病自我管理类医疗APP的现状,分析和评价各医疗APP的主要功能,推动慢性病移动信息化管理的发展。方法:选取10款常见的慢性病管理类医疗APP,并统计其主要功能,对其数据记录与病情评估、医疗咨询和生活疗法三大功能进... 目的:了解国内的慢性病自我管理类医疗APP的现状,分析和评价各医疗APP的主要功能,推动慢性病移动信息化管理的发展。方法:选取10款常见的慢性病管理类医疗APP,并统计其主要功能,对其数据记录与病情评估、医疗咨询和生活疗法三大功能进行分析。结果:慢性病管理类医疗APP的功能基本形成,但主要功能缺乏实用性和便利性,同质化比较严重,有待进一步改善。结论:利用"互联网+医疗"的技术发展"APP+硬件+云端"的医疗管理模式,加大移动医疗APP的监管力度,完善慢性病移动信息化的管理机制,提高慢性病患者的自我管理效率。 展开更多
关键词 慢病管理 移动信息化 医疗APP 功能分析
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“体裁教学法”在英语阅读教学中的应用与分析 被引量：31
8
作者 梁文花 《西安外国语大学学报》 2010年第1期94-98,共5页
"体裁教学法"对英语作为一语和二语环境下的语言教学产生了深刻影响,也引起我国外语教学界的广泛关注,但目前仍处于理论探索阶段,真正意义上的课堂教学实践应用尚不多见。本文在前期实证研究的基础上,将澳大利亚学派的"... "体裁教学法"对英语作为一语和二语环境下的语言教学产生了深刻影响,也引起我国外语教学界的广泛关注,但目前仍处于理论探索阶段,真正意义上的课堂教学实践应用尚不多见。本文在前期实证研究的基础上,将澳大利亚学派的"体裁教学法"应用于英语专业阅读教学,并探讨其实践效果,旨在为该方法在我国课堂教学中的推广提供参照。 展开更多
关键词 体裁教学法 教学-学习循环 阅读教学 体裁分析 功能分析
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紫花苜蓿NAC类转录因子基因MsNAC2的克隆及其功能分析 被引量：31
9
作者 申玉华 徐振军 +4 位作者 唐立红 杨晓坡 黄文婕 武小斌 张文波 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第15期2925-2938,共14页
【目的】NAC转录因子是植物特有的一类转录因子,N端含有一段高度保守、约150个氨基酸组成的NAC结构域,而C端为高度变异的转录调控区。NAC转录因子不仅参与植物生长发育的调控,而且在植物抗逆反应中具有重要的调控作用。作者从紫花苜蓿... 【目的】NAC转录因子是植物特有的一类转录因子,N端含有一段高度保守、约150个氨基酸组成的NAC结构域,而C端为高度变异的转录调控区。NAC转录因子不仅参与植物生长发育的调控,而且在植物抗逆反应中具有重要的调控作用。作者从紫花苜蓿中克隆了一个NAC类转录因子基因Ms NAC2,期望通过分析其DNA和氨基酸序列特征,阐明其在紫花苜蓿中响应非生物胁迫的表达模式,通过在烟草中过量表达鉴定其生物学功能,为进一步了解Ms NAC2在紫花苜蓿中的耐逆调控机理提供试验基础,并为通过转基因技术改善紫花苜蓿抗逆力和提高其品质奠定研究基础。【方法】应用RT-PCR和RACE技术获得紫花苜蓿Ms NAC2全长序列,并进行生物信息学分析。应用real-time PCR技术分析该基因在非生物胁迫下的时空表达特征。构建Ms NAC2-GFP融合表达载体,进行基因表达的亚细胞定位分析。同时构建p BI121-Ms NAC2植物超表达载体,通过农杆菌介导法转化烟草叶盘,比较逆境胁迫条件下野生型烟草和转基因株系的表型和生理指标,鉴定超表达Ms NAC2对烟草耐逆能力的调控效应。【结果】Ms NAC2全长1 358 bp,开放阅读框长度为1 023 bp,编码340个氨基酸,编码蛋白质分子量为39.4 k D,其N端含有典型的NAC保守结构域,C端高度变异。进化树聚类分析表明,该基因与脐橙Cs NAC亲缘关系较近,属于NAC蛋白的ATAF亚家族。洋葱亚细胞定位分析表明Ms NAC2定位于细胞核。转录水平表达分析表明Ms NAC2受250 mmol·L-1Na Cl、20%PEG6000、0.1 mmol·L-1 ABA和4℃胁迫诱导而显著升高,并且Ms NAC2在根中的表达量要明显高于在叶中的表达量。抗性试验结果显示,在Na Cl、PEG和4℃冷害胁迫下,转基因烟草苗高、根长、鲜重和干重等生长指标均高于野生型。生理指标检测结果表明,在250 mmol·L-1 Na Cl、20%PEG6000和4℃处理24 h后,转基因烟草叶片丙二醛含量明显低 展开更多
关键词 紫花苜蓿 MS NAC2 基因克隆 功能分析
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基于模型的系统工程技术探析 被引量：28
10
作者 吴颖 刘俊堂 郑党党 《航空科学技术》 2015年第9期69-73,共5页
介绍了基于模型的系统工程(MBSE)技术基本概念,结合飞机研制过程,分析了MBSE技术的实施方法,详细阐述了MBSE技术的需求定义、功能分析、逻辑设计、物理设计以及测试、集成和验证的数字化设计与验证流程。
关键词 基于模型的系统工程 需求定义 功能分析 逻辑设计 物理设计 系统工程 飞机
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野生大豆S-腺苷甲硫氨酸合成酶基因的克隆及功能分析 被引量：22
11
作者 樊金萍 柏锡 +4 位作者 李勇 纪巍 王希 才华 朱延明 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1581-1587,共7页
干旱、盐碱和低温等非生物逆境是危害作物诸多因素中最为严重的自然灾害,它可以使作物减产,甚至死亡。目前通过生物技术手段获得可利用的抗性基因是提高植物抗性的重要途径。东北野生大豆具有丰富的基因资源,是基因克隆的理想材料。从低... 干旱、盐碱和低温等非生物逆境是危害作物诸多因素中最为严重的自然灾害,它可以使作物减产,甚至死亡。目前通过生物技术手段获得可利用的抗性基因是提高植物抗性的重要途径。东北野生大豆具有丰富的基因资源,是基因克隆的理想材料。从低温(4℃)、干旱(30%PEG)及盐胁迫(200mmolL-1NaCl)处理的东北野生大豆幼苗叶片中提取总RNA,经反转录合成cDNA第一链,并以此链为模板,从已构建的盐胁迫全长cDNA文库和东北野生大豆盐胁迫EST数据库中筛选出与渗透胁迫直接相关的EST序列,根据该序列设计一对PCR引物扩增S-腺苷甲硫氨酸(SAM)合成酶基因的全长序列,经Blast比较分析,确定所获得的SAMS基因全长序列。构建以pBI121为基础的CaMV35S启动子调控的植物表达载体;利用农杆菌介导法将其导入烟草,获得了180株转基因烟草,并进行了低温、干旱和盐胁迫处理,通过测定在不同胁迫处理下的生理指标,分析了基因的功能。野生大豆的SAMS基因在烟草中的超量表达提高了转基因烟草的抗低温、干旱和耐盐能力。 展开更多
关键词 野生大豆 SAM合成酶 基因克隆 功能分析
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厚朴转录组SSR标记的开发及功能分析 被引量：25
12
作者 代娇 时小东 +4 位作者 顾雨熹 盛玉珍 徐莺 陈放 庄国庆 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2017年第13期2726-2732,共7页
目的分析厚朴转录组中的SSR位点,并设计引物初步验证,对含SSR的序列进行功能分析,为厚朴分子辅助标记育种和资源保护提供了有利工具。方法将通过厚朴高通量转录组测序获得的Unigene序列进行SSR位点挖掘,利用Primer.03进行引物设计,随机... 目的分析厚朴转录组中的SSR位点,并设计引物初步验证,对含SSR的序列进行功能分析,为厚朴分子辅助标记育种和资源保护提供了有利工具。方法将通过厚朴高通量转录组测序获得的Unigene序列进行SSR位点挖掘,利用Primer.03进行引物设计,随机挑选45对引物进行PCR,并利用Blast软件对含有SSR的Unigene进行功能分析。结果在16 369条厚朴转录组序列中共获得8 635个SSR位点,出现频率为52.75%。SSR序列中单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸为优势重复类型,重复比例最高为10次,主导重复基元类型为A/T(47.16%)、AG/CT(31.74%)、AAG/CTT(6.53%)。45对引物中22对(48.89%)可以扩增出预期大小的条带。含SSR的Unigene与能量和氧化还原等代谢过程,以及RNA转运、剪接体和植物激素信号转导等通路有关。结论厚朴高通量转录组序列的SSR位点具有类型丰富、特异性强和潜能高等特点,同时SSR序列的功能分析将为厚朴基因挖掘和分子标记辅助育种提供有利的工具。 展开更多
关键词 厚朴 转录组 SSR 功能分析 PCR
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高职院校校内实训基地功能分析与实现途径研究 被引量：23
13
作者 徐澍敏 《金华职业技术学院学报》 2009年第1期5-8,共4页
高等职业教育的职业教育、高等教育的双重特征,决定了高职院校校内实训基地功能的多样性。根据校内实训基地功能定位的现状与存在的问题,校内实训基地必须具备以生产性实训为主的教学实训功能,以职业技能鉴定为主的技能考证功能,以及科... 高等职业教育的职业教育、高等教育的双重特征,决定了高职院校校内实训基地功能的多样性。根据校内实训基地功能定位的现状与存在的问题,校内实训基地必须具备以生产性实训为主的教学实训功能,以职业技能鉴定为主的技能考证功能,以及科技研发、社会培训和成果展示等社会功能。结合学校实际,探讨校内实训基地功能实现的途径,以促进高职人才培养模式的改革。 展开更多
关键词 高职教育 实训基地 功能分析 实现途径
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马立克氏病病毒meq基因功能研究 被引量：20
14
作者 韦平 崔治中 L.F.Lee 《广西科学》 CAS 2003年第1期52-62,共11页
从马立克氏病病毒(MDV)不同致病型毒株meq基因序列、meq基因产物及其细胞内表达特性和meq蛋白生物学功能的研究探讨马立克氏病病毒致瘤基因meq功能。完成了648A、CVI988/Rispens、814、广西地方毒株G2、N、0093、0095、0297、0304共9个... 从马立克氏病病毒(MDV)不同致病型毒株meq基因序列、meq基因产物及其细胞内表达特性和meq蛋白生物学功能的研究探讨马立克氏病病毒致瘤基因meq功能。完成了648A、CVI988/Rispens、814、广西地方毒株G2、N、0093、0095、0297、0304共9个MDV毒株meq基因的序列测定。MDV不同致病型毒株的。meq基因序列相对比较保守,它们相互间核苷酸和氨基酸序列的同源性均很高;与所有7个致瘤的MDV毒株相比,在2个MDV-1弱毒疫苗CVl988/Rispens株和814株发现有二个特征性位点突变;此外,还在其ORF中首次发现含15个氨基酸残基(EELCAQLCSTPPPPI)的2个重复和含6个氨基酸残基(PPICTP)的4个重复,全分布在MEQ蛋白C-端的转录激活域内。MEQ蛋白的表达仅局限于感染细胞的核内,而且随感染时间增加,具有从核质向核仁和核膜转移趋向;Western Blotting和免疫沉淀试验证实重组杆状病毒感染细胞裂解物中有大小约为60 kD的特异带。利用表达的MEQ蛋白产物免疫BALB/c小鼠,获得的杂交瘤细胞被克隆并与MDV感染的鸡胚成纤维细胞(CEF)做免疫荧光试验(FA),获得4株稳定产生抗MEQ蛋白单克隆抗体(McAb)的杂交瘤细胞,其中3G12E6单克隆抗体能够检测到MDV致瘤株感染的CEF及自然MD肿瘤细胞中表达的meq基因产物,而CVl988/Rispens感染的细胞则未检测到。发现细? 展开更多
关键词 马立克氏病病毒 致瘤基因 MEQ基因 单克隆抗体 基因功能 畜禽疾病
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森林消防车的发展现状和功能分析 被引量：20
15
作者 丛静华 何瑞银 王家胜 《林业机械与木工设备》 2006年第8期4-6,13,共4页
介绍了国内外当前森林消防车的发展现状以及几种有代表性的产品机型;对森林消防车应具备的功能进行了详细分析,如灭火性能、越野性能、运载能力、防火功能及通信功能等,并对森林消防车的发展趋势做了预测。
关键词 森林消防车 发展现状 功能分析 发展趋势 灭火性能 越野性能 运载能力
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甘蔗收获机扶蔗机构的概念设计与创新设计 被引量：19
16
作者 邓劲莲 李尚平 梁式 《农业机械学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2003年第6期58-61,共4页
对甘蔗收获机的扶蔗机构进行概念设计 ,采用构思设计法 ( Beitz)构建部件的功能原理解和设计过程模型 ,并对原理解进行功能分解 ;对概念设计所产生的概念样机进行发散性创新设计 ,建立满足功能要求的虚拟概念样机 ;针对传统螺旋扶蔗机... 对甘蔗收获机的扶蔗机构进行概念设计 ,采用构思设计法 ( Beitz)构建部件的功能原理解和设计过程模型 ,并对原理解进行功能分解 ;对概念设计所产生的概念样机进行发散性创新设计 ,建立满足功能要求的虚拟概念样机 ;针对传统螺旋扶蔗机构 ,采用 TRIZ创新设计方法 ,提出了能够解决传统螺旋扶蔗器对严重顺倒伏和较小程度的侧顺。 展开更多
关键词 甘蔗收获机 扶蔗机构 概念设计 创新设计 功能分解
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采用物质—场的功能分析法 被引量：16
17
作者 张建辉 檀润华 陈子顺 《机械设计与研究》 CSCD 北大核心 2009年第1期19-23,共5页
概念设计是产品创新的关键设计阶段,进行产品的功能分析和原理解求解是该阶段的主要任务,功能定义及功能分解是功能分析的前提。介绍了TRIZ理论中用于功能分析的物质—场分析法。提出了采用物质—场的功能分析用于产品创新设计的方法,... 概念设计是产品创新的关键设计阶段,进行产品的功能分析和原理解求解是该阶段的主要任务,功能定义及功能分解是功能分析的前提。介绍了TRIZ理论中用于功能分析的物质—场分析法。提出了采用物质—场的功能分析用于产品创新设计的方法,举例说明了该方法的应用。 展开更多
关键词 TRIZ 物质—场分析 功能分析 标准解
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紫花苜蓿盐诱导HD-Zip类转录因子MsHB2的克隆及功能分析 被引量：19
18
作者 李明娜 龙瑞才 +3 位作者 杨青川 沈益新 康俊梅 张铁军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期622-632,共11页
【目的】在已有的一条紫花苜蓿(Medicago sativa L.cv.Zhongmu-1)盐诱导未知基因的EST序列基础上,克隆其(MsHB2)全长序列并分析其功能,以进一步了解其在紫花苜蓿中的耐盐调控机理。【方法】以先前获得的EST序列为基础设计引物,使用RACE... 【目的】在已有的一条紫花苜蓿(Medicago sativa L.cv.Zhongmu-1)盐诱导未知基因的EST序列基础上,克隆其(MsHB2)全长序列并分析其功能,以进一步了解其在紫花苜蓿中的耐盐调控机理。【方法】以先前获得的EST序列为基础设计引物,使用RACE法从紫花苜蓿中克隆得到MsHB2的3′和5′末端序列,经DNAMAN软件拼接后得到其全长序列。使用多种生物信息学软件对MsHB2的开放阅读框,编码蛋白等电点、分子量、疏水性、亚细胞定位、进化关系等进行预测分析。构建MsHB2的亚细胞定位瞬时表达载体,使用基因枪转化法将MsHB2与GFP在洋葱表皮细胞中融合瞬时表达并观察其亚细胞定位荧光信号。将生长30 d的中苜一号分别进行300 mmol·L-1NaCl和0.1 mmol·L-1 ABA胁迫处理,取胁迫处理0、2、4、10、24 h后的根和茎叶组织提取总RNA并进行荧光定量PCR分析。构建了MsHB2的植物超表达载体,转化农杆菌GV3101菌株,使用农杆菌花序侵染法转化拟南芥并在盐胁迫条件下对转基因株系进行相关表型分析。【结果】将RACE法克隆得到MsHB2的3′和5′末端序列拼接后得到1 126 bp的全长序列,序列分析表明,其编码蛋白包含247个氨基酸,具有一个同源异型结构域和一个亮氨酸拉链结构域,与拟南芥HD-Zip第I类转录因子ATHB12具有较高相似性。进化树聚类分析表明MsHB2属于第Ⅰ类同源异型域亮氨酸拉链蛋白。洋葱亚细胞定位分析表明MsHB2定位于细胞核。转录水平表达分析表明MsHB2受300mmol·L-1 NaCl和0.1 mmol·L-1 ABA胁迫诱导而表达量显著升高。转基因研究表明在NaCl和ABA胁迫下,过量表达MsHB2的转基因拟南芥表现比野生型拟南芥更敏感。【结论】从紫花苜蓿中克隆得到一个定位于细胞核的同源异型域亮氨酸拉链蛋白基因MsHB2,其在紫花苜蓿中受NaCl和ABA胁迫诱导,并在NaCl和ABA胁迫条件下抑制转基因拟南芥的生长。推测MsHB2可能通过A 展开更多
关键词 紫花苜蓿 同源异型结构域 亮氨酸拉链 亚细胞定位 功能分析 转录因子
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不同植物查尔酮合成酶CHS基因的生物信息学分析 被引量：18
19
作者 张弢 《江西农业学报》 CAS 2012年第6期5-8,共4页
采用生物信息学方法对GenBank中已登录的10种不同植物中的查尔酮合成酶基因的核苷酸序列及所推测的氨基酸序列的理化性质、信号肽、跨膜结构、亲/疏水性、功能结构域以及其二级结构进行了详细的分析,构建了不同植物CHS的系统进化树。结... 采用生物信息学方法对GenBank中已登录的10种不同植物中的查尔酮合成酶基因的核苷酸序列及所推测的氨基酸序列的理化性质、信号肽、跨膜结构、亲/疏水性、功能结构域以及其二级结构进行了详细的分析,构建了不同植物CHS的系统进化树。结果表明,10种植物中CHS基因的开放阅读框的全长在1.2 kb左右,大约编码399个氨基酸;不同植物中的CHS的氨基酸序列均包括1个N-糖基化位点(32NMSS),4个蛋白激酶c磷酸化位点(69TIR、158SVK、202TFR、359SAK)和1个查尔酮合成酶活性位点(161RLMMYQQGCFAGGTVLR),均不存在信号肽、无跨膜结构域,是一个疏水性蛋白。 展开更多
关键词 查尔酮合成酶 生物信息学 功能分析 结构预测
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饲喂玉米秸秆的白星花金龟幼虫肠道细菌多样性 被引量：17
20
作者 田小燕 宋福平 +4 位作者 张杰 刘荣梅 张兴鹏 段江燕 束长龙 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期632-641,共10页
【目的】分析比较饲喂玉米Zea mays L.秸秆的白星花金龟Protaetia brevitarsis幼虫中肠、后肠中细菌群落结构,挖掘肠道细菌在白星花金龟消化秸秆中的功能。【方法】分别提取健康白星花金龟3龄幼虫10个样品(5个中肠内含物、5个后肠内含物... 【目的】分析比较饲喂玉米Zea mays L.秸秆的白星花金龟Protaetia brevitarsis幼虫中肠、后肠中细菌群落结构,挖掘肠道细菌在白星花金龟消化秸秆中的功能。【方法】分别提取健康白星花金龟3龄幼虫10个样品(5个中肠内含物、5个后肠内含物)肠道细菌总DNA,利用Illumina HiSeq技术对白星花金龟幼虫中肠和后肠细菌的16S rDNA V4区序列进行测序,统计样品操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)数量,分析物种丰度、α多样性和β多样性,并将细菌群落信息映射到KEGG基因组数据库,进行细菌群落功能挖掘。【结果】共获得白星花金龟3龄幼虫肠道细菌1 062 897高质量reads,聚类为2 441个OTUs,总共注释到27个门,51个纲,77目,168科,326属。在属的分类阶元上,中肠中以假单胞菌属Pseudomonas为最优势属,后肠中以脱硫弧菌属Desulfovibrio为最优势属。α多样性分析表明,后肠群落多样性更丰富;β多样性分析结果显示,后肠微生物群落更稳定。细菌群落功能分析结果显示,中肠、后肠细菌群落都含有降解秸秆相关的酶系,其中,中肠降解木质素相关的通路更丰富,后肠降解纤维素的酶更多。【结论】采用Illumina HiSeq测序技术明确了饲喂玉米秸秆的白星花金龟幼虫中肠、后肠细菌群落结构与特点,进一步发现了肠道细菌在白星花金龟秸秆消化过程中发挥的作用,相关研究结果将为白星花金龟消化秸秆的机制深入研究提供参考,为我国秸秆资源化利用提供新思路。 展开更多
关键词 白星花金龟 肠道细菌 16S RDNA V4区 细菌群落 群落多样性 功能分析
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