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乙醇-水混合溶剂中离子介质效应的测定
1
作者 史生华 周红 高耀庭 《西北大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 1992年第4期407-415,共9页
报道了离子选择电极电位法测定电解质从水向质量分数为0.40的乙醇-水中的标准迁移自由能△G~θ(MX)(MX=NaF,NaCl,NaBr,NaI,LiCl,HCl)。根据△G~θ_t(NaF)和△G~θ_t(NaCl)的直线外推所计算的单个离子的迁移自由能△G~θ(i)与碱金属氯化... 报道了离子选择电极电位法测定电解质从水向质量分数为0.40的乙醇-水中的标准迁移自由能△G~θ(MX)(MX=NaF,NaCl,NaBr,NaI,LiCl,HCl)。根据△G~θ_t(NaF)和△G~θ_t(NaCl)的直线外推所计算的单个离子的迁移自由能△G~θ(i)与碱金属氯化物的△_tG~θ(MCl)外推所计算的相当一致。本文明确证明了由于Cl^-是硬碱而I^-是软碱根据3个大卤素离子的△_tG~θ(MX)作图的Feakins外推法计算△_tG~θ(i)是错误的方法,而用硬碱和硬酸的△_tG~θ(MX)的外推法都是正确的。 展开更多
关键词 介质效应 乙醇-水溶剂 离子
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一组和AMBER力场配合的普适波恩模型参数 被引量：2
2
作者 章威 侯廷军 +1 位作者 乔学斌 徐筱杰 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第4期289-292,共4页
提出了一套和AMBER力场相匹配的普适波恩模型参数.新的参数集包含21种原子类型的初始半径和屏蔽因子.参数通过遗传算法拟合359个小分子水合自由能的实验值得到.采用新的参数,预测了44个小分子的水合自由能,预测值和实验值能很好地吻合,... 提出了一套和AMBER力场相匹配的普适波恩模型参数.新的参数集包含21种原子类型的初始半径和屏蔽因子.参数通过遗传算法拟合359个小分子水合自由能的实验值得到.采用新的参数,预测了44个小分子的水合自由能,预测值和实验值能很好地吻合,而且大大优于采用Jayaram参数得到的结果.此外,采用新的参数,还预测了15个蛋白质的水合自由能,预测值和PB/SA预测得到的结果能很好地吻合. 展开更多
关键词 AMBER力场 普适波恩模型参数 水合自由能 溶剂效应 泊松-玻尔兹曼方程 静电相互作用能 溶剂化自由能 生物大分子体系 模拟
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基于原子表面的蛋白质水合自由能预测模型
3
作者 侯廷军 章威 +2 位作者 黄钦 乔学斌 徐筱杰 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第8期723-726,共4页
提出了一种计算蛋白质水合自由能的简化模型(SAWSA2).模型把蛋白质分子中的原子分为20种不同的原子类型,通过每类原子的溶剂可及化表面以及相应的溶剂化参数,就可以得到分子的水合自由能.不同原子类型的溶剂化参数通过110个蛋白质分子... 提出了一种计算蛋白质水合自由能的简化模型(SAWSA2).模型把蛋白质分子中的原子分为20种不同的原子类型,通过每类原子的溶剂可及化表面以及相应的溶剂化参数,就可以得到分子的水合自由能.不同原子类型的溶剂化参数通过110个蛋白质分子水合自由能拟合得到,水合自由能的标准值采用了基于求解Possion-Boltzmann方程(PB)以及分子表面计算(SA)相结合的方法.采用得到的模型,预测了20个蛋白质分子的水合自由能,预测值的相对值和绝对值都能和PB/SA的计算值很好地吻合,大大优于两种已报导的水合自由能模型. 展开更多
关键词 原子表面 蛋白质 水合自由能 预测模型 分子表面模型 溶剂效应 蛋白质
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