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ForenSeq^(TM) DNA Signature Prep试剂盒在浙江畲族人群中的法医学应用
被引量:
1
1
作者
屈轶龄
林源
+10 位作者
杨子豪
陶瑞旸
夏若成
曹正军
高瑞祥
于欢
王紫薇
杨琪
张晓春
张素华
李成涛
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2021年第6期817-824,共8页
目的评估ForenSeq^(TM) DNA Signature Prep试剂盒(以下简称ForenSeq试剂盒)对浙江畲族人群STR序列的解读能力及法医学应用效能。方法应用MiSeq FGx法医基因组学系统和ForenSeq试剂盒对50例浙江畲族人群样本进行大规模平行测序(massivel...
目的评估ForenSeq^(TM) DNA Signature Prep试剂盒(以下简称ForenSeq试剂盒)对浙江畲族人群STR序列的解读能力及法医学应用效能。方法应用MiSeq FGx法医基因组学系统和ForenSeq试剂盒对50例浙江畲族人群样本进行大规模平行测序(massively parallel sequencing,MPS)检测,采用ForenSeq^(TM)通用分析软件分析测序数据,获取58个STR基因座的分型结果及序列结构信息。将MPS与PCR-CE技术的分型结果进行一致性比对,并计算等位基因频率和群体遗传学参数。结果在50例浙江畲族人群样本中,共观察到448种序列多态性等位基因,与PCR-CE技术检测的片段长度多态性结果相比,基于ForenSeq试剂盒的MPS检测增加了82个等位基因,在6个基因座的侧翼区共发现7个SNP变异。22例男性的24个Y染色体STR基因座中共检测到19种单倍型。27个常染色体STR基因座的累积个体识别率为1-8.87×10^(-30),累积二联体非父排除率为0.999999962640657,累积三联体非父排除率为0.999999999999633。结论基于MiSeq FGx法医基因组学系统使用ForenSeq试剂盒进行MPS检测,极大提高了检测效能。58个STR基因座在所调查的浙江畲族人群中具有良好的遗传多态性,可应用于法医学个体识别和亲权鉴定。
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关键词
法医遗传学
大规模平行测序
短串联重复
多态现象
遗传
^
forenseq
^(
tm
)
dna
signature
prep
试剂盒
畲族
浙江
下载PDF
职称材料
题名
ForenSeq^(TM) DNA Signature Prep试剂盒在浙江畲族人群中的法医学应用
被引量:
1
1
作者
屈轶龄
林源
杨子豪
陶瑞旸
夏若成
曹正军
高瑞祥
于欢
王紫薇
杨琪
张晓春
张素华
李成涛
机构
苏州大学基础医学与生物科学学院
司法鉴定科学研究院上海市法医学重点实验室司法部司法鉴定重点实验室上海市司法鉴定专业技术服务平台
华东政法大学
盐城市公安局刑警支队
出处
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2021年第6期817-824,共8页
基金
万人计划青年拔尖人才项目(WRQB2019)
中青年科技创新领军人才项目(2018RA2102)
+2 种基金
司法部司法鉴定重点实验室资助项目
上海市法医学重点实验室资助项目(21DZ2270800)
上海市司法鉴定专业技术服务平台资助项目(19DZ2292700)。
文摘
目的评估ForenSeq^(TM) DNA Signature Prep试剂盒(以下简称ForenSeq试剂盒)对浙江畲族人群STR序列的解读能力及法医学应用效能。方法应用MiSeq FGx法医基因组学系统和ForenSeq试剂盒对50例浙江畲族人群样本进行大规模平行测序(massively parallel sequencing,MPS)检测,采用ForenSeq^(TM)通用分析软件分析测序数据,获取58个STR基因座的分型结果及序列结构信息。将MPS与PCR-CE技术的分型结果进行一致性比对,并计算等位基因频率和群体遗传学参数。结果在50例浙江畲族人群样本中,共观察到448种序列多态性等位基因,与PCR-CE技术检测的片段长度多态性结果相比,基于ForenSeq试剂盒的MPS检测增加了82个等位基因,在6个基因座的侧翼区共发现7个SNP变异。22例男性的24个Y染色体STR基因座中共检测到19种单倍型。27个常染色体STR基因座的累积个体识别率为1-8.87×10^(-30),累积二联体非父排除率为0.999999962640657,累积三联体非父排除率为0.999999999999633。结论基于MiSeq FGx法医基因组学系统使用ForenSeq试剂盒进行MPS检测,极大提高了检测效能。58个STR基因座在所调查的浙江畲族人群中具有良好的遗传多态性,可应用于法医学个体识别和亲权鉴定。
关键词
法医遗传学
大规模平行测序
短串联重复
多态现象
遗传
^
forenseq
^(
tm
)
dna
signature
prep
试剂盒
畲族
浙江
Keywords
forensic
genetics
massively
parallel
sequencing
short
tandem
repeat(STR)
polymorphism,genetic
^
forenseq
^(
tm
)
dna
signature
prep
kit
She
ethnic
group
Zhejiang
分类号
D919 [医药卫生—法医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ForenSeq^(TM) DNA Signature Prep试剂盒在浙江畲族人群中的法医学应用
屈轶龄
林源
杨子豪
陶瑞旸
夏若成
曹正军
高瑞祥
于欢
王紫薇
杨琪
张晓春
张素华
李成涛
《法医学杂志》
CAS
CSCD
2021
1
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