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Recent progress in two-photon small molecule fluorescent probes for enzymes 被引量:1
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作者 Ding Chen Wenjing Qin +4 位作者 Haixiao Fang Lan Wang Bo Peng Lin Li Wei Huang 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2019年第10期1738-1744,共7页
Enzymes are macromolecular biological catalysts which can accelerate chemical reactions in living organisms. Almost all the physiological metabolism activities in the cell need enzymes to sustain life via rapid cataly... Enzymes are macromolecular biological catalysts which can accelerate chemical reactions in living organisms. Almost all the physiological metabolism activities in the cell need enzymes to sustain life via rapid catalysis. Currently, medical research has proved that abnormal enzyme activity is associated with numerous diseases, such as Parkinson’s disease(PD), Alzheimer’s disease(AD) and cancers. On the other hand, early diagnosis of those diseases is of great significance to improve the survival rate and cure rate.In the current diagnostic tools, two-photon fluorescent probes(TPFPs) are developing rapidly due to their unique advantages, such as higher spatial resolution, deeper imaging depth, and lower biotoxicity.Therefore, the design and synthesis of two-photon(TP) small molecule enzymatic probes have broad prospects for early diagnosis and treatment of diseases. As of now, scientists have developed many TP small molecule enzymatic probes. This review aims to summarize the TP small molecule enzymatic probes and expound the reaction mechanism. 展开更多
关键词 ENZYMES FLUORESCENCE TWO-PHOTON probes fluorogenic probes Small MOLECULE DISEASE
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SNAP-tag fluorogenic probes for wash free protein labeling
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作者 Shuang Leng Qing-Long Qiao +3 位作者 Yue Gao Lu Miao Wu-Guo Deng Zhao-Chao Xu 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2017年第10期1911-1915,共5页
Protein labeling by using a protein tag and tag-specific fluorescent probes is increasingly becoming a useful technique for the real-time imaging of proteins in living cells. SNAP-tag as one of the most prominent fusi... Protein labeling by using a protein tag and tag-specific fluorescent probes is increasingly becoming a useful technique for the real-time imaging of proteins in living cells. SNAP-tag as one of the most prominent fusion tags has been widely used and already commercially available. Recently, various fluorogenic probes for SNAP-tag based protein labeling were reported. Owing to turn-on fluorescence response, fluorogenic probes for SNAP-tag minimize the fluorescence background caused by unreacted or nonspecifically bound probes and allow for direct imaging in living cells without wash-out steps. Thus,real-time analysis of protein localization, dynamics and interactions has been made possible by SNAP-tag fluorogenic probes. In this review,we describe the design strategies of fluorogenic probes for SNAP-tag and their applications in cellular protein labeling. 展开更多
关键词 fluorogenic probes Wash free SNAP-TAG Protein labeling
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β-内酰胺酶的活性检测和抑制研究进展 被引量:1
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作者 丁阳 吴琼 李林 《安徽科技学院学报》 2021年第1期1-9,共9页
β-内酰胺类抗生素是20世纪的伟大发明之一,拯救了数以万计生命。然而,随着抗生素临床应用的普及,由β-内酰胺酶导致的致病菌耐药性问题也日益突出。耐药菌的进化和传播严重影响到人类健康和全球社会经济发展。因此,检测/抑制β-内酰胺... β-内酰胺类抗生素是20世纪的伟大发明之一,拯救了数以万计生命。然而,随着抗生素临床应用的普及,由β-内酰胺酶导致的致病菌耐药性问题也日益突出。耐药菌的进化和传播严重影响到人类健康和全球社会经济发展。因此,检测/抑制β-内酰胺酶的活性对合理使用抗生素、有效治疗感染类疾病具有重要意义。目前,特异性检测、抑制β-内酰胺酶的相关方法和临床应用已有报道。本综述主要阐述细菌产生β-内酰胺酶的耐药机理,总结近年来β-内酰胺酶荧光探针和抑制剂的发展,以期为今后设计特异性高、灵敏度强的该类荧光探针和抑制剂提供理论依据,解决抗生素耐药性问题。 展开更多
关键词 Β-内酰胺酶 耐药菌 抗生素 荧光探针 抑制剂
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活体底栖有孔虫鉴别方法及其应用
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作者 张涵 许博超 +2 位作者 郭肖伊 张晓洁 于志刚 《地球科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1247-1257,共11页
活体底栖有孔虫在底栖生态系统的环境指示研究等诸多研究领域都极具应用价值,但如何准确快速有效地识别活体有孔虫具有挑战性。目前,研究人员已经建立了多种方法用于识别活体底栖有孔虫。在调研相关研究的基础上,对这些方法的优缺点及... 活体底栖有孔虫在底栖生态系统的环境指示研究等诸多研究领域都极具应用价值,但如何准确快速有效地识别活体有孔虫具有挑战性。目前,研究人员已经建立了多种方法用于识别活体底栖有孔虫。在调研相关研究的基础上,对这些方法的优缺点及其应用中的注意事项进行了总结。虎红染色法操作快速简便、实验成本低,是最为常用的活体有孔虫鉴别方法。苏丹黑B染色法和MTT染色法比虎红染色法准确性更高,但操作略显复杂,在野外调查研究中应用较少。荧光探针法不影响有孔虫生命活动且准确性更高,但其操作复杂、成本较高,常被推荐用于低氧/缺氧条件下的有孔虫研究。三磷酸腺苷分析法和超显微结构法均具有较高的准确性,但操作复杂、设备要求高,前者被广泛应用于活体有孔虫数量密度的估算和生物量的计算,并被推荐用于低氧/缺氧条件下的有孔虫相关研究,后者主要用于分析评价有孔虫对缺氧、重金属污染等环境压力的适应性。研究者应根据研究目的、研究成本等条件选择一种或多种合适的研究方法,以获得更为可靠的研究结果。 展开更多
关键词 活体底栖有孔虫 虎红染色法 荧光探针法 三磷酸腺苷分析法 超显微结构法
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2型糖尿病患者肝脂肪酶基因标签单核苷酸多态性与血脂水平分析
5
作者 张阳东 冯鑫 +3 位作者 穆飞航 楚瑞雪 时磊 陈珂 《标记免疫分析与临床》 CAS 2011年第6期395-398,共4页
观察汉族人群肝脂肪酶(HL)基因2个标签单核苷酸多态性(SNP)与2型糖尿病(T2DM)及血脂代谢的相关性。应用荧光标记单碱基延伸分型技术及寡核苷酸微阵列芯片杂交技术检测HL基因rs12462668和rs10426971多态性。用全自动生化分析仪检测CHO、T... 观察汉族人群肝脂肪酶(HL)基因2个标签单核苷酸多态性(SNP)与2型糖尿病(T2DM)及血脂代谢的相关性。应用荧光标记单碱基延伸分型技术及寡核苷酸微阵列芯片杂交技术检测HL基因rs12462668和rs10426971多态性。用全自动生化分析仪检测CHO、TG、HDL-C、LDL-C、载脂蛋白A1(ApoA1)及载脂蛋白B(ApoB)。结果表明:T2DM组rs12462668的AA、GG基因型频率、等位基因频率及由2个SNP构建的单倍型频率与对照组比较差异有统计学意义。T2DM组的TG和ApoB显著高于对照组,HDL-C和ApoA1显著低于对照组。组间各基因型血脂水平比较结果显示,2个SNP与TG、HDL-C和ApoA1代谢紊乱有关。组内各基因型间血脂水平比较结果显示,T2DM患者的HDL-C水平与rs12462668多态性有关,而TG水平与rs10426971多态性有关。这提示HL基因的2个标签SNP与T2DM的发生密切相关,并可影响血脂的代谢。 展开更多
关键词 肝脂肪酶 2型糖尿病 基因 单核苷酸多态性 荧光标记 芯片杂交技术 生化分析仪
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实时荧光定量聚合酶链反应法检测肺结核患者痰标本价值的对照研究 被引量:10
6
作者 梁晓海 黄平东 《现代中西医结合杂志》 CAS 2006年第3期287-288,共2页
目的探讨不同方法对肺结核的诊断价值。方法以实时荧光定量聚合酶链反应法、痰直接涂片找抗酸杆菌法、痰结核杆菌培养法对我院56例确诊肺结核患者痰标本检查比较。结果荧光定量PCR法检出结核杆菌阳性率显著高于痰涂片抗酸染色和培养法,... 目的探讨不同方法对肺结核的诊断价值。方法以实时荧光定量聚合酶链反应法、痰直接涂片找抗酸杆菌法、痰结核杆菌培养法对我院56例确诊肺结核患者痰标本检查比较。结果荧光定量PCR法检出结核杆菌阳性率显著高于痰涂片抗酸染色和培养法,其他非肺结核结果阳性率仅为2.7%,特异度较高。结论实时荧光定量聚合酶链反应法对肺结核诊断方面灵敏度及特异度较高,同时反映抗结核治疗过程中痰标本中的结核杆菌的数量变化,对抗结核药物疗效有良好的监控效果,应列入肺结核常规实验室检查项目。 展开更多
关键词 肺结核 诊断 实时荧光定量聚合酶链反应
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活细胞RNA动态成像技术进展
7
作者 高万锴 陈振寅 +1 位作者 荣霄霄 李幸 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2024年第4期651-667,共17页
RNA是生命“中心法则”的主要成员,广泛参与细胞内各种生命活动.RNA在活细胞内的区室定位和动态过程与RNA功能息息相关.因此,需要开发活细胞内RNA成像技术,追踪RNA时空动态过程,原位阐明RNA活性和功能,进一步解析RNA相关生命过程和疾病... RNA是生命“中心法则”的主要成员,广泛参与细胞内各种生命活动.RNA在活细胞内的区室定位和动态过程与RNA功能息息相关.因此,需要开发活细胞内RNA成像技术,追踪RNA时空动态过程,原位阐明RNA活性和功能,进一步解析RNA相关生命过程和疾病的关系.本文系统阐述两大活细胞RNA成像体系:(i)RNA发夹:荧光蛋白体系;(ii)荧光响应RNA适配体:小分子探针体系.并介绍其他可用于动态示踪RNA的技术,概述不同技术在追踪活细胞RNA方面的特点和问题,讨论RNA动态成像技术未来的发展方向. 展开更多
关键词 活细胞RNA成像 荧光蛋白 RNA适配体 小分子探针
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基质金属蛋白酶MMP-2/9分子探针对临床结肠癌组织的检测 被引量:8
8
作者 余祖红 栾富娟 +6 位作者 冷霞 史玉雪 王洁 尹玲 何蕾 史海斌 陈卫昌 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第3期318-326,共9页
研发基质金属蛋白酶MMP-2/9特异性识别的荧光分子探针并用于临床结肠癌组织的快速、准确性检测意义重大,但仍然具有一定的挑战性.本文基于基质金属蛋白酶MMP-2和MMP-9(MMP-2/9)特异性识别的多肽底物,利用一价铜离子催化的"点击&qu... 研发基质金属蛋白酶MMP-2/9特异性识别的荧光分子探针并用于临床结肠癌组织的快速、准确性检测意义重大,但仍然具有一定的挑战性.本文基于基质金属蛋白酶MMP-2和MMP-9(MMP-2/9)特异性识别的多肽底物,利用一价铜离子催化的"点击"化学和酰胺化反应,分别将荧光素(FITC-N_3)和荧光淬灭基团Dabcyl-NHS偶联于多肽底物两端,制备得到MMP-2/9特异性识别的荧光能量共振转移(FRET)荧光分子探针Dab-GPLGVRGYFITC.通过将重组基质金属蛋白酶MMP-2/9与探针作用,跟踪检测溶液在520 nm处荧光信号变化的情况,对探针的特异性和检测灵敏度进行评估.此外,利用人源大肠癌细胞LoVo和30例临床结肠癌组织样本开展了结肠癌快速体外检测初步研究.体外重组酶检测实验表明,探针对MMP-2/9具有较强的特异性和选择性,对MMP-2的最低检测限可达14 ng/mL.共聚焦显微成像实验显示,相比于正常人胃黏膜上皮细胞GES-1,肠癌细胞LoVo表现出较强的绿色荧光信号,如预先加入抑制剂,细胞的荧光信号则很弱.另外,15例活性MMP-2高表达的临床结直肠癌组织裂解液与探针作用后荧光信号较胃炎组织增强5~9倍,而15例癌旁组织裂解液荧光则增强约0.9~3.0倍.值得注意的是,如果将探针喷洒到结肠癌组织和癌旁组织表面,相比于胃炎组织,荧光信号明显增强.总之,该探针对基质金属蛋白酶MMP-2/9过表达肠癌细胞和结肠癌组织表现出较好的特异性和检测灵敏度,具有应用于临床结肠癌早期诊断的极大潜力. 展开更多
关键词 荧光探针 荧光能量共振转移(FRET) 基质金属蛋白酶MMP-2/9 结肠癌
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A novel fluorogenic probe for monoamine oxidase assays 被引量:3
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作者 You You Lu Yu Guang Wang Bin Dai Yi Qi Dai Zhao Wang Zheng Wei Fu Qing Zhu 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2008年第8期947-950,共4页
Monoamine oxidase is flavoenzymes, widely distributed in mammals. It is well recognized that MAOs serve an important role in metabolism that they have close relationship with health .Along with the discoveries between... Monoamine oxidase is flavoenzymes, widely distributed in mammals. It is well recognized that MAOs serve an important role in metabolism that they have close relationship with health .Along with the discoveries between MAOs and neurotic disease, more and more studies have been jumped in .In this paper, we design a new probe for assaying the activities of MAOs. The results showed that the probe [7-(3-aminopropoxy)coumarin] is simple, effective and sensitive for MAOB. 展开更多
关键词 Monoamine oxidase fluorogenic probe ASSAY
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荧光探针杂交-聚合酶链反应检测沙门菌的研究及应用 被引量:3
10
作者 张建琼 韩光明 +3 位作者 张雪萍 林陵 高良 单祥年 《上海医学检验杂志》 北大核心 2002年第4期201-203,共3页
目的 建立一种快速检测沙门菌的荧光探针杂交 聚合酶链反应 (PCR)方法。方法 利用TaqDNA聚合酶的 5’ 3’核酸外切酶活性降解特异性杂交于模板上的荧光标记探针 ,导致荧光强度的改变 ,通过检测荧光强度分析PCR扩增产物。结果 选用 1... 目的 建立一种快速检测沙门菌的荧光探针杂交 聚合酶链反应 (PCR)方法。方法 利用TaqDNA聚合酶的 5’ 3’核酸外切酶活性降解特异性杂交于模板上的荧光标记探针 ,导致荧光强度的改变 ,通过检测荧光强度分析PCR扩增产物。结果 选用 13株常见致病性沙门菌和 7株非沙门菌进行特异性分析 ,所有沙门菌的荧光△RQ值介于 3~ 8之间 ,而所有非沙门菌的荧光△RQ值均小于 1;在敏感性分析中 ,采用菌落CFU计数法 ,最低限度可检测到每PCR扩增体系中含 2 .2 5CFU的沙门菌 ;与传统细菌培养鉴定方法对照 ,对 4 0份各种标本进行沙门菌的检测 ,结果该方法的特异性为 10 0 % ,敏感性为 93.1% ,两种方法的符合率为 95 %。结论 用荧光探针杂交 PCR检测沙门菌 ,是一种快速。 展开更多
关键词 荧光探针杂交 聚合酶链反应 检测 沙门菌 研究 应用
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Detection of Hepatitis B Virus DNA by Duplex Scorpion Primer-based PCR Assay 被引量:1
11
作者 孔德明 沈含熙 宓怀风 《Chinese Journal of Chemistry》 SCIE CAS CSCD 2004年第9期903-907,共5页
The application of a new fluorogenic probe-based PCR assay (PCR duplex scorpion primer assay) to the detection of Hepatitis B virus (HBV) DNA in human sera was described. Duplex scorpion primer is a modified variant o... The application of a new fluorogenic probe-based PCR assay (PCR duplex scorpion primer assay) to the detection of Hepatitis B virus (HBV) DNA in human sera was described. Duplex scorpion primer is a modified variant of duplex Amplifluor, and the incorporation of a PCR stopper between probe and primer sequences improve the detection specificity and sensitivity. Combined with PCR amplification, this probe can give unambiguous positive results for the reactions initiated with more than 20 HBV molecules. In addition, the particular unimolecular probing mechanism of this probe makes the use of short target-specific probe sequence possible, which will render this probe applicable in some specific systems. 展开更多
关键词 duplex scorpion primer hepatitis B virus (HBV) DNA fluorogenic probe
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Fluorescence imaging mitochondrial copper(Ⅱ) via photocontrollable fluorogenic probe in live cells
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作者 Liulin Wang Buxiang Chen +7 位作者 Pingping Peng Wenbo Hu Zhipeng Liu Xiaohua Pei Weihong Zhao Chengwu Zhang Lin Li Wei Huang 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2017年第10期1965-1968,共4页
Monitoring mitochondrial derived copper(Ⅱ) in live cells is highly demanded, but accurately detecting is unmet due to the interference with cytoplasmic copper(Ⅱ). Herein, we have reported the design,synthesis an... Monitoring mitochondrial derived copper(Ⅱ) in live cells is highly demanded, but accurately detecting is unmet due to the interference with cytoplasmic copper(Ⅱ). Herein, we have reported the design,synthesis and characterization of photocontrollable fluorogenic probe, MCu-3, which is equipped with a photo-labile group(nitrobenzyl group) and mitochondria targeting unit(triphenylphosphonium salt).This novel probe showed an intense fluorescence enhancement in response to copper(Ⅱ) without interference from other metal cations in the biological condition(p H 6–9). The detection limit is 1.7 ×10^(-7) mol/L in HEPES buffer. The confocal fluorescence imaging results demonstrated MCu-3 can visualize mitochondrial copper(Ⅱ) in live mammalian cells. The clear advantage of our photocontrollable method is successful to avoid the influence of cytoplasmic copper(Ⅱ) during mitochondria specific detection. 展开更多
关键词 MITOCHONDRIA Photocontrollable fluorogenic probe Fluorescence imaging Copper(Ⅱ)
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尿激酶型纤溶酶原激活剂mRNA在卵巢癌组织中的表达及其意义 被引量:8
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作者 舒晓燕 熊俊 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 2004年第20期57-58,共2页
目的研究尿激酶型纤溶酶原激活剂(uPA)mRNA在卵巢癌组织中的表达及其意义。方法应用荧光定量RT-PCR方法,分别检测23例卵巢癌组织中uPA mRNA的表达,与卵巢良性肿瘤相比较。同时,分析uPA mRNA的表达与卵巢癌的临床分期之间的关系。结果23... 目的研究尿激酶型纤溶酶原激活剂(uPA)mRNA在卵巢癌组织中的表达及其意义。方法应用荧光定量RT-PCR方法,分别检测23例卵巢癌组织中uPA mRNA的表达,与卵巢良性肿瘤相比较。同时,分析uPA mRNA的表达与卵巢癌的临床分期之间的关系。结果23例卵巢癌组织中uPA mRNA的表达阳性率为60.9%,卵巢良性肿瘤uPA mRNA表达阳性率为30.0%,且uPA mRNA表达卵巢癌的临床分期呈正相关。结论uPA mRNA表达可作为判断卵巢癌恶性程度及预后的指标之一。 展开更多
关键词 卵巢癌 荧光定量逆转录酶链式反应 尿激酶型纤溶酶原激活剂
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聚合酶链反应分子灯塔法检测结核分枝杆菌 被引量:8
14
作者 李国利 赵铭 +5 位作者 庄玉辉 王巍 夏湘萱 徐淼 戴海峰 方翔 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期82-83,共2页
目的 评价聚合酶链反应 (PCR )分子灯塔法检测临床标本中结核分枝杆菌 (结核菌 )的应用价值。方法 应用涂片镜检法、培养法及PCR分子灯塔法检测 142份结核病患者痰标本 ,42份非结核呼吸系疾病患者痰标本。结果 涂片镜检法检测结核病... 目的 评价聚合酶链反应 (PCR )分子灯塔法检测临床标本中结核分枝杆菌 (结核菌 )的应用价值。方法 应用涂片镜检法、培养法及PCR分子灯塔法检测 142份结核病患者痰标本 ,42份非结核呼吸系疾病患者痰标本。结果 涂片镜检法检测结核病患者临床标本中结核菌阳性率为 35 .2 % (5 0 / 142 ) ,培养法阳性率为 35 .9% (5 1/ 142 ) ,PCR分子灯塔法阳性率为 44 .4% (6 3/ 142 )。用PCR分子灯塔法检测临床标本特异性为 10 0 %。结论 PCR分子灯塔法是一种全新的PCR分子杂交模式 ,PCR扩增、荧光探针杂交、检测一体化 ,在单一管内完成 ,其简便、快速、防污染 ,敏感性较高、特异性强 。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 聚合酶链反应 荧光探针杂交 分子灯塔法
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荧光探针杂交技术检测临床标本内结核分支杆菌的价值 被引量:7
15
作者 李国利 赵铭 +5 位作者 王巍 夏懿 沈建伟 夏湘萱 庄玉辉 常京元 《中国防痨杂志》 CAS 北大核心 2003年第2期65-67,共3页
目的 评价聚合酶链反应 (PCR)荧光探针杂交技术 (TaqMan技术 )检测临床标本中结核分支杆菌的应用价值。方法 应用细菌学方法(涂片镜检和培养 )及TaqMan法检测 1 3 3份结核病患者痰标本 ,5 3份非结核呼吸系疾病患者痰标本。结果 细菌... 目的 评价聚合酶链反应 (PCR)荧光探针杂交技术 (TaqMan技术 )检测临床标本中结核分支杆菌的应用价值。方法 应用细菌学方法(涂片镜检和培养 )及TaqMan法检测 1 3 3份结核病患者痰标本 ,5 3份非结核呼吸系疾病患者痰标本。结果 细菌学方法检测结核病患者临床标本中结核分支杆菌阳性率为 3 6.1 % ,TaqMan法阳性率为 61 .7% ,高于细菌学检测法 ,经统计学处理 ,两者有显著性差异 (P <0 .0 5 ) ,用TaqMan法检测临床标本特异性为 96.2 %。 结论 TaqMan技术将PCR扩增、荧光探针杂交及检测一体化 ,在单一管内完成 ,具有简便、快速、防污染、敏感性及特异性较高等优点 ,是结核病辅助诊断的有效方法之一。 展开更多
关键词 结核分支杆菌 聚合酶链反应 荧光探针杂交
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荧光定量PCR技术检测喉鳞状细胞癌标本中Skp2基因表达 被引量:5
16
作者 郭剑锋 陈福进 +6 位作者 管志伟 吴绮丽 曾朝辉 陈艳峰 李秋梨 欧阳电 胡斌 《临床耳鼻咽喉头颈外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期547-550,共4页
目的:探讨细胞S相激酶相关蛋白(Skp2)基因在喉鳞状细胞癌发生、发展中的作用。方法:应用荧光定量逆转录PCR(FQ-PCR)技术检测40例喉鳞状细胞癌及10例癌旁正常组织中Skp2 mRNA拷贝数,并分析其与临床相关因素的关系。结果:40例喉鳞状细胞癌... 目的:探讨细胞S相激酶相关蛋白(Skp2)基因在喉鳞状细胞癌发生、发展中的作用。方法:应用荧光定量逆转录PCR(FQ-PCR)技术检测40例喉鳞状细胞癌及10例癌旁正常组织中Skp2 mRNA拷贝数,并分析其与临床相关因素的关系。结果:40例喉鳞状细胞癌Skp2 mRNA中位拷贝数为6 622.54 copy/μg RNA,10例癌旁正常组织为0 copy/μg RNA,两组差异有统计学意义(P<0.01);喉鳞状细胞癌和癌旁正常组织Skp2 mRNA阳性表达率分别为50%和0,差异有统计学意义(P<0.01)。喉鳞状细胞癌中颈淋巴结转移组Skp2 mRNA中位拷贝数为617 138.4 copy/μg RNA,颈淋巴结无转移组为0 copy/μg RNA,两组差异有统计学意义(P<0.05);喉鳞状细胞癌中颈淋巴结转移组和颈淋巴结无转移组Skp2 mRNA阳性表达率分别为100.00%和35.48%,差异有统计学意义(P<0.01)。结论:Skp2基因可能与喉鳞状细胞癌颈淋巴结转移有关,FQ-PCR为一精确检测喉鳞状细胞癌Skp2 mRNA表达的方法,Skp2 mRNA表达水平可能成为预测喉鳞状细胞癌颈淋巴结转移的更加灵敏的指标。 展开更多
关键词 喉肿瘤 鳞状细胞 荧光定量PCR SKP2基因
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Establishment of Real-Time TaqMan-Fluorescence Quantitative RT-PCR Assay for Detection and Quantification of Porcine Lipoprotein Lipase mRNA 被引量:4
17
作者 LIAN Hong-xia LU De-xun GAO Min 《Agricultural Sciences in China》 CSCD 2009年第10期1256-1262,共7页
Porcine lipoprotein lipase (LPL) cDNA was cloned as the standard for real-time quantifying LPL mRNA and the TaqMan-fluorescence quantitative PCR assay for detection was established. The total RNA extracted from Long... Porcine lipoprotein lipase (LPL) cDNA was cloned as the standard for real-time quantifying LPL mRNA and the TaqMan-fluorescence quantitative PCR assay for detection was established. The total RNA extracted from Longissimus dorsi of porcine was reverse-transcribed to cDNA. LPL cDNA was ligated with pGM-T vector and transformed into Escherichia coli TOP10. Plasmid DNA extracted from positive clones was verified by PCR amplification and sequenced. LPL was amplified by real-time fluorescence quantitative PCR from the plasmid DNA. The concentration of DNA template purified was detected by analyzing absorbance in 260 nm and then the combined plasmid was diluted to series as standard for fluorescence quantitative PCR (FQ-PCR). The method of LPL mRNA real-time PCR was well established, which detected as low as 103 with the linear range 10^3 to 10^10 copies. The standard curves showed high correlations (R2 = 0.9871). A series of standards for real-time PCR analysis have been constructed successfially, and real-time TaqMan-fluorescence quantitative RT-PCR is reliable to quantitatively evaluate FQ-PCR mRNA in L. dorsi of porcine. 展开更多
关键词 PORCINE lipoprotein lipase FQ-PCR TaqMan fluorogenic probe
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基于自淬灭探针的LAMP可视化快速检测方法
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作者 熊雄 薛晗玥 +2 位作者 费延堻 王诗慧 谢普军 《食品研究与开发》 CAS 2024年第9期166-173,共8页
该研究拟筛选与自淬灭探针互补的寡核苷酸序列,利用双链DNA的荧光超淬灭机制,构建可视化反应体系,从而实现基于自淬灭探针的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)可视化快速检测。结果表明:添加与自淬灭探针完... 该研究拟筛选与自淬灭探针互补的寡核苷酸序列,利用双链DNA的荧光超淬灭机制,构建可视化反应体系,从而实现基于自淬灭探针的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)可视化快速检测。结果表明:添加与自淬灭探针完全互补的寡核苷酸序列,体系的背景荧光强度会出现显著下降(P<0.05)。当熔解温度(melting temperature,Tm)值高于室温时,缩短互补序列的长度(从3'端)不会影响其淬灭作用。基于互补序列的荧光超淬灭机制构建的LAMP可视化反应体系能够有效降低背景荧光,反应结束后表现出易于读取的可视化结果,并成功用于虹鳟鱼的快速检测。综上,合适的互补序列能够降低自淬灭探针的背景荧光,利用该互补序列和自淬灭探针建立低背景荧光的LAMP体系能够在可视化检测中表现出适用性。 展开更多
关键词 自淬灭探针 荧光淬灭 互补序列 Tm值 可视化
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TaqMan荧光定量RT-PCR检测猪脂蛋白酯酶mRNA方法的建立 被引量:3
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作者 廉红霞 卢德勋 高民 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期1464-1469,共6页
【目的】克隆猪cDNA,作为猪LPLmRNA定量检测的标准品,建立检测方法。【方法】用RT-PCR,从猪背最长肌的总RNA中逆转录扩增LPL的cDNA,将纯化的LPLcDNA与pGM-T载体进行连接,转化宿主菌TOP10,提取重组质粒DNA,PCR鉴定并测序分析,对质粒标准... 【目的】克隆猪cDNA,作为猪LPLmRNA定量检测的标准品,建立检测方法。【方法】用RT-PCR,从猪背最长肌的总RNA中逆转录扩增LPL的cDNA,将纯化的LPLcDNA与pGM-T载体进行连接,转化宿主菌TOP10,提取重组质粒DNA,PCR鉴定并测序分析,对质粒标准进行实时荧光定量PCR检测。纯化质粒并检测260nm吸光度,确定原液的重组质粒拷贝浓度并以此制备荧光定量PCR梯度浓度标准品。【结果】建立了猪LPLmRNA实时定量PCR检测方法,特异性好,检测灵敏度达103拷贝,线性范围为1×103~1×1010拷贝,阈值与PCR体系中起始模板量的对数值之间有着良好的线性关系(R2=0.9871)。【结论】成功克隆了LPL实时荧光PCR定量标准,且TaqMan荧光定量RT-PCR的方法可对猪背最长肌LPLmRNA的表达进行准确定量。 展开更多
关键词 脂蛋白酯酶 实时定量RT-PCR TaqMan荧光探针
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自身淬灭荧光定量PCR检测慢性粒细胞白血病bcr/abl mRNA
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作者 彭辉 冯文莉 +6 位作者 王小中 曾建明 肖青 潘健 曹唯希 罗云萍 黄宗干 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期1227-1231,共5页
目的利用自身淬灭探针技术建立一种能检测慢性粒细胞白血病(CML)bcr/abl融合基因mRNA的实时荧光定量PCR方法,为CML的诊断、疗效观察以及微量残留白血病(MRD)的监测提供有效手段。方法用逆转录PCR方法(RT—PCR)扩增K562细胞的bcr... 目的利用自身淬灭探针技术建立一种能检测慢性粒细胞白血病(CML)bcr/abl融合基因mRNA的实时荧光定量PCR方法,为CML的诊断、疗效观察以及微量残留白血病(MRD)的监测提供有效手段。方法用逆转录PCR方法(RT—PCR)扩增K562细胞的bcr/abl融合基因,A-T克隆法构建定量标准模板;设计自身淬灭荧光引物(探针),建立自身淬灭荧光定量逆转录PCR方法(FQ—RT—PCR),并对该方法的线性检测范围、灵敏度、重复性、稳定性进行检测;然后检测临床白血病患者骨髓标本bcr/abl mRNA。结果建立的FQ—RT—PCR方法可检测10copies/μl的bcr/abl重组质粒,并能从10^5个正常细胞中检出1个白血病细胞,该方法的批内、批间变异系数(CV)分别为2.1%、6.1%,线性检测范围为10^2-10^9copies/μl。25例CML患者bcr/abl融合基因mRNA表达量中位数为4.50×10^4[(0.45—89.00)×10^4]copies/μg RNA,其中11例慢性期初诊患者bcr/abl mRNA表达量中位数为5.45×10^4[(2.95—19.30)×10^4]copies/μg RNA,6例急变期患者bcr/abl mRNA表达量中位数为13.00×10^4[(4.10~89.00)×10^4]copies/μg RNA,8例慢性期治疗后复查患者bcr/abl mRNA表达量中位数为2.35×10^4[(0.45—5.12)×10^4]copies/μg RNA,CML急变期患者bcr/abl融合基因表达水平与慢性期患者之间差异有统计学意义(q=3.41,P〈0.05)。PCR产物经电泳分析,其中21例CML患者为b3a2型,4例CML患者为b2a2型;3例急性淋巴细胞白血病(ALL)患者中,1例有bcr/abl mRNA表达,为b2a2型。结论所建立的基于自身淬灭探针技术的实时荧光定量PCR检测方法灵敏、特异、重复性好,结果用拷贝数表示,准确可靠,利于标准统一。可广泛用于CML的诊断、疗效观察以及MRD的监测。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 自身淬灭探针 白血病 粒细胞 慢性期 BCR/ABL融合基因
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