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题名罗汉果法呢基焦磷酸合成酶基因的克隆及其序列分析
被引量：13
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作者
蒙姣荣
陈本勇
黎起秦
李惠
陈保善
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机构
广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室
广西大学农学院
中山大学生命科学学院
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出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第12期2512-2517,共6页
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基金
广西自然科学基金资助项目(桂科自0832045)
广西创新能力建设项目(桂科能05112001-1B,桂科能05112001-1)
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文摘
目的对罗汉果甜苷V生物合成途径的关键酶法呢基焦磷酸合成酶(Farnesyl pyrophosphate synthase,FPPS)基因的全长cDNA序列进行克隆,为研究罗汉果甜苷V生物合成与基因调控奠定基础。方法根据植物FPPS基因保守功能域设计简并引物,通过PCR和RACE方法克隆罗汉果FPPS基因的全长cDNA。结果获得罗汉果FPPS(SgFPPS)基因的全长cDNA序列共1 354个核苷酸,包含一个1 026核苷酸的开放阅读框架(open reading frame,ORF),cDNA编码的蛋白包含342个氨基酸,推断蛋白质相对分子质量为3.92×104。NCBI Blastx结果显示,SgFPPS基因编码的蛋白与苹果树来源FPPS具有最高同源性,氨基酸一致度达85.1%。SgFPPS具有异戊烯基转移酶的5个典型保守功能域。进化树分析结果显示,SgFPPS基因与苹果树的FPPS具有较近的亲缘关系。结论首次克隆SgFPPS基因的全长cDNA序列,为分析SgFPPS基因表达特性及其在罗汉果甜苷V生物合成中的功能奠定基础。
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关键词
法呢基焦磷酸合成酶
罗汉果甜苷V
生物合成
基因克隆
序列分析
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Keywords
farnesyl pyrophosphate synthase（fpps）
mogroside V
biosynthesis
gene cloning
sequence analysis
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分类号
R282.12
[医药卫生—中药学]
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题名杧果FPPS基因的鉴定和序列分析
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作者
盖江涛
朱敏
党志国
陈华蕊
陈振玺
王鹏
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机构
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
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出处
《广东农业科学》
CAS
2016年第6期69-75,F0002,共8页
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基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(1630032015026
1630032014013)
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文摘
法尼基焦磷酸合成酶(Farnesyl Pyrophosphate Synthase,FPPS,EC∶2.5.1.1)是倍半萜合成中的一个关键酶,在植物萜类合成过程中有关键作用。以杧果FPPS基因为研究对象,以拟南芥FPPS基因为参考,通过BLAST方法从番木瓜、金钱橘、甜橙、苹果、小果野蕉、桃子、白梨、葡萄、中华猕猴桃、无油樟基因组数据中获得了FPPS基因,共19条FPPS基因序列,对其进行了系统进化分析和生物信息学分析。系统进化结果显示:双子叶植物纲果树与单子叶植物纲果树关系较远,同是双子叶植物纲的果树关系较近,同科果树亲缘关系更近。生物信息学分析结果显示:氨基酸序列中,酸性蛋白占94.7%,稳定性蛋白占84.2%,有信号肽的蛋白占5.3%,有导肽的蛋白占10.5%,所有蛋白均为有明显跨膜现象的亲水性蛋白;所有FPPS基因亚细胞定位于线粒体中,均有蛋白活性位点。
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关键词
杧果
萜类
法尼基焦磷酸合成酶
系统进化
生物信息学
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Keywords
mango
terpenoid
farnesyl pyrophosphate synthase （ fpps ）
phylogenetic
bioinformatics
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分类号
S667.7
[农业科学—果树学]
Q37
[农业科学—园艺学]
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