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虎斑乌贼FMRFamide的表达定位及其Na^(+)通道受体基因的克隆鉴定、表达分析
1
作者
曹慧敏
朱阳
+4 位作者
郭祖霆
李双
周旭
迟长凤
郑利兵
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期233-245,共13页
FMRFamide是神经肽家族的一类重要代表成员,参与无脊椎动物的多种生理调控过程。利用同源克隆和RACE技术获得了虎斑乌贼神经肽FMRFamide的Na^(+)通道受体(Sp FaNaC)的cDNA全长共2090 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)1782 bp,编...
FMRFamide是神经肽家族的一类重要代表成员,参与无脊椎动物的多种生理调控过程。利用同源克隆和RACE技术获得了虎斑乌贼神经肽FMRFamide的Na^(+)通道受体(Sp FaNaC)的cDNA全长共2090 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)1782 bp,编码一个由593个氨基酸残基组成的多肽链,N端无信号肽,具有2个跨膜区;序列分析显示其与头足纲、腹足纲和双壳纲相似性较高,聚类为姐妹支。荧光定量PCR(qRT-PCR)检测到SpFaNaC主要分布在中枢神经系统的视叶、脑,其次是心脏和副缠卵腺。SpFaNaC原位杂交结果显示其阳性信号存在于视网膜感光细胞的细胞体、视叶深层视网膜的内颗粒细胞层和外细胞颗粒层、食道上神经团的各亚叶,尤以交界区最为集中。同时,原位杂交和免疫组化观察到神经肽FMRFamide主要分布在视叶的中央髓质区、边缘髓质区、内细胞颗粒层和外细胞颗粒层;食道上神经团的阳性信号较少,主要集中为亚叶交界处。实验结果为研究虎斑乌贼FMRFamide及Sp FaNaC的生理功能研究奠定一定的理论基础。
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关键词
虎斑乌贼
FMRFAMIDE
fanac
表达定位
原位杂交
免疫组化
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职称材料
转录因子FaNAC56在草莓果实成熟中的功能分析
被引量:
1
2
作者
许田
吴敏
+2 位作者
陈雪雪
黄芸
沈元月
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期2072-2081,共10页
【目的】研究NAC转录因子FaNAC56在草莓果实成熟中的作用。【方法】根据前期果实成熟过程中的蛋白组数据,以八倍体红颜草莓为试材,克隆FaNAC56基因及其启动子。在蛋白水平,利用MEGA构建FaNAC56系统进化树,并通过生物信息学预测其编码蛋...
【目的】研究NAC转录因子FaNAC56在草莓果实成熟中的作用。【方法】根据前期果实成熟过程中的蛋白组数据,以八倍体红颜草莓为试材,克隆FaNAC56基因及其启动子。在蛋白水平,利用MEGA构建FaNAC56系统进化树,并通过生物信息学预测其编码蛋白的二级结构,以及利用烟草进行亚细胞定位;在转录调控水平,利用预测网站分析FaNAC56启动子区顺式作用元件以及下游靶基因,并通过RT-qPCR分析FaNAC56的时空表达模式。最后,利用果实圆片温育方法分析FaNAC56基因受外源激素诱导情况。【结果】FaNAC56基因全长1035 bp,编码344个氨基酸,具有NAC转录因子NAM保守结构域。系统发育分析表明FaNAC56与月季NAC56同源性最高。亚细胞定位显示FaNAC56定位于细胞核内。FaNAC56在果实中高度表达并随果实成熟表达量急剧增加。FaNAC56启动子区含有ABA、赤霉素、生长素、乙烯等激素和胁迫相关响应元件,其表达水平受这些激素诱导。靶基因分析发现FaNAC56可能响应多种激素、花色苷和蔗糖调控元件。【结论】FaNAC56可能通过多种激素调控草莓果实的发育和成熟。
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关键词
草莓
fanac
56
表达分析
亚细胞定位
激素诱导
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职称材料
题名
虎斑乌贼FMRFamide的表达定位及其Na^(+)通道受体基因的克隆鉴定、表达分析
1
作者
曹慧敏
朱阳
郭祖霆
李双
周旭
迟长凤
郑利兵
机构
浙江海洋大学海洋科学与技术学院、海洋生物种质资源发掘利用国家地方联合工程研究中心
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期233-245,共13页
基金
国家自然科学基金项目,31872547号
浙江省自然科学基金项目,LY20C190007号。
文摘
FMRFamide是神经肽家族的一类重要代表成员,参与无脊椎动物的多种生理调控过程。利用同源克隆和RACE技术获得了虎斑乌贼神经肽FMRFamide的Na^(+)通道受体(Sp FaNaC)的cDNA全长共2090 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)1782 bp,编码一个由593个氨基酸残基组成的多肽链,N端无信号肽,具有2个跨膜区;序列分析显示其与头足纲、腹足纲和双壳纲相似性较高,聚类为姐妹支。荧光定量PCR(qRT-PCR)检测到SpFaNaC主要分布在中枢神经系统的视叶、脑,其次是心脏和副缠卵腺。SpFaNaC原位杂交结果显示其阳性信号存在于视网膜感光细胞的细胞体、视叶深层视网膜的内颗粒细胞层和外细胞颗粒层、食道上神经团的各亚叶,尤以交界区最为集中。同时,原位杂交和免疫组化观察到神经肽FMRFamide主要分布在视叶的中央髓质区、边缘髓质区、内细胞颗粒层和外细胞颗粒层;食道上神经团的阳性信号较少,主要集中为亚叶交界处。实验结果为研究虎斑乌贼FMRFamide及Sp FaNaC的生理功能研究奠定一定的理论基础。
关键词
虎斑乌贼
FMRFAMIDE
fanac
表达定位
原位杂交
免疫组化
Keywords
Sepia pharaonis
FMRFamide
fanac
expression localization
in situ hybridization(ISH)
immumohistochemical staining(IHC)
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
S931 [农业科学—渔业资源]
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职称材料
题名
转录因子FaNAC56在草莓果实成熟中的功能分析
被引量:
1
2
作者
许田
吴敏
陈雪雪
黄芸
沈元月
机构
北京农学院植物科学技术学院·农业应用新技术北京市重点实验室
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期2072-2081,共10页
基金
国家自然科学基金(32030100,32102362)。
文摘
【目的】研究NAC转录因子FaNAC56在草莓果实成熟中的作用。【方法】根据前期果实成熟过程中的蛋白组数据,以八倍体红颜草莓为试材,克隆FaNAC56基因及其启动子。在蛋白水平,利用MEGA构建FaNAC56系统进化树,并通过生物信息学预测其编码蛋白的二级结构,以及利用烟草进行亚细胞定位;在转录调控水平,利用预测网站分析FaNAC56启动子区顺式作用元件以及下游靶基因,并通过RT-qPCR分析FaNAC56的时空表达模式。最后,利用果实圆片温育方法分析FaNAC56基因受外源激素诱导情况。【结果】FaNAC56基因全长1035 bp,编码344个氨基酸,具有NAC转录因子NAM保守结构域。系统发育分析表明FaNAC56与月季NAC56同源性最高。亚细胞定位显示FaNAC56定位于细胞核内。FaNAC56在果实中高度表达并随果实成熟表达量急剧增加。FaNAC56启动子区含有ABA、赤霉素、生长素、乙烯等激素和胁迫相关响应元件,其表达水平受这些激素诱导。靶基因分析发现FaNAC56可能响应多种激素、花色苷和蔗糖调控元件。【结论】FaNAC56可能通过多种激素调控草莓果实的发育和成熟。
关键词
草莓
fanac
56
表达分析
亚细胞定位
激素诱导
Keywords
Strawberry
fanac
56
Expression analysis
Subcellular localization
Hormone induction
分类号
S668.4 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
虎斑乌贼FMRFamide的表达定位及其Na^(+)通道受体基因的克隆鉴定、表达分析
曹慧敏
朱阳
郭祖霆
李双
周旭
迟长凤
郑利兵
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
转录因子FaNAC56在草莓果实成熟中的功能分析
许田
吴敏
陈雪雪
黄芸
沈元月
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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职称材料
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