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Regulation of FN1 degradation by the p62/SQSTM1-dependent autophagy-lysosome pathway in HNSCC 被引量:8
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作者 Xinchen Liu Lin Meng +6 位作者 Xing Li Daowei Li Qilin Liu Yumeng Chen Xiangwei Li Wenhuan Bu Hongchen Sun 《International Journal of Oral Science》 SCIE CAS CSCD 2020年第4期327-337,共11页
Epithelial–mesenchymal transition(EMT)is involved in both physiological and pathological processes.EMT plays an essential role in the invasion,migration and metastasis of tumours.Autophagy has been shown to regulate ... Epithelial–mesenchymal transition(EMT)is involved in both physiological and pathological processes.EMT plays an essential role in the invasion,migration and metastasis of tumours.Autophagy has been shown to regulate EMT in a variety of cancers but not in head and neck squamous cell carcinoma(HNSCC).Herein,we investigated whether autophagy also regulates EMT in HNSCC.Analyses of clinical data from three public databases revealed that higher expression of fibronectin-1(FN1)correlated with poorer prognosis and higher tumour pathological grade in HNSCC.Data from SCC-25 cells demonstrated that rapamycin and Earle’s balanced salt solution(EBSS)promoted autophagy,leading to increased FN1 degradation,while 3-methyladenine(3-MA),bafilomycin A1(Baf A1)and chloroquine(CQ)inhibited autophagy,leading to decreased FN1 degradation.On the other hand,autophagic flux was blocked in BECN1 mutant HNSCC Cal-27 cells,and rapamycin did not promote autophagy in Cal-27 cells;also in addition,FN1 degradation was inhibited.Further,we identified FN1 degradation through the lysosome-dependent degradation pathway using the proteasome inhibitor MG132.Data from immunoprecipitation assays also showed that p62/SQSTM1 participated as an autophagy adapter in the autophagy–lysosome pathway of FN1 degradation.Finally,data from immunoprecipitation assays demonstrated that the interaction between p62 and FN1 was abolished in p62 mutant MCF-7 and A2780 cell lines.These results indicate that autophagy significantly promotes the degradation of FN1.Collectively,our findings clearly suggest that FN1,as a marker of EMT,has adverse effects on HNSCC and elucidate the autophagy–lysosome degradation mechanism of FN1. 展开更多
关键词 inhibited INVASION fn1
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FN1、PROS1在甲状腺乳头状癌合并桥本甲状腺炎中的表达意义
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作者 贾宁 蹇顺海 赵棋 《诊断病理学杂志》 2024年第4期313-317,共5页
目的探讨FN1、PROS1在甲状腺乳头状癌(PTC)合并桥本甲状腺炎(HT)中的表达意义。方法应用免疫组化方法检测FN1、PROS1在114例PTC合并HT组织与81例仅为HT组织中表达情况、临床病理特征关系及二者表达相关性。采用受试者工作特性(ROC)曲线... 目的探讨FN1、PROS1在甲状腺乳头状癌(PTC)合并桥本甲状腺炎(HT)中的表达意义。方法应用免疫组化方法检测FN1、PROS1在114例PTC合并HT组织与81例仅为HT组织中表达情况、临床病理特征关系及二者表达相关性。采用受试者工作特性(ROC)曲线分析FN1、PROS1及二者联合对合并HT的PTC诊断价值。结果在合并HT的PTC组织中,FN1、PROS1表达阳性率显著高于HT组织(P<0.001)。FN1、PROS1表达均与淋巴结转移相关(均P<0.05)。Spearman分析结果示,在合并HT的PTC组织中FN1、PROS1表达水平成正相关(r=0.398,P<0.001)。ROC曲线分析显示,FN1、PROS1及二者联合检测合并HT的PTC敏感度分别为95.06%、88.89%和90.12%,特异度分别为91.23%、92.11%和95.61%。结论FN1、PROS1在合并HT的PTC组织中高表达,且阳性表达与淋巴结转移有关,对合并HT的PTC具有较高的辅助诊断价值。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 诊断效能 免疫组化 fn1 PROS1
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胃癌相关基因COL1A2、FN1、COL6A3预后分析 被引量:6
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作者 姚远 李胜昔 《解剖科学进展》 2019年第5期525-527,531,共4页
目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采... 目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采用GEO在线分析工具GEO2R分析数据,选取TOP250,输出差异表达基因,并通过在线生物信息学绘制韦恩图,获得共有差异基因;通过KM plotter数据库的应用分析COL1A2、FN1、 COL6A3与预后的关系。结果通过分析GSE2685、GSE19826、GSE79973芯片数据,共获得6个共表达基因,利用差异倍数作图,选取差异倍数在2倍以上的基因COL1A2、FN1、COL6A3进行分析,KM plotter数据库的分析显示COL1A2、FN1、COL6A3与胃癌的总生存期成负相关。结论 COL1A2、FN1、COL6A3在胃癌组织中表达高于癌旁组织,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。 展开更多
关键词 胃癌 预后 KM plotter数据库 COL1A2 fn1 COL6A3
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Fibronectin 1促进胃癌细胞耐药及其作用机制研究 被引量:1
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作者 岳芙蓉 彭科瑜 +1 位作者 张力 张军 《肿瘤药学》 CAS 2023年第1期43-49,共7页
目的探讨纤连蛋白1(FN1)促进胃癌细胞耐药及其作用机制。方法选择胃癌细胞系MKN45、MKN45/DDP、MKN45/VCR进行pLV-FN1、pLV-NC、FN1 siRNA慢病毒和脂质体3000瞬时转染,将转染pLVFN1的设为FN1过表达组(FN1),转染pLV-NC的为阴性对照组(Vec... 目的探讨纤连蛋白1(FN1)促进胃癌细胞耐药及其作用机制。方法选择胃癌细胞系MKN45、MKN45/DDP、MKN45/VCR进行pLV-FN1、pLV-NC、FN1 siRNA慢病毒和脂质体3000瞬时转染,将转染pLVFN1的设为FN1过表达组(FN1),转染pLV-NC的为阴性对照组(Vector),转染FN1 siRNA慢病毒的为FN1敲低组(si-FN1),转染脂质体3000的为空白对照组(si-control)。分别采用qRT-PCR、MTT、克隆形成实验、Western blotting检测FN1 mRNA和蛋白的表达,MKN45/DDP细胞增殖、凋亡、集落形成情况及耐药相关蛋白的表达。结果FN1 mRNA和蛋白在MKN45和MKN45/VCR细胞中的表达水平均显著低于MKN45/DDP细胞(P<0.05);FN1敲低组细胞增殖能力显著低于空白对照组(P<0.001),FN1过表达组细胞增殖能力明显高于阴性对照组(P<0.001);FN1敲低组细胞凋亡率明显高于空白对照组(P<0.001),FN1过表达组细胞凋亡率显著低于阴性对照组(P<0.05);FN1敲低组细胞集落形成能力明显低于空白对照组(P<0.001),FN1过表达组细胞集落形成能力显著高于阴性对照组(P<0.001);FN1敲低组MRP-1、p-STAT3、STAT3、p-AKT蛋白表达水平均明显低于空白对照组(P<0.001)。结论FN1的高表达可能参与胃癌化疗耐药的相关过程,下调FN1表达有助于恢复耐药胃癌细胞对化疗的敏感性,有望为改善胃癌化疗疗效提供新的思路和方法。 展开更多
关键词 fn1 胃癌 耐药 增殖 凋亡
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结肠癌组织中SATB1、FN1和PDGFRB蛋白表达水平及临床意义 被引量:4
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作者 林玲 吕黄勇 +1 位作者 聂川 韩峰 《现代肿瘤医学》 CAS 2020年第8期1333-1337,共5页
目的:探讨结肠癌组织中特异AT序列结合蛋白1(special AT-rich sequence binding protein,SATB1)、纤维连接蛋白1(fibronectin 1,FN1)和血小板衍生生长因子受体(platelet-derived growth factor receptor,PDGFRB)蛋白表达水平及临床意义... 目的:探讨结肠癌组织中特异AT序列结合蛋白1(special AT-rich sequence binding protein,SATB1)、纤维连接蛋白1(fibronectin 1,FN1)和血小板衍生生长因子受体(platelet-derived growth factor receptor,PDGFRB)蛋白表达水平及临床意义。方法:选取2012年1月至2012年12月在我院肛肠科住院的42例结肠癌患者组织作为病理,并选取癌旁组织(距肿瘤边缘>5 cm)作为对照,用免疫组织化学法检测SATB1、FN1和PDGFRB蛋白的表达水平,分析它们与结肠患者临床病理参数间的关系及结肠癌患者术后生存期的关系。结果:SATB1、FN1和PDGFRB在结肠癌组织中阳性表达率分别为57.1%(24/42)、61.9%(26/42)和66.7%(28/42),在癌旁组织中阳性表达率分别为9.5%(4/42)、7.1%(3/42)和9.5%(4/42),差异有统计学意义(P<0.05);SATB1、FN1和PDGFRB表达水平与年龄和性别不相关;与TNM分期、肿瘤分化程度和有无转移相关;随访发现,13例结肠癌患者死亡,生存29例,中位生存时间为34个月;进行二分类Logistic逐步回归分析,结果显示,SATB1、FN1、PDGFRB、肿瘤浸润深度和有转移是结肠癌患者生存结局的独立危险因素。结论:SATB1、FN1和PDGFRB在结肠癌组织中高表达,与结肠癌的发生和发展密切相关,可作为判断患者预后的指标。 展开更多
关键词 结肠癌 SATB1 fn1 PDGFRB
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基于生物信息学分析高表达FN1在乳腺癌组织及其耐药性细胞中的作用 被引量:3
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作者 李晶晶 许丁文 严慧深 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期318-323,共6页
目的研究FN1在乳腺癌组织及其耐药性细胞中的作用。方法运用GEPIA在线工具分析FN1在正常乳腺组织和乳腺癌组织中的表达高低,运用km-plot分析FN1关于乳腺癌患者的生存曲线。运用GEO数据库分析FN1在阿霉素敏感性与耐药性乳腺癌细胞株中表... 目的研究FN1在乳腺癌组织及其耐药性细胞中的作用。方法运用GEPIA在线工具分析FN1在正常乳腺组织和乳腺癌组织中的表达高低,运用km-plot分析FN1关于乳腺癌患者的生存曲线。运用GEO数据库分析FN1在阿霉素敏感性与耐药性乳腺癌细胞株中表达高低。进一步运用基因互作分析、基因通路富集和文本挖掘、miRNA-mRNA互作分析方法证明FN1调控乳腺癌耐药性,探索内在机制。结果FN1在乳腺癌中表达明显高于正常乳腺组织,高表达FN1患者生存率低,阿霉素耐药的乳腺癌细胞株FN1表达明显高于阿霉素敏感性乳腺癌细胞株,紫杉醇耐药的细胞系中的FNI表达显著高于敏感组,FN1表达量与达沙替尼敏感性呈负相关,与FN1高度关联的基因大部分与乳腺癌耐药性有关,基因通路富集发现细胞骨架的构建通路富集程度最高,文本挖掘显示细胞增殖、凋亡等生物学过程与FN1、乳腺癌、耐药性有显著关联。miRNA-mRNA互作分析发现,与FN1明显相关的10个微小RNA中8个已被证明与乳腺癌及乳腺癌耐药性有关。结论FN1与乳腺癌的耐药性有关。 展开更多
关键词 fn1 乳腺癌 耐药性 生物信息学
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炙马钱子胶囊抑制BIPN的临床疗效及基于lncRNA ZFAS1(XIST)活化FAK信号通路抑制神经炎症的机制
7
作者 毛梦珂 葛杭萍 +3 位作者 项静静 郑智茵 沈建平 邓姝 《浙江中医药大学学报》 CAS 2023年第12期1495-1504,共10页
[目的]评估炙马钱子胶囊医治硼替佐米相关性周围神经病(bortezomib induced peripheral neuropathy,BIPN)的有效性,初步探究其基于长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)X失活特异性转录本(X inactive specific transcript,XIST)/... [目的]评估炙马钱子胶囊医治硼替佐米相关性周围神经病(bortezomib induced peripheral neuropathy,BIPN)的有效性,初步探究其基于长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)X失活特异性转录本(X inactive specific transcript,XIST)/锌指结构反义转录本1(ZNFX1 antisense RNA 1,ZFAS1)干预BIPN的机制。[方法]通过前瞻性非随机对照的研究方法,共收集20例符合多发性骨髓瘤中西医诊断并接受硼替佐米(bortezomib,BTZ)治疗而且发生BIPN接受炙马钱子胶囊治疗的患者,与未接受马钱子治疗的患者进行中医症候积分、神经毒性评分、周围神经病变(peripheral neuropathy,PN)分级、部分周围神经传导速度的比较。通过自身对照,采集治疗组患者的外周血液样本,使用酶联免疫吸附试验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)检测炎症相关因子表达。培养DRG 50B11细胞,通过细胞增殖毒性检测筛选马钱子最佳作用浓度和时间及BTZ最佳作用时间,随机分为正常对照组、BTZ组、马钱子+BTZ组,以实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time quantitative polymerase chain reaction,Real-time qPCR)检测炎症相关因子及细胞总RNA相关指标表达,分析差异性及相关性。[结果]临床研究显示,与对照组比较,患者治疗后PN、中医证候积分、神经毒性评分降低,周围神经传导速度增加(P<0.05),无明显不良反应。实验研究显示,与治疗前比较,白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)、IL-1β、IL-6、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、神经生长因子(nerve growth factor,NGF)、脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor,BDNF)表达均降低(P<0.05),且与时间存在显著负相关性(P<0.01)。与BTZ组比较,马钱子+BTZ组IL-17、TNF-α、IL-1β、IL-6、NGF、BDNF、lncRNA XIST、纤维粘连蛋白1(fibronectin 1,FN1)、磷酸化局部黏着斑激酶(phospho-focal adhesion kinase,p-FAK)表达降低(P<0.05),miR-96-5P、miR-1271-5P表达升高(P<0.05),lncRNA 展开更多
关键词 炙马钱子胶囊 周围神经病变 硼替佐米 lncRNA XIST miR-96-5P fn1 FAK 信号通路
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温肾醒脾化浊方对慢性肾功能衰竭模型肾损伤干预机制的研究
8
作者 顾茜兰 吴敏曼 +4 位作者 朱丹 祁燕 司怡然 徐莹 万春平 《云南中医药大学学报》 2023年第1期52-57,共6页
目的探索温肾醒脾化浊方治疗慢性肾衰竭的效应机制,为温肾醒脾化浊法临床应用于治疗慢性肾炎提供科学基础。方法通过阿霉素(6 mg/kg)尾静脉注射构建肾功能衰竭模型大鼠,随机分为正常组、模型组、温肾醒脾化浊方低、中、高剂量组(1.49 g... 目的探索温肾醒脾化浊方治疗慢性肾衰竭的效应机制,为温肾醒脾化浊法临床应用于治疗慢性肾炎提供科学基础。方法通过阿霉素(6 mg/kg)尾静脉注射构建肾功能衰竭模型大鼠,随机分为正常组、模型组、温肾醒脾化浊方低、中、高剂量组(1.49 g/kg、2.98 g/kg和5.95 g/kg),灌胃给药27 d后,考马斯亮蓝法检测24 h蛋白尿含量;全自动生化分析仪测定各组大鼠血清肾功能肌酐(Scr)、尿素氮(BUN)和尿酸(UA)含量;苏木精-伊红(H&E)染色观察大鼠肾脏病理损伤程度;荧光定量PCR法检测肾组织MMP-9基因、金属蛋白酶抑制剂(TIMP-1)、Col4a2R、转化生长因子-β1(TGF-β1)、纤维连接蛋白1(Fn1)mRNA的表达水平。结果温肾醒脾化浊方显著减少24 h蛋白尿和肾体质量的异常增加,有效降低慢性肾功能衰竭大鼠尿素氮、肌酐、尿酸水平(P<0.05或P<0.01),改善肾组织的炎性细胞浸润、纤维化增生以及肾小球变形萎缩等病变。温肾醒脾化浊方干预显著下调TIMP-1、TGF-β1、Col4a2R和Fn1 mRNA表达,上调MMP-9转录表达(P<0.05),调节MMP-9/TIMP-1失衡(P<0.05)。结论温肾醒脾化浊方可能通过调控MMP9/TIMP-1失衡,下调TGF-β1及Fn1的表达,减少细胞外基质的积聚,从而保护肾功能和延缓肾纤维化。 展开更多
关键词 温肾醒脾化浊方 慢性肾功能衰竭 肾纤维化 细胞外基质 大鼠模型 机制研究 Col4a2R 金属蛋白酶抑制剂 转化生长因子-β1 纤维连接蛋白1 MMP-9
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柚皮苷抑制纤维化相关蛋白表达改善大鼠肾细胞纤维化 被引量:2
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作者 林园园 肖锋 《中医学报》 CAS 2022年第11期2397-2404,共8页
目的:探讨柚皮苷(naringin,NAR)对转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)诱导的肾纤维化的作用。方法:采用不同浓度TGF-β1诱导正常大鼠肾细胞构建肾纤维化细胞模型,根据α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)的转录水平确定TGF-... 目的:探讨柚皮苷(naringin,NAR)对转化生长因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)诱导的肾纤维化的作用。方法:采用不同浓度TGF-β1诱导正常大鼠肾细胞构建肾纤维化细胞模型,根据α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)的转录水平确定TGF-β1的最佳诱导浓度;将细胞分为正常组、TGF-β1组、TGF-β1+NAR(1μmol·L^(-1))组、TGF-β1+NAR(10μmol·L^(-1))组、TGF-β1+NAR(40μmol·L^(-1))组,细胞处理完成后,采用细胞计数试剂盒(cell counting kit-8,CCK-8)检测细胞活力;显微镜观察法观察细胞形态变化;免疫荧光法检测结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)和纤维连接蛋白(fibronectin1,FN1)表达;Western Blot法检测Ⅰ型胶原蛋白(CollagenⅠ)的表达。结果:5μg·L^(-1) TGF-β1为肾纤维化细胞模型建立的最佳诱导浓度。CCK-8检测显示,NAR可抑制肾纤维化模型细胞异常增殖。与正常组比较,TGF-β1组CTGF、FN1、CollagenⅠ表达水平显著升高(P<0.05),细胞形态发生变化,出现纤维化;与TGF-β1组比较,NAR给药组CTGF、FN1蛋白表达水平显著降低(P<0.05),CollagenⅠ表达水平呈剂量依赖性降低(P<0.05),细胞纤维化得到改善。结论:柚皮苷可通过抑制CTGF、FN1和CollagenⅠ蛋白表达改善TGF-β1诱导的肾纤维化。 展开更多
关键词 柚皮苷 肾细胞纤维化 CTGF fn1 CollagenⅠ
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甲状腺乳头状癌的FN1表达增加与BRAF突变、免疫浸润及预后不良有关 被引量:3
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作者 陈兴 郑俊杰 +1 位作者 张爱龙 游振辉(指导) 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第15期1841-1847,共7页
目的:探索甲状腺乳头状癌(PTC)在诊断和预后判断的关键因素。方法:通过下载NCBI-GEO的3个甲状腺乳头状癌数据集并应用R语言进行关键基因的筛选,结合TCGA数据集及在线分析网站对其进行综合分析。同时,利用RTPCR对50例甲状腺乳头状癌及癌... 目的:探索甲状腺乳头状癌(PTC)在诊断和预后判断的关键因素。方法:通过下载NCBI-GEO的3个甲状腺乳头状癌数据集并应用R语言进行关键基因的筛选,结合TCGA数据集及在线分析网站对其进行综合分析。同时,利用RTPCR对50例甲状腺乳头状癌及癌旁组织进行mRNA表达量检测。结果:从3个甲状腺乳头状癌GEO数据集中鉴定出142个差异表达基因,在50例甲状腺乳头状癌组织中检测到FN1表达显著上升且BRAF-V600E基因突变的甲状腺乳头状癌组织中有着更高的FN1表达水平。此外,FN1的表达水平与甲状腺乳头状癌中的不良预后及免疫浸润密切相关,基因共表达分析结果显示FN1共表达的基因富集在p53信号通路。结论:FN1可作为甲状腺乳头状癌诊断及预后标志物,同时FN1在甲状腺乳头状癌中的作用机制可能与BRAF-V600E突变、免疫浸润及p53信号通路相关。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 fn1 BRAF突变 免疫浸润 p53信号通路 生物信息学
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Sirt1和Stat3在甲状腺癌中的表达及临床诊断意义 被引量:2
11
作者 陈森镇 陈诺琦 陈锦凤 《新医学》 CAS 2022年第6期423-430,共8页
目的测定沉默信息调节因子1(Sirt1)、信号转导与转录激活因子3(Stat3)、纤维连接蛋白1(FN1)和E-钙黏蛋白(E-cadherin)在甲状腺乳头状癌(PTC)和良性甲状腺病变中的表达,分析其对PTC的诊断价值,为PTC诊断和鉴别诊断提供依据。方法收集甲... 目的测定沉默信息调节因子1(Sirt1)、信号转导与转录激活因子3(Stat3)、纤维连接蛋白1(FN1)和E-钙黏蛋白(E-cadherin)在甲状腺乳头状癌(PTC)和良性甲状腺病变中的表达,分析其对PTC的诊断价值,为PTC诊断和鉴别诊断提供依据。方法收集甲状腺疾病病理标本142例,其中PTC组83例,甲状腺腺瘤组28例,结节性甲状腺肿组21例,正常甲状腺组织组10例。采用免疫组织化学SP法和qPCR方法检测Sirt1、Stat3、FN1和E-cadherin在4种不同病理类型甲状腺组织中的表达。结果Sirt1、Stat3和FN1蛋白与mRNA在PTC组中的表达明显高于甲状腺腺瘤组、结节性甲状腺肿组和正常甲状腺组织组,差异均有统计学意义(P均<0.05)。E-cadherin蛋白和mRNA在PTC组中的表达明显低于甲状腺腺瘤组、结节性甲状腺肿组和正常甲状腺组织组,差异均有统计学意义(P均<0.05)。Sirt1和Stat3在PTC组中的表达与淋巴结转移密切相关,淋巴结转移组的表达明显增加,高于无淋巴结转移组(P均<0.05),不同性别、年龄患者间Sirt1和Stat3的表达差异均无统计学意义(P均>0.05)。FN1和E-cadherin在PTC组中的表达与患者的性别、年龄和有无淋巴结转移均无关(P均>0.05)。单一免疫标志物用于诊断PTC时,Sirt1的特异度、灵敏度和诊断准确率均最高。不同组合免疫标志物用于诊断PTC时,Sirt1+Stat3+FN1组合和Sirt1+Stat3+FN1+E-cadherin组合的特异度并列第一(均为98.3%),以Sirt1+Stat3+FN1组合的诊断准确率最高,以Sirt1+FN1的灵敏度最高。结论Sirt1和Stat3在PTC的发生发展以及转移过程中发挥重要的作用。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 沉默信息调节因子1 信号转导与转录激活因子3 纤维连接蛋白1 E-钙黏蛋白
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敲低纤维连接蛋白1表达抑制甲状腺乳头状癌细胞增殖 被引量:1
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作者 罗锦琳 童璐 +1 位作者 邹联洪 范培芝 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2022年第13期2315-2319,共5页
目的:研究纤维连接蛋白1(fibronectin 1,FN1)对甲状腺乳头状癌细胞增殖的影响及相关分子机制。方法:采用慢病毒感染的方法敲低甲状腺乳头状癌细胞TPC-1和BCPAP中FN1的表达,通过CCK8实验证明FN1对甲状腺乳头状癌增殖的影响;采用三代测序... 目的:研究纤维连接蛋白1(fibronectin 1,FN1)对甲状腺乳头状癌细胞增殖的影响及相关分子机制。方法:采用慢病毒感染的方法敲低甲状腺乳头状癌细胞TPC-1和BCPAP中FN1的表达,通过CCK8实验证明FN1对甲状腺乳头状癌增殖的影响;采用三代测序技术对FN1敲低的TPC-1细胞及其对照组进行全长转录组测序,筛选差异表达基因,使用BMKCloud在线分析软件对差异基因行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,通过STRING数据库对筛选出的差异表达基因进行蛋白互作网络分析。结果:敲低FN1能够抑制甲状腺乳头状癌细胞的增殖;FN1敲低后与对照组转录本的表达差异明显,GO功能富集显示差异转录本主要集中在细胞过程、细胞部分的组成、细胞黏附功能、催化活性功能,在KEGG富集上显示在HIF-1信号途径、糖酵解、碳代谢富集明显,PPI结果显示FN1和HSPA8是关键蛋白。结论:本研究通过细胞实验证明敲低FN1的表达能够抑制甲状腺乳头状癌细胞的增殖,测序及生物信息学分析为后续甲状腺乳头状癌诊断及靶向治疗的进一步研究提供数据支持。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 fn1 生物信息分析 HSPA8 DNA测序
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FN1(-)及Vimentin(+)与早期乳腺癌非前哨淋巴结转移的关系 被引量:1
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作者 徐胜昔 李森 +3 位作者 石颖芳 王恒丹 李梦琴 汪志春 《实用癌症杂志》 2022年第4期577-582,共6页
目的探讨早期乳腺癌非前哨淋巴结转移的独立风险因素。方法收集111例早期乳腺癌患者的临床病理资料,临床腋窝表现为阴性,成功行前哨淋巴结活检,显示为阳性,随后行同侧腋窝淋巴结清扫,应用统计学软件对相关因素进行分析。将单因素分析有... 目的探讨早期乳腺癌非前哨淋巴结转移的独立风险因素。方法收集111例早期乳腺癌患者的临床病理资料,临床腋窝表现为阴性,成功行前哨淋巴结活检,显示为阳性,随后行同侧腋窝淋巴结清扫,应用统计学软件对相关因素进行分析。将单因素分析有统计学显著意义的因素纳入logistic多因素回归分析,找出非前哨淋巴结转移的独立风险因素。结果在单因素分析中,患者年龄、原发肿瘤大小、与淋巴管血管侵犯状况、Ki-67状态、SLN转移阳性数(SLN+)、SLN转移阴性数(SLN-)、SLN转移阳性数占SLN总数的比例(SLN+/SLN)、纤维连接蛋白1(FN1)表达以及波形蛋白(Vimentin)表达等因素在非前哨淋巴结阳性组与阴性组间有统计学差异,对以上因素采用二元logistic回归分析,结果显示原发肿瘤大小,纤维连接蛋白1(FN1)表达水平以及波形蛋白(Vimentin)表达水平,两组具有统计学上差异(P<0.05)。结论原发肿瘤大小,FN1(-)以及Vimentin(+)是早期乳腺癌非前哨淋巴结转移的独立风险因素。 展开更多
关键词 乳腺癌 非前哨淋巴结 fn1 VIMENTIN 独立风险因素
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血清S100钙结合蛋白B、TIMP金属肽酶抑制剂1、纤连蛋白1联合对子痫前期的诊断价值 被引量:2
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作者 袁国平 蒋永亮 程玉霞 《实用医院临床杂志》 2020年第1期125-127,共3页
目的探讨血清S100钙结合蛋白B(S100b),TIMP金属肽酶抑制剂1(TIMP1),纤连蛋白1(FN1)联合对子痫前期的诊断价值。方法我院收治的妊娠期子痫前期患者70例(研究组),同期健康孕中期妊娠妇女70例(对照组)。检测两组血清S100b、TIMP1、FN1表达... 目的探讨血清S100钙结合蛋白B(S100b),TIMP金属肽酶抑制剂1(TIMP1),纤连蛋白1(FN1)联合对子痫前期的诊断价值。方法我院收治的妊娠期子痫前期患者70例(研究组),同期健康孕中期妊娠妇女70例(对照组)。检测两组血清S100b、TIMP1、FN1表达量。用受试者工作特征曲线(ROC)的曲线下面积(AUC)分析S100b,TIMP1,FN1检测在子痫前期中的诊断意义。结果研究组血清S100b、TIMP1、FN1表达量均高于对照组(P <0. 05)。血清S100b、TIMP1、FN1单项诊断子痫前期的灵敏度分别为87%、88%、97%,特异度分别为87%、85%、60%;联合诊断子痫前期的灵敏度为94. 29%,特异度为85. 71%,准确度为90. 00%。结论血清中S100b、TIMP1、FN1的表达量检测可作为子痫前期的潜在标志。 展开更多
关键词 S100钙结合蛋白B TIMP金属肽酶抑制剂1 纤连蛋白1 子痫前期 诊断
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FN1在GBM中的表达差异及对预后的影响
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作者 张钰霄 肖博 《生物技术》 CAS 2022年第6期772-778,共7页
[目的]探究纤维连接蛋白1(Fibronectin 1,FN1)在多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达情况及对患者预后的影响,为GBM的早期诊断和治疗提供生物标志物。[方法]CCLE数据库分析FN1在不同肿瘤细胞系中的表达;UALCAN和GEPIA2数据库分析FN1在GBM... [目的]探究纤维连接蛋白1(Fibronectin 1,FN1)在多形性胶质母细胞瘤(GBM)中的表达情况及对患者预后的影响,为GBM的早期诊断和治疗提供生物标志物。[方法]CCLE数据库分析FN1在不同肿瘤细胞系中的表达;UALCAN和GEPIA2数据库分析FN1在GBM肿瘤组织和正常组织中的表达差异;The Human Protein Atlas数据库分析FN1蛋白在GBM肿瘤组织和正常组织中的表达;GEPIA2数据库分析FN1在肿瘤组织中的异常表达对GBM患者总体生存率和无病生存率的影响;DAVID 6.8在线软件对FN1相关基因进行KEGG通路富集。[结果]在所有类型肿瘤细胞系中,GBM肿瘤细胞系中FN1 mRNA表达水平中排第八;FN1在GBM肿瘤组织中的表达高于正常组织(***P<0.001和*P<0.05),并且FN1高表达后GBM患者的总体生存率和无病生存率均降低(P=0.028和P=0.0056);KEGG分析结果表明与FN1正相关的基因富集通路有57个,癌症通路位于第三位。[结论]FN1在GBM中明显上调,是GBM诊断和预后的有效生物标志物。 展开更多
关键词 多形性胶质母细胞瘤 fn1 TCGA 生物标志物 生存率
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拉布拉多犬与金毛寻回猎犬基因组中与髋关节发育不良相关基因COL6A3、FN1的SNP位点检测 被引量:1
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作者 白静 马雪娜 +4 位作者 陈舒婷 周子娟 王福金 王爱国 王靖宇 《实验动物科学》 2019年第3期35-39,共5页
目的检测拉布拉多犬与金毛寻回猎犬基因组DNA中与髋关节发育不良密切相关的COL6A3基因、FN1基因中的3个SNP位点,以期为拉布拉多犬与金毛寻回猎犬幼犬的选育提供有效的遗传学诊断方法。方法全国范围内募集经过影像学诊断的髋关节发育不... 目的检测拉布拉多犬与金毛寻回猎犬基因组DNA中与髋关节发育不良密切相关的COL6A3基因、FN1基因中的3个SNP位点,以期为拉布拉多犬与金毛寻回猎犬幼犬的选育提供有效的遗传学诊断方法。方法全国范围内募集经过影像学诊断的髋关节发育不良的拉布拉多犬8只、金毛寻回猎犬5只,中国导盲犬大连培训基地提供经影像学诊断的健康的拉布拉多犬23只、金毛寻回猎犬7只作为实验对象,静脉采血,提取血细胞的基因组DNA样本,采用PCR/测序方法对COL6A3基因上的2个SNP位点(CFA25∶51031100,51040259)和FN1基因的1个SNP位点(CFA37∶25095511)进行基因型检测,并统计分析SNP位点的基因型与髋关节发育不良的关联度。结果 COL6A3(CFA25∶51031100,51040259)和FN1(CFA37∶25095511)SNP位点的基因型与犬的髋关节发育不良没有显著相关性(P>0.05)。结论 COL6A3(CFA25∶51031100,51040259)和FN1(CFA37∶25095511)SNP位点均不能成为拉布拉多犬与金毛寻回猎犬髋关节发育不良的实用性遗传学诊断指标。 展开更多
关键词 髋关节发育不良 拉布拉多犬 金毛寻回猎犬 COL6A3 fn1
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干扰VIRMA基因对胃癌细胞迁移的影响和机制研究 被引量:1
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作者 代聪聪 吴立胜 +1 位作者 缪冉 朱志强 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2020年第7期1013-1018,共6页
目的观察和分析干扰VIRMA基因对胃癌细胞迁移能力的影响,并初步探究其机制。方法慢病毒转染干扰MGC803和SGC7901胃癌细胞中VIRMA基因的表达;使用CCK-8法检测胃癌细胞的增殖能力;细胞划痕实验和Transwell小室实验检测各组胃癌细胞的迁移... 目的观察和分析干扰VIRMA基因对胃癌细胞迁移能力的影响,并初步探究其机制。方法慢病毒转染干扰MGC803和SGC7901胃癌细胞中VIRMA基因的表达;使用CCK-8法检测胃癌细胞的增殖能力;细胞划痕实验和Transwell小室实验检测各组胃癌细胞的迁移能力;实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测VIRMA及FN1的mRNA及蛋白表达相关情况。结果在胃癌细胞中VIRMA基因表达被慢病毒抑制后,其mRNA量及蛋白表达有所下降(P<0.05);CCK-8法结果显示干扰VIRMA基因使胃癌细胞的增殖能力受到了抑制(P<0.05);干扰组胃癌细胞的24 h划痕愈合距离变少,穿膜细胞数相比于对照组也减少(P<0.05);干扰VIRMA基因后FN1的表达量下降(P<0.05)。结论慢病毒介导的抑制VIRMA表达,可以抑制胃癌MGC803及SGC7901细胞的迁移能力,其机制可能和调控FN1的表达水平有关。 展开更多
关键词 VIRMA 胃癌 细胞迁移 fn1 CCK-8
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甲状腺乳头状癌预后不良相关基因的生物信息学分析 被引量:1
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作者 高建 张国烈 +2 位作者 林元美 章国亮 陈一钧 《右江医学》 2020年第7期492-500,共9页
目的通过甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)生物信息学分析,获取与PTC预后显著相关的基因,为PTC的发病机制提供理论依据。方法从NCBI的GEO Databases数据库检索PTC的芯片数据GSE3678、GSE33630和GSE82208,三组基因芯片... 目的通过甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)生物信息学分析,获取与PTC预后显著相关的基因,为PTC的发病机制提供理论依据。方法从NCBI的GEO Databases数据库检索PTC的芯片数据GSE3678、GSE33630和GSE82208,三组基因芯片共包含94例PTC及77例癌旁组织基因表达谱。使用GEO2R工具分析PTC与癌旁组织差异表达的基因;将共表达的基因导入可视化数据库(the database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)进行基因富集分析(gene ontology,GO)和信号通路分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG);使用STRING和Cytoscape进行蛋白质互作网络分析(protein-protein interaction,PPI);使用GEPIA分析核心基因的生存信息。随后培养PTC细胞株,收集52例临床组织样本,分别验证FN1在PTC组织样本和细胞中的表达情况。结果 GSE3678、GSE33630和GSE82208共有152个共表达基因,其中24个上调表达,128个下调表达。这152个异常表达基因(different expression genes,DEGs)在PTC细胞组分、分子功能、生物学行为上主要集中于影响细胞正常分化及富集于甲状腺激素合成信号通路等。PPI显示,基因AGTR1、AVPR1A、EGR2、FGFR2、FN1、FOSB、GNA14、JUN、EDN、IRS1、SPP1相互之间紧密相关。进一步的生存分析显示,AGTR1、AVPR1A、EGR2、FGFR2、FN1、FOSB、GNA14、JUN与无病生存时间相关,但总体生存时间无差异。FN1在31例(59.61%)PTC组织中呈上调表达,平均表达倍数变化为(3.75±5.90)倍。与Nthy-ori 3-1细胞相比,BCPAP和TPC-1中FN1的表达水平分别提高了(4.75±1.12)倍、(11.89±3.53)倍(P<0.01)。结论 AGTR1、AVPR1A、EGR2、FGFR2、FN1、FOSB、GNA14、JUN在PTC中异常表达且预示着较差的临床预后;FN1基因在PTC组织和细胞株中表达增高。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 生物信息学 异常表达基因 fn1 临床预后
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猪肛门闭锁候选基因FN1的克隆及其编码区突变 被引量:1
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作者 金秋实 刘睿泽 +1 位作者 余梅 李小平 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期72-77,共6页
利用猪的SNP芯片筛选锁肛致病候选基因,在猪15号染色体候选区域筛选出纤连蛋白1(fibronectin 1,FN1)基因。分别用锁肛猪和正常猪cDNA池克隆得到FN1基因开放阅读框的7 437bp序列,鉴定3个选择性剪切外显子,并通过直接测序获得21个编码区... 利用猪的SNP芯片筛选锁肛致病候选基因,在猪15号染色体候选区域筛选出纤连蛋白1(fibronectin 1,FN1)基因。分别用锁肛猪和正常猪cDNA池克隆得到FN1基因开放阅读框的7 437bp序列,鉴定3个选择性剪切外显子,并通过直接测序获得21个编码区单核苷酸多态位点(SNPs)。其中第22外显子的148A>G和第27外显子的50G>C引起氨基酸的改变(1 167Ile>Val,1 435Glu-Asp),且这2个SNPs在现有锁肛猪和正常猪样品中基因型频率和基因频率均差异显著。研究结果提示FN1基因的突变可能影响肛门直肠的正常发育过程,但还需要进一步的功能验证。 展开更多
关键词 fn1 肛门闭锁 SNPS
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伴肾小球薄基膜改变的IgA肾病非胶原Ⅳ基因变异分析
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作者 徐华 余学问 +6 位作者 梁莹莹 李芸 曾又佳 张露 徐洲稳 李霞 邵牧民 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1153-1158,共6页
目的探讨伴薄基膜改变的IgA肾病中非胶原Ⅳ基因变异意义及临床病理特征。方法提取6例伴薄基膜改变的IgA肾病患者的外周血单个核细胞总DNA,通过全外显子组测序技术检测基因变异情况,并采用Sanger测序进行验证,对候选变异基因进行生物信... 目的探讨伴薄基膜改变的IgA肾病中非胶原Ⅳ基因变异意义及临床病理特征。方法提取6例伴薄基膜改变的IgA肾病患者的外周血单个核细胞总DNA,通过全外显子组测序技术检测基因变异情况,并采用Sanger测序进行验证,对候选变异基因进行生物信息学功能分析;收集患者临床及实验室检查信息,分析临床表现及特点;采用HE、免疫组化及免疫荧光法对伴薄基膜改变的IgA肾病进行检测,观察患者肾脏穿刺组织病理学特征。结果6例样本中2例发现FN1基因变异(c.3289G>A和c.4616C>G),同时还分别存在NUP160(c.160G>A)和ITGA3(c.3046-4G>A)基因变异;其中FN1变异为可能致病性变异,NUP160、ITGA3变异为意义未明变异。2例患者均为年轻女性,临床表现为血尿及非肾病综合征范围蛋白尿,早期肾功能正常,均伴有皮疹。病理形态学为局灶节段性硬化及轻度系膜增生,系膜区可见电子致密物沉积,基膜均质变薄,足细胞不同程度微绒毛活化及足突融合,坏死或新月体不常见。结论伴薄基膜改变的IgA肾病中存在FN1、NUP160、ITGA3等非胶原Ⅳ基因变异,该类患者具有皮疹等独特的临床和病理学特征。丰富了伴薄基膜改变的IgA肾病中非胶原Ⅳ的候选变异基因谱及FN1相关肾病的疾病表型谱;NUP160、ITGA3可能是对此类疾病蛋白尿起协同作用的基因变异。 展开更多
关键词 IGA肾病 薄基膜 基因变异 fn1 NUP160 ITGA3
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