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酪氨酸激酶抑制剂的三维定量构效关系研究
被引量：
2
1
作者
彭涛
裴剑锋
周家驹
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第2期163-166,共4页
利用柔性原子受体模型(FLARM)方法对一系列的异黄酮和喹诺酮衍生物表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂进行了三维定量构效关系研究,得到了合理的构效关系模型.FLARM方法的计算结果还给出了虚拟的受体模型,该模型说明了抑制剂与受体之间...
利用柔性原子受体模型(FLARM)方法对一系列的异黄酮和喹诺酮衍生物表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂进行了三维定量构效关系研究,得到了合理的构效关系模型.FLARM方法的计算结果还给出了虚拟的受体模型,该模型说明了抑制剂与受体之间可能的相互作用.由该虚拟受体模型得到的受体-配体相互作用与Novartis药效团模型比较类似.
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关键词
酷氨酸激酶抑制剂
三维定量构效关系
柔性原子受体模型
flarm
下载PDF
职称材料
柔性原子受体模型(FLARM)
被引量：
6
2
作者
裴剑锋
周家驹
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期973-979,共7页
柔性原子受体模型 (FlexibleAtomReceptorModel,FLARM)方法使用了改进的遗传算法 (IGA) ,比传统的受体模型方法具有更快的计算速度 ;FLARM受体模型中的原子空间坐标在遗传演化过程中是可变的 ,避免了不合适的起始位点对模型的影响 ;另外...
柔性原子受体模型 (FlexibleAtomReceptorModel,FLARM)方法使用了改进的遗传算法 (IGA) ,比传统的受体模型方法具有更快的计算速度 ;FLARM受体模型中的原子空间坐标在遗传演化过程中是可变的 ,避免了不合适的起始位点对模型的影响 ;另外 ,FLARM用增加空原子权重的方法 ,可以生成不完全封闭的、允许有大段空区域的受体模型 ,这样的模型能更好地模拟实际受体的结构 ,并且容易和药效团模型找到对应关系 .我们用FLARM方法分别计算了甾类化合物体系的CBG蛋白亲和性和 1,1,3 三氧 2H ,4H 噻吩并 [3,4 e][1,2 ,4]噻二嗪衍生物 (TTD)体系的抗HIV 1活性 ,计算结果表明FLARM生成的虚拟受体模型对配体分子的活性具有较高的预测能力 ,在此虚拟受体模型的基础上还可以进一步分析虚拟受体分子与配体分子的相互作用机制 。
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关键词
柔性原子受体模型
遗传算法
甾类化合物
TTD
药物设计
药效团模型
抗HIV-1活性
下载PDF
职称材料
GABA受体抑制剂的柔性原子受体模型研究
被引量：
2
3
作者
沈斌
陆忠华
+2 位作者
迟学斌
吕海峰
任天瑞
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2005年第7期800-803,共4页
利用Flarm软件为GABA受体抑制剂建立了其抑制家蝇和大鼠GABA受体的柔性原子受体模型,很好地模拟了两种受体与药物分子结合的情况,具有较好的预测能力,预测集的预测值与实验值的相关系数(r2)分别达到0.923和0.733,模型的结果与药效团模...
利用Flarm软件为GABA受体抑制剂建立了其抑制家蝇和大鼠GABA受体的柔性原子受体模型,很好地模拟了两种受体与药物分子结合的情况,具有较好的预测能力,预测集的预测值与实验值的相关系数(r2)分别达到0.923和0.733,模型的结果与药效团模型有很大的一致性,为揭示药物与两种受体作用的区别提供了依据.
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关键词
柔性原子受体模型(
flarm
)
GABA受体
定量构效关系(QSAR)
抑制剂
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职称材料
题名
酪氨酸激酶抑制剂的三维定量构效关系研究
被引量：
2
1
作者
彭涛
裴剑锋
周家驹
机构
中国科学院过程工程研究所
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第2期163-166,共4页
基金
国家基础研究发展规划项目(G1998051115)资助~
文摘
利用柔性原子受体模型(FLARM)方法对一系列的异黄酮和喹诺酮衍生物表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂进行了三维定量构效关系研究,得到了合理的构效关系模型.FLARM方法的计算结果还给出了虚拟的受体模型,该模型说明了抑制剂与受体之间可能的相互作用.由该虚拟受体模型得到的受体-配体相互作用与Novartis药效团模型比较类似.
关键词
酷氨酸激酶抑制剂
三维定量构效关系
柔性原子受体模型
flarm
Keywords
Tyrosine kinase inhibitor, 3D QSAR,Flexible atom receptor model
分类号
R914 [医药卫生—药物化学]
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职称材料
题名
柔性原子受体模型(FLARM)
被引量：
6
2
作者
裴剑锋
周家驹
机构
中国科学院过程工程研究所
出处
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002年第6期973-979,共7页
文摘
柔性原子受体模型 (FlexibleAtomReceptorModel,FLARM)方法使用了改进的遗传算法 (IGA) ,比传统的受体模型方法具有更快的计算速度 ;FLARM受体模型中的原子空间坐标在遗传演化过程中是可变的 ,避免了不合适的起始位点对模型的影响 ;另外 ,FLARM用增加空原子权重的方法 ,可以生成不完全封闭的、允许有大段空区域的受体模型 ,这样的模型能更好地模拟实际受体的结构 ,并且容易和药效团模型找到对应关系 .我们用FLARM方法分别计算了甾类化合物体系的CBG蛋白亲和性和 1,1,3 三氧 2H ,4H 噻吩并 [3,4 e][1,2 ,4]噻二嗪衍生物 (TTD)体系的抗HIV 1活性 ,计算结果表明FLARM生成的虚拟受体模型对配体分子的活性具有较高的预测能力 ,在此虚拟受体模型的基础上还可以进一步分析虚拟受体分子与配体分子的相互作用机制 。
关键词
柔性原子受体模型
遗传算法
甾类化合物
TTD
药物设计
药效团模型
抗HIV-1活性
Keywords
flarm
receptor model
genetic algorithm
steroid
TTD
drug design
分类号
R914.2 [医药卫生—药物化学]
R978.1 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
GABA受体抑制剂的柔性原子受体模型研究
被引量：
2
3
作者
沈斌
陆忠华
迟学斌
吕海峰
任天瑞
机构
中国科学院计算机网络信息中心
中国科学院过程工程研究所
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2005年第7期800-803,共4页
基金
中国科学院知识创新工程信息化建设重大专项(INF105-SCE)
国家十五"863"项目(2002AA104540)
"973"项目(2003CB114401)资助~~
文摘
利用Flarm软件为GABA受体抑制剂建立了其抑制家蝇和大鼠GABA受体的柔性原子受体模型,很好地模拟了两种受体与药物分子结合的情况,具有较好的预测能力,预测集的预测值与实验值的相关系数(r2)分别达到0.923和0.733,模型的结果与药效团模型有很大的一致性,为揭示药物与两种受体作用的区别提供了依据.
关键词
柔性原子受体模型(
flarm
)
GABA受体
定量构效关系(QSAR)
抑制剂
Keywords
flexible atom receptor model(
flarm
)
GABA receptor
quantitative structure activity relationship(QSAR)
Inhibitor
分类号
TQ450.11 [化学工程—农药化工]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
酪氨酸激酶抑制剂的三维定量构效关系研究
彭涛
裴剑锋
周家驹
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003
2
下载PDF
职称材料
2
柔性原子受体模型(FLARM)
裴剑锋
周家驹
《化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2002
6
下载PDF
职称材料
3
GABA受体抑制剂的柔性原子受体模型研究
沈斌
陆忠华
迟学斌
吕海峰
任天瑞
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2005
2
下载PDF
职称材料
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