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结核分枝杆菌eis基因及其编码蛋白的生物信息学分析
被引量:
14
1
作者
张西燕
付玉荣
伊正君
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2018年第2期140-145,151,共7页
目的获取结核分枝杆菌(H37Rv)的eis基因序列及其编码蛋白(Eis蛋白)的氨基酸序列,预测和分析该蛋白的结构和功能。方法从NCBI BenBank数据库获取eis基因及其编码蛋白序列,利用ORF Finger工具分析eis基因的开放阅读框;利用Expasy PortPara...
目的获取结核分枝杆菌(H37Rv)的eis基因序列及其编码蛋白(Eis蛋白)的氨基酸序列,预测和分析该蛋白的结构和功能。方法从NCBI BenBank数据库获取eis基因及其编码蛋白序列,利用ORF Finger工具分析eis基因的开放阅读框;利用Expasy PortParam、SignalP 4.0Server、TMHMM Server v.2.0、SOPMA、BLAST、SWISS-MODEL、ABCpred、SYFPEITHI以及NetMHCIIpan 3.1Server等软件对Eis蛋白的生物学特性进行预测分析。结果结核分枝杆菌eis基因全长1 164bp,有7个开放阅读框,最长一个被通读,编码387个氨基酸。Eis蛋白分子式C1870H2958N550O542S11,等电点(pI)为6.46,属于不稳定、疏水性蛋白;无跨膜区,信号肽切割位点位于第21位氨基酸处;二级结构预测无规则卷曲占30.23%,含有一个保守结构域;建立同源三级模型,GMQE为0.98;预测该蛋白至少含有6个B细胞优势抗原表位和14个优势CTL表位。优势抗原表位数个。结论生物学信息学方法预测结核分枝杆菌的Eis蛋白具有优势T、B细胞抗原性表位,所含保守结构域与其功能密切相关。eis基因以及Eis蛋白与结核分枝杆菌抑制细胞自噬及其耐药机制密切相关,可作为抗结核治疗的切入点。
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关键词
eis
基因
eis
蛋白
结核分枝杆菌
巨噬细胞
生物信息学
原文传递
肺结核患者结核分支杆菌EIS抗原特异性细胞免疫的临床研究
被引量:
5
2
作者
王火生
陈心春
+6 位作者
李美忠
张维
邓群益
付向东
张红梅
王辉
周伯平
《中国危重病急救医学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第8期498-500,共3页
目的探讨肺结核患者结核分支杆菌EIS抗原特异性细胞免疫水平与病情的关系。方法选择30例初治、痰涂片结核杆菌阳性的活动性肺结核患者,采用比色法测定其外周血淋巴细胞对结核分支杆菌EIS抗原的增殖反应,酶联免疫吸附法测定细胞分泌的γ...
目的探讨肺结核患者结核分支杆菌EIS抗原特异性细胞免疫水平与病情的关系。方法选择30例初治、痰涂片结核杆菌阳性的活动性肺结核患者,采用比色法测定其外周血淋巴细胞对结核分支杆菌EIS抗原的增殖反应,酶联免疫吸附法测定细胞分泌的γ干扰素(IFNγ)及白细胞介素10(IL10)的水平,并与20名健康对照者和16例康复的肺结核患者进行比较。结果康复者对EIS的细胞免疫最为强烈,其外周血淋巴细胞的细胞增殖强度显著高于健康对照者和活动性肺结核患者(P均<0.01)。活动性肺结核患者外周血淋巴细胞在受到EIS刺激时分泌的IFNγ显著低于康复者(P<0.05)。EIS抗原刺激主要诱导细胞分泌Th2型细胞因子IL10。结论活动性肺结核患者对EIS抗原的细胞免疫水平低下,经抗结核治疗康复后,细胞免疫维持在较高水平。EIS抗原诱导Th1/Th2免疫失衡可能是EIS参与结核发病的机制之一。
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关键词
肺结核
细胞免疫
eis
蛋白
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职称材料
结核分枝杆菌重组EIS蛋白血清学诊断价值的研究
被引量:
2
3
作者
肖松生
李美忠
+5 位作者
王火生
邓群益
蔡雄茂
周伯平
张维
陈心春
《中国防痨杂志》
CAS
2006年第3期167-169,共3页
目的研究结核分枝杆菌重组EIS蛋白的抗原性,观察抗结核化疗对抗EIS抗体滴度影响,初步探讨EIS蛋白作为血清诊断抗原在筛选活动性肺结核作用的可能性。方法采用基因工程方法表达纯化EIS抗原,以EIS为抗原建立酶联免疫方法,检测肺结核病人...
目的研究结核分枝杆菌重组EIS蛋白的抗原性,观察抗结核化疗对抗EIS抗体滴度影响,初步探讨EIS蛋白作为血清诊断抗原在筛选活动性肺结核作用的可能性。方法采用基因工程方法表达纯化EIS抗原,以EIS为抗原建立酶联免疫方法,检测肺结核病人和健康对照者中抗EIS抗体的存在情况。对初次化疗的肺结核病人进行抗EIS抗体水平的随访,观察化疗对抗体反应的影响。结果肺结核病人抗EIS抗体的水平显著高于健康对照和肺部非肺结核疾病对照(P<0.000 1),结核化疗对抗体反应的影响不大,在整个化疗过程中抗体水平无显著差别。结论EIS抗体的检测可能有助于活动性肺结核的筛选。
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关键词
eis
蛋白
结核
肺/诊断
抗体反应
下载PDF
职称材料
题名
结核分枝杆菌eis基因及其编码蛋白的生物信息学分析
被引量:
14
1
作者
张西燕
付玉荣
伊正君
机构
潍坊医学院医学检验学系
潍坊医学院病原生物学教研室
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2018年第2期140-145,151,共7页
基金
国家自然科学基金项目(No.30972639)
山东省自然科学基金项目(No.ZR2016HM09)
文摘
目的获取结核分枝杆菌(H37Rv)的eis基因序列及其编码蛋白(Eis蛋白)的氨基酸序列,预测和分析该蛋白的结构和功能。方法从NCBI BenBank数据库获取eis基因及其编码蛋白序列,利用ORF Finger工具分析eis基因的开放阅读框;利用Expasy PortParam、SignalP 4.0Server、TMHMM Server v.2.0、SOPMA、BLAST、SWISS-MODEL、ABCpred、SYFPEITHI以及NetMHCIIpan 3.1Server等软件对Eis蛋白的生物学特性进行预测分析。结果结核分枝杆菌eis基因全长1 164bp,有7个开放阅读框,最长一个被通读,编码387个氨基酸。Eis蛋白分子式C1870H2958N550O542S11,等电点(pI)为6.46,属于不稳定、疏水性蛋白;无跨膜区,信号肽切割位点位于第21位氨基酸处;二级结构预测无规则卷曲占30.23%,含有一个保守结构域;建立同源三级模型,GMQE为0.98;预测该蛋白至少含有6个B细胞优势抗原表位和14个优势CTL表位。优势抗原表位数个。结论生物学信息学方法预测结核分枝杆菌的Eis蛋白具有优势T、B细胞抗原性表位,所含保守结构域与其功能密切相关。eis基因以及Eis蛋白与结核分枝杆菌抑制细胞自噬及其耐药机制密切相关,可作为抗结核治疗的切入点。
关键词
eis
基因
eis
蛋白
结核分枝杆菌
巨噬细胞
生物信息学
Keywords
eis
gene
eis
protein
Mycobacterium tuberculosis
macrophage
bioinformatics
分类号
R378.99 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
肺结核患者结核分支杆菌EIS抗原特异性细胞免疫的临床研究
被引量:
5
2
作者
王火生
陈心春
李美忠
张维
邓群益
付向东
张红梅
王辉
周伯平
机构
深圳市东湖医院
出处
《中国危重病急救医学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第8期498-500,共3页
基金
广东省深圳市科技计划项目(200304204)
文摘
目的探讨肺结核患者结核分支杆菌EIS抗原特异性细胞免疫水平与病情的关系。方法选择30例初治、痰涂片结核杆菌阳性的活动性肺结核患者,采用比色法测定其外周血淋巴细胞对结核分支杆菌EIS抗原的增殖反应,酶联免疫吸附法测定细胞分泌的γ干扰素(IFNγ)及白细胞介素10(IL10)的水平,并与20名健康对照者和16例康复的肺结核患者进行比较。结果康复者对EIS的细胞免疫最为强烈,其外周血淋巴细胞的细胞增殖强度显著高于健康对照者和活动性肺结核患者(P均<0.01)。活动性肺结核患者外周血淋巴细胞在受到EIS刺激时分泌的IFNγ显著低于康复者(P<0.05)。EIS抗原刺激主要诱导细胞分泌Th2型细胞因子IL10。结论活动性肺结核患者对EIS抗原的细胞免疫水平低下,经抗结核治疗康复后,细胞免疫维持在较高水平。EIS抗原诱导Th1/Th2免疫失衡可能是EIS参与结核发病的机制之一。
关键词
肺结核
细胞免疫
eis
蛋白
Keywords
pulmonary tuberculosis
cellular immune response
enhance intracellular survival
分类号
R521 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
结核分枝杆菌重组EIS蛋白血清学诊断价值的研究
被引量:
2
3
作者
肖松生
李美忠
王火生
邓群益
蔡雄茂
周伯平
张维
陈心春
机构
广东省深圳市东湖医院深圳
出处
《中国防痨杂志》
CAS
2006年第3期167-169,共3页
文摘
目的研究结核分枝杆菌重组EIS蛋白的抗原性,观察抗结核化疗对抗EIS抗体滴度影响,初步探讨EIS蛋白作为血清诊断抗原在筛选活动性肺结核作用的可能性。方法采用基因工程方法表达纯化EIS抗原,以EIS为抗原建立酶联免疫方法,检测肺结核病人和健康对照者中抗EIS抗体的存在情况。对初次化疗的肺结核病人进行抗EIS抗体水平的随访,观察化疗对抗体反应的影响。结果肺结核病人抗EIS抗体的水平显著高于健康对照和肺部非肺结核疾病对照(P<0.000 1),结核化疗对抗体反应的影响不大,在整个化疗过程中抗体水平无显著差别。结论EIS抗体的检测可能有助于活动性肺结核的筛选。
关键词
eis
蛋白
结核
肺/诊断
抗体反应
Keywords
eis
protein
Pulmonary tuberculosis/diagnosis
Antibody response
分类号
R521 [医药卫生—内科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
结核分枝杆菌eis基因及其编码蛋白的生物信息学分析
张西燕
付玉荣
伊正君
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2018
14
原文传递
2
肺结核患者结核分支杆菌EIS抗原特异性细胞免疫的临床研究
王火生
陈心春
李美忠
张维
邓群益
付向东
张红梅
王辉
周伯平
《中国危重病急救医学》
CAS
CSCD
北大核心
2006
5
下载PDF
职称材料
3
结核分枝杆菌重组EIS蛋白血清学诊断价值的研究
肖松生
李美忠
王火生
邓群益
蔡雄茂
周伯平
张维
陈心春
《中国防痨杂志》
CAS
2006
2
下载PDF
职称材料
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