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2016年云南省边境地区健康儿童肠道病毒带毒调查研究
1
作者 熊庆 胡筱莛 +4 位作者 樊帆 张杰 丁峥嵘 文卫华 田炳均 《中国病毒病杂志》 CAS 2018年第4期268-274,共7页
目的了解2016年云南省边境地区健康儿童肠道病毒(enterovirus,EV)带毒情况及病毒型别,为今后预防和控制EV提供实验室基础。方法于2016年采集云南省10个边境县(市)<15岁健康儿童粪便标本500份(均为单份便),进行病毒分离和基因测序定... 目的了解2016年云南省边境地区健康儿童肠道病毒(enterovirus,EV)带毒情况及病毒型别,为今后预防和控制EV提供实验室基础。方法于2016年采集云南省10个边境县(市)<15岁健康儿童粪便标本500份(均为单份便),进行病毒分离和基因测序定型。结果 500份便标本中共检测到EV 41株(带毒率为8.20%,41/500)。41株EV中,EV-A病毒3株(阳性率0.60%,3/500);EV-B病毒35株(阳性率7.00%,35/500),其中新型病毒EV-B73 1株(阳性率0.20%),EV-B80 1株(阳性率0.20%);EV-C病毒3株(阳性率0.60%),EV-C病毒中脊髓灰质炎(简称脊灰)病毒(poliovirus,PV)1株(阳性率0.20%),为疫苗株,未发现脊灰野病毒,EV-C99病毒1株(阳性率0.20%)。结论 2016年云南省边境地区健康儿童粪便标本EV病毒检测结果以EV-B组病毒为主,并分离到新型病毒EV-B73、EV-B80和EV-C99各1株。云南省维持无脊髓灰质炎状态良好。对E-30和E-3病毒的基因进化特征分析表明这两种病毒具有基因多样性特点。 展开更多
关键词 肠道病毒 健康儿童 边境地区 测序定型 ev-B73 ev-B80 ev-c99 基因特征分析
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云南省健康儿童中1株肠道病毒新毒株EV—C99的分离及其基因特征分析 被引量：2
2
作者 张杰 胡筱莛 +2 位作者 樊帆 丁峥嵘 田炳均 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期451-455,共5页
目的对云南省2016年健康儿童中1株肠道病毒（enterovirus，EV）新毒株EV-C99进行分离并对其基因特征进行分析。方法按世界卫生组织（World Health Organization，WHO）推荐的方法对该名儿童的大便标本进行病毒分离，提取该病毒RNA并对其... 目的对云南省2016年健康儿童中1株肠道病毒（enterovirus，EV）新毒株EV-C99进行分离并对其基因特征进行分析。方法按世界卫生组织（World Health Organization，WHO）推荐的方法对该名儿童的大便标本进行病毒分离，提取该病毒RNA并对其VP1区基因进行RT-PCR和基因测序，用Sequencher 5.0软件对序列进行编辑和拼接。所得序列在GenBank进行＂BLAST＂搜索，得到初步结果，再用MEGA5.2软件计算与原型株的核苷酸和氨基酸同源性，按目前肠道病毒测序定型标准确定病毒最终型别并进行基因特征分析。结果该病毒能被494/496和495/497引物扩增，经Sequencher 5.0软件拼接和编辑后得到约1 200 bp的序列，该序列在GenBank进行＂BLAST＂搜索，初步结果为新型肠道病毒EV-C99。与EV-C99病毒的原型株BAN00-10461（基因库编号：EF015008）对比分析后得到该病毒VP1区完整序列为909 bp，与原型株的核苷酸（nucleotide，nt）同源性（identity）为77.05%，氨基酸（amino acid，aa）同源性为90.04%，按肠道病毒测序定型标准，确定该病毒为EV-C99，是人类肠道病毒C组中的一种新型病毒。结论2016年云南省健康儿童肠道病毒带毒调查中分离到一株肠道病毒新毒株EV-C99，是国内第3次报道该病毒。基因进化分析表明，云南分离株与新疆分离株、山东分离株都为B基因型，但3个省的分离株位于不同的进化分支，该病毒具有基因多样性特点。 展开更多
关键词 健康儿童 ev-c99 测序定型 基因特征
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