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猪繁殖候选基因ERK2的电子克隆与生物信息学分析 被引量:3
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作者 方梅霞 周晓宁 +3 位作者 沈栩 王亚军 聂庆华 张细权 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期11-15,22,共6页
利用生物信息学和比较基因组学方法对猪细胞外信号调节激酶2(Extracellular signal-regulated kinase 2,ERK2)基因的结构、表达和功能进行了分析,结果表明:(1)电子克隆获得的猪ERK2基因cDNA全长1 803 bp,包括1 080bp的编码区和200 bp 5&... 利用生物信息学和比较基因组学方法对猪细胞外信号调节激酶2(Extracellular signal-regulated kinase 2,ERK2)基因的结构、表达和功能进行了分析,结果表明:(1)电子克隆获得的猪ERK2基因cDNA全长1 803 bp,包括1 080bp的编码区和200 bp 5'UTR、523 bp 3'UTR,编码合成359个氨基酸的多肽;(2)猪ERK2基因CDS序列与人、小鼠和大鼠的同源性分别为94.6%、91.6%和91.3%,编码合成的猪ERK2与人、小鼠和大鼠之间的同源性也高达99.4%、98.9%和98.9%;(3)猪ERK2蛋白的相对分子质量为41 303.69 Da,不含信号肽,具有ATP结合位点、MAP激酶保守位点和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性位点等结构域;(4)基于cDNA及EST数据库的检索显示,猪ERK2基因在卵巢、睾丸、肾上腺、眼、肺、淋巴、关节囊、副乳、未成熟的树突状细胞和脂肪细胞等组织和细胞中表达。 展开更多
关键词 erk2基因 电子克隆 生物信息学
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猪繁殖候选基因ERK2的克隆、表达及基因多态分析 被引量:1
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作者 方梅霞 张伟 +4 位作者 胡永胜 欧阳宏佳 贾新正 聂庆华 张细权 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期210-217,共8页
【目的】ERK2基因在细胞增殖和分化调控以及启动卵巢排卵的分子信号等过程中发挥重要作用,是影响猪繁殖性状的重要候选基因。本试验对猪ERK2基因序列、基因结构、基因多态性及其表达规律进行初步研究。【方法】以大白猪为材料,采用RT-PC... 【目的】ERK2基因在细胞增殖和分化调控以及启动卵巢排卵的分子信号等过程中发挥重要作用,是影响猪繁殖性状的重要候选基因。本试验对猪ERK2基因序列、基因结构、基因多态性及其表达规律进行初步研究。【方法】以大白猪为材料,采用RT-PCR方法克隆了猪ERK2基因,Real-Time PCR测定该基因在猪各组织器官中的分布,并对该基因的结构和多态性进行分析。【结果】从猪卵巢组织中克隆获得ERK2基因部分cDNA序列,长1 888 bp,包括一个1 080 bp的开放阅读框,编码359个氨基酸与预测的猪ERK2基因、已报道的人和小鼠等的ERK2基因高度相似;猪ERK2基因在各组织中表达广泛,其中脾脏是表达量最高的组织,在脂肪组织、前后腿肌中基本不表达;猪ERK2基因定位于14号染色体,全长在22 kb以上,包含9个外显子和8个内含子;对第2—9外显子及内含子外显子交界处的内含子序列进行序列突变检测,共检测到11个SNPs和1个插入缺失突变,但绝大部分的变异都是在内含子区域,仅有1个SNP发生于3′UTR区域。【结论】猪ERK2基因cDNA为1 888 bp,编码359个氨基酸残基;在猪各组织中广泛分布,以脾脏的表达量最高;该基因由9个外显子和8个内含子组成,基因保守性较高,共检测到11个SNP和1个插入缺失突变均不在编码区中。 展开更多
关键词 erk2基因 CDNA克隆 组织表达 SNP
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反义ERK2基因对结缔组织生长因子诱导肾小管上皮细胞向间充质转化的调控效应 被引量:1
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作者 丁召 陈知水 +3 位作者 宫念樵 陈曦林 蔡明 郭晖 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期153-157,共5页
目的研究细胞外信号调节激酶2(ERK2)信号转导通路对结缔组织生长因子(CTGF)诱导人肾小管上皮细胞(HK-2)向间充质细胞转化的调控效应。方法腺病毒介导的反义ERK2基因(Adanti-ERK2)按感染强度50、100、200转染HK-2细胞,确定最适感染强度... 目的研究细胞外信号调节激酶2(ERK2)信号转导通路对结缔组织生长因子(CTGF)诱导人肾小管上皮细胞(HK-2)向间充质细胞转化的调控效应。方法腺病毒介导的反义ERK2基因(Adanti-ERK2)按感染强度50、100、200转染HK-2细胞,确定最适感染强度。按作用因素的不同将HK-2细胞分为对照组、Ad-LacZ组、CTGF组和Adanti-ERK2组。免疫组织化学检测E-Cadherin和Vi mentin的表达,Western blot法检测E-Cadherin、Vi mentin及ERK2的表达变化;细胞接种Boyden小室1、3、5 d时检测各组HK-2细胞迁移数目的变化。结果①Adanti-ERK2转染HK-2细胞最适感染强度为100。②HK-2细胞在CTGF刺激下E-Cadherin蛋白表达明显减少,Vi mentin表达增加,同时细胞内的ERK2蛋白表达显著增加;而Adanti-ERK2组E-Cadherin和Vi mentin表达变化不明显,ERK2蛋白表达较对照组明显减少。③接种5 d,HK-2细胞在CTGF刺激下细胞运动能力显著高于其他各组,而Adanti-ERK2组与对照组和Ad-LacZ组相比差异无显著性意义。结论以反义ERK2基因治疗可以有效阻断CTGF诱导的肾小管上皮细胞向间充质转化。提示ERK2信号转导通路在该转化中发挥重要作用。 展开更多
关键词 反义erk2基因 结缔组织生长因子 上皮细胞-间充质转化 纤维化
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腺病毒介导ERK-2基因在生长板软骨细胞中的表达 被引量:1
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作者 季煜华 曾耀英 +3 位作者 邢飞跃 俞瑜 王会营 江颖娟 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期503-508,共6页
目的:构建ERK-2基因重组腺病毒载体,检测构建的腺病毒感染原代大鼠生长板软骨细胞的效率以及目的基因的表达。方法:将ERK-2 cDNA亚克隆到腺病毒穿梭载体pAdTrack-CMV中,线性化后与腺病毒骨架质粒pAdEasy-1共同转染E.Col.i B J5183,将筛... 目的:构建ERK-2基因重组腺病毒载体,检测构建的腺病毒感染原代大鼠生长板软骨细胞的效率以及目的基因的表达。方法:将ERK-2 cDNA亚克隆到腺病毒穿梭载体pAdTrack-CMV中,线性化后与腺病毒骨架质粒pAdEasy-1共同转染E.Col.i B J5183,将筛选、鉴定的重组腺病毒质粒线性化后转染HEK293细胞进行病毒颗粒的包装;流式细胞术检测不同感染复数(MO I)ERK-2重组腺病毒感染原代培养的大鼠肋生长板软骨细胞的效率,W estern b lot检测腺病毒感染的生长板软骨细胞中ERK-2蛋白的表达。结果:成功构建ERK-2重组腺病毒,MO I 50的腺病毒感染原代生长板软骨细胞的效率大于90%,感染的生长板软骨细胞中ERK-2表达显著增加。结论:构建的重组腺病毒可介导ERK-2基因在原代大鼠生长板软骨细胞中高表达。 展开更多
关键词 erk-2基因 生长板软骨细胞 腺病毒
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ERK干扰质粒的构建及对胃癌细胞株BGC823 DcR3表达的影响
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作者 范鑫 庄国洪 +4 位作者 黄小平 杨东海 刘彬 程小峰 刘忠臣 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1039-1042,1047,共5页
目的探讨胃癌发展的分子机制,通过构建ERK1/2shRNA真核表达载体,体外研究其对人胃癌细胞株BGC823ERK1/2蛋白及DcR3表达水平的影响。方法应用PRNAT-U6.1/Neo载体构建ERK1/2基因shRNA重组质粒,经脂质体法导入BGC823细胞中,分别设置对照组... 目的探讨胃癌发展的分子机制,通过构建ERK1/2shRNA真核表达载体,体外研究其对人胃癌细胞株BGC823ERK1/2蛋白及DcR3表达水平的影响。方法应用PRNAT-U6.1/Neo载体构建ERK1/2基因shRNA重组质粒,经脂质体法导入BGC823细胞中,分别设置对照组、干扰组和U0126抑制剂组。Westernblot法检测转染后BGC823细胞及抑制剂使用后ERK1/2蛋白的表达变化,荧光显微镜检测质粒自带GFP基因的表达情况确认转染效率,ELISA法检测各组细胞上清中DcR3分泌蛋白的表达特点。结果成功构建ERK1/2基因shRNA重组质粒。证明了ERK1/2蛋白的表达与DcR3的分泌水平在BGC823细胞株中呈正相关。结论 ERK1/2干扰质粒明显降低BGC823细胞的ERK1/2蛋白表达水平,ERK信号通路对DcR3的分泌具有重要调控作用,为其下游调控机制的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 erk1/2基因 DCR3 RNA干扰 胃癌
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滋阴经方经TGF-β途径抑制小鼠自发乳腺癌生长的机理 被引量:11
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作者 郑里翔 林栋美 +1 位作者 刘红宁 余世平 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1793-1795,共3页
目的观察滋阴经方-六味地黄丸对荷瘤小鼠乳腺癌的影响及部分机理。方法以清洁级昆明雌性小鼠种鼠自发乳腺癌为模型,用六味地黄丸治疗直至濒死期,肿瘤病理分析用HE染色,TGF-β(Transforming Growth Factor-β)、磷酸化胞外调节蛋白激酶(p... 目的观察滋阴经方-六味地黄丸对荷瘤小鼠乳腺癌的影响及部分机理。方法以清洁级昆明雌性小鼠种鼠自发乳腺癌为模型,用六味地黄丸治疗直至濒死期,肿瘤病理分析用HE染色,TGF-β(Transforming Growth Factor-β)、磷酸化胞外调节蛋白激酶(p–ERK1/2,phospho-ERKp44,p42)基因表达的产物用RT-PCR及Western bloting方法测定。结果六味地黄丸高、低剂量组的瘤质量明显低于对照组(P<0.05),瘤块中TGF-β、p-ERK基因表达产物也明显低于对照组(P<0.01)。结论六味地黄丸可通过TGF-β信号转导途径抑制乳腺癌的生长。 展开更多
关键词 六味地黄丸 自发乳腺癌小鼠 瘤质量 TGF-β/p-erk1/2基因表达
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