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2015-2016年病毒性脑炎流行病学分析 被引量:25
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作者 李慧 刘威 赵建民 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第1期72-75,共4页
目的分析2015-2016年病毒性脑炎流行病学特征,为临床疾病防控提供指导。方法收集2015-2016年311例病毒性脑炎患者血清、脑脊液标本,检测病毒IgM抗体。采用RD和Hep-2细胞分离肠道病毒,经序列分析后鉴定其亚型。结果 311例病毒性脑炎患者... 目的分析2015-2016年病毒性脑炎流行病学特征,为临床疾病防控提供指导。方法收集2015-2016年311例病毒性脑炎患者血清、脑脊液标本,检测病毒IgM抗体。采用RD和Hep-2细胞分离肠道病毒,经序列分析后鉴定其亚型。结果 311例病毒性脑炎患者中,2015年137例,2016年174例。2015-2016年1~3月、4~6月、7~9月、10~12月患者分别为39例(12.54%)、79例(25.40%)、141例(45.34%)、52例(16.72%),7~9月显著高于其他月份(χ2=5.4084,P<0.05)。0~岁103例(33.12%),13~岁71例(22.83%),19~岁39例(12.54%),39~岁43例(13.83%),≥58岁55例(17.68%),0~岁与其他各年龄组比较,差异有统计学意义(χ2=70.9003,P<0.05)。311例病毒性脑炎中,男性183例,女性128例,2015年男性患者76例(55.47%),女性患者61例(44.53%);2016年男性患者105例(60.34%),女性患者69例(39.66%),2015和2016年男、女患者发病差异有统计学意义(χ2=14.8966,P<0.05)。临床表现为发热、恶心、呕吐、上呼吸道感染、头痛、病理性脑膜刺激症阳性、咽部充血和扁桃体肿大患者分别有264例(84.89%)、124例(39.87%)、239例(76.85%)、198例(63.67%)、257例(82.64%)、37例(11.90%)、241例(77.49%);葡萄糖异常、蛋白定量异常、CSF白细胞异常、EEG异常、心肌酶升高、CSF压力增高患者分别有21例(6.75%)、88例(28.30%)、223例(71.70%)、269例(86.50%)、146例(24.95%)、240例(77.17%)。共分离出102株病毒,其中埃可病毒、柯萨奇病毒、脊髓灰质炎病毒、腮腺炎病毒、巨细胞病毒分别为42、27、16、11和6株;埃可病毒亚型33型27株,30型11株,51型4株;27株柯萨奇病毒均为B5型。结论 2015-2016年间发病高峰为7~9月,儿童患者常见,临床表现以发热、头痛、呕吐为主,常规检查中EEG异常和CSF压力增高居多。肠道病毒是病毒性脑炎致病的主要流行毒株,且以埃可病毒33亚型常见。 展开更多
关键词 病毒性脑炎 肠道病毒 埃可病毒 流行病学特征
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Molecular Epidemiology of Echovirus 18 Circulating in China's Mainland from 2015 to 2016 被引量:13
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作者 Xiangpeng Chen Tianjiao Ji +3 位作者 Jiayun Guo Wei Wang Wenbo Xu Zhengde Xie 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期50-58,共9页
Echovirus 18(E18), a serotype of Enterovirus B(EV-B) species, is an important pathogen in aseptic meningitis. E18 had rarely been detected in China's Mainland, but became the predominant pathogen associated with v... Echovirus 18(E18), a serotype of Enterovirus B(EV-B) species, is an important pathogen in aseptic meningitis. E18 had rarely been detected in China's Mainland, but became the predominant pathogen associated with viral encephalitis(VE) and meningitis in Hebei province for the first time in 2015. To investigate the molecular epidemiology and genetic characteristics of E18 in China's Mainland, sixteen E18 strains from patient throat swabs with hand, foot, and mouth disease(HFMD) in six provinces in China collected between 2015 and 2016, and four E18 strains isolated from 18 patient cerebrospinal fluid specimens with VE in Hebei Province in 2015 were obtained and sequenced. Combined with the sequences from the GenBank database, we performed an extensive genetic analysis. Phylogenetic analysis of VP1 gene sequences revealed that all E18 strains from China's Mainland after 2015 belonged to subgenotype C2. There were no obvious specific differences in phylogenetic and variation analyses of E18 genome sequences between HFMD and VE/meningitis strains. Potential multiple recombination may have occurred in the 50-untranslated region and in the P2 and P3 nonstructural protein-encoding regions of E18 strains from China. The current E18 strains were potential multiplerecombinant viruses. Overall, these findings supported that E18 caused HFMD, VE, and meningitis, although there were no significant associations between clinical features and viral genomic characteristics. 展开更多
关键词 GENETIC characteristics echovirus 18 (E18) GENOME ENTEROVIRUS Recombination
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浙江省2002-2018年病毒性脑膜炎病原学与分子流行病学特征 被引量:11
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作者 缪梓萍 严菊英 +7 位作者 孙逸 陈寅 龚黎明 葛琼 史雯 潘军航 茅海燕 张严峻 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期562-566,共5页
目的了解2002-2018年浙江省病毒性脑膜炎病原学及分子流行病学特征。方法从设立的监测点医院采集疑似病毒性脑膜炎患者样本2173份,其中脑脊液1718份、粪便455份,用荧光定量PCR方法检测脑脊液中人类肠道病毒(HEV)、腮腺炎病毒(MuV)、单... 目的了解2002-2018年浙江省病毒性脑膜炎病原学及分子流行病学特征。方法从设立的监测点医院采集疑似病毒性脑膜炎患者样本2173份,其中脑脊液1718份、粪便455份,用荧光定量PCR方法检测脑脊液中人类肠道病毒(HEV)、腮腺炎病毒(MuV)、单纯疱疹病毒(HSV)、巨细胞病毒(CMV)和乙型脑炎病毒(JEV)核酸,粪便样本只检测HEV;用ELISA方法检测脑脊液中上述5种病毒IgM抗体;对HEV核酸阳性样本扩增病毒VP1基因和测序,确定病毒型别并进行进化分析。结果在2002-2018年2173份样本中检出HEV核酸阳性871份(40.1%),其中脑脊液1718份、阳性654份(38.1%),粪便455份、阳性217份(47.7%);871份HEV核酸阳性样本,VP1扩增测序阳性670份,其中HEV-A 5份、HEV-B 665份,涉及23个病毒血清型,分别为柯萨奇病毒(CV)A组CVA4、CVA6、CVA9、CVA10,CVB组1~5,埃可病毒(EchoV;E)E3、E4、E6、E7、E9、E11、E14、E16、E18、E21、E25、E30、E33和肠道病毒(EV)-71,位于前3位的分别为E30、E6和CVB5,该3个血清型间隔若干年呈现病毒活动性增强的趋势。从2012-2015和2018年795份脑脊液中检出HEV核酸阳性374份、MuV 6份、HSV和CMV均为5份,对其中的368份脑脊液同时检测5种病毒IgM抗体,HEV抗体阳性2份、JEV 6份、MuV 1份。670份HEV中除1份EV-71外,EchoV 517份、CV 152份,两者之比为3.4∶1,两类病毒间隔3~5年存在优势株交替变化的趋势。VP1进化树显示,浙江省HEV位于HEV-A和HEV-B分支上,E30存在h和i基因亚型。结论浙江省病毒性脑膜炎的主要病原为HEV-B;EchoV检出率明显高于CV,两类病毒存在交替变化的趋势;优势血清型E30、CVB5和E6间隔若干年呈现病毒活动性增强的趋势;监测点HEV活动强度与病毒性脑膜炎暴发疫情的发生两者之间在时间上有较好的相关性。 展开更多
关键词 病毒性脑膜炎 肠道病毒 埃可病毒 柯萨奇病毒
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银川市某医院体检人群EV71型和ECHO病毒感染率的调查 被引量:7
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作者 白永生 杨安宁 +3 位作者 张静 孙炜炜 王菊 郭爱玲 《宁夏医科大学学报》 2012年第5期453-455,共3页
目的了解银川市不同年龄组人群肠道病毒71型(EV71型)和埃克病毒(ECHO)感染率情况及IgG抗体阳性率分布情况。方法采集宁夏银川市某医院204份不同年龄组体检人群血清,用间接酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清中的EV71型和ECHO IgG抗体。结... 目的了解银川市不同年龄组人群肠道病毒71型(EV71型)和埃克病毒(ECHO)感染率情况及IgG抗体阳性率分布情况。方法采集宁夏银川市某医院204份不同年龄组体检人群血清,用间接酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清中的EV71型和ECHO IgG抗体。结果 204例受检人群血清中EV71型和ECHO IgG阳性率分别为32.4%和15.1%,其中1岁以内婴幼儿EV71抗体阳性率低,1岁~组EV71 IgG抗体阳性率最高达48.3%,但与其他组比较差异无统计学意义。1岁以内婴幼儿ECHO抗体阳性率低,随着年龄增长,抗体阳性率增高,15~65岁组ECHO IgG抗体阳性率最高,为22.3%,与其他组比较差异无统计学意义。结论普通人群中可能存在EV71型和ECHO隐性感染者,成人EV71隐性感染率较低,儿童是EV71的主要感染者,15岁以下儿童为ECHO感染的高危人群,人群通过自然感染获得免疫保护。 展开更多
关键词 肠道病毒71型(EV71) 埃可病毒(ECHO) 隐性感染
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埃可病毒感染特征及医院感染防控要点 被引量:7
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作者 李春辉 吴安华 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期882-887,共6页
人肠道病毒(HEV)属小RNA病毒科中的肠道病毒属,是重要的人类致病原,作为普通的机会性感染病原体可感染各年龄人群,婴幼儿的发病率明显高于成人。HEV的传染性较强,可引起流行和暴发。HEV包括脊髓灰质炎病毒、A组柯萨奇病毒、B组柯萨奇病... 人肠道病毒(HEV)属小RNA病毒科中的肠道病毒属,是重要的人类致病原,作为普通的机会性感染病原体可感染各年龄人群,婴幼儿的发病率明显高于成人。HEV的传染性较强,可引起流行和暴发。HEV包括脊髓灰质炎病毒、A组柯萨奇病毒、B组柯萨奇病毒、埃可病毒(EchoV)及新型肠道病毒,可导致脑(膜)炎、支气管炎、心肌炎、手足口病、弛缓性麻痹、1型糖尿病等疾病,其中由EchoV导致的感染较重,特别是新生儿在医院获得的感染,往往导致暴发流行。近年来,我国由EchoV引起的感染暴发疫情时有发生,传染性强。2019年广东某医院发生的新生儿EchoV感染,导致了5例致死性病例,后果严重,影响力极大。此文对EchoV感染特征及医院感染防控要点进行综述,以期为感染诊治及医院感染防控工作提供帮助。 展开更多
关键词 人肠道病毒 埃可病毒 EchoV 暴发 医院感染
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Genetic characterizations and molecular epidemiology of human echovirus 30 isolated from Ningxia,China 被引量:1
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作者 Fang Yuan Xinfeng Wei +10 位作者 Xueping Ma Jiangtao Ma Xuemin Ma Xiaoqiang Sun Min Cao Juan Zhou Wei Zhang Hui Chen Rui Wang Jichen Li Qiang Sun 《Biosafety and Health》 CAS CSCD 2023年第6期346-354,共9页
In October 2017,a small outbreak of echovirus 30(E30)associated with aseptic meningitis in nine cases occurred at a primary school in the Ningxia Hui Autonomous Region.That year,we observed a significant increase in E... In October 2017,a small outbreak of echovirus 30(E30)associated with aseptic meningitis in nine cases occurred at a primary school in the Ningxia Hui Autonomous Region.That year,we observed a significant increase in E30 levels in an acute flaccid paralysis(AFP)case surveillance system.To investigate their phylogenetic relationships,we determined the whole genomic sequences of 12 strains isolated from aseptic meningitis cases,AFP cases,and healthy children.We found that the E30 strains circulating in Ningxia belong to two lineages(H and J).The strains isolated in 2010,2012,and 2016 belonged to the H lineage.In 2017,a new lineage,J,emerged as the dominant lineage.Phylogenetic trees were constructed based on the whole genome andP1,P2,andP3 regions;clustering with other types of enterovirus species B was found,suggesting that recombination events had occurred.The recombination sites were mainly in regions2B,2C,and3D.This study confirmed that the E30 strains in Ningxia in 2010,2012,and 2016 had different recombination patterns and were recombined with different enteroviruses.The 2017 epidemic E30 originated from another new lineage with a complex recombination pattern and formed an independent transmission chain in Ningxia. 展开更多
关键词 echovirus 30(E30) Complete genome sequence Molecular epidemiology
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2010-2021年杭州市儿童埃可病毒感染及流行特征分析 被引量:1
7
作者 邱晓枫 李钧 +3 位作者 张国忠 于新芬 潘劲草 赵刚 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期401-409,共9页
研究杭州市儿童感染埃可病毒(Echovirus,E)状况和流行病学特征。收集2010-2021年杭州市发热患儿咽拭子、肛拭子等临床样本。首先通过实时荧光RT-PCR试剂盒进行肠道病毒(Enterovirus,EV)通用筛查。选取Ct值≤30且EV-A71、CVA16、CVA6、CV... 研究杭州市儿童感染埃可病毒(Echovirus,E)状况和流行病学特征。收集2010-2021年杭州市发热患儿咽拭子、肛拭子等临床样本。首先通过实时荧光RT-PCR试剂盒进行肠道病毒(Enterovirus,EV)通用筛查。选取Ct值≤30且EV-A71、CVA16、CVA6、CVA10均为阴性的EV阳性核酸样本,用普通PCR方法扩增EV VP1序列。获得VP1序列通过GenBank进行BLAST比对,确定埃可病毒血清型,并对埃可病毒优势血清型构建遗传进化树。通过回顾性调查埃可病毒阳性患儿的临床资料进行流行病学特征分析。采用卡方检验对埃可病毒阳性患儿的采样时间、年龄、性别等进行分组比较。本研究共收集临床样本7 835份,获得EV通用阳性样本数共计2 023份。选取827份Ct值≤30且EV-A71、CVA16、CVA6、CVA10均为阴性的EV通用核酸阳性样本;共检出埃可病毒68份,8个血清型,阳性率为8.22%;分别为21份E30、12份E9、13份E6、7份E11、11份E18、2份E25、1份E7、1份E3。春、夏、秋、冬四季的埃可病毒阳性率分别为4.37%、21.03%、1.75%、1.22%。0~4岁、4~7岁、7~14岁患儿的埃可病毒阳性数分别为29、23、16,在EV阳性病例中的阳性率分别为5.24%、10.09%、34.78%。男、女童埃可病毒阳性率分别为9.48%、6.13%。埃可病毒阳性患儿临床诊断主要以急性上呼吸道感染为主,有29例占42.65%;其次是病毒性脑炎25例占36.76%;再是手足口病11例占16.18%。构建E30遗传进化树,发现杭州21株E30病毒株有多个不同进化分支,可能存在不同的流行传播链。E30杭州株之间核苷酸和氨基酸序列相似性分别为88.0%~100.0%、97.3%~100.0%。2010-2021年期间,夏季是杭州市儿童埃可病毒感染的高发季;建议医疗机构在夏季加强埃可病毒监测,有效预防和控制夏季埃可病毒引起的疫情暴发流行。 展开更多
关键词 埃可病毒 发热儿童 病毒性脑炎 手足口病 VP1基因 流行病学
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Epidemiology and control measures of an outbreak of neonatal echovirus 11 infections in Guangdong, China: A retrospective analysis 被引量:1
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作者 Chunxiao Fang Xiaoming Zhang +2 位作者 Xuemin Huang Fengqin Xu Danyang Zhao 《Biosafety and Health》 CAS CSCD 2023年第4期227-232,共6页
The objective of this study was to investigate the outbreak of echovirus 11 (ECHO 11) infection in newborns at a hospital in Guangdong Province, China, and to study the effectiveness of prevention and control measures... The objective of this study was to investigate the outbreak of echovirus 11 (ECHO 11) infection in newborns at a hospital in Guangdong Province, China, and to study the effectiveness of prevention and control measures to infer the epidemiological characteristics of ECHO 11 and explore the effective measures for its prevention and control. We performed retrospective analyses of hospital records and laboratory test data. In this outbreak, ten cases of ECHO 11 infection were identified, of which nine cases were nosocomial infections. Most of the cases (90%) were severe, and three died. The onset time interval of 10 patients was 1-4 days, most of which occur in 1-2 days. There were eight (80%) males and two females (20%). The gestational age of the patients was 31 to 40 weeks (mean, 35+4 weeks;median, 35+4 weeks). The onset time was 3-26 days (average 9 days;median 8 days). The birth weights of the patients ranged from 1,650 g to 3,450 g (mean 2,385 g;median 2,250 g). We concluded that neonatal infection with ECHO 11 will lead to serious symptoms and high mortality, and is prone to outbreaks of nosocomial infection. We speculate that ECHO 11 is most likely to spread via contact transmission;however, we do not rule out the possibility of droplet transmission. Prevention and control measures can effectively prevent and control hospital enteroviral infections. 展开更多
关键词 echovirus 11 Nosocomial infection OUTBREAK EPIDEMIOLOGY Control measures
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Echovirus serotypes circulating in Malaysia from 2002 to 2013 被引量:2
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作者 Jeyanthi Suppiah TS Saraswathy Subramaniam +2 位作者 Amry Khursany Ismail Apandi Yusof Zainah Sa'at 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2016年第3期246-249,共4页
Objective:To identify the circulating serotypes of human echovinis in Malaysia from 2002 in 2013.Methods:A toial of 31 retrospective samples from non-polio acute flacid paralysis,hand-food-and-mouth disease,viral meni... Objective:To identify the circulating serotypes of human echovinis in Malaysia from 2002 in 2013.Methods:A toial of 31 retrospective samples from non-polio acute flacid paralysis,hand-food-and-mouth disease,viral meningitis and enterovirus cases were subjected to amplification of partial VPI gene by RT-PCR.Results:Sequencing and phylogeneiic analysis of the partial sequences identified presence of human echovinis and human coxsackie viruses.It was found that echovinis 11 was the commonly circulating serotype followed by echovinis6.echovinis 7.echovinis 3.echovinis 9.echovinis 30 and echovinis I in decreasing order.Additionally two types of human coxsackie virus isolates were detected which were coxsackie A24 and B3.Condusions:From the findings,there is a possibility that echovinis 11 is the predominant serotype among Malaysian patients with echovinis infection.However,a larger sample size will yield a more confident result to support this evidence.____________________ 展开更多
关键词 echovirus VPI MALAYSIA PHYLOGENETIC SEROTYPE
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浙江衢州地区儿童病毒性脑炎埃可病毒优势血清型与VP1基因分析 被引量:4
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作者 邱晓枫 曹国平 +5 位作者 潘劲草 张国忠 李钧 占炳东 陈树昶 吕华坤 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2020年第2期169-174,共6页
目的了解浙江省衢州地区儿童病毒性脑炎埃可病毒(Echovirus,ECHOV)优势血清型与变迁并分析ECHOV VP1基因分子特征。方法采集53例病毒性脑炎患儿脑脊液标本进行病毒分离培养。采用荧光RT-PCR和PCR分别检测脑脊液标本中人肠道病毒(human e... 目的了解浙江省衢州地区儿童病毒性脑炎埃可病毒(Echovirus,ECHOV)优势血清型与变迁并分析ECHOV VP1基因分子特征。方法采集53例病毒性脑炎患儿脑脊液标本进行病毒分离培养。采用荧光RT-PCR和PCR分别检测脑脊液标本中人肠道病毒(human enterovirus,HEV)包括ECHOV、柯萨奇病毒(coxsackie virus,CV)和新型肠道病毒(enterovirus,EV),以及流行性乙型脑炎病毒(japanese encephalitis virus,JEV)、腮腺炎病毒(mumps virus,MuV)、西尼罗病毒(west nile virus,WNV)、基孔肯雅病毒(chikungunya virus,CHIKV)、单纯疱疹病毒(herpes simplex virus,HSV)和巨细胞病毒(cytomegalovirus,CMV)。HEV阳性脑脊液标本采用RT-PCR法扩增HEV-B组全长VP1基因序列,测序后用多种生物信息学软件分析ECHOV VP1基因型、基因重组和遗传进化特征。结果RD细胞分离培养出6株毒株,但Hep-2细胞分离培养结果均阴性。11份标本HEV通用荧光RT-PCR结果阳性,但其他病毒检测结果均阴性。11份HEV阳性标本中6份检出ECHOV,与分离培养结果一致,分别为4株ECHO6、1株为ECHO7和1株ECHO30血清型,柯萨奇病毒和EV检测结果均阴性。4株ECHO6病毒属于ECHO6-C2基因亚型,但分为ECHO6-41/46和ECHO6-45/48两个流行克隆,ECHO7和ECHO30分别属于ECHO7-C和ECHO30-C基因型。ECHO6与ECHO30病毒在进化过程中存在VP1基因重组。结论ECHOV是该地区儿童病毒性脑炎主要病原体,且可能存在局部暴发流行。ECHO6与ECHO30病毒VP1基因存在重组可能性,ECHO6有成为ECHOV优势血清型的可能。 展开更多
关键词 病毒性脑炎 埃可病毒 VP1基因 血清型/基因型 基因重组
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2006—2020年四川省急性弛缓性麻痹病例埃可病毒的基因特征分析 被引量:1
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作者 陈娜 马小珍 +2 位作者 文海燕 王成 郝玉通 《中国国境卫生检疫杂志》 CAS 2021年第6期419-422,共4页
目的了解四川省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例感染的不同型别埃可病毒的时间及地区分布,以及优势型别的基因特征。方法使用细胞培养法对2006—2020年四川省5089份AFP病例粪便标本进行病毒分离,并对分离的埃可病毒毒... 目的了解四川省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例感染的不同型别埃可病毒的时间及地区分布,以及优势型别的基因特征。方法使用细胞培养法对2006—2020年四川省5089份AFP病例粪便标本进行病毒分离,并对分离的埃可病毒毒株进行VP1基因核苷酸序列测定及分析。结果分离到75株埃可病毒,经测序鉴定出18个型别,包括E1、E3、E6、E7、E11、E12、E13、E14、E16、E17、E18、E19、E20、E21、E24、E25、E30、E33,其中数量最多的是E11,占分离株数量的22.7%,其次是E6(20.0%)、E14(14.7%)、E3(9.3%)、E13(6.7%)等。四川省E11的优势流行株在2006—2010年为A1-2基因亚型,2015—2019年为D5基因亚型。结论2006—2020年四川省共分离鉴定出18个型别的埃可病毒,E11的优势流行株从A基因型转变为D基因型。 展开更多
关键词 埃可病毒 急性弛缓性麻痹 埃可病毒11型 基因特征
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埃可病毒7型分离株全基因序列分析 被引量:3
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作者 邱晓枫 吕华坤 +3 位作者 刘小东 潘劲草 汪皓秋 陈树昶 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1050-1058,共9页
埃可病毒7型(Echovirus 7,ECHO7)属于小RNA病毒科人肠道病毒属,常引起儿童病毒性脑炎、手足口病和急性迟缓性麻痹等疾病。为了解病毒性脑炎患者脑脊液中分离获得的一株ECHO7毒株(40/Longyou/ZJ)的全基因组特征,进行全基因组测序并分析... 埃可病毒7型(Echovirus 7,ECHO7)属于小RNA病毒科人肠道病毒属,常引起儿童病毒性脑炎、手足口病和急性迟缓性麻痹等疾病。为了解病毒性脑炎患者脑脊液中分离获得的一株ECHO7毒株(40/Longyou/ZJ)的全基因组特征,进行全基因组测序并分析其分子变异和遗传进化特点。设计引物,提取病毒RNA,PCR扩增和序列测定获得全基因序列。利用Mega4.1、DNAstar、RDP4和SimPlot3.5.1软件分析全基因序列。40/Longyou/ZJ病毒株基因组全长7426个核苷酸(nt),5′端和3′端分别为741nt和100nt的非编码区(Untranslated region,UTR),5′UTR和3′UTR间为一个6585nt长的开放阅读框,编码含2194个氨基酸的多聚蛋白。与GenBank中12株ECHO7代表株的全序列比较发现,核苷酸相似性为79.3%~85.7%,氨基酸相似性为95.5%~97.8%。基于5′UTR、P1和P2区构建的遗传进化树中,40/Longyou/ZJ株与ECHO7参考株均在同一进化分支;但在P3区的遗传进化树中却与其他肠道病毒B组病毒聚类。RDP4和SimPlot3.5.1软件分析均证实40/Longyou/ZJ分离株与柯萨奇病毒B组4型(Coxsackievirus B4,CVB4)存在基因自然重组现象,重组位点主要在编码逆转录酶蛋白的3D区。本研究首次对我国脑脊液中分离的ECHO7进行全基因序列测定和分析,发现40/Longyou/ZJ分离株与CVB4存在基因重组,对研究ECHO7的遗传特性具有重要意义。 展开更多
关键词 埃可病毒 全基因组 序列分析 重组
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盐城市1起病毒性脑炎疫情的肠道病毒Echovirus18VP1基因分子特征
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作者 李春香 陈国清 +3 位作者 王瑶 李峰 徐士林 李长城 《江苏预防医学》 CAS 2021年第1期13-16,共4页
目的对盐城市1起病毒性脑炎聚集性疫情分离的Echovirus18(E-18)型肠道病毒进行VP1基因分子进化特征分析。方法通过实时荧光RT-PCR方法,对2019年盐城市病毒性脑炎聚集性疫情标本进行肠道病毒的检测,对非EV71或CVA16其他肠道病毒进行分子... 目的对盐城市1起病毒性脑炎聚集性疫情分离的Echovirus18(E-18)型肠道病毒进行VP1基因分子进化特征分析。方法通过实时荧光RT-PCR方法,对2019年盐城市病毒性脑炎聚集性疫情标本进行肠道病毒的检测,对非EV71或CVA16其他肠道病毒进行分子分型,采用RT-PCR扩增E-18型肠道病毒VP1基因并测序,采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸和分子进化3个层面进行分子特征分析。结果该起病毒性脑炎聚集性疫情是由E-18型肠道病毒感染引起,其6例病例;肛拭子肠道病毒核酸通用阳性4例,阳性率66.67%;均为轻症,全部治愈。4株E-18型肠道病毒株VP1基因片段均未见核苷酸的插入或者缺失,长度均为861bp、编码287个氨基酸,其核苷酸、氨基酸同源性分别为99.9%~100.0%和100.0%;与2019年E-18型手足口病盐城株(151/HFMD/JSYC/2019)VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为99.5%~99.7%和100.0%;与原型株Metcalf VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为79.0%~79.1%和93.4%。遗传进化树显示,2019年盐城市4株病毒性脑炎代表株与1株手足口病代表株聚集成簇,构成1个独立进化分支,属于C2基因亚群分支毒株。与原型株Metcalf相比,盐城市4株病毒性脑炎代表株涉及19个氨基酸位点的变异,变异率为6.62%,与1株手足口病代表株在VP1基因B-C loop区域发生了R84N氨基酸位点的变异。结论该起病毒性脑炎聚集疫情由E-18型肠道病毒引起,该病毒属于C2基因亚群优势进化分支,与本地手足口病代表株可能有共同的来源。 展开更多
关键词 病毒性脑炎 echovirus 18型肠道病毒 基因型 VP1基因 序列分析
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2009年云南省 Echo30分离株 KM/A363/09全基因组序列分析 被引量:1
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作者 白巍 陈俊英 +4 位作者 潘玥 朱艳菊 邵聪文 刘建生 马绍辉 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期388-392,共5页
目的:对2009年从中国云南省1名脑炎患儿粪便标本中分离到的Echo30云南分离株KM/A363/09进行全基因组测序和分析,了解该株病毒的遗传特性。方法设计针对Echo30引物,提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得全基因组序列,利用Gen... 目的:对2009年从中国云南省1名脑炎患儿粪便标本中分离到的Echo30云南分离株KM/A363/09进行全基因组测序和分析,了解该株病毒的遗传特性。方法设计针对Echo30引物,提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得全基因组序列,利用Geneious和Mega5.1软件进行核苷酸、氨基酸序列比对及其系统进化分析,应用RDP3和SimPlot3.5.1重组软件对序列进行重组分析。结果该分离株全基因组核苷酸序列长度为7425 bp,编码2194个氨基酸。其核苷酸和氨基酸序列与其原型株Bastianni的同源性分别为81.2%和95.8%;与其他Echo30型毒株的各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为81.2%~88.6%和95.8%~97.8%;进化分析发现KM/A363/09毒株属于中国Echo30分支中的一支。而且发现KM/A363/09株基因序列在非结构区可能存在重组事件。结论云南分离株KM/A363/09属于中国Echo30分支中的一支,而中国分离株已经发生一定的进化。 展开更多
关键词 ECHO30 全基因序列 序列分析 echovirus 30
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间接ELISA检测无菌性脑膜炎患儿的埃可病毒特异性IgM抗体 被引量:1
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作者 刘民 李晓眠 《天津医科大学学报》 2001年第4期492-493,496,共3页
目的 :研究检测患儿脑脊液和血清标本的特异性IgM在诊断埃可病毒感染的无菌性脑膜炎的实用价值。方法:采用埃可病毒混合抗原包被酶标板 ,用间接ELISA方法检测脑脊液和血清标本的特异性IgM抗体。结果 :在临床诊断为无菌性脑膜炎患儿的78... 目的 :研究检测患儿脑脊液和血清标本的特异性IgM在诊断埃可病毒感染的无菌性脑膜炎的实用价值。方法:采用埃可病毒混合抗原包被酶标板 ,用间接ELISA方法检测脑脊液和血清标本的特异性IgM抗体。结果 :在临床诊断为无菌性脑膜炎患儿的78份脑脊液和203份血清标本中分别有14份 (17.9 % )和48份 (23.6 % )阳性 ,而36份细菌性脑膜炎和30份脑外伤患者脑脊液仅1份阳性 ;细菌性脑膜炎、正常成人血清均为阴性。结论:本方法快速、简便、可靠 ,适合于临床早期诊断。 展开更多
关键词 酶联免疫吸附试验 埃可病毒 无菌性脑膜炎 IGM抗体 儿童
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河南省肠道病毒Echo6型脑炎病毒分离株全基因组序列分析 被引量:1
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作者 李幸乐 黄学勇 +1 位作者 陈豪敏 许汴利 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期876-877,共2页
2008年7—9月河南省多个地区出现以儿童为主的中枢神经系统感染性疾病暴发,证实为肠道病毒Echo6型感染。本研究筛选2株脑脊液分离株进行全基因组序列测定。
关键词 埃可病毒 全基因 序列分析
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人埃可病毒20型KM/EV20/2010分离株的全基因组序列分析
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作者 潘玥 邵聪文 +5 位作者 王晓辉 朱艳菊 陈俊英 陈伟 马绍辉 刘建生 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期501-505,共5页
目的对人埃可病毒20型(EcH020)KM/EV20/2010分离株全基因组进行序列测定,并分析其分子变异和进化特点。方法设计针对KM/EV20/2010引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增和序列测定获得全基因序列。利用Mega4.1、RDP3和SimPlot3.5.1... 目的对人埃可病毒20型(EcH020)KM/EV20/2010分离株全基因组进行序列测定,并分析其分子变异和进化特点。方法设计针对KM/EV20/2010引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增和序列测定获得全基因序列。利用Mega4.1、RDP3和SimPlot3.5.1软件分析全基因序列。结果KM/EV20/2010病毒株基因组全长7395bp个核苷酸(nt),5’端和3’端分别为744nt和96nt的非编码区,5’和3’非编码区间为一个6549rlt长的开放阅读框,编码一个含2183个氨基酸的多聚蛋白,编码区内未见核苷酸的插入或缺失。与GenBank中现有唯-1株ECH020JVl-1原型株全基因组序列相比对,核苷酸同源性为80.1%,氨基酸同源性为96.7%;构建基于全长VP1基因序列的进化树图并进行基因分型分析,ECH020可分为6个基因型,中国分离株分属Ⅲ和Ⅳ基因型,其中KM/EV20/2010属于基因型Ⅳ,且6个基因型之间核苷酸的差异为9.4%-21.7%。基于全基因组序列的种系进化分析提示KM/EV20/2010分离株与ECH020原型株JV-1遗传距离很远,未与原型株JV-1聚簇分布,而与ECH030病毒株遗传距离较近。分析发现KM/EV20/2010序列在非结构区可能存在重组。结论中国ECH020可分为6个基因型,KM/EV20/2010分离株属于Ⅳ基因型。 展开更多
关键词 埃可病毒 全基因组 序列分析
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Seroepidemiology of echovirus 30 in Korean children
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作者 Joo Young Lee Yumi Seo +2 位作者 Ui Yoon Choi Jong-Hyun Kim Jin Han Kang 《World Journal of Pediatrics》 SCIE CAS CSCD 2017年第6期611-614,共4页
Background:Although aseptic meningitis associated with echovirus type 30 has emerged as a global public health concern,no data have been reported on children's immune status against echovirus type 30.The current s... Background:Although aseptic meningitis associated with echovirus type 30 has emerged as a global public health concern,no data have been reported on children's immune status against echovirus type 30.The current study aimed to investigate the seropositivity among Korean children for antibodies against echovirus 30.Methods:Two hundred and fifty residual serum samples were collected at St.Paul's Hospital.Individuals were categorized by age into four groups:group 1 (3 months-2 years),group 2 (3-6 years),group 3 (7-10 years) and group 4 (11-15 years).Neutralizing antibodies against echovirus 30 were measured.Results:Seroprotective neutralizing antibodies against echovirus 30 were detected in 129 (49%) individuals.Seropositivity rates were 23%,48%,55% and 73% in groups 1-4,respectively.For antibody titers,1:256-1:512 was the highest neutralizing antibody titer range in group 2,while 1:1024-1:2048 in group 3 and 4.Among the seropositive individuals in group 3 and 4,6% and 12% had neutralizing antibody titers of 1:2048,respectively.Conclusions:The seropositivity rate increased significantly with age..The distribution of neutralizing antibody titers varied by age group,and higher ranges of neutralizing antibody titers were observed in higher age groups.These findings suggest high susceptibility to echovirus 30 infection in children younger than 2 years old.Echovirus 30 infection in childhood may have contributed to increased neutralizing antibody titers with age. 展开更多
关键词 echovirus 30 Korea SEROEPIDEMIOLOGY
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兰州市柯萨奇病毒、埃可病毒和EB病毒抗体检测分析
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作者 周兰霞 唐艳 赵丽 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2013年第2期440-442,共3页
目的:探讨兰州市患者柯萨奇病毒、埃可病毒和EB病毒感染的病原学分布现状,为防治工作提供资料。方法:应用ELISA法检测患者急性期血清中3种病毒(ECHO、COX、EBV)特异性IgM抗体,以了解病原学分布。结果:本研究共检测埃可病毒(ECHO)6412例... 目的:探讨兰州市患者柯萨奇病毒、埃可病毒和EB病毒感染的病原学分布现状,为防治工作提供资料。方法:应用ELISA法检测患者急性期血清中3种病毒(ECHO、COX、EBV)特异性IgM抗体,以了解病原学分布。结果:本研究共检测埃可病毒(ECHO)6412例,阳性143例(2.23%),柯萨奇病毒(COX)6435例,阳性218例(3.39%),EB病毒(EBV)6567例,阳性311例(4.74%)。其中COX和EBV感染女性明显高于男性(P<0.01)。在不同年龄组中,1岁~7岁两组ECHO感染明显高于其它年龄组(P<0.05)。大于1岁的四个年龄组COX、EBV感染显著高于另外两个年龄组(P<0.01)。在不同季节中,ECHO感染在夏季最高(P<0.01)。COX和EBV感染无明显季节性差异(P>0.05)。结论:三种病毒4岁~7岁组患者感染最高。ECHO病毒夏季感染明显高于其他季节。COX、EB病毒在女性患者中感染较高。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒 埃可病毒 EB病毒 免疫球蛋白M
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一起传染病暴发中肠道病毒血清型鉴定和ECHO30基因特征分析 被引量:30
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作者 王海岩 许文波 +6 位作者 徐爱强 朱贞 杨会利 李岩 纪峰 崔爱利 张勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期106-112,共7页
2003年5~9月,山东省泰安市发生了由肠道病毒(Enterovirus,EV)感染所致的传染病暴发,临床症状以手足口病(HFMD)为主,同时有心肌炎和无菌性脑膜炎等中枢神经系统症状患者也占较大比例。131份病人(粪便、咽拭子、脑脊液)标本中共分离到EV6... 2003年5~9月,山东省泰安市发生了由肠道病毒(Enterovirus,EV)感染所致的传染病暴发,临床症状以手足口病(HFMD)为主,同时有心肌炎和无菌性脑膜炎等中枢神经系统症状患者也占较大比例。131份病人(粪便、咽拭子、脑脊液)标本中共分离到EV62株,其中ECHO1939株,EV716株,ECHO304株,其它肠道病毒13株。4株ECHO30病毒中的2株分离自2个患者的粪便标本,但用WHO肠道组合血清中和试验未能定出型别。另外2株分离自同一患者的粪便和脑脊液标本。病原学分析表明,ECHO30是引起该患者无菌性脑膜炎的病原。抗E-CHO30标准株的血清中和这4株病毒的滴度低于标准株5~20倍。VP1区全基因序列测定和同源性比较分析表明,4株ECHO30分离株病毒核苷酸同源性在98.0%~98.5%,氨基酸同源性在98.9%~99.3%,提示这4株病毒来源于同一传播链,2003年5-9月ECHO30在该地区可能有局部流行。系统进化树分析表明,ECHO30病毒可以划分为6个基因型,其中基因型1~5为GenBank中已发表的ECHO30分离株,山东分离株与其它5个基因型成员核苷酸差异分别在9.4%~24.4%,在进化树上形成了较独立的分支,是一个新基因型,将其划分为第6基因型。 展开更多
关键词 患者 肠道病毒 暴发 无菌性脑膜炎 传染病 脑脊液 基因型 分离株 血清型鉴定 粪便
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