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大肠杆菌编码序列碱基片段的统计分析
被引量：
4
1
作者
李宏
罗辽复
《内蒙古大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
2000年第2期153-160,共8页
对大肠杆菌基因 1 2 3 1个编码开始区域和 1 3 0 7个编码终止区域内的 6碱基片段、4碱基片段和 3碱基片段进行了统计 ,发现 6碱基片段模式数的对数与其相对频率成线性下降关系 ,绝大多数 4碱基和 3碱基片段出现在相对频率小于 2的范围之...
对大肠杆菌基因 1 2 3 1个编码开始区域和 1 3 0 7个编码终止区域内的 6碱基片段、4碱基片段和 3碱基片段进行了统计 ,发现 6碱基片段模式数的对数与其相对频率成线性下降关系 ,绝大多数 4碱基和 3碱基片段出现在相对频率小于 2的范围之内 ;编码区出现最多的碱基片段是多聚A ;编码开始区域和编码终止区域的碱基构成模式有明显区别 ;编码开始区域里GGA类的稀有片段恰恰是SD区域最偏好的碱基片段 ;密码子之间 ,以TAG或CTA构造的关联模式为编码区禁用模式 .另外 ,还发现编码开始区域或编码终止区域碱基片段的相对频率与基因表达水平有明显关系 ,多数高频出现的碱基片段其相对频率随基因表达水平的提高而增加 .
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关键词
碱基片段
大肠杆菌
基因编码区
统计分析
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职称材料
大肠杆菌基因编码区碱基分布非均匀性的研究
被引量：
6
2
作者
李宏
罗辽复
《内蒙古大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
1999年第5期579-583,共5页
基于大肠杆菌 １２９２ 个基因编码区．１）统计出了氨基酸丰度分布，与一般生物氨基酸丰度比较发现，构成大肠杆菌蛋白质的氨基酸中疏水氨基酸相对较多，小氨基酸相对较少，二硫键相对较少；２）发现编码区碱基分布的非均匀性与氨基酸...
基于大肠杆菌 １２９２ 个基因编码区．１）统计出了氨基酸丰度分布，与一般生物氨基酸丰度比较发现，构成大肠杆菌蛋白质的氨基酸中疏水氨基酸相对较多，小氨基酸相对较少，二硫键相对较少；２）发现编码区碱基分布的非均匀性与氨基酸丰度的分布和同义密码子的非均匀使用紧密相关；３）分析了编码开始区域、编码终止区域碱基分布和氨基酸丰度分布的差别，得到了一些有意义的结论．
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关键词
大肠杆菌基因
编码区
碱基
非均匀分布
开始区
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职称材料
题名
大肠杆菌编码序列碱基片段的统计分析
被引量：
4
1
作者
李宏
罗辽复
机构
内蒙古大学理论物理和理论生物学研究室
出处
《内蒙古大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
2000年第2期153-160,共8页
基金
国家自然科学基金!(3966003 5)
文摘
对大肠杆菌基因 1 2 3 1个编码开始区域和 1 3 0 7个编码终止区域内的 6碱基片段、4碱基片段和 3碱基片段进行了统计 ,发现 6碱基片段模式数的对数与其相对频率成线性下降关系 ,绝大多数 4碱基和 3碱基片段出现在相对频率小于 2的范围之内 ;编码区出现最多的碱基片段是多聚A ;编码开始区域和编码终止区域的碱基构成模式有明显区别 ;编码开始区域里GGA类的稀有片段恰恰是SD区域最偏好的碱基片段 ;密码子之间 ,以TAG或CTA构造的关联模式为编码区禁用模式 .另外 ,还发现编码开始区域或编码终止区域碱基片段的相对频率与基因表达水平有明显关系 ,多数高频出现的碱基片段其相对频率随基因表达水平的提高而增加 .
关键词
碱基片段
大肠杆菌
基因编码区
统计分析
Keywords
bas
e
e
l
e
m
e
nt
r
e
lativ
e
fr
e
qu
e
ncy
e
.
coli
coding region
g
e
n
e
e
xpr
e
ssion
l
e
v
e
l
分类号
Q753 [生物学—分子生物学]
Q523
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职称材料
题名
大肠杆菌基因编码区碱基分布非均匀性的研究
被引量：
6
2
作者
李宏
罗辽复
机构
内蒙古大学理论物理和理论生物学研究室
出处
《内蒙古大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
1999年第5期579-583,共5页
基金
国家自然科学基金
文摘
基于大肠杆菌 １２９２ 个基因编码区．１）统计出了氨基酸丰度分布，与一般生物氨基酸丰度比较发现，构成大肠杆菌蛋白质的氨基酸中疏水氨基酸相对较多，小氨基酸相对较少，二硫键相对较少；２）发现编码区碱基分布的非均匀性与氨基酸丰度的分布和同义密码子的非均匀使用紧密相关；３）分析了编码开始区域、编码终止区域碱基分布和氨基酸丰度分布的差别，得到了一些有意义的结论．
关键词
大肠杆菌基因
编码区
碱基
非均匀分布
开始区
Keywords
e
.
coli
Amino
acid
abundanc
e
un
e
v
e
n
bas
e
distribution
of
coding region
cod
e
starting
region
cod
e
t
e
rminal
region
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大肠杆菌编码序列碱基片段的统计分析
李宏
罗辽复
《内蒙古大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
2000
4
下载PDF
职称材料
2
大肠杆菌基因编码区碱基分布非均匀性的研究
李宏
罗辽复
《内蒙古大学学报（自然科学版）》
CAS
CSCD
1999
6
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职称材料
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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