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1996~1998年中国流行的E亚型艾滋病病毒1型毒株的分子流行病学研究 被引量:24
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作者 邢辉 潘品良 +4 位作者 苏玲 范秀娟 冯毅 强来英 邵一鸣 《中国性病艾滋病防治》 2002年第4期200-203,共4页
目的通过对1996~1998年采集的艾滋病病毒1型(HIV-1)毒株样本的env基因的序列分析,阐明在中国流行的E亚型HIV-1毒株的特点、来源和传播方式。为中国E亚型HIV-1疫苗的研制和应用提供基础资料。方法 从HIV感染者淋巴细胞(PBMC)中提取前病... 目的通过对1996~1998年采集的艾滋病病毒1型(HIV-1)毒株样本的env基因的序列分析,阐明在中国流行的E亚型HIV-1毒株的特点、来源和传播方式。为中国E亚型HIV-1疫苗的研制和应用提供基础资料。方法 从HIV感染者淋巴细胞(PBMC)中提取前病毒DNA.使用嵌套式聚合酶链反应(PCR)方法扩增HIV-1的env基因的C2V5区。PCR产物不经克隆直接测序并使用GCG软件包进行序列分析。结果样品采自1996~1998年中国29个省(自治区,直辖市),总共发现37个E亚型HIV-1感染者。他们中大部分是通过性途径感染(23人,占62.2%);部分在静脉吸毒人群中发现(10人,占27.0%);少数是在职业献血员中发现(4人,占10.8%)。经C2-V3区序列分析发现,大部分中国E亚型HIV-1毒株与泰国株很相近,而与非洲株相差很大。而来自广西壮族自治区的毒株与越南吸毒人群中的流行株U48720相一致;系统树分析结果发现,中国的E亚型HIV-1株与泰国(CM240X、H93TH966)、越南(U48720)的代表株聚在一起。结论 中国E亚型HIV-1毒株目前仅在东南沿海地区流行,涉及静脉吸毒、输供血和性乱等各种人群,通过env区的序列分析发现其主要来源于泰国,部分来源于与中国接壤的越南。 展开更多
关键词 中国 e亚型 艾滋病 分子流行病学 艾滋病病毒 嵌套式聚合酶链式反应 序列分析 系统树分析 AIDS
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禽白血病的病理及分子生物学诊断
2
作者 肖静 万金隆 +2 位作者 杨江宇 杨梦娇 焦海宏 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期2671-2679,共9页
【目的】了解新疆某市鸡群E型禽白血病(E-avian leukosis)的感染情况及基因分子特征,为禽白血病的诊断和防控提供参考。【方法】本研究通过病理剖检、病理组织学观察、PCR检测、克隆载体连接等对疑似禽白血病病例进行实验室诊断,并通过D... 【目的】了解新疆某市鸡群E型禽白血病(E-avian leukosis)的感染情况及基因分子特征,为禽白血病的诊断和防控提供参考。【方法】本研究通过病理剖检、病理组织学观察、PCR检测、克隆载体连接等对疑似禽白血病病例进行实验室诊断,并通过DNAStar软件将分离株与参考毒株进行env基因核苷酸序列相似性比对、系统进化树构建和变异位点分析。【结果】发病鸡肝脏、心脏、脾脏、肾脏、肺脏等器官肿大,有大小不一的白色结节状病灶。病理组织学观察病灶为大小一致的成淋巴细胞,呈局灶性、弥漫性分布。禽白血病病毒(Avian leukaemia virus, ALV)基因组PCR扩增结果显示,获得大小为302 bp的目的条带,为ALV阳性;对阳性样品进行分型鉴定,阳性样品出现大小为1 074 bp的ALV-E特异性条带,分别命名为AKS2101和AKS2102。序列分析结果显示,分离株与E亚群毒株序列相似性为91.6%~98.6%。系统进化树显示,所得序列与ALV-E亚群参考株处于同一分支,与A、B、C、D、J、K亚群参考株处于不同进化分支,进一步说明该鸡群存在ALV-E感染。基因变异分析显示,分离株存在24处核苷酸变异和17处氨基酸位点变异,且可变位点位于序列高变区。【结论】新疆某市鸡群存在ALV-E感染,本试验为明确该地禽白血病流行情况提供基础数据。 展开更多
关键词 禽白血病病毒(ALV) e亚型 病理 分子生物学 基因序列 诊断
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人类免疫缺陷病毒-1CRF08_BC、CRF07_BC及CRF01_AE亚型耐药突变研究 被引量:5
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作者 姚之莹 杨翠先 +1 位作者 张米 杨壁珲 《中华传染病杂志》 CSCD 北大核心 2017年第10期626-629,共4页
截止2015年底,我国现报道了HIV感染者和艾滋病患者(HIV/AIDS)达57.7万例,其中死亡17.3万例。云南省是我国HIV-1流行最为严重的地区之一,且其流行的HIV-1亚型种类复杂多变。云南省的HIV-1毒株流行、演变经历了欧洲B和泰国B及印度... 截止2015年底,我国现报道了HIV感染者和艾滋病患者(HIV/AIDS)达57.7万例,其中死亡17.3万例。云南省是我国HIV-1流行最为严重的地区之一,且其流行的HIV-1亚型种类复杂多变。云南省的HIV-1毒株流行、演变经历了欧洲B和泰国B及印度C亚型的流行至逐渐被重组毒株CRF07-BC和CRF08-BC取代的过程,CRF07-BC和CRF08-BC毒株有共同的祖先,在中国的西南和西北地区广泛流行,患者之间的差异保持较低的水平。 展开更多
关键词 耐药突变 HIV-1毒株 HIV-1亚型 e亚型 CRF 艾滋病患者 人类 HIV感染者
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逆转录聚合酶链反应在艾滋病患者HIV-1毒株env基因的序列测定和亚型分析中的应用 被引量:3
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作者 王辉 李兵 +4 位作者 徐六妹 陆坚 李丽雄 胡毅文 周伯平 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期430-432,共3页
目的了解深圳地区艾滋病患者中Ⅰ型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)毒株各亚型的感染情况,及其不同亚型对患者疾病进程的影响。方法采用巢式逆转录聚合酶链反应(RTPCR)法对26例艾滋病患者血浆中的HIV-1毒株的env基因片段进行扩增,并对扩增片段... 目的了解深圳地区艾滋病患者中Ⅰ型人类免疫缺陷病毒(HIV-1)毒株各亚型的感染情况,及其不同亚型对患者疾病进程的影响。方法采用巢式逆转录聚合酶链反应(RTPCR)法对26例艾滋病患者血浆中的HIV-1毒株的env基因片段进行扩增,并对扩增片段进行序列测定和分析,同时检测其CD4+细胞计数与血浆病毒载量。结果基因系统树显示深圳地区26例艾滋病患者的HIV-1毒株env基因序列,B亚型12例,其中1例与欧美B亚型序列十分接近,11例与中国云南B亚型序列十分接近;循环重组亚型AE(CRF01AE)13例,均与泰国AE亚型序列十分接近。比较B、AE亚型感染患者的CD4细胞计数与病毒载量之间的差异无统计学意义。结论深圳地区艾滋病患者中以HIV-1毒株以B亚型和循环重组亚型AE最常见,尚未观察到B、AE亚型对艾滋病进展的影响。 展开更多
关键词 HIV-1毒株 艾滋病患者 序列测定 eNV基因 亚型分析 巢式逆转录聚合酶链反应 Ⅰ型人类免疫缺陷病毒 CD4^+细胞计数 CD4细胞计数 深圳地区 血浆病毒载量 毒株env B亚型 e亚型 感染情况 疾病进程 不同亚型 基因片段 患者血浆
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内源性禽白血病病毒的RT-PCR检测与基因序列分析 被引量:5
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作者 陈广 温贵兰 +9 位作者 张喜懿 程振涛 王开功 文明 周碧君 张升波 田浪 杨佰启 李昌红 徐丽 《贵州畜牧兽医》 2019年第2期24-27,共4页
为了解贵州省是否存在内源性禽白血病病毒(ALV)感染情况,试验选取无明显ALV症状的送检病料,采用RTPCR方法对ALV进行扩增。结果:扩增出1条744 bp左右的目的条带。对扩增产物进行测序和基因序列分析,同源性分析结果表明:序列与E亚型ALV中... 为了解贵州省是否存在内源性禽白血病病毒(ALV)感染情况,试验选取无明显ALV症状的送检病料,采用RTPCR方法对ALV进行扩增。结果:扩增出1条744 bp左右的目的条带。对扩增产物进行测序和基因序列分析,同源性分析结果表明:序列与E亚型ALV中的ev-1、ev-3株同源性最高(99.5%),与J亚型ALV中的HPRS-103株同源性较低(42%)。系统进化树中该序列与内源性ALV中的ev-1、ev-3株属同1个分支,亲缘关系最近,说明其属于内源性ALV。 展开更多
关键词 禽白血病病毒 e亚型 RT-PCR检测 基因序列
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HIV—1不同遗传亚型在美国检出
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作者 谭晓 《中国社会医学杂志》 1996年第2期93-94,共2页
HIV—1是以范围较宽的遗传多相性为特征的。至少有9种亚型(A~H和O),A、C、D亚型常见于非洲,E亚型主要分布在泰国。B亚型病毒主要流行在欧洲和美国,使绝大多数的资源用于这种亚型的疫苗开发,令人担心的是这些疫苗产品不能产生广泛的足... HIV—1是以范围较宽的遗传多相性为特征的。至少有9种亚型(A~H和O),A、C、D亚型常见于非洲,E亚型主要分布在泰国。B亚型病毒主要流行在欧洲和美国,使绝大多数的资源用于这种亚型的疫苗开发,令人担心的是这些疫苗产品不能产生广泛的足够的免疫性去防止其他亚型在世界范围的感染。国际性的HIV—1亚型的广泛传播和日常的国际旅游业最终会使其他亚型在美国传播开来。 展开更多
关键词 B亚型 e亚型 遗传多样性 D亚型 军队人员 国际旅游业 性传播疾病 疫苗开发 疫苗产品 免疫性
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INF2基因突变导致显性遗传中间型腓骨肌萎缩症E亚型一例 被引量:1
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作者 汪伟 董明睿 +2 位作者 曹娅丽 汪仁斌 焦劲松 《中华神经科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期65-66,共2页
临床资料 患者男性,20岁,因“双下肢力弱4~5年”于2013年5月22日收住我院神经内科.患者4~5年前开始无明显诱因出现双下肢力弱,走路易崴脚、摔跤,脚尖抬起费力,并发现双足部变形,蹲下时足跟不能着地,上述症状缓慢进展,目前平地行走也... 临床资料 患者男性,20岁,因“双下肢力弱4~5年”于2013年5月22日收住我院神经内科.患者4~5年前开始无明显诱因出现双下肢力弱,走路易崴脚、摔跤,脚尖抬起费力,并发现双足部变形,蹲下时足跟不能着地,上述症状缓慢进展,目前平地行走也易摔倒,无明显上肢及下肢近段力弱;伴有发作性言语不利,表现为言语不清、难以理解,持续数分钟缓解;曾有站立位出现发作性头晕,发作前无心慌、胸闷,发作时无视物旋转,伴有双手麻木、双下肢力弱不能站立,持续数分钟缓解.足月顺产,生长发育同同龄儿,否认家族中类似疾病者.入院体检:意识清楚,语言流利,双眼左右视可见不持续水平眼震,余脑神经体检未见明显异常,双侧深浅感觉对称存在,双下肢足背屈肌力Ⅱ级,高弓足,余肢体肌力V级,双手部小肌肉萎缩,双手可见细颤,四肢共济运动稳准,双侧腱反射偏低,病理征阴性. 展开更多
关键词 腓骨肌萎缩症 显性遗传 基因突变 e亚型 中间型 发作性头晕 入院体检 肢体肌力
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HBV基因型的流行病学和病毒学特征及与临床的关系(上)
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作者 闵佳 《传染病网络动态》 2005年第10期21-22,共2页
自1988年Okamoto发现HBV可分为不同基因型后,有许多学者相继进行了这方面的研究。2003年日本学者Sugauchi发现B基因型和C基因型之间还可能发生重组,依是否与C基因型重组分为HBVB基因型j亚型(HBV/Bj)和HBVB基因型a亚型(HBV/Ba);... 自1988年Okamoto发现HBV可分为不同基因型后,有许多学者相继进行了这方面的研究。2003年日本学者Sugauchi发现B基因型和C基因型之间还可能发生重组,依是否与C基因型重组分为HBVB基因型j亚型(HBV/Bj)和HBVB基因型a亚型(HBV/Ba);2004年Sugauchi又对HBVA基因型(HBV/A)进行分析,发现HBV/A可分为e亚型(HBV/Ae)和a亚型(HBv/Aa)。现就HBV基因型的流行病学和病毒学特征及与临床的关系综述如下。 展开更多
关键词 HBV基因型 病毒学特征 流行病学 临床 B基因型 C基因型 不同基因型 A亚型 e亚型
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罗曼粉蛋鸡感染E亚型禽白血病病毒的分子生物学检测分析
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作者 何建宇 孙芸 +8 位作者 徐飞 罗东还 张小波 吴诗卉 冉凤 龙小川 王廷龙 李涛 温贵兰 《贵州畜牧兽医》 2022年第5期53-56,共4页
为排查贵州省惠水县某养鸡场禽白血病病毒的感染情况,对鸡场送检的10只病死罗曼粉蛋鸡进行禽白血病病毒PCR检测和遗传进化分析。结果:10份病料样品中6份检测出禽白血病病毒;基因序列分析与E亚型禽白血病病毒E-ros001、E-B9、E-TYR株同... 为排查贵州省惠水县某养鸡场禽白血病病毒的感染情况,对鸡场送检的10只病死罗曼粉蛋鸡进行禽白血病病毒PCR检测和遗传进化分析。结果:10份病料样品中6份检测出禽白血病病毒;基因序列分析与E亚型禽白血病病毒E-ros001、E-B9、E-TYR株同源性高达99.1%,与J亚型GZN16株同源性最低为37.1%;系统进化树分析表明与E亚型毒株亲缘关系最近。结论:该养鸡场存在E亚型禽白血病病毒感染。 展开更多
关键词 罗曼粉蛋鸡 e亚型禽白血病病毒 PCR检测 基因序列
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前列腺素E_(2)受体亚型1(EP1)研究进展
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作者 陈书涛 季爽 +1 位作者 郭美娜 陈丽红 《生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期105-118,共14页
前列腺素E_(2)(prostaglandinE_(2),PGE_(2))是花生四烯酸代谢产生的重要脂质分子,在多种生理和病理活动中发挥重要作用。非甾体抗炎药(non-steroidal anti-inflammatory drugs,NSAIDs)主要通过抑制PGE_(2)的生成而被广泛用于各类炎症... 前列腺素E_(2)(prostaglandinE_(2),PGE_(2))是花生四烯酸代谢产生的重要脂质分子,在多种生理和病理活动中发挥重要作用。非甾体抗炎药(non-steroidal anti-inflammatory drugs,NSAIDs)主要通过抑制PGE_(2)的生成而被广泛用于各类炎症性疾病的治疗和发热、疼痛症状的缓解。PGE_(2)功能的发挥主要依赖于与4种不同的G蛋白耦联受体相结合,其中PGE_(2)受体亚型1(PGE_(2)receptor1,EP1)的分布相对比较局限,且PGE_(2)与EP1的亲和力相对较低。尽管如此,EP1在心血管、泌尿、消化等系统的生理功能维持和稳态调节方面却发挥重要作用。此外,EP1广泛参与炎症反应、痛觉维持和多系统的病理生理学功能调节。本文拟就近年来有关EP1在生理和病理生理学方面的功能和研究现状,以及与之相关药物的研究进展进行简要综述。 展开更多
关键词 前列腺素e_(2) 前列腺素e2受体亚型1 炎症
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前列腺按摩后尿液中融合基因TMPRSS2:ERG亚型T1E4 mRNA的定量检测在前列腺癌诊断中的应用 被引量:1
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作者 沈默 孔凡慧 +3 位作者 陶志华 戴美洁 陈伟 吴秀玲 《中国卫生检验杂志》 CAS 2010年第11期2896-2899,共4页
目的:建立实时荧光定量RT-PCR检测前列腺按摩后尿液中融合基因TMPRSS2:ERG亚型T1E4 mRNA的方法学并探讨T1E4 mRNA在前列腺癌临床诊断中的应用价值。方法:前列腺癌(PCa)患者46例,前列腺增生(BPH)患者44例,收集前列腺按摩后尿液,离心取细... 目的:建立实时荧光定量RT-PCR检测前列腺按摩后尿液中融合基因TMPRSS2:ERG亚型T1E4 mRNA的方法学并探讨T1E4 mRNA在前列腺癌临床诊断中的应用价值。方法:前列腺癌(PCa)患者46例,前列腺增生(BPH)患者44例,收集前列腺按摩后尿液,离心取细胞沉淀物,提取总RNA,实时荧光定量RT-PCR方法分别检测PSA mRNA和T1E4 mRNA,以T1E4 mRNA/PSA mRNA比值表示融合基因T1E4 mRNA的含量。比较PCa组与BPH组尿液T1E4 mR-NA的含量(T1E4 mRNA/PSA mRNA比值),用受试者工作曲线(ROC)评价尿液T1E4 mRNA含量对前列腺癌的诊断价值,并分析尿液T1E4 mRNA阳性率与前列腺癌骨转移及Gleason评分之间的关系。结果:PCa组尿液T1E4 mRNA含量(9.6×10-3,0~12.6)明显高于BPH组(0,0~8.5×10-3)(P<0.01)。尿液T1E4 mRNA含量诊断前列腺癌的曲线下面积(AUC)为0.810(95%CI:0.719~0.902),以1.0×10-5为截断值时,其诊断前列腺癌的敏感度和特异性分别为71.7%和81.8%。尿液T1E4 mRNA阳性率与前列腺癌骨转移及Gleason评分之间无关。结论:前列腺按摩后尿液中融合基因TMPRSS2:ERG亚型T1E4 mRNA含量检测对前列腺癌诊断有较高的敏感度和特异性,作为前列腺癌早期诊断指标具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 尿液 前列腺癌 融合基因 TMPRSS2:eRG T1e4亚型
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