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2种白刺对盐胁迫的代谢响应机制 被引量:6
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作者 闫海冰 张慧芳 +2 位作者 冯帆 于兆友 杨秀清 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第1期20-29,共10页
【目的】研究盐胁迫下2种白刺叶片代谢物及其代谢通路的变化,以揭示白刺对盐胁迫的代谢响应机制,为有效提高白刺对盐碱地的持续生物改良及适应性研究提供理论依据。【方法】对唐古特白刺和西伯利亚白刺实生苗进行300 mmol·L^(-1) N... 【目的】研究盐胁迫下2种白刺叶片代谢物及其代谢通路的变化,以揭示白刺对盐胁迫的代谢响应机制,为有效提高白刺对盐碱地的持续生物改良及适应性研究提供理论依据。【方法】对唐古特白刺和西伯利亚白刺实生苗进行300 mmol·L^(-1) NaCl胁迫处理,蒸馏水处理为对照,采用GC-TOF-MS代谢组学方法,分析盐胁迫对2种白刺叶片代谢物及其代谢通路的影响。【结果】1)与未胁迫处理相比,盐胁迫后唐古特白刺叶片存在差异代谢物11种,其中8种显著上调,包括1种脂肪酸、5种有机酸、1种醇和1种碱基衍生物;而西伯利亚白刺叶片中存在差异代谢物108种,其中106种显著上调,包括51种氨基酸、22种糖、11种脂肪酸、8种有机酸、7种醇、5种生物碱以及2种维生素。2)通过KEGG注释可将唐古特白刺的差异代谢物富集到6条代谢通路中,拓扑分析筛选到与代谢物差异相关性最高的关键路径为硫代谢、TCA循环及二羧酸循环;而西伯利亚白刺的差异代谢物可被富集到46条代谢通路中,其中,氨基酸代谢多达13条,筛选到的关键路径为缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成、C5支链二元酸代谢、泛酸和CoA生物合成。【结论】2种白刺对盐胁迫有不同的代谢响应机制。唐古特白刺通过以有机酸为主的11种代谢物参与盐胁迫响应,并通过加强以硫代谢为主的6条代谢通路来应答盐胁迫。西伯利亚白刺通过以氨基酸、糖、脂肪酸为主的108种代谢物参与盐胁迫响应,并通过加强以氨基酸代谢为主的46条代谢通路应答盐胁迫。西伯利亚白刺参与盐胁迫调控的代谢物较唐古特白刺种类更多,代谢途径更广,对盐胁迫的代谢响应更为显著。 展开更多
关键词 唐古特白刺 西伯利亚白刺 差异代谢物 代谢通路 代谢响应
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早熟砂梨‘苏翠1号’与其亲本‘翠冠’‘华酥’成熟果实差异代谢产物及差异基因比较分析 被引量:4
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作者 王宏 杨王莉 +4 位作者 蔺经 杨青松 李晓刚 盛宝龙 常有宏 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期493-508,共16页
‘苏翠1号’梨因其极早熟、汁多味甜、肉质细脆而深受广大消费者喜欢。为了解‘苏翠1号’成熟果实主要代谢产物及代谢通路相关基因表达情况,探究其果实优异性状形成的物质和分子基础,对‘苏翠1号’及其亲本‘翠冠’和‘华酥’成熟果实... ‘苏翠1号’梨因其极早熟、汁多味甜、肉质细脆而深受广大消费者喜欢。为了解‘苏翠1号’成熟果实主要代谢产物及代谢通路相关基因表达情况,探究其果实优异性状形成的物质和分子基础,对‘苏翠1号’及其亲本‘翠冠’和‘华酥’成熟果实样本进行代谢组和转录组测序分析。代谢组分析发现,3个品种间,前25个差异代谢产物主要包括有机酸、碳水化合物、氨基酸、甘油磷酸脂、脂肪酸和绿原酸。HPLC测定表明,蔗糖含量在‘苏翠1号’中最高,葡萄糖含量在‘翠冠’中最高,果糖含量在‘苏翠1号’和‘翠冠’中相似,略高于‘华酥’,山梨醇含量在‘苏翠1号’和‘华酥’中均显著低于‘翠冠’;苹果酸含量在‘苏翠1号’中最高,柠檬酸含量在‘华酥’中最高,‘苏翠1号’和‘华酥’总酸含量相近,均高于‘翠冠’。氨基酸含量分析表明,‘苏翠1号’的氨基酸总含量及天冬氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸含量显著高于‘翠冠’和‘华酥’。转录组GO和KEGG分析表明,相较于‘翠冠’和‘华酥’,‘苏翠1号’有机底物分解过程、脂质代谢、有机酸生物合成、羧酸生物合成、多糖代谢等生物学过程及代谢途径显著富集。进一步挖掘差异基因发现,糖代谢中的SPS、山梨醇代谢中的S6PDH、SDH,TCA循环中的FUM1、ICDH、PDH、OGDHL,氨基酸代谢途径中的GAT、GLSN、LASPO、SAMS,以及脂肪酸代谢中的DGK1、ACCA、KASC2、ADH、PLDA等基因在‘苏翠1号’中显著高表达。这些基因可能与‘苏翠1号’更活跃的蔗糖、山梨醇、氨基酸、甘油磷酯代谢及TCA循环有关。 展开更多
关键词 砂梨 果实品质 差异代谢产物 差异基因 qRT-PCR
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基于代谢组学分析黑莓、黑树莓果实代谢物的差异 被引量:4
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作者 吴雅琼 张春红 +3 位作者 杨海燕 闾连飞 李维林 吴文龙 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第3期790-797,共8页
为了探究黑莓、黑树莓成熟果实中主要代谢物的差异,利用液相色谱-质谱技术对其进行比较分析。结果表明,在正离子、负离子模式下分别存在1288个、971个具有显著表达差异的代谢物,通过KEGG数据平台分析发现,代谢通路是富集差异表达代谢物... 为了探究黑莓、黑树莓成熟果实中主要代谢物的差异,利用液相色谱-质谱技术对其进行比较分析。结果表明,在正离子、负离子模式下分别存在1288个、971个具有显著表达差异的代谢物,通过KEGG数据平台分析发现,代谢通路是富集差异表达代谢物数量最多的(共104个),其次是次生代谢物合成通路(有65个差异表达代谢物)。此外,黄酮和黄酮醇生物合成通路也是主要差异代谢物显著富集的代谢途径之一,包含11个差异代谢物。而在花色苷合成通路上,与黑莓果实相比,黑树莓果实中有6个代谢物表达量下调,而矢车菊素-3-O-葡萄糖苷代谢物表达量上调。在异黄酮合成通路中,与黑树莓果实相比,黑莓果实中的(S)-柚皮素相对表达量增加了2.7倍。研究结果为更好地了解黑树莓、黑莓果实代谢物的异同和高效利用悬钩子属果实中黄酮、花色苷等次生代谢物提供理论依据。 展开更多
关键词 黑莓 黑树莓 黄酮 差异代谢物 合成通路
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基于代谢组学的西伯利亚白刺耐盐机理研究 被引量:3
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作者 冯帆 杨秀清 闫海冰 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2019年第3期88-94,共7页
[目的]为研究基于代谢组学的西伯利亚白刺在盐胁迫条件下的耐盐机理。[方法]本文使用LECO-Fiehn Rtx5数据库对盐胁迫前后差异代谢物进行定性及聚类分析,采用富集分析和拓扑分析方法找到差异代谢物参与的代谢途径。[结果]共鉴定出108种... [目的]为研究基于代谢组学的西伯利亚白刺在盐胁迫条件下的耐盐机理。[方法]本文使用LECO-Fiehn Rtx5数据库对盐胁迫前后差异代谢物进行定性及聚类分析,采用富集分析和拓扑分析方法找到差异代谢物参与的代谢途径。[结果]共鉴定出108种差异代谢物,包括51种氨基酸类、22种糖类、11种脂肪酸类、8种有机酸类、7种醇类、6种生物碱、2种维生素及1种碱基衍生物,层次聚类分析将这些代谢物主要分成了两大类,共参与46条代谢途径。西伯利亚白刺对盐胁迫的应答主要依靠小分子渗透调节物质的积累以及糖代谢和TCA循环产生的能量以保障代谢活动的正常进行,进而增强其对盐胁迫环境的抵抗能力。[结论]结果将为深入揭示西伯利亚白刺的耐盐机制及适应性研究提供一定的理论依据。 展开更多
关键词 西伯利亚白刺 耐盐机理 差异代谢物 代谢途径
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基于液质联用技术和植物代谢组学的乌药醋制前后质量差异研究 被引量:1
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作者 易柳 王瑞颖 +2 位作者 高元峰 林丽美 欧阳荣 《中国药师》 CAS 2022年第6期1000-1007,共8页
目的:基于广泛靶标代谢组学技术分析,分析乌药醋制前后化学成分的差异。方法:运用超高效液相色谱-三重四极杆复合线性离子阱质谱(UPLC-Q-Trap/MS)技术对乌药醋制前后的化学成分信息进行采集,结合主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘-判别分... 目的:基于广泛靶标代谢组学技术分析,分析乌药醋制前后化学成分的差异。方法:运用超高效液相色谱-三重四极杆复合线性离子阱质谱(UPLC-Q-Trap/MS)技术对乌药醋制前后的化学成分信息进行采集,结合主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘-判别分析(OPLS-DA)等多元统计分析方法对所采集到的相关信息进行处理分析,发现并鉴定乌药与醋乌药的差异代谢物。结果:运用多元变量统计分析和单变量统计分析,筛选出了156个具有显著性的差异代谢物,并找到了与差异代谢物相关性最高的通路——黄酮和黄酮醇生物合成途径。结论:本文从化学成分以及代谢物合成通路的角度,揭示了乌药醋制前后化学成分的差异,可为醋乌药的质量控制和药效研究奠定物质基础。 展开更多
关键词 乌药 醋乌药 化学成分 超高效液相色谱-三重四极杆复合线性离子阱质谱 植物代谢组学 多元变量统计分析 质量差异标志物
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基于LC-MS/MS代谢组学比较HFpEF与HFrEF小鼠心肌代谢特征的异同
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作者 张占依 冯雪莹 +5 位作者 王子豪 黄雨芝 杨文博 张文娇 周娟 袁祖贻 《中华心血管病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期722-730,共9页
目的:采用代谢组学揭示射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)与射血分数降低的心力衰竭(HFrEF)小鼠心肌代谢特征的异同。方法:将实验小鼠分为对照组、HFpEF组、假手术组以及HFrEF组共4组,每组10只。采用高脂饮食与Nω-硝基-L-精氨酸甲基脂(L-N... 目的:采用代谢组学揭示射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)与射血分数降低的心力衰竭(HFrEF)小鼠心肌代谢特征的异同。方法:将实验小鼠分为对照组、HFpEF组、假手术组以及HFrEF组共4组,每组10只。采用高脂饮食与Nω-硝基-L-精氨酸甲基脂(L-NAME)干预构建“two-hit”HFpEF小鼠模型,主动脉弓缩窄术(TAC)构建HFrEF小鼠模型。采用非靶向代谢组学(UHPLC-QE-MS)检测HFpEF与HFrEF小鼠心肌组织中差异代谢物的表达情况。以变量投影重要度>1,P<0.05为标准对这两种小鼠中的差异代谢物进行筛选与分类。KEGG功能富集与通路影响分析展示在这两种小鼠中发生了显著变化的代谢通路。结果:HFpEF小鼠中共有109个差异代谢物,HFrEF小鼠中共有270个差异代谢物。与对照组相比,HFpEF小鼠心肌组织中甘油磷脂的改变最为显著,而HFrEF小鼠中则以羧酸及其衍生物的占比最多。KEGG富集与通路影响分析显示HFpEF小鼠中的差异代谢物主要富集在不饱和脂肪酸的生物合成、醚脂代谢、氨基糖与核苷糖代谢、甘油磷脂代谢、花生四烯酸代谢以及精氨酸与脯氨酸代谢等通路上,而HFrEF小鼠中的差异代谢物则主要富集在精氨酸与脯氨酸代谢、甘氨酸和丝苏氨酸代谢、泛酸盐和CoA的生物合成、甘油磷脂代谢、烟酸盐和烟酰胺代谢以及花生四烯酸代谢等通路上。结论:HFpEF小鼠与HFrEF小鼠相比具有显著不同的心肌代谢物表达谱。此外,不饱和脂肪酸的生物合成、花生四烯酸代谢、甘油磷脂代谢以及精氨酸和脯氨酸代谢在HFpEF与HFrEF小鼠中都出现了显著改变,提示这些代谢通路可能在这两类心力衰竭的疾病进展中都发挥着重要作用。 展开更多
关键词 心力衰竭 代谢组学 差异代谢物 功能富集分析
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