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枫斗类石斛cpDNA psbA-trnH的序列分析与鉴别 被引量：38
1
作者 邵世光 韩丽 +3 位作者 马艳红 沈洁 张伟超 丁小余 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期1173-1178,共6页
本研究对常见枫斗类石斛cpDNA的psbA-trnH区进行了测序,利用MEGA4.0对该区序列进行了比较分析。结果显示:15种常见的枫斗类石斛的psbA-trnH序列长度为721～767bp,变异位点42个,简约信息位点11个。以Kimura-2参数计算遗传距离,常见枫斗... 本研究对常见枫斗类石斛cpDNA的psbA-trnH区进行了测序,利用MEGA4.0对该区序列进行了比较分析。结果显示:15种常见的枫斗类石斛的psbA-trnH序列长度为721～767bp,变异位点42个,简约信息位点11个。以Kimura-2参数计算遗传距离,常见枫斗类石斛的种间遗传距离为0.0013～0.0183,平均遗传距离为0.0148。不同石斛种间均存在序列差异,全序列中共出现6处indels,导致种间片段长度差异较大;暂未发现所检测的枫斗类石斛居群间在psbA-trnH区的序列存在差异。利用枫斗类石斛psbA-trnH序列数据库及遗传分析软件,通过对待检种的psbA-trnH序列的测定,成功鉴别了待检种。cpDNA的psbA-trnH区可作为枫斗类石斛分子鉴别的候选标记。 展开更多
关键词 石斛属 枫斗类石斛 PSBA-TRNH 分子鉴别
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新型联合片段:nrDNA ITS+nad 1-intron 2在枫斗类石斛鉴定中的意义 被引量：10
2
作者 耿丽霞 郑瑞 +5 位作者 任洁 牛志韬 孙宇龙 薛庆云 刘薇 丁小余 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1060-1067,共8页
本文从线粒体基因片段入手,利用PCR技术扩增出17种枫斗类石斛39个个体的线粒体基因co I、nad 5部分序列及nad 1-intron 2序列,nr DNA ITS及叶绿体基因序列rbc L、mat K、psb A-trn H,同时筛选出合适的基因片段来研究多片段联合在枫斗类... 本文从线粒体基因片段入手,利用PCR技术扩增出17种枫斗类石斛39个个体的线粒体基因co I、nad 5部分序列及nad 1-intron 2序列,nr DNA ITS及叶绿体基因序列rbc L、mat K、psb A-trn H,同时筛选出合适的基因片段来研究多片段联合在枫斗类石斛植物鉴定方面的应用。结果表明:在7个基因片段中,nr DNA ITS、nad 1-intron 2和psb A-trn H的序列变异度较高,可用于枫斗类石斛的鉴定。但是,仅利用单一序列无法对细茎石斛及霍山石斛进行鉴别。而nr DNA ITS+nad 1-intron 2新型联合片段构建的UPGMA树与其他联合片段相比,更能有效的对枫斗类石斛基原植物进行鉴别并可区分细茎石斛及霍山石斛。此外,借助nr DNA ITS+nad 1-intron 2新型联合片段构建的UPGMA树对3个待检种进行了成功鉴别,分别为霍山石斛、细茎石斛和铁皮石斛。本研究首次将nr DNA ITS与线粒体基因片段联合用于枫斗类石斛的鉴定,为石斛药材的鉴别提供了可靠的科学依据,同时也将对规范枫斗类石斛市场提供理论指导。 展开更多
关键词 枫斗类石斛 线粒体基因序列 UPGMA树 联合片段
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铁皮枫斗HPLC特征图谱研究 被引量：1
3
作者 刘东辉 杨丽娥 +1 位作者 黄月纯 魏刚 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 2013年第4期390-394,共5页
目的建立铁皮枫斗HPLC特征图谱。方法采用ZorbaxSBC18色谱柱；流动相为乙腈．0．2％的甲酸溶液，梯度洗脱；检测波长为270nm；柱温为35℃；流速为1．0mL·min^-1。结果铁皮枫斗标示出36个特征共有峰，10批样品的相似度为0．898～0．... 目的建立铁皮枫斗HPLC特征图谱。方法采用ZorbaxSBC18色谱柱；流动相为乙腈．0．2％的甲酸溶液，梯度洗脱；检测波长为270nm；柱温为35℃；流速为1．0mL·min^-1。结果铁皮枫斗标示出36个特征共有峰，10批样品的相似度为0．898～0．969。结论本方法准确可靠，重复性好，为铁皮枫斗的质量控制提供了一定的方法依据。 展开更多
关键词 铁皮枫斗 特征图谱 高效液相色谱法
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枫斗类石斛rDNA ITS区的全序列数据库及其序列分析鉴别 被引量：84
4
作者 丁小余 王峥涛 +2 位作者 徐红 徐珞珊 周开亚 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第7期567-573,共7页
目的　建立枫斗类石斛的rDNAITS区碱基全序列数据库 ,利用该数据库对枫斗类石斛待检种进行准确鉴别。方法　对枫斗类石斛的rDNAITS区进行了PCR扩增、测序 ,运用CLUSTRAL ,MEGA等软件以及枫斗类石斛rDNAITS区全序列数据库对待检种rDNAIT... 目的　建立枫斗类石斛的rDNAITS区碱基全序列数据库 ,利用该数据库对枫斗类石斛待检种进行准确鉴别。方法　对枫斗类石斛的rDNAITS区进行了PCR扩增、测序 ,运用CLUSTRAL ,MEGA等软件以及枫斗类石斛rDNAITS区全序列数据库对待检种rDNAITS区进行序列分析鉴别。结果　建立了 2 1种枫斗类石斛的rDNAITS区全序列数据库 ,枫斗类石斛在该区的种间差异显著而稳定 ,转换和颠换总数为 11～ 12 2 ,变异位点数为 34 1,信息位点数为195。与外类群植物云南石仙桃间的差异较大 ,转换和颠换总数为 131～ 16 1。枫斗类石斛居群间的差异较小 ,转换和颠换总数为 0～ 6。结论　利用枫斗类石斛的全序列数据库及遗传分析软件 ,通过对待检种rDNAITS区进行序列测定 ,可以成功鉴别属于数据库中枫斗类石斛的待检种。 展开更多
关键词 石斛属 枫斗类石斛 rDNAITS区 碱基全序列 DNA分子鉴别
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