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A mathematical Model for Inter-Cellular Inductive
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作者 Jeyaraman Srividhya 《Computational Molecular Bioscience》 2012年第3期102-107,共6页
In vertebrate limb, a group of specialized epithelial cells called Apical Ectodermal Ridge (AER) form at the boundary of dorsal and ventral limb ectoderm. Recent experiments suggest that AER forms at the boundary of F... In vertebrate limb, a group of specialized epithelial cells called Apical Ectodermal Ridge (AER) form at the boundary of dorsal and ventral limb ectoderm. Recent experiments suggest that AER forms at the boundary of Fringe expressing and Fringe non-expressing cells by a specific type of receptor-ligand interaction called as inductive signaling, involving the transmembrane proteins Notch, Serrate and Delta. Experiments conducted on Drosophila wing disc have shown that Fringe inhibits the binding ability of Serrate ligand to Notch and enhances that of Delta to Notch. Although several of the signaling elements have been identified experimentally, it remains unclear how the inter-cellular interactions can give rise to such a boundary of specialized cells. Here we present an ordinary differential equation (ODE) model involving Delta→Notch and Serrate→Notch interactions between juxtaposed Fringe expressing and Fringe nonexpressing cells. When simulated in a compartmentalized set up, this model gives rise to high Notch levels at the boundary of Fringe expressing and Fringe non-expressing cells. 展开更多
关键词 delta-notch SIGNALING APICAL Ectodermal RIDGE Compucell3D Boundary Formation INDUCTIVE SIGNALING
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DNER通过抑制线粒体自噬促进胃癌细胞恶性进展的机制研究
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作者 付永生 卢静芬 +2 位作者 赵昕 王卫 朱其聪 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第4期50-55,共6页
目的研究Delta/Notch样表皮生长因子相关受体(delta/notch-like epidermal growth factor-related receptor,DNER)在胃癌中的作用及其调节机制。方法通过实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白免疫印迹(Western blot)检测胃癌组织和细胞... 目的研究Delta/Notch样表皮生长因子相关受体(delta/notch-like epidermal growth factor-related receptor,DNER)在胃癌中的作用及其调节机制。方法通过实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白免疫印迹(Western blot)检测胃癌组织和细胞中DNER mRNA和蛋白表达水平。构建沉默DNER表达的胃癌细胞系SGC7901,用线粒体动力相关蛋白(dynamin-related protein 1,DRP1)抑制剂Mdivi-1处理细胞。CCK-8法、Transwell实验和流式细胞术分别检测细胞活力、侵袭能力和细胞凋亡。Western blot检测DNER蛋白、凋亡相关蛋白[半胱天冬氨酸蛋白酶3(cysteinyl aspartate-specific proteinase-3,Caspase-3)、Bcl-2相关X蛋白(Bcl-2 associated X,Bax)]、自噬相关蛋白[微管相关蛋白1轻链3-Ⅱ/Ⅰ(microtubule-associated protein 1 light chain 3-II/Ⅰ,LC3Ⅱ/Ⅰ)、p62,PTEN诱导激酶1(PTEN induced putative kinase 1,PINK1)和Parkin],以及线粒体裂变和融合蛋白[DRP1,线粒体分裂因子(mitochondrial fission factor,MFF)、线粒体分裂蛋白1(fission mitochondrial 1,FIS1)、视神经萎缩蛋白1(optic atrophy 1,OPA1)、线粒体融合蛋白1(mitofusin 1,MFN1)和MFN2]水平。结果胃癌肿瘤组织和细胞中DNER mRNA,蛋白表达水平分别显著高于相邻正常组织(t=-52.485,-46.955)和人正常胃上皮细胞(F=60.551,60.652),差异具有统计学意义(均P<0.001)。沉默DNER显著抑制SGC7901细胞的增殖和侵袭、诱导细胞凋亡、增加细胞凋亡相关蛋白表达,差异具有统计学意义(t=8.026~25.903,均P<0.05)。沉默DNER显著升高LC3Ⅱ/Ⅰ比率(t=18.086),降低p62蛋白水平(t=6.747),促进PINK1和Parkin蛋白在线粒体的聚集(t=15.630,18.171),抑制线粒体融合蛋白OPA1,MFN1和MFN2表达(t=12.835,8.963,9.732),促进线粒体裂变蛋白DRP1,MFF和FIS1表达(t=16.034,16.939,15.971),差异具有统计学意义(均P<0.05)。Mdivi-1处理可抵消沉默DNER对胃癌细胞线粒体自噬及细胞增殖、侵袭和凋亡的影响。结论DNER通过抑制线粒体动力学失衡减� 展开更多
关键词 胃癌 自噬 delta/notch样表皮生长因子相关受体 线粒体融合 线粒体裂变
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射血分数保留的心力衰竭患者血清Myostatin、DLL1与心室重构指标和预后的关系研究
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作者 苗艳丽 李红净 +1 位作者 周海静 吴海涛 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第7期841-846,共6页
目的探讨射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)患者血清肌肉生长抑制素(Myostatin)、Delta样缺口配体1(DLL1)与心室重构指标和预后的关系。方法选取2021年1月至2022年1月该院收治的117例HFpEF患者为HFpEF组,另选取同期100例体检健康者为对照... 目的探讨射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)患者血清肌肉生长抑制素(Myostatin)、Delta样缺口配体1(DLL1)与心室重构指标和预后的关系。方法选取2021年1月至2022年1月该院收治的117例HFpEF患者为HFpEF组,另选取同期100例体检健康者为对照组。比较HFpEF组与对照组血清Myostatin、DLL1水平和心室重构指标[左心室舒张末期内径(LVEDD)、左心室后壁厚度(LVPWT)、舒张末期室间隔厚度(IVST)、左心室心肌质量指数(LVMI)]。采用Pearson相关性分析HFpEF患者血清Myostatin、DLL1与心室重构指标的相关性。根据随访1年的预后状况,将HFpEF患者分为预后不良组和预后良好组。采用多因素Logistic回归分析HFpEF患者预后不良的影响因素,受试者工作特征(ROC)曲线分析血清Myostatin、DLL1水平对HFpEF患者预后不良的评估价值。结果HFpEF组血清Myostatin、DLL1水平及LVEDD、LVPWT、IVST、LVMI均高于对照组(P<0.05)。HFpEF患者血清Myostatin、DLL1与LVEDD、LVPWT、IVST、LVMI均呈正相关(P<0.05)。随访1年后,HFpEF患者预后不良发生率为33.33%(39/117)。多因素Logistic回归分析显示,纽约心脏协会(NYHA)心功能分级≥Ⅲ级、有高血压和LVEDD、N末端B型利钠肽前体(NT-proBNP)、Myostatin、DLL1升高为HFpEF患者预后不良的独立危险因素(P<0.05)。ROC曲线分析显示,血清Myostatin联合DLL1预测HFpEF患者预后不良的曲线下面积高于各指标单独预测。结论HFpEF患者血清Myostatin、DLL1水平升高,且与心室重构加重和预后不良有关。血清Myostatin、DLL1联合检测对HFpEF患者预后不良具有较好的评估价值。 展开更多
关键词 射血分数保留的心力衰竭 肌肉生长抑制素 delta样缺口配体1 心室重构 预后
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Delta样典型Notch配体3基因在脑胶质瘤中的表达及其临床意义 被引量:1
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作者 赵征 孙志延 +2 位作者 吴凡 刘玉清 张莹 《中华神经外科杂志》 CSCD 北大核心 2021年第7期721-727,共7页
目的:研究Delta样典型Notch配体3(DLL3)基因在脑胶质瘤中的表达特征及其临床意义,进而探索其在脑胶质瘤中的生物学功能。方法:回顾性分析中国脑胶质瘤基因组图谱计划数据库(CGGA)的两套mRNA测序数据集及其匹配的临床数据,其中数据集1包... 目的:研究Delta样典型Notch配体3(DLL3)基因在脑胶质瘤中的表达特征及其临床意义,进而探索其在脑胶质瘤中的生物学功能。方法:回顾性分析中国脑胶质瘤基因组图谱计划数据库(CGGA)的两套mRNA测序数据集及其匹配的临床数据,其中数据集1包含325例样本,数据集2包含693例样本。应用R软件分析DLL3在不同世界卫生组织(WHO)分级、不同分子分型脑胶质瘤的表达模式,并应用免疫组织化学染色检测方法验证DLL3蛋白在不同WHO级别脑胶质瘤中的表达水平。通过Kaplan-Meier生存曲线评价DLL3不同表达水平的脑胶质瘤患者的生存差异。采用单因素和多因素Cox回归分析法分析影响脑胶质瘤患者总体生存期的因素。通过Pearson相关性检验分析与DLL3表达相关的基因。采用功能富集分析方法分析与DLL3表达相关基因的生物学功能。结果:在数据集1中,DLL3的表达随着WHO级别的升高而下调,差异有统计学意义(P<0.001);DLL3在异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变型患者中的表达量高于IDH野生型患者(P<0.001);DLL3在IDH野生型患者中的表达量低于IDH突变型且染色体1p/19q共缺失患者和IDH突变型且染色体1p/19q非共缺失患者(P<0.001);DLL3在O 6-甲基鸟嘌呤DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化患者中的表达量高于非甲基化患者(P<0.001);通过免疫组织化学染色方法验证DLL3表达随着WHO级别的升高而下调(P<0.01);DLL3的上述结果在数据集2中得到相似结果。在两个数据集中,DLL3高表达组患者的总体生存期均长于低表达组患者(均P<0.01)。多因素Cox回归分析结果显示,WHO分级(WHOⅢ级:HR=2.861,95%CI:1.910~4.287;Ⅳ级:HR=4.655,95%CI:3.010~7.199)、染色体1p/19q共缺失(HR=0.439,95%CI:0.293~0.657)以及DLL3高表达(HR=0.593,95%CI:0.427~0.823)均为脑胶质瘤患者预后的独立影响因素(均P<0.001)。与DLL3表达相关的基因有661个(|r|≥0.4,P<0.05);生物信息学分析提示,DLL3可能与脑胶质瘤 展开更多
关键词 神经胶质瘤 基因表达 预后 delta样典型notch配体3 突触功能
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