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六号染色体短臂MHC区DRB3、DRB1基因多态性与精神分裂症症状的关系探讨 被引量:4
1
作者 于雅琴 俞琼 +4 位作者 郭英君 桑红 史洁萍 刘树铮 尉军 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第9期815-818,共4页
目的 探讨六号染色体短臂MHC区DRB3、DRB1基因多态性与精神分裂症症状的相关性。方法 采用聚合酶链反应 (PCR)和限制性内切酶片段长度多态性 (RFLP)方法检测两个基因位点上的单核苷酸多态性 (SNPs) ,并对 116例精神分裂症患者家系进... 目的 探讨六号染色体短臂MHC区DRB3、DRB1基因多态性与精神分裂症症状的相关性。方法 采用聚合酶链反应 (PCR)和限制性内切酶片段长度多态性 (RFLP)方法检测两个基因位点上的单核苷酸多态性 (SNPs) ,并对 116例精神分裂症患者家系进行连锁不平衡分析。结果DRB1的SNP(rs70 795 4 :G/T碱基互换 )等位基因与关系妄想症状呈显著相关 (χ2 =5 .4 84 ,df=1,P =0 .0 19) ,GG、GT、TT三种基因型频率在关系妄想症状中呈显著相关 (χ2 =6 .771,df=2 ,P =0 .0 34)。rs70 795 4的三种基因型频率与情感淡漠症状呈显著相关 (χ2 =12 .110 ,df=4 ,P =0 .0 17)。结论 DRB1位点等位基因与关系妄想和情感淡漠症状高度相关 ,DRB1基因型与关系妄想症状高度相关。 展开更多
关键词 六号染色体短臂MHC区 drb3 drbl 基因多态性 精神分裂症 症状 易感基因 单核苷酸多态性
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大通牦牛DRB3.2基因的遗传多样性 被引量:1
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作者 包鹏甲 梁春年 +2 位作者 郭宪 丁学智 阎萍 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2013年第4期800-806,共7页
为研究大通牦牛DRB3.2基因的遗传多样性,对69头大通牦牛的DRB3.2基因进行半巢式PCR扩增及序列测定,与GenBank下载的牛亚科其他群体对应基因序列进行比较分析。结果表明,大通牦牛DRB3.2基因在核苷酸组成上与其他牛种无明显差异,变异主要... 为研究大通牦牛DRB3.2基因的遗传多样性,对69头大通牦牛的DRB3.2基因进行半巢式PCR扩增及序列测定,与GenBank下载的牛亚科其他群体对应基因序列进行比较分析。结果表明,大通牦牛DRB3.2基因在核苷酸组成上与其他牛种无明显差异,变异主要源于碱基的颠换,以T/G和C/G为主,等位基因多样性为0.991,平均核苷酸差异数为5.30,核苷酸多样性为2.01%,非同义替换与同义替换的比率(ω)为3.487 0,氨基酸分析结果表明发生变异的位点主要集中在该基因的抗原结合区及其相邻区域。正向检验结果表明,大通牦牛正受到强烈的正向选择,这种变异可能与该基因适应环境因子的特殊功能有关。 展开更多
关键词 遗传多样性 drb3 2 半巢式PCR
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多浪羊MHC-DRB3基因座的PCR-RFLP多态性分析 被引量:20
3
作者 刘云芳 剡根强 王新峰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期59-62,共4页
主要组织相容性复合体(MHC)是由紧密连锁的高度多态的基因位点所组成的染色体上的一个遗传区域,它在动物机体的免疫系统中发挥着非常重要的作用。应用PCR RFLP技术首次对多浪羊的MHC DRB3的外显子2进行分子遗传多态性检测与分析。结果显... 主要组织相容性复合体(MHC)是由紧密连锁的高度多态的基因位点所组成的染色体上的一个遗传区域,它在动物机体的免疫系统中发挥着非常重要的作用。应用PCR RFLP技术首次对多浪羊的MHC DRB3的外显子2进行分子遗传多态性检测与分析。结果显示,多浪羊MHC DRB3基因的外显子2在TaqⅠ、PstⅠ和HaeⅢ酶切位点存在多态,其酶切位点分别由2、2和6种共显性等位基因控制。综合3种酶切结果,本实验研究在多浪羊中检测到了DRB3基因的24种等位基因。 展开更多
关键词 多浪羊 分子遗传多态性 PCR-RFLP MHC-drb3基因座
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荷斯坦牛BoLA-DRB_3基因多态性及其与乳房炎抗性关系分析 被引量:20
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作者 张夫千 郑小敏 +2 位作者 唐大伟 赵鹏 史远刚 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期115-119,共5页
以PCR-RFLP方法检测了BoLA-DRB3基因在荷斯坦奶牛中的多态性,并统计分析了产犊年季和BoLA-DRB3基因分别被RsaⅠ和HaeⅢ酶切后的不同基因型对SCS及其它产乳性状的影响。结果表明:RsaⅠAD型的SCS显著高于RsaⅠEG型(P<0.05)。另外,年季... 以PCR-RFLP方法检测了BoLA-DRB3基因在荷斯坦奶牛中的多态性,并统计分析了产犊年季和BoLA-DRB3基因分别被RsaⅠ和HaeⅢ酶切后的不同基因型对SCS及其它产乳性状的影响。结果表明:RsaⅠAD型的SCS显著高于RsaⅠEG型(P<0.05)。另外,年季和BoLA-DRB3被RsaⅠ酶切后的不同基因型对蛋白率和乳脂率的影响均达到了显著水平(P<0.05)。HaeⅢAB型个体的蛋白率显著高于HaeⅢAA型(P<0.05)。 展开更多
关键词 奶牛乳房炎 抗性 MHC BOLA-drb3 SCS
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四川4个地方山羊品种(群体)MHC-DRB_3外显子2的多态性 被引量:12
5
作者 杨易 徐金瑞 +2 位作者 王杰 杨雪 郑玉才 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2006年第1期12-15,共4页
采用TaqⅠ、PstⅠ和HaeⅢ限制性内切酶对四川4个地方山羊品种(群体)GoLA-DRB3基因第二外显子的特异性扩增产物进行消化。结果表明:山羊GoLADRB3第二外显子多态性极丰富,在122,154,168,220,241位点的碱基且为多碱基突变;X2适合性检验表... 采用TaqⅠ、PstⅠ和HaeⅢ限制性内切酶对四川4个地方山羊品种(群体)GoLA-DRB3基因第二外显子的特异性扩增产物进行消化。结果表明:山羊GoLADRB3第二外显子多态性极丰富,在122,154,168,220,241位点的碱基且为多碱基突变;X2适合性检验表明金堂黑山羊和富顺黑山羊GoLADRB3基因的第二外显子第122位点的碱基突变未达到HardyWeinberg平衡状态;4个山羊品种(群体)在第241位点的碱基突变均已达到HardyWeinberg平衡状态;金堂黑山羊、成都麻羊和乐至黑山羊在HaeⅢ酶切位点均未达到HardyWeinberg平衡状态。 展开更多
关键词 山羊 GoLA—drb3 遗传多态性 PCR—RFLP
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牛抗病基因BoL A-DRB3的新等位基因的发现 被引量:14
6
作者 王兴平 许尚忠 +3 位作者 昝林森 高雪 任红艳 陈金宝 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期722-726,共5页
BoLA-DRB3基因是主要组织相容性复合物(Major Histocompatibility Complex,MHC)基因家族中的Ⅱ类基因,它是该基因家族中最主要的功能基因,所编码的MHC抗原与免疫应答、抗病性密切相关。其第2外显子是编码抗原的主要功能区。本试验以地... BoLA-DRB3基因是主要组织相容性复合物(Major Histocompatibility Complex,MHC)基因家族中的Ⅱ类基因,它是该基因家族中最主要的功能基因,所编码的MHC抗原与免疫应答、抗病性密切相关。其第2外显子是编码抗原的主要功能区。本试验以地方良种鲁西牛、秦川牛、晋南牛和南阳牛为研究对象,采用PCR-RFLP方法对DRB3基因307bp的扩增产物进行多态性分析,结果表明DRB3基因第2外显子的第154位C→A,从而产生新的等位基因。经χ2适合性检验,鲁西牛在MHC-DRB3基因第2外显子的MspⅠ酶切位点未达到Hardy-Wein-berg平衡状态(P<0.05)。 展开更多
关键词 黄牛 抗病性 BOLA-drb3 PCR-RFLP
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牛BoLA-DRB_3基因的多态性与乳房炎相关性初探 被引量:12
7
作者 杨东英 陈宏 +4 位作者 张良志 胡沈荣 苏利红 王新庄 王居强 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2006年第7期7-9,共3页
利用PCR-RFLP技术对易感乳房炎的奶牛血样24份,不易感染乳房炎的2个黄牛品种南阳牛、秦川牛血样66份共计90个个体进行牛BoL A-DRB3基因第2外显子多态性分析。结果表明:扩增大小为252 bp的片段经限制性内切酶B stU I酶切后表现多态,且奶... 利用PCR-RFLP技术对易感乳房炎的奶牛血样24份,不易感染乳房炎的2个黄牛品种南阳牛、秦川牛血样66份共计90个个体进行牛BoL A-DRB3基因第2外显子多态性分析。结果表明:扩增大小为252 bp的片段经限制性内切酶B stU I酶切后表现多态,且奶牛AA型个体显著高于黄牛品种,提示BoL A等位基因A作为母牛乳房炎易感性的候选标记具有潜在的有效性。 展开更多
关键词 BoLA—drb3 PCR—RFLP 多态性
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蒙古山羊和哈萨克山羊GOL A-DRB3基因的HaeⅢ酶切多态性分析 被引量:11
8
作者 孙东晓 张沅 李宁 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期55-58,共4页
采用限制性内切核酸酶HaeⅢ对蒙古山羊和哈萨克山羊GOLA DRB3基因外显子2的285bp扩增产物进行了PCR RFLP多态性分析,共检测到17种基因型,由A、B、C、D、E、F和H等7个复等位基因控制;通过酶切图谱分析发现蒙古山羊和哈萨克山羊的GOLA DRB... 采用限制性内切核酸酶HaeⅢ对蒙古山羊和哈萨克山羊GOLA DRB3基因外显子2的285bp扩增产物进行了PCR RFLP多态性分析,共检测到17种基因型,由A、B、C、D、E、F和H等7个复等位基因控制;通过酶切图谱分析发现蒙古山羊和哈萨克山羊的GOLA DRB3基因外显子2的154、168和220位碱基表现出多态性。并对基因型频率和等位基因频率进行了统计分析,结果表明,GOLA DRB3基因的部分基因型频率和等位基因频率在两个群体之间差异显著(P<0.10或P<0.05)或极显著(P<0.01);χ2适合性检验结果表明,蒙古山羊和哈萨克山羊的GOLA DRB3基因外显子2的HaeⅢ酶切位点均未达到Hardy Weinberg平衡状态(P<0.01)。 展开更多
关键词 蒙古山羊 哈萨克山羊 GOLA-drb3基因 外显子
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4个绵羊品种MHC-DRB3基因外显子2的多态性分析 被引量:9
9
作者 魏丽君 石国庆 +4 位作者 王晓申 柳楠 管峰 代荣 任航行 《中国畜牧兽医》 CAS 2007年第7期63-66,共4页
采用PCR-RFLP方法分析4个绵羊品种(阿勒泰羊、中国美利奴肉用多胎品系、湖羊和陶塞特羊)MHC-DRB3基因第2外显子的多态性,并进行聚类分析以及基因杂合度和多态信息含量的计算。结果表明:在绵羊MHC-DRB3基因第2外显子第122、154、168、... 采用PCR-RFLP方法分析4个绵羊品种(阿勒泰羊、中国美利奴肉用多胎品系、湖羊和陶塞特羊)MHC-DRB3基因第2外显子的多态性,并进行聚类分析以及基因杂合度和多态信息含量的计算。结果表明:在绵羊MHC-DRB3基因第2外显子第122、154、168、220和241 bp碱基处表现出多态性;χ^2适合性检验结果表明,4个绵羊群体MHC-DRB3基因的第2外显子的PstⅠ酶切位点达到了Hardy-Weinberg平衡状态,TaqⅠ和HaeⅢ酶切位点多态性均未达到Hardy-Weinberg平衡状态;4个绵羊群体基因杂合度和多态信息含量值分别在0.693-0.774和0.662-0.738之间,表明4个绵羊品种具有丰富的遗传多样性;聚类结果表明,中国美利奴肉用多胎羊和湖羊亲缘关系最近,阿勒泰羊和陶塞特羊关系较远,与实际选育过程一致,MHC-DRB3多态性可作为绵羊育种标记进一步研究。 展开更多
关键词 绵羊 MHC-drb3 PCR-RFLP 遗传多态性
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三江黄牛Bola-DRB_3基因第二外显子的PCR-RFLP多态性研究 被引量:7
10
作者 陈智华 顾磊 +1 位作者 钟金城 陈雪梅 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2007年第4期782-787,共6页
用PCR-RFLP方法,对三江黄牛和黑白花奶牛的MHCⅡ类基因座位Bola-DRB3基因第2外显子的遗传样性进行了研究.结果表明:①三江黄牛HaeIII酶切出现3种基因型,即SS、RS、RR,由S和R两个基因控制,RR为优势基因型,R为优势基因;RsaI酶切出现4种基... 用PCR-RFLP方法,对三江黄牛和黑白花奶牛的MHCⅡ类基因座位Bola-DRB3基因第2外显子的遗传样性进行了研究.结果表明:①三江黄牛HaeIII酶切出现3种基因型,即SS、RS、RR,由S和R两个基因控制,RR为优势基因型,R为优势基因;RsaI酶切出现4种基因型,即XX、XM、LM、MM,由X、M和L三个复等位基因控制,LM为优势基因型,M为优势基因;两种内切酶在三江黄牛Bola-DRB3基因的第二个外显子上有150、202、65、180等酶切位点,且4个位点的碱基存在多态性,表现为多碱基突变;经χ2适合性检验,HaeIII和RsaI酶切位点的χ2值分别为7.0802、14.1358,差异显著(p<0.05),说明三江黄牛Bola-DRB3基因第2外显子的4个酶切位点的碱基突变未达到Hardy-Weinberg平衡状态,存在选择、基因突变、近交、遗传漂变等因素的影响.②黑白花奶牛HaeIII酶切出现4种基因型,即JJ、KI、IJ、KJ,由J、K和I三个复等位基因控制,JJ为优势基因型,J为优势基因;RsaI酶切出现3种基因型,即LL、MM、LM,由L和M两个基因控制,LM为优势基因型,M为优势基因;HaeIII和RsaI两种内切酶在黑白花奶牛中也有多个酶切位点,在150、48、65、202位上有碱基多态性,表现为多碱基突变;经χ2适合性检验,RsaI酶切位点的χ2值为3.456,差异不显著(p>0.05),处于Hardy-Weinberg平衡状态;HaeIII酶切位点的χ2值为18.4211,差异显著(p<0.05),未达到Hardy-Weinberg平衡状态.③用两种酶在三江黄牛中共检测到7种基因型,且与黑白花奶牛在酶切位点上具有较多的差异,说明三江黄牛具有丰富的遗传多样性;这一结果与张成忠、赖松家等从血液蛋白、染色体、mtDNA等水平上的研究结果一致,也同三江黄牛的育成历史和所处生态条件一致.综上所述,三江黄牛具有丰富的遗传多样性,今后应加强对三江黄牛遗传多态性以及起源、演化和分类的研究,为这一畜种资源的进一步开发利用和保护提供理论基础. 展开更多
关键词 三江黄牛 Bola-drb3基因 PCR—RFLP 遗传多样性
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自贡黑山羊MHC-DRB_3基因的多态性研究 被引量:2
11
作者 王杰 郑玉才 +2 位作者 杨易 王永 欧阳熙 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2006年第7期7-9,共3页
本实验研究了自贡黑山羊、金堂黑山羊、乐至黑山羊和成都麻羊MHC-DRB3基因的多态性。MHC-DRB3第2外显子的PCR扩增产物分别经限制性核酸内切酶TaqⅠ、PstⅠ、HaeⅢ消化,结果在第122、154、168、220、241位碱基显示出多态性;4个山羊群体... 本实验研究了自贡黑山羊、金堂黑山羊、乐至黑山羊和成都麻羊MHC-DRB3基因的多态性。MHC-DRB3第2外显子的PCR扩增产物分别经限制性核酸内切酶TaqⅠ、PstⅠ、HaeⅢ消化,结果在第122、154、168、220、241位碱基显示出多态性;4个山羊群体分别检测到9、10、7个和8个等位基因;聚类分析表明:金堂黑山羊和成都麻羊亲缘关系最近,首先聚为一类,再与乐至黑山羊聚为一类,最后自贡黑山羊与其他3个山羊品种聚为一类。 展开更多
关键词 畜牧 兽医科学基础学科 MHC-drb3 遗传多态性 山羊
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奶牛DRB3基因生物信息学分析 被引量:6
12
作者 徐飞 成述儒 罗玉柱 《中国奶牛》 2011年第2期4-8,共5页
利用生物基因组学数据库,对奶牛MHCⅡ区DRB3基因进行生物信息学分析,以预测DRB3基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建DRB3同源基因的系统进化树。结果表明,DRB3编码产物为不稳定亲水性蛋白,具有明显的信号肽,其切割位点位于29... 利用生物基因组学数据库,对奶牛MHCⅡ区DRB3基因进行生物信息学分析,以预测DRB3基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建DRB3同源基因的系统进化树。结果表明,DRB3编码产物为不稳定亲水性蛋白,具有明显的信号肽,其切割位点位于29~30位的氨基酸之间。二级结构主要以无规则卷曲和延伸链为主,主要在细胞质中发挥生物学作用。序列分析表明,DRB3编码产物可能具有免疫应答、受体、胁迫应答、信号转导等功能,可能在免疫应答和胁迫应答过程中发挥重要作用,可能对奶牛免疫力和抗病性起关键作用。DRB3编码产物氨基酸邻接系统树表明,奶牛DRB3与绵羊、羚羊、塔尔羊、麝牛、亚洲水牛等物种DRB3氨基酸距离较近,它们具有高度同源性。 展开更多
关键词 主要组织相容性复合体 drb3基因 生物信息学 奶牛
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小尾寒羊MHC-DRB3基因外显子2的多态性分析 被引量:3
13
作者 尚友国 宋美玲 +2 位作者 李建平 于艳 王建民 《中国畜牧兽医》 CAS 2006年第2期36-38,共3页
采用PCR-RFLP方法对小尾寒羊MHC-DRB 3基因第二外显子285 bp的扩增产物进行多态性分析,结果共检测到内切酶P stⅠ的3种基因型,由2个等位基因控制,通过酶切图谱分析结果表明:小尾寒羊的MHC-DRB 3基因第二外显子的第241位的碱基表现出多态... 采用PCR-RFLP方法对小尾寒羊MHC-DRB 3基因第二外显子285 bp的扩增产物进行多态性分析,结果共检测到内切酶P stⅠ的3种基因型,由2个等位基因控制,通过酶切图谱分析结果表明:小尾寒羊的MHC-DRB 3基因第二外显子的第241位的碱基表现出多态性,等位基因B的基因频率为0.81879。x2适合性检验结果表明:小尾寒的MHC-DRB 3基因的第2外显子的P stⅠ酶切位点达到了H ardy-W e inberg平衡状态。 展开更多
关键词 小尾寒羊 MHC-drb3 PCR-RFLP
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巴什拜羊OLA-DRB3基因多态性与绵羊肺炎支原体感染相关性研究 被引量:5
14
作者 冷青文 闫遵祥 +1 位作者 李志远 剡根强 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2015年第17期6-9,22,共5页
本研究旨在分析巴什拜羊DRB3基因遗传多态性与MO感染的相关性。采用PCR-RFLP方法分析巴什拜羊OLA-DRB3基因第2外显子多态性,并计算基因杂合度、多态信息含量和有效等位基因数等遗传参数;通过分析和差异性检验MO阴性和阳性巴什拜羊OLA-D... 本研究旨在分析巴什拜羊DRB3基因遗传多态性与MO感染的相关性。采用PCR-RFLP方法分析巴什拜羊OLA-DRB3基因第2外显子多态性,并计算基因杂合度、多态信息含量和有效等位基因数等遗传参数;通过分析和差异性检验MO阴性和阳性巴什拜羊OLA-DRB3基因型频率和等位基因频率,初步判定MO的抗性或易感性基因。结果表明:巴什拜羊OLA-DRB3第2外显子在第122、154、168和241碱基处表现出多态性;在Taq I、Pst I位点达到Hardy-Weinberg平衡,根据基因杂合度和多态信息含量,表明巴什拜羊具有较为丰富的遗传多样性。在巴什拜羊的24种基因型中,HaeⅢBC(P<0.05)为MO抗性基因,HaeⅢDD(P<0.05)为MO易感基因型;Pst I A(P<0.01)和Pst I B(P<0.01)、HaeⅢC(P<0.01)分别是巴什拜羊MO易感和抗性相关等位基因。此结果可为绵羊抗病育种研究提供理论支持。 展开更多
关键词 巴什拜羊 MO OLA-drb3 PCR-RFLP
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荷斯坦奶牛BoLA-DRB3基因多态性与乳房炎相关性分析 被引量:4
15
作者 王彦亮 张兆霞 +2 位作者 赵长红 赖寿贵 何高明 《中国奶牛》 2009年第5期8-11,共4页
本研究采用Hae Ⅲ和BstYⅠ内切酶,以PCR-RFLP方法分别检测了新疆地区引进的澳大利亚荷斯坦奶牛BoLA-DRB3基因的多态性及其与乳房炎的相关性。结果共检测到9种基因型5种等位基因,其中基因型HaeⅢAB和BstYⅠAA为优势基因型,等位基因HaeⅢA... 本研究采用Hae Ⅲ和BstYⅠ内切酶,以PCR-RFLP方法分别检测了新疆地区引进的澳大利亚荷斯坦奶牛BoLA-DRB3基因的多态性及其与乳房炎的相关性。结果共检测到9种基因型5种等位基因,其中基因型HaeⅢAB和BstYⅠAA为优势基因型,等位基因HaeⅢA和BstYⅠA为优势基因;在高于健康牛的分布频率中,基因型Hae Ⅲ AB和BstYⅠAB,基因Hae ⅢB和BstYⅠA基因频率在感染牛中分布频率最高;在高于感染牛的分布频率中,基因型Hae Ⅲ AA和BstYⅠAA,基因Hae Ⅲ A和BstYⅠA在健康牛中分布频率最高。经χ2适合性检验,Hae Ⅲ酶切位点的碱基突变偏离平衡状态(P<0.01),而BstYⅠ酶切位点碱基突变达到平衡状态(P>0.05);Hae Ⅲ酶切基因型和基因频率在感染牛和健康牛中分布差异均极显著(P<0.01);BstYⅠ酶切基因型和基因频率在感染牛和健康牛中的分布差异均不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 荷斯坦奶牛:BoLA—drb3 PCR—RFLP 多态性 乳房炎
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山东地方绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLPs反应体系的优化 被引量:5
16
作者 尚友国 宋美玲 王建民 《草食家畜》 2005年第2期17-19,共3页
本文探讨了影响山东地方绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLPs扩增的因素,实验结果表明:抗凝剂、模板的浓度、纯度、Mg2+的浓度、引物的浓度、变性温度、Taq聚合酶、退火温度等因素对扩增结果的影响,为此我们对影响扩增结果的各个因素和反应程序... 本文探讨了影响山东地方绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLPs扩增的因素,实验结果表明:抗凝剂、模板的浓度、纯度、Mg2+的浓度、引物的浓度、变性温度、Taq聚合酶、退火温度等因素对扩增结果的影响,为此我们对影响扩增结果的各个因素和反应程序进行了研究和浓度梯度的对比试验,建立了绵羊MHC-DRB3基因PCR-RFLPs的最佳反应体系和反应程序。 展开更多
关键词 MHC 基因 绵羊 山东 PCR-RFLPS 优化 最佳反应体系 反应程序 MG^2+ 变性温度 退火温度 对比试验 浓度梯度 抗凝剂 聚合酶 TAQ
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河西绒山羊DRB3基因外显子2多态性分析 被引量:4
17
作者 罗秀刚 马小军 +3 位作者 张小丽 岳燕 李富强 姜力飞 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期80-86,共7页
研究采用PCR-SSCP方法检测1 046只河西绒山羊DRB3基因第2外显子的多态性,并克隆、测序群体内变异产生的各等位基因,分析各等位基因间的遗传关系和进化意义。结果表明,河西绒山羊DRB3基因第2外显子表现了18个等位基因(LG001-LG018)控制... 研究采用PCR-SSCP方法检测1 046只河西绒山羊DRB3基因第2外显子的多态性,并克隆、测序群体内变异产生的各等位基因,分析各等位基因间的遗传关系和进化意义。结果表明,河西绒山羊DRB3基因第2外显子表现了18个等位基因(LG001-LG018)控制的31个基因型,LG005为优势等位基因,LG005*005为优势基因型,18个单倍型序列分析发现44个核苷酸多态位点、29个氨基酸多态位点;与GenBank下载序列比对分析结果表明,16个DRB3的等位基因是本研究首次发现;DRB3基因遗传多态指数中,观察杂合度为0.269 6,多态信息含量为0.869 9,有效等位基因数为1.369 1;经χ2适合性检验,该群体偏离了Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05);18个DRB3基因外显子2的单倍型序列NJ系统发育树呈2支分化趋势。研究认为河西绒山羊DRB3基因第2外显子具有丰富的遗传多态性;河西绒山羊DRB3基因最初由2个等位基因突变分化成两大类等位基因。 展开更多
关键词 drb3基因 多态性 PCR-SSCP 河西绒山羊
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金堂黑山羊GoLA-DRB_3基因多态性与体尺性状相关性研究 被引量:4
18
作者 杨易 徐金瑞 +1 位作者 郑玉才 王杰 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期10-12,共3页
采用TaqⅠ、PstⅠ和HaeⅢ三种限制性内切酶对111只金堂黑山羊GoLA-DRB3基因第二外显子的遗传多态性进行检测,结果表明:金堂山羊GoLA-DRB3第二外显子多态性极丰富,且为多碱基突变;除241位点外,第122、154、168和220几个位点的碱基突变均... 采用TaqⅠ、PstⅠ和HaeⅢ三种限制性内切酶对111只金堂黑山羊GoLA-DRB3基因第二外显子的遗传多态性进行检测,结果表明:金堂山羊GoLA-DRB3第二外显子多态性极丰富,且为多碱基突变;除241位点外,第122、154、168和220几个位点的碱基突变均未达到Hardy-Weinberg平衡状态;TaqⅠ酶切的各基因型对胸围、管围影响达到显著水平(P<0.05);PstⅠ酶切的3种基因型间体长及管围差异极显著(P<0.01),HaeⅢ酶切的3种基因型对体高影响达到极显著水平(P<0.01)。 展开更多
关键词 金堂黑山羊 GoLA—drb3 遗传多态性 PCR—RFLP
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德昌水牛Bola-DRB3基因第二外显子的PCR-RFLP多态性研究 被引量:3
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作者 陈智华 顾磊 钟金城 《家畜生态学报》 2007年第6期49-53,共5页
本研究应用PCR-RFLP方法,对德昌水牛MHCⅡ类基因座位的Bola-DRB3基因第2外显子进行了遗传多态性研究。结果表明:HaeIII酶切出现7种基因型,即AA、AB、AD、BC、AC、BF和BB,共有A、B、C、D、F 5个复等位基因控制;AA型的频率最高,为优势基因... 本研究应用PCR-RFLP方法,对德昌水牛MHCⅡ类基因座位的Bola-DRB3基因第2外显子进行了遗传多态性研究。结果表明:HaeIII酶切出现7种基因型,即AA、AB、AD、BC、AC、BF和BB,共有A、B、C、D、F 5个复等位基因控制;AA型的频率最高,为优势基因型,A基因为优势基因。RsaI酶切结果出现3种基因型,即GH、GG、HH,共有G、H 2个基因控制;GG的频率最高,为优势基因型,G基因为优势基因。这表明德昌水牛在Bola-DRB3基因第2外显子上具有丰富的多态性。在RsaI酶切位点上,德昌水牛未达到Hardy-Weiberg平衡状态,显示在群体中有选择、基因突变、近交、遗传漂变等因素的一定影响,这是对保种极为不利的,应引起畜牧工作者的关注。在德昌水牛遗传资源的开发利用和保存中,作者认为应严格划定杂交改良和保种区的范围;在杂交改良区内可以进行选育、品种间杂交,充分利用杂种优势,提高其生产性能;而在保种区或群中不进行杂交,同时减少选育;使德昌水牛遗传资源的有效保存和充分利用有机的结合起来。 展开更多
关键词 德昌水牛 Bola—drb3基因 PCR—RFLP 遗传多态性
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部分中国黄牛BoLA-DRB3基因序列分析 被引量:2
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作者 王昆 张沅 孙东晓 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期853-857,共5页
通过DNA测序,分别对4个中国黄牛地方品种的MHC-Ⅱ类基因DRB3外显子2的多态性进行分析。通过序列比对,共检测到DRB3*exon2等位基因259种,其中新等位基因131个。等位基因的分布具有品种特异性。各等位基因之间存在大量多态位点,统计分析表... 通过DNA测序,分别对4个中国黄牛地方品种的MHC-Ⅱ类基因DRB3外显子2的多态性进行分析。通过序列比对,共检测到DRB3*exon2等位基因259种,其中新等位基因131个。等位基因的分布具有品种特异性。各等位基因之间存在大量多态位点,统计分析表明:发生非同义替换的多态位点均主要分布在抗原结合位点对应的编码序列中,共有17个变异位点的氨基酸组成在品种间具有显著差异,其中7个位点差异显著(P<0.05);10个位点差异极显著(P<0.01)。在变异位点中,有8个位点为抗原结合位点。 展开更多
关键词 中国黄牛 BoLA—drb3外显子2 等位基因 序列测定 多态性
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