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Programmable DNA-responsive microchip for the capture and release of circulating tumor cells by nucleic acid hybridization 被引量:2
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作者 Shan Guo Haiyan Huang +6 位作者 Xujing Deng Yuqi Chen Zhuoran Jiang Min Xie Songmei Liu Weihua Huang Xiang Zhou 《Nano Research》 SCIE EI CAS CSCD 2018年第5期2592-2604,共13页
The detection and analysis of circulating tumor cells (CTCs) from patients' blood is important to assess tumor status; however, it remains a challenge. In the present study, we developed a programmable DNA-responsi... The detection and analysis of circulating tumor cells (CTCs) from patients' blood is important to assess tumor status; however, it remains a challenge. In the present study, we developed a programmable DNA-responsive microchip for the highly efficient capture and nondestructive release of CTCs via nucleic acid hybridization. Transparent and patternable substrates with hierarchical architectures were integrated into the microchip with herringbone grooves, resulting in greatly enhanced cell-surface interaction via herringbone micromixers, more binding sites, and better matched topographical interactions. In combination with a high-affinity aptamer, target cancer cells were specifically and efficiently captured on the chip. Captured cancer cells were gently released from the chip under physiological conditions using toehold-mediated strand displacement, without any destructive factors for cells or substrates. More importantly, aptamercontaining DNA sequences on the surface of the retrieved cancer cells could be further amplified by polymerase chain reaction (PCR), facilitating the detection of cell surface biomarkers and characterization of the CTCs. Furthermore, this system was extensively applied to the capture and release of CTCs from patients' blood samples, demonstrating a promising high-performance platform for CTC enrichment, release, and characterization. 展开更多
关键词 dna-responsive microchip hierarchical architecture circulating tumor cells(CTCs) aptamer CAPTURE RELEASE nucleic acid hybridization
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DNA双链断裂损伤反应及它的医学意义 被引量:7
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作者 宋宜 孙志贤 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第9期929-934,共6页
DNA损伤应激反应是维持基因组稳定性的基石.细胞在长期进化中形成了由损伤监视、周期调控、损伤修复、凋亡诱导等在内的自稳平衡机制.一方面,借助感应、识别并启动精细而复杂的修复机制修复损伤;另一方面,通过DNA损伤应激活化的细胞周... DNA损伤应激反应是维持基因组稳定性的基石.细胞在长期进化中形成了由损伤监视、周期调控、损伤修复、凋亡诱导等在内的自稳平衡机制.一方面,借助感应、识别并启动精细而复杂的修复机制修复损伤;另一方面,通过DNA损伤应激活化的细胞周期检查点机制,延迟或阻断细胞周期进程,为损伤修复提供时间,使细胞能安全进入新一轮细胞周期;损伤无法修复时则诱导细胞凋亡.DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs)是真核基因组后果最严重的损伤类型之一,其修复不利,同肿瘤等人类疾病的发生发展密切相关.新进展揭示:DSBs损伤反应信号分子ATM-Chk2-p53、H2AX等的组成性活化,是肿瘤形成早期所激活的细胞内可诱导的抗癌屏障,其信号网络的精确、精细调控在基因组稳定性维持中发挥重要作用.此外,HIV病毒整合进入宿主细胞基因组的过程也依赖于宿主细胞中ATM介导的DSBs损伤反应信号转导;ATM特异性的小分子抑制剂在抗HIV感染中显示重要的功能意义.文中重点讨论调控DSBs损伤应激反应信号网络的主要研究进展,及其在肿瘤发生、发展及抗HIV感染中的新医学意义. 展开更多
关键词 dna损伤反应 dna双链断裂(DSBs) ATM P53 dna损伤检查点
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R-loop的调控及其生理功能
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作者 张译匀 叶素敏 金建平 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1099-1109,共11页
R环(R-loop)是一种DNA∶RNA杂合链(DNA∶RNA hybrids),由一条RNA单链侵入双链DNA,与其中一条DNA模板链结合,从而释放出一条DNA单链而产生。R-loop在细胞生命活动中扮演着重要角色,与基因组稳定性、转录调控,以及表观修饰等重要生物学过... R环(R-loop)是一种DNA∶RNA杂合链(DNA∶RNA hybrids),由一条RNA单链侵入双链DNA,与其中一条DNA模板链结合,从而释放出一条DNA单链而产生。R-loop在细胞生命活动中扮演着重要角色,与基因组稳定性、转录调控,以及表观修饰等重要生物学过程有着密不可分的关系。很多因素参与对R-loop的调控,例如RNA转录和加工、染色体的修饰、DNA损伤反应等;同时,许多酶蛋白,如核糖核酸酶、解旋酶和拓扑异构酶等也参与调节细胞内的R-loop水平。了解R-loop的调控机制及其生物学功能有助于更好地理解基因组稳定性的维持机制,为治疗骨髓增生异常综合征、白血病、乳腺癌、前列腺癌等疾病开拓新思路。 展开更多
关键词 R环 dna∶RNA杂合链 基因组稳定性 转录 dna损伤反应
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DNA损伤修复因子WDR70的生物学功能及其在人卵巢癌中的突变研究 被引量:2
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作者 郭莲娣 王丹 +11 位作者 杨帆 梁语珈 杨雪琴 覃意扬 任来峰 曾鸣 唐子执 王小军 王思 刘聪 楼江燕 陈杰 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期501-506,共6页
目的在细胞水平上分析新发现的DNA损伤修复因子WDR70的生物学功能,确定WDR70基因在人卵巢癌中的突变发生情况,以验证该基因的功能丢失是否与卵巢癌关联。方法在人细胞中用siRNA干扰WDR70基因表达,或用慢病毒和质粒过表达WDR70的野生型... 目的在细胞水平上分析新发现的DNA损伤修复因子WDR70的生物学功能,确定WDR70基因在人卵巢癌中的突变发生情况,以验证该基因的功能丢失是否与卵巢癌关联。方法在人细胞中用siRNA干扰WDR70基因表达,或用慢病毒和质粒过表达WDR70的野生型和突变体,通过免疫印迹和免疫荧光等方法研究该基因在DNA损伤后的亚细胞定位和DNA损伤信号通路中的作用;此外,抽提1例正常卵巢组织和16例卵巢癌标本的mRNA进行半定量RT-PCR扩增,对这些标本中的WDR70基因进行测序分析。结果 WDR70基因沉默和过表达其突变体导致同源重组功能蛋白——DNA复制蛋白A(RPA32)磷酸化修饰水平降低和重组酶——重组蛋白A(RAD51)向DNA损伤位点招募的能力减低;WDR70的功能障碍还导致染色体的断裂增多;同时,卵巢癌样本中发现多例WDR70突变型别。结论在体外系统中,WDR70参与DNA损伤修复过程,沉默或过表达其突变体将导致同源重组修复缺陷和染色体结构的不稳定;在卵巢癌基因组中,WDR70基因频繁出现突变,可能导致相应的DNA修复缺陷和基因组不稳定性的发生。因此,WDR70是一个潜在的卵巢癌抗癌基因。 展开更多
关键词 dna损伤应答 卵巢癌 WDR70
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幽门螺杆菌感染对胃黏膜上皮细胞REDD1表达的影响及调控机制 被引量:2
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作者 闫宗宝 毛方圆 +2 位作者 单治国 赵永亮 庄园 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期413-420,共8页
目的探讨DNA损伤应答蛋白1(regulated in development and DNA damage responses-1,REDD1)在幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)感染中的表达及调控机制。方法建立H.pylori感染C57小鼠及胃上皮细胞模型,运用实时荧光定量PCR、免... 目的探讨DNA损伤应答蛋白1(regulated in development and DNA damage responses-1,REDD1)在幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)感染中的表达及调控机制。方法建立H.pylori感染C57小鼠及胃上皮细胞模型,运用实时荧光定量PCR、免疫组织化学染色和Western blot检测REDD1 mRNA和蛋白的表达;并在细胞模型中采用信号通路抑制剂的方法探讨H.pylori感染诱导REDD1上调的机制。结果相对于未感染组,H.pylori感染小鼠胃黏膜中的REDD1水平显著增高;而相对于野生型(Wild Type,WT)全毒株,敲除cagA基因后,H.pylori感染诱导REDD1上调的能力则显著下降(P<0.05);H.pylori感染可诱导胃上皮细胞AGS REDD1表达上调,并具有时间、感染菌量以及cagA依赖性(P<0.05);P38/MAPK信号通路阻断可显著抑制H.pylori感染诱导的REDD1上调表达(P<0.05)。结论H.pylori依赖磷酸化的cagA蛋白激活MAPKp38通路诱导REDD1表达增高。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 dna损伤应答蛋白1 MAPK P38
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CRL4泛素化酶在卵巢癌中的功能和突变研究 被引量:1
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作者 唐子执 王海斌 +2 位作者 曾鸣 刘聪 李德华 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期693-698,共6页
目的研究泛素化酶CRL4蛋白复合体家族成员CRL4-WD40重复序列结构域蛋白70(WDR70)在卵巢癌细胞中的DNA修复功能,以及卵巢癌组织中该泛素化酶基因的突变规律。方法利用免疫荧光方法,检测CRL4骨架蛋白DDB1及WDR70基因特异性沉默的卵巢癌细... 目的研究泛素化酶CRL4蛋白复合体家族成员CRL4-WD40重复序列结构域蛋白70(WDR70)在卵巢癌细胞中的DNA修复功能,以及卵巢癌组织中该泛素化酶基因的突变规律。方法利用免疫荧光方法,检测CRL4骨架蛋白DDB1及WDR70基因特异性沉默的卵巢癌细胞与其对应的对照组细胞在化疗药物或放射线照射诱导产生DNA双链断裂后,组蛋白H2AX(γH2AX)及单链DNA结合蛋白32(RPA32)磷酸化灶点显示的差异;BrdU标记和染色实验检测WDR70基因对DNA复制是否存在影响,同时利用免疫组化染色检测卵巢癌组织临床病理标本及正常卵巢组织标本中的WDR70和组蛋白H2B单泛素化(uH2B)染色差异,以阐明CRL4的DNA损伤应答特征,RT-PCR测定卵巢癌组织中WDR70的基因表达水平,并采用DNA测序确定WDR70突变位点。结果免疫荧光染色结果显示,CRL4-WDR70的不同蛋白亚基(DDB1、WDR70)在细胞周期检验点激活和uH2B介导的DNA末端回切过程中起着不同的作用:DDB1参与以上两个机制的调控,而WDR70只促进末端回切、RPA32在DNA断裂点的招募和同源重组修复。BrdU标记和染色结果显示WDR70基因对DNA复制并不存在影响。免疫组化结果显示,卵巢癌组织临床病理标本及正常卵巢组织标本中的WDR70和uH2B表达存在差异。RT-PCR结果显示WDR70基因的全长、5′和3′转录本水平在50%的卵巢癌组织中水平减低,出现多处外显子突变位点。结论 CRL4在DNA修复过程中具有促进H2B单泛素化、促进DNA末端回切和激活细胞周期检验点等多种重要功能,是维持基因组稳定性、遏阻卵巢癌发生的重要抗癌机制。 展开更多
关键词 H2B单泛素化CRL4 dna损伤应答 卵巢癌
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发育及DNA损伤反应调节基因1mRNA在癫痫患者脑组织中的表达及临床意义
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作者 席志芹 王学峰 +9 位作者 龚云 李劲梅 刘风英 汪建华 晏勇 栾国明 王玉平 李云林 张建国 李红卫 《中风与神经疾病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期167-169,共3页
目的观察REDD1mRNA在癫痫患者脑组织中的表达及临床意义。方法将50例癫痫患者分成难治性(42例)和非难治性癫痫(8例)两组,用基因芯片和免疫荧光定量PCR分别检测脑组织中REDD1mRNA基因表达,并与对照组进行比较。结果基因芯片扫描提示REDD1... 目的观察REDD1mRNA在癫痫患者脑组织中的表达及临床意义。方法将50例癫痫患者分成难治性(42例)和非难治性癫痫(8例)两组,用基因芯片和免疫荧光定量PCR分别检测脑组织中REDD1mRNA基因表达,并与对照组进行比较。结果基因芯片扫描提示REDD1mRNA在癫痫患者脑组织中与对照组比较表达明显增加,难治性癫痫组和非难治性癫痫组没有明显的表达差异,免疫荧光定量PCR的结果与基因芯片结果一致。结论 REDD1mRNA在癫痫患者脑部中存在高表达,这种高表达可能通过雷帕霉素哺乳动物靶标系统导致神经元坏死与凋亡。 展开更多
关键词 REDD1 癫痫 基因芯片 免疫荧光定量PCR
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乙肝核酸疫苗NV-HB/s接种小鼠的免疫反应 被引量:5
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作者 秦山 赵连三 +3 位作者 范红 何芳 雷学忠 刘丽 《华西医科大学学报》 CSCD 北大核心 2002年第4期497-500,共4页
目的 研究乙型肝炎核酸疫苗 NV- HB/s经肌肉注射、皮下注射、转化伤寒杆菌 CVD90 8后再经口服等不同途径接种小鼠后 ,小鼠产生体液免疫应答的规律 ,以及磷酸钙在提高核酸疫苗免疫效能中的作用。方法用自制的乙肝核酸疫苗、佐剂化乙肝... 目的 研究乙型肝炎核酸疫苗 NV- HB/s经肌肉注射、皮下注射、转化伤寒杆菌 CVD90 8后再经口服等不同途径接种小鼠后 ,小鼠产生体液免疫应答的规律 ,以及磷酸钙在提高核酸疫苗免疫效能中的作用。方法用自制的乙肝核酸疫苗、佐剂化乙肝核酸疫苗及口服疫苗 ,以不同接种途径免疫小鼠 ,分别检测小鼠外周血中的HBs Ag及抗 HBs;肌肉组织标本中的疫苗质粒以及 C- m yc m RNA。结果 肌注 NV- HB/s 3天后 ,在接种部位检出了 HBs Ag;1月后外周血中检出了抗 HBs。肌注与皮下注射对 NV- HB/s的免疫效能无显著影响 ;口服接种所诱生的抗 HBs阳转率及滴度低于肌肉注射与皮下注射。磷酸钙处理可降低核酸疫苗的用量 ,增加其安全性。结论 乙肝核酸疫苗 NV- HB/s能有效地诱导小鼠产生抗 HBs;在免疫后 6个月内 。 展开更多
关键词 免疫反应 乙型肝炎 核酸疫苗 免疫应答 口服接种
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