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几种滇产龙胆属Gentiana药用植物的DNA超级条形码研究
被引量:
10
1
作者
胡海粟
张德全
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第20期5260-5269,共10页
龙胆属Gentiana为龙胆科中一个具有重要药用价值但种属比较复杂的类群。该属包含众多药用植物种类,其物种鉴定比较困难。该研究利用Illumina Hisep 2500测序平台对几种滇产龙胆属药用植物(滇龙胆草G.rigescens、红花龙胆G.rhodantha和...
龙胆属Gentiana为龙胆科中一个具有重要药用价值但种属比较复杂的类群。该属包含众多药用植物种类,其物种鉴定比较困难。该研究利用Illumina Hisep 2500测序平台对几种滇产龙胆属药用植物(滇龙胆草G.rigescens、红花龙胆G.rhodantha和微籽龙胆G.delavayi)进行二代测序,经组装、注释得到3条完整的叶绿体全基因组序列,并结合已发表的粗茎秦艽G.crassicaulis数据,对DNA超级条形码在龙胆属中的物种鉴定进行初步研究。研究发现,滇龙胆草、红花龙胆、微籽龙胆的叶绿体全基因组总长相对较短(分别为146944、148992、148796 bp),共注释得到114个基因,包括78个蛋白编码基因、30个tRNA基因、4个rRNA基因及2个假基因,其叶绿体基因组比较保守。同时,以叶绿体全基因组作为DNA超级条形码,对4种滇产龙胆属药用植物进行物种鉴定。结果表明,这几种龙胆属植物均聚为明显的单系分支,且具有较高的支持率(100%)。这说明DNA超级条形码,在龙胆属这类复杂类群的物种鉴定上具有较大优势。该研究结果将为龙胆属药用植物的准确鉴定、开发利用及其资源保护提供科学依据。
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关键词
龙胆属
药用植物
叶绿体全基因组
dna
超级
条形码
物种鉴定
原文传递
题名
几种滇产龙胆属Gentiana药用植物的DNA超级条形码研究
被引量:
10
1
作者
胡海粟
张德全
机构
大理大学药学院
大理大学药物研究所
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第20期5260-5269,共10页
基金
国家自然科学基金项目(32060091,31660081)
云南省教育厅科学研究基金项目(2021Y402)。
文摘
龙胆属Gentiana为龙胆科中一个具有重要药用价值但种属比较复杂的类群。该属包含众多药用植物种类,其物种鉴定比较困难。该研究利用Illumina Hisep 2500测序平台对几种滇产龙胆属药用植物(滇龙胆草G.rigescens、红花龙胆G.rhodantha和微籽龙胆G.delavayi)进行二代测序,经组装、注释得到3条完整的叶绿体全基因组序列,并结合已发表的粗茎秦艽G.crassicaulis数据,对DNA超级条形码在龙胆属中的物种鉴定进行初步研究。研究发现,滇龙胆草、红花龙胆、微籽龙胆的叶绿体全基因组总长相对较短(分别为146944、148992、148796 bp),共注释得到114个基因,包括78个蛋白编码基因、30个tRNA基因、4个rRNA基因及2个假基因,其叶绿体基因组比较保守。同时,以叶绿体全基因组作为DNA超级条形码,对4种滇产龙胆属药用植物进行物种鉴定。结果表明,这几种龙胆属植物均聚为明显的单系分支,且具有较高的支持率(100%)。这说明DNA超级条形码,在龙胆属这类复杂类群的物种鉴定上具有较大优势。该研究结果将为龙胆属药用植物的准确鉴定、开发利用及其资源保护提供科学依据。
关键词
龙胆属
药用植物
叶绿体全基因组
dna
超级
条形码
物种鉴定
Keywords
Gentiana
medicinal species
complete chloroplast genome
dna
super-barcoding
species identification
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
几种滇产龙胆属Gentiana药用植物的DNA超级条形码研究
胡海粟
张德全
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
10
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