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DNA芯片技术研究进展 被引量:61
1
作者 李凌 马文丽 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 2000年第2期151-155,共5页
DNA芯片技术是近年来发展迅速的生物高技术 .其基本过程是采用寡核苷酸原位合成或显微打印手段 ,将大量探针片段有序地固化于支持物如硅芯片的表面 ,然后与扩增、标记的生物样品杂交 ,通过对杂交信号的检测分析 ,即可得出样品的遗传信... DNA芯片技术是近年来发展迅速的生物高技术 .其基本过程是采用寡核苷酸原位合成或显微打印手段 ,将大量探针片段有序地固化于支持物如硅芯片的表面 ,然后与扩增、标记的生物样品杂交 ,通过对杂交信号的检测分析 ,即可得出样品的遗传信息 .该技术不仅可以对遗传信息进行定性、定量分析 ,而且扩展到基因组研究和基因诊断等方面的应用 .尽管目前在硬件和软件上还面临一些困难 ,但其发展和应用的前景广阔 . 展开更多
关键词 dna芯片 基因诊断 基因组研究 技术原理 制备
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单核苷酸多态性的研究进展 被引量:51
2
作者 杜玮南 孙红霞 方福德 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期392-394,共3页
单核苷酸多态性 (SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的一种 DNA序列多态性。SNP现象在人类基因组中广泛存在 ,并具有很高的信息含量。目前已发现数万个 SNP标记 ,且有多个生物医学网站开辟了专页对其加以介绍。随着对 SN... 单核苷酸多态性 (SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的一种 DNA序列多态性。SNP现象在人类基因组中广泛存在 ,并具有很高的信息含量。目前已发现数万个 SNP标记 ,且有多个生物医学网站开辟了专页对其加以介绍。随着对 SNP检测和分析技术的进一步发展 ,尤其是与 DNA芯片等技术的结合 ,它已成为第三代遗传标记 ,初步满足对疾病相关基因定位研究的需要 ,尤其是对多基因遗传病高精度基因定位的要求 ,并将最终取代目前最常用的微卫星标记技术进入基因应用研究的领域。 展开更多
关键词 单核苷酸多态性 遗传标记 基因研究 dna芯片
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鼠疫耶尔森菌基因组进化与生态位适应研究 被引量:77
3
作者 周冬生 韩延平 +18 位作者 宋亚军 童宗中 裴德翠 戴二黑 张玲 包静月 李敏 崔百忠 张秀清 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期204-210,共7页
目的 探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系。方法 对 36株鼠疫耶尔森菌和 7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析 ,鉴定差异区段 (DFR) ,并对 2 6 0株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证 ,分析... 目的 探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系。方法 对 36株鼠疫耶尔森菌和 7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析 ,鉴定差异区段 (DFR) ,并对 2 6 0株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证 ,分析各DFR在这些鼠疫耶尔森菌中的分布 ,同时进行基因组岛分析。结果 在鼠疫耶尔森菌基因组中鉴定出 2 2个DFR ,基于DFR图谱 ,将鼠疫耶尔森菌中国分离株分成 14个基因组型。鼠疫耶尔森菌共有 2 1个基因组岛 ,其中 18个已存在于假结核杆菌中 ,余下 3个为鼠疫耶尔森菌独有。结论 探明了各基因组岛在鼠疫耶尔森菌和假结核耶尔森菌间的差异分布 ,探究了鼠疫耶尔森菌的起源进化 ;建立了鼠疫耶尔森菌基因组分型系统 ;建立了各基因组型别间的系统发育关系 ,初步揭示了鼠疫耶尔森菌基因组的进化规律及其与鼠疫耶尔森菌生态位适应和鼠疫疫源地扩展之间的关系 。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 dna芯片 基因组进化 生态位适应
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DNA条形码识别Ⅰ.DNA条形码研究进展及应用前景 被引量:62
4
作者 莫帮辉 屈莉 +3 位作者 韩松 何建伟 赵明 曾晓茂 《四川动物》 CSCD 北大核心 2008年第2期303-306,共4页
DNA条形码(DNA Barcoding)是近年来生物分类学中引人注目的发展热点。本文综述了DNA条形码的发展历史、识别原理以及公共数据库,并讨论了DNA条形码在检疫检验领域的应用前景。DNA条形码与DNA芯片技术的结合,将推动传统物种鉴定方法的更... DNA条形码(DNA Barcoding)是近年来生物分类学中引人注目的发展热点。本文综述了DNA条形码的发展历史、识别原理以及公共数据库,并讨论了DNA条形码在检疫检验领域的应用前景。DNA条形码与DNA芯片技术的结合,将推动传统物种鉴定方法的更新,可在检疫检验领域中实现非专家检定,这对进出口口岸生物监测具有重要的理论意义和应用价值。 展开更多
关键词 细胞色素C氧化酶亚单位I(CO I) dna条形码 dna芯片
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DNA分子标记技术及其原理 被引量:18
5
作者 许云华 沈洁 《连云港师范高等专科学校学报》 2003年第3期78-82,共5页
综述几种DNA分子标记技术:RFLP是用限制性内切酶切割不同个体基因组DNA后,含同源序列的酶切片段在长度上的差异,可靠性较高、但操作烦琐,信息含量低;染色体原位杂交是利用特异性核酸片段作探针,直接同染色体DNA片段杂交,在染色体上显示... 综述几种DNA分子标记技术:RFLP是用限制性内切酶切割不同个体基因组DNA后,含同源序列的酶切片段在长度上的差异,可靠性较高、但操作烦琐,信息含量低;染色体原位杂交是利用特异性核酸片段作探针,直接同染色体DNA片段杂交,在染色体上显示特异DNA,准确、直观,但技术非常复杂;PCR是模仿DNA在生物体内的自然复制过程来扩增DNA片段,安全性好,快速易行;RAPD是以人工合成的碱基顺序随机排列的寡核苷酸单链为引物,对所研究的基因组DNA进行PCR扩增,产生多态性的RAPD片段,可以检测多个基因位点,但不能识别杂合子位点;AFLP指纹技术是在RFLP与RAPD两种指纹技术基础上建立和发展起来的,有较高的稳定性,但对基因组纯度和反应条件要求较高;DNA芯片技术是一种以杂交测序基本理论为基础的新型生物技术,用于测序、基因表达、疾病诊断等,但造价、探针的密度与纯度还有待完善;小卫星DNA一般与RFLP技术结合以获得小卫星DNA指纹图谱,信息含量高,但它在染色体上分布不均匀;微卫星DNA既可用作探针获得指纹图谱,也可通过PCR方法进行微卫星位点多态性分析,但工作量大;ISSR即内部简单重复序列,也是一种新兴的分子标记技术,具有很好的稳定性和多态性。 展开更多
关键词 dna分子标记技术 RFLP 染色体原位杂交 PCR RAPD AFLP dna芯片 卫星指纹技术 ISSR
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水稻全生育期均一化cDNA文库的构建和鉴定 被引量:22
6
作者 储昭晖 彭开蔓 +3 位作者 张利达 周斌 魏君 王石平 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2002年第21期1656-1662,共7页
以优良杂交水稻的恢复系明恢63为材料,构建覆盖水稻基因组的cDNA文库,用于功能基因组的研究.选择水稻全生育期过程中的9个时期的不同组织和病原诱导的组织分别构建了15个定向cDNA文库.依据基因组DNA饱和杂交的原理,将从15个独立的cDNA... 以优良杂交水稻的恢复系明恢63为材料,构建覆盖水稻基因组的cDNA文库,用于功能基因组的研究.选择水稻全生育期过程中的9个时期的不同组织和病原诱导的组织分别构建了15个定向cDNA文库.依据基因组DNA饱和杂交的原理,将从15个独立的cDNA文库中提取的质粒混合,并与固定在磁珠上具有互补性的2份基因组DNA亲和体系饱和杂交,收集杂交组分中的质粒并重新转化大肠杆菌,获得全生育期均一化cDNA文库.该文库平均插入片段1.4 kb,含62000个克隆子.反向Northern杂交显示,该文库收集了众多表达丰度极低的基因以及特异表达的基因.对文库中随机的10750个克隆进行了测序,序列分析比较后获得6399条非重复的EST(expressed sequence tag)序列,非重复序列占59.5%,.目前,用该文库制作的cDNA芯片已被用于功能基因组的研究. 展开更多
关键词 水稻 均一化 Cdna文库 dna芯片 全生育期 序列测定 功能基因组
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在DNA芯片平台上探测AIV不同亚型cDNA 被引量:33
7
作者 王秀荣 邓国华 +5 位作者 于康震 石锐 刘丽玲 乔传玲 陈化兰 孔宪刚 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期394-398,共5页
对以基因芯片技术为基础的检测H5、H7、H9亚型禽流感病毒的快速诊断技术进行了研究。试验中所使用的病毒为A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)、A/African starling/983/79(H7N1)和 A/Turkey/Wisconsin/1/66(H9N2)。通过RT-PCR获得大约500... 对以基因芯片技术为基础的检测H5、H7、H9亚型禽流感病毒的快速诊断技术进行了研究。试验中所使用的病毒为A/Goose/Guangdong/1/96(H5N1)、A/African starling/983/79(H7N1)和 A/Turkey/Wisconsin/1/66(H9N2)。通过RT-PCR获得大约500 bp的禽流感病毒基因cDNAs片段,克隆,从重组质粒扩增DNA片段,并点到玻璃载体上,制成芯片。在病毒RNA反转录过程中,用Cy5标记样品 cDNAs。样品 cDNAs是一个包括禽流感病毒HA和M基因的混合物。依据M基因鉴别型,依据HA基因鉴别亚型。扫描芯片上探针结合位点,杂交信号与预期设想基本一致。结果显示,DNA芯片技术可以提供一种有效的AIV诊断方法。 展开更多
关键词 H9亚型禽流感病毒 鉴别 M基因 dna芯片 快速诊断技术 基因芯片技术 HA基因 AIV 禽流感病毒 H5N1
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DNA芯片制作原理及其杂交信号检测方法 被引量:33
8
作者 张天浩 张春平 +1 位作者 张光寅 陈瑞阳 《生物工程进展》 CAS CSCD 2000年第2期64-68,共5页
文章讨论了DNA芯片的制作原理和杂交信号的检测方法。依其结构 ,DNA芯片可分为两种形式 ,DNA阵列和寡核苷酸微芯片。DNA芯片的制作方法主要有光导原位合成法和自动化点样法。DNA芯片与标记的探针或DNA样品杂交 ,并通过探测杂交信号谱型... 文章讨论了DNA芯片的制作原理和杂交信号的检测方法。依其结构 ,DNA芯片可分为两种形式 ,DNA阵列和寡核苷酸微芯片。DNA芯片的制作方法主要有光导原位合成法和自动化点样法。DNA芯片与标记的探针或DNA样品杂交 ,并通过探测杂交信号谱型来实现DNA序列或基因表达的分析。适应于DNA芯片的发展 ,同时出现了许多新型的杂交信号检测方法。主要有激光荧光扫描显微镜、激光扫描共焦显微镜、结合使用CCD相机的荧光显微镜、光纤生物传感器、化学发生法、光激发磷光物质存储屏法、光散射法等。 展开更多
关键词 dna芯片 分子杂交 信号检测 制作原理 杂交信号
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慢性浅表性胃炎脾虚证患者与健康人物质能量代谢基因差异表达研究 被引量:42
9
作者 杨泽民 陈蔚文 王颖芳 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期159-163,共5页
目的分析慢性浅表性胃炎脾虚证患者体内脂类、蛋白质、糖类和核酸代谢情况,从物质能量代谢的角度探讨脾虚证的病理发生机制。方法选择4例2004年6月—2005年3月就诊于广州中医药大学一附院和广东省中医院的慢性浅表性胃炎脾虚证患者,选... 目的分析慢性浅表性胃炎脾虚证患者体内脂类、蛋白质、糖类和核酸代谢情况,从物质能量代谢的角度探讨脾虚证的病理发生机制。方法选择4例2004年6月—2005年3月就诊于广州中医药大学一附院和广东省中医院的慢性浅表性胃炎脾虚证患者,选择广州中医药大学健康人4名,钳取患者及健康人胃黏膜进行DNA芯片实验,利用BRB ArrayTools和IPA软件对DNA芯片双通道数据进行数据挖掘和生物信息学分析。结果获得15个与物质能量代谢相关差异基因,占总差异表达基因(20个)的75%,其中上调基因1个,下调基因14个,11个基因为酶基因。其中脂类代谢相关差异基因有ACAA2和CYP20A1,表现为脂肪酸分解和胆固醇转化降低;蛋白质代谢相关差异基因有ALDH9A1、ASL、ASS1、PCYOX1L、RPS28、UBE2D2、UBXN1、B3GNT1、GCNT1和PPP1R3C,表现为影响自主神经、尿素循环等生物学过程的氨基酸代谢降低,蛋白质合成降低,错误折叠蛋白泛素化降解增加,翻译后糖基化和磷酸化修饰降低;糖类代谢相关差异基因有PPP1R3C、B3GNT1和GCNT1,表现为糖原和聚糖合成降低;核酸代谢相关差异基因有RMI1、SMARCD3和PARP1,表现为DNA复制和转录降低,DNA损伤修复增加。结论慢性浅表性胃炎脾虚证患者体内脂类、蛋白质、糖类和核酸代谢水平明显降低,并且主要表现为酶基因表达下调,推测此可能是导致脾虚证营养代谢障碍的重要机制之一。 展开更多
关键词 脾虚证 dna芯片 物质代谢 慢性浅表性胃炎
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用DNA芯片快速检测结核分支杆菌对利福平的耐药性 被引量:35
10
作者 景奉香 胡忠义 +2 位作者 孙悦 孙斌 赵建龙 《中华结核和呼吸杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第9期551-554,共4页
目的 研制一种新型DNA芯片 ,用于结核分支杆菌对利福平的耐药性快速检测。方法 根据结核分支杆菌rpoB基因的序列信息设计探针并制作DNA芯片 ,PCR扩增并荧光标记包含结核分支杆菌rpoB基因突变热点的目的片段 ,与芯片杂交 ,同时以DNA测... 目的 研制一种新型DNA芯片 ,用于结核分支杆菌对利福平的耐药性快速检测。方法 根据结核分支杆菌rpoB基因的序列信息设计探针并制作DNA芯片 ,PCR扩增并荧光标记包含结核分支杆菌rpoB基因突变热点的目的片段 ,与芯片杂交 ,同时以DNA测序法为对照。结果  17株随机抽取的耐利福平结核分支杆菌菌株有 14株可用DNA芯片检测出来 ,效率可达 83%;患者痰液中少量的DNA足够进行芯片检测 ,无须进行培养。结论 用DNA芯片来检测结核分支杆菌对利福平的耐药性具有较高的特异性和灵敏度 ,该法快速、精确 。 展开更多
关键词 结核分支杆菌 RPOB基因 利福平 药物耐受性 dna芯片
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慢性浅表性胃炎脾虚与脾胃湿热证患者物质能量代谢基因差异表达研究 被引量:41
11
作者 杨泽民 陈蔚文 王颖芳 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期1180-1187,共8页
目的分析慢性浅表性胃炎脾虚证与脾胃湿热证患者体内脂类、蛋白质、核酸、糖类、微量元素和能量代谢情况,从物质能量代谢的角度探讨脾虚证病理发生机制。方法选择2004年6月—2005年3月就诊于广州中医药大学第一附属医院和广东省中医院... 目的分析慢性浅表性胃炎脾虚证与脾胃湿热证患者体内脂类、蛋白质、核酸、糖类、微量元素和能量代谢情况,从物质能量代谢的角度探讨脾虚证病理发生机制。方法选择2004年6月—2005年3月就诊于广州中医药大学第一附属医院和广东省中医院慢性浅表性胃炎患者8例,其中脾虚证和脾胃湿热证患者各4例,取两组胃黏膜进行DNA芯片实验,利用BRBArrayTools和IPA软件对DNA芯片双通道数据进行数据挖掘和生物信息学分析。结果获得与物质能量代谢相关且表达倍数>2的显著差异表达基因56个,其中上调基因11个,下调基因45个。其中与脂类代谢相关的基因有CRLS1、LRP11、FUT9、GPCPD1、PIGL、SULT1A4、B3GNT1、ST8SIA4和ACADVL,主要涉及脂肪酸、胆固醇、磷脂和糖脂的代谢;与蛋白质代谢相关的基因有ASR-GL1、AARSD1、EBNA1BP2、PUM2、MRPL52、C120RF65、PSMB8、PSME2、UBA7、RNF11、FBXO44、ZFYVE26、CHMP2A、SSR4、SNX4、RAB3B、RABL2A、GOLGA2、KDELR1、PHPT1、ACPP、PTPRF、CRKL、HDAC7、ADPRHL2、B3GNT1、ST8SIA4、DDOST和FUT9,主要涉及到蛋白质的生物合成、蛋白质泛素化、靶向输送和翻译后修饰过程;与核酸代谢相关的基因有DFFB、FLJ35220、TOP2A、SF3A3、CREB3、CRTC2、NR1D2、MED6、GTF2IRD1、C1ORF83、ZNF773和ZMYND11,主要涉及DNA复制与修复,转录调节等;与糖类代谢相关的基因有AGL、B3GNT1、FUT9、ST8SIA4、SULT1A4、DDOST和PIGL,主要涉及糖原的分解和糖复合物的合成;与微量元素代谢相关的基因有COMMD1、SLC39A6、FTL、CHRFAM7A、SCGN和S100A6,主要涉及铜离子、锌离子、铁离子和钙离子代谢;与能量代谢相关的基因有AK3和COX7B,涉及线粒体结构和氧化磷酸化过程。结论脾虚证患者体内脂类、蛋白质、核酸、糖类、微量元素和能量代谢水平明显降低,这可能是导致脾虚证疾病发生的重要机制。 展开更多
关键词 慢性浅表性胃炎 脾虚证 湿热证 dna芯片 物质代谢 能量代谢
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面向21世纪的微电子技术 被引量:21
12
作者 王阳元 张兴 《世界科技研究与发展》 CSCD 1999年第4期4-11,共8页
本文对21 世纪微电子技术的发展趋势作了一个展望。本文认为21 世纪初的微电子技术仍将以硅基 C M O S 电路为主流工艺,但将突破目前所谓的物理“限制”,继续快速发展;集成电路将逐步发展成为集成系统;微电子技术将与其他... 本文对21 世纪微电子技术的发展趋势作了一个展望。本文认为21 世纪初的微电子技术仍将以硅基 C M O S 电路为主流工艺,但将突破目前所谓的物理“限制”,继续快速发展;集成电路将逐步发展成为集成系统;微电子技术将与其他技术结合形成一系列新的增长点,例如微机电系统( M E M S) 、 D N A 芯片等将得到突飞猛进的发展。具体地,超微细光刻技术、虚拟工厂技术、铜互连及低κ互连绝缘介质、高κ栅绝缘介质、 S O I 技术等将在近几年内得到快速发展。21 展开更多
关键词 微电子技术 集成系统 微光机电系统 dna芯片 21世纪 发展趋势 CMOS电路
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DNA芯片技术用于贝母的基因分型和种类鉴别(英文) 被引量:37
13
作者 蔡佩欣 胡学善 +4 位作者 黄文秀 陈士林 方宏勋 肖培根 杨梦苏 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期185-190,共6页
目的 通过对贝母几个种遗传多态性的研究来开发在分子水平上用于鉴别贝母基因型及不同种类的DNA芯片技术。方法 用PCR扩增法和DNA直接测序法确定核苷酸多态性 ,用DNA芯片进行基因检测。结果 首先提取来自多种贝母根茎的基因组DNA ,对... 目的 通过对贝母几个种遗传多态性的研究来开发在分子水平上用于鉴别贝母基因型及不同种类的DNA芯片技术。方法 用PCR扩增法和DNA直接测序法确定核苷酸多态性 ,用DNA芯片进行基因检测。结果 首先提取来自多种贝母根茎的基因组DNA ,对 2 6SrDNA基因D2与D3区的多态性片段进行扩增和测序 ,然后将不同种属多态性片段的特异性寡核苷探针点置于经多聚赖氨酸处理包被的芯片。用来自不同种贝母的荧光素标记的PCR产物与DNA芯片进行杂交 ,可在芯片特定位置检测到不同种贝母的荧光信号。结论 本研究显示DNA芯片技术可为植物种属的验证与质量控制提供一种快速。 展开更多
关键词 dna芯片 基因型检测 贝母 种类鉴别
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DNA芯片技术及其应用 被引量:25
14
作者 安海谦 卢圣栋 《生物工程进展》 CSCD 1998年第2期37-40,共4页
DNA芯片技术及其应用安海谦卢圣栋(中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室)DNA芯片(DNAChip)又被称为生物集成模片,DNA阵列或寡核苷酸微芯片(Bio-Chip,DNAarrays,ali... DNA芯片技术及其应用安海谦卢圣栋(中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室)DNA芯片(DNAChip)又被称为生物集成模片,DNA阵列或寡核苷酸微芯片(Bio-Chip,DNAarrays,aligonucleotidemicro... 展开更多
关键词 dna芯片 制作原理 基因诊断 基因组 肿瘤
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百合科贝母属药用植物分类研究进展 被引量:31
15
作者 王书军 高文远 +1 位作者 于琳 肖培根 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第16期1609-1614,共6页
对近年来关于贝母属Fritillaria药用植物的分类学研究进行了综述。贝母属药用植物的分类学主要从3个方面进行研究:根据传统的形态学特征进行分类,根据植物中的特征性化学成分进行分类,分子水平上的DNA芯片技术在基因分型和种类鉴别上的... 对近年来关于贝母属Fritillaria药用植物的分类学研究进行了综述。贝母属药用植物的分类学主要从3个方面进行研究:根据传统的形态学特征进行分类,根据植物中的特征性化学成分进行分类,分子水平上的DNA芯片技术在基因分型和种类鉴别上的应用。通过比较发现,DNA芯片技术可为贝母属植物种属的验证与质量控制提供一种快速、高通量的检测工具,是最有发展前景的用于植物种类鉴别的方法。DNA芯片技术在植物种类鉴别上的应用为分子水平上的植物分类学研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 贝母 分类学 形态 特征性化学成分 dna芯片
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生物芯片技术的发展与应用 被引量:21
16
作者 许俊泉 贺学忠 +2 位作者 周玉祥 刘理天 程京 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 1999年第24期2600-2606,共7页
生物芯片 (biochip)技术是 90年代初期发展起来的一门新兴技术 .通过微加工技术制作的生物芯片 ,可以把成千上万乃至几十万个生命信息集成在一个很小的芯片上 ,达到对基因、抗原和活体细胞等进行分析和检测的目的 .用这些生物芯片制作... 生物芯片 (biochip)技术是 90年代初期发展起来的一门新兴技术 .通过微加工技术制作的生物芯片 ,可以把成千上万乃至几十万个生命信息集成在一个很小的芯片上 ,达到对基因、抗原和活体细胞等进行分析和检测的目的 .用这些生物芯片制作的各种生化分析仪和传统仪器相比较具有体积小、重量轻、便于携带、无污染、分析过程自动化、分析速度快、所需样品和试剂少等诸多优点 .这类仪器的出现将给生命科学研究、疾病诊断、新药开发、生物武器战争、司法鉴定、食品卫生监督、航空航天等领域带来一场革命 .因此 ,生物芯片现已成为各国学术界和工业界所瞩目的一个研究热点 . 展开更多
关键词 生物芯片 基因诊断 生物信息 微加工 dna芯片
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EST技术及其应用综述 被引量:15
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作者 于凤池 《中国农学通报》 CSCD 2005年第2期54-58,共5页
EST(Expressed Sequence Tag,EST)指的是一组cDNA的部分序列,一般长度为150~500bp,是由大规模随机挑取的cDNA克隆测序得到的组织或细胞基因组的表达序列标签.一个EST代表生物某一时期的某种组织或细胞的一个表达基因.主要综述了EST技... EST(Expressed Sequence Tag,EST)指的是一组cDNA的部分序列,一般长度为150~500bp,是由大规模随机挑取的cDNA克隆测序得到的组织或细胞基因组的表达序列标签.一个EST代表生物某一时期的某种组织或细胞的一个表达基因.主要综述了EST技术的原理方法以及EST技术在构建遗传学图谱、分离与鉴定新基因、基因表达谱的研究、比较基因组学的研究和制备DNA芯片等方面的应用. 展开更多
关键词 EST技术 基因表达谱 细胞基因 遗传学 新基因 dna芯片 测序 比较基因组学 表达基因 表达序列标签
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PRRS-CSF-PCV2诊断DNA芯片构建研究 被引量:22
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作者 肖驰 曹三杰 +3 位作者 文心田 张焕容 肖国生 黄小波 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期799-803,共5页
本研究旨在研制CSF-PRRS-PCV2诊断DNA芯片。根据各病毒序列选取靶标,制备相应探针,并构建DNA芯片。结果表明:该芯片能同时检测PRRS、CSF和PCV2感染,并能区分PRRSV欧洲型和美洲型毒株,芯片检测阳性判读标准为SNR≥1.5(信号总强度模式量化... 本研究旨在研制CSF-PRRS-PCV2诊断DNA芯片。根据各病毒序列选取靶标,制备相应探针,并构建DNA芯片。结果表明:该芯片能同时检测PRRS、CSF和PCV2感染,并能区分PRRSV欧洲型和美洲型毒株,芯片检测阳性判读标准为SNR≥1.5(信号总强度模式量化)或信号强度≥1 000(信号中位值模式量化)。该芯片具有特异性高、灵敏度高和可重复利用的优点。应用PRRS-CSF-PCV2诊断DNA芯片检测20份临床病料发现PRRSV、CSFV和PCV2单独感染分别为0、15%和5%,PRRSV与CSFV、PRRSV与PCV2、PRRSV、PCV2和CS-FV混合感染分别为15%、35%和15%。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 猪瘟病毒 猪圆环病毒2型 dna芯片 诊断
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DNA条形码识别 Ⅲ.媒介蚊类DNA条形码芯片的初步研究 被引量:26
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作者 赵明 谭玲 +3 位作者 莫帮辉 刘伟 王仕应 曾晓茂 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期99-103,共5页
目的利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的医学媒介蚊类鉴定方法。方法以蚊科5属15种,共30个样本为研究材料,获取其DNA条形码信息(COⅠ基因片段序列),采用基因块motif技术,搜索15个样本的同源保守基因序列,制作虚拟DNA条形码芯... 目的利用DNA条形码信息研制DNA芯片,建立快速高效的医学媒介蚊类鉴定方法。方法以蚊科5属15种,共30个样本为研究材料,获取其DNA条形码信息(COⅠ基因片段序列),采用基因块motif技术,搜索15个样本的同源保守基因序列,制作虚拟DNA条形码芯片。虚拟电子杂交30个样本,应用软件Bio-Edit计算属、种及种内个体间的同一性,应用phylip3.66软件以最大简约法分别对杂交结果和原序列进行聚类分析比较。结果选择78个DNA片段制作一张虚拟DNA条形码芯片,计算属间的平均同一性为0.75,同一属内种间的平均同一性为0.84,种内个体间的平均同一性为0.98,聚类分析结果一致。结论研制的虚拟DNA芯片能够鉴定本研究中的15种蚊虫,利用DNA条形码信息,设计DNA芯片在理论上可行。 展开更多
关键词 CO I基因 dna条形码 dna芯片 蚊虫
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不同转移潜能人肝癌细胞系转录因子活性差异分析 被引量:21
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作者 潘奇 王鲁 +3 位作者 孙惠川 刘银坤 叶胜龙 汤钊猷 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期37-40,共4页
目的分析不同转移潜能人肝癌细胞系细胞核内转录因子活性的差异,筛选与肝癌转移相关的转录因子。方法应用转录因子活性芯片技术,在功能水平分析三种不同转移潜能人肝癌细胞系(Hep3B、 MHCC97L和MHCC97H)细胞核内转录因子活性的差异,并... 目的分析不同转移潜能人肝癌细胞系细胞核内转录因子活性的差异,筛选与肝癌转移相关的转录因子。方法应用转录因子活性芯片技术,在功能水平分析三种不同转移潜能人肝癌细胞系(Hep3B、 MHCC97L和MHCC97H)细胞核内转录因子活性的差异,并用电泳迁移率变动分析和蛋白免疫印迹实验验证芯片结果。结果在345个候选的转录因子中,筛选出7个活性差异转录因子。随人肝癌细胞转移潜能的增高(Hep3B<MHCC97L<MHCC97H),活性上调的转录因子有5个,包括p53、缺氧诱导因子-1α(HIF- 1α)、核因子k b、信号传导及转录活化因子3(stat3)和Spl;活性下调的转录因子有2个,包括Rb和Smad3。结论转录因子活性异常与肝癌转移密切相关,本实验筛选出的转录因子可能有助于揭示肝癌转移的分子机制,并寻找新的预测指标及干预治疗的靶点。 展开更多
关键词 肝细胞 肿瘤转移 转录因子 蛋白质芯片 dna芯片 细胞株
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