肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,具有发病率高、预后差、死亡率高等特点。其中,DNA甲基化在HCC的发生发展中起重要作用。本研究从肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中获取...肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,具有发病率高、预后差、死亡率高等特点。其中,DNA甲基化在HCC的发生发展中起重要作用。本研究从肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中获取HCC甲基化数据、RNA-seq数据和临床预后信息。用MethylMix R包分析肿瘤组织和正常组织的差异甲基化状态,获得338个与疾病相关的甲基化驱动基因。利用DAVID和ConsensusPathDB工具对上述基因进行功能和通路富集分析。通过单因素和多因素Cox回归分析构建了基于5个甲基化驱动基因表达谱的预后风险模型。同时,通过甲基化和基因表达联合生存分析进一步探讨这5个基因及其甲基化位点的预后价值。本研究将对HCC的早期诊断和预后评估提供新的标志物和新思路。展开更多
