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题名基于比较基因组学的簸箕柳DNA模体预测
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作者
徐逸卿
毕长伟
张福全
杜思源
蒋安纳
业宁
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机构
南京林业大学信息科学技术学院
东南大学计算机科学与工程学院
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出处
《北方园艺》
CAS
北大核心
2018年第6期67-73,共7页
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基金
国家重点基础研究发展计划资助项目(2012CB114505)
国家重点研发计划资助项目(2016YFD0600101)
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文摘
以已完成全基因组测序及组装的模式生物拟南芥和具有很高研究价值的园艺植物柳树(Salix)的全基因组测序为数据源,采用基于位置的基因序列匹配方法,研究了新测序物种簸箕柳(Salix suchowensis)的DNA模体序列,以期为进一步了解柳树乃至林木的基因调控网络提供参考依据。结果表明:此次预测的结果与手工验证的部分簸箕柳的DNA模体一致,该研究发布的基于簸箕柳全基因组的DNA模体预测结果对于杨柳科植物的研究具有重要的意义。
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关键词
簸箕柳
dna模体
比较基因组学
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Keywords
Salix suchowensis
dna motif
comparative genetics
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分类号
S792.12
[农业科学—林木遗传育种]
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题名差分隐私DNA模体识别安全共享平台的设计与实现
被引量：2
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作者
魏裕阳
马凯
吴响
毛亚青
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机构
徐州医科大学医学信息学院
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出处
《计算机测量与控制》
2018年第12期234-237,共4页
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基金
江苏省高等学校自然科学研究面上项目(18KJB520049)
徐州市科技计划项目(XM13B021)
国家安全生产重大事故防治关键技术科技项目(Jiangsu-0006-2016AQ)
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文摘
在数据共享平台进行DNA模体识别的过程中,如何防止个体信息泄露已成为该领域发展的研究热点;对此,设计并实现了基于差分隐私的DNA模体识别安全共享平台,内置多种满足差分隐私保护模型的DNA模体识别算法,实现数据源选择、算法选择、隐私预算设置、结果评估、图形化结果展示等功能;同时,除具备对内置DNA数据的模体识别外,还允许科研人员自主上传、共享DNA数据库,并对共享的DNA数据进行差分隐私模体识别,为科研工作人员提供安全可靠的基因序列分析研究平台和数据共享平台;通过平台测试证明,安全共享平台能够实现DNA数据的有效识别和安全共享,设计方案有效可行。
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关键词
dna模体识别
差分隐私
安全共享
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Keywords
dna motif finding
differential privacy
secure sharing
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分类号
TP27
[自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
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