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应用AFLP分子标记鉴定苹果品种 被引量:92
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作者 祝军 王涛 +2 位作者 赵玉军 张文 李光晨 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期102-106,共5页
在建立苹果品种AFLP分析体系的基础上 ,从 6 8对引物中筛选出了 4对多态性高、分辨能力强的引物 (即P32M4 6、P4 4M53、P59M4 1和P79M6 1)。分析了P32M4 6引物绘制的我国 2 5个苹果重要品种的AFLP指纹图谱的遗传多样性 ,确定了各供试品... 在建立苹果品种AFLP分析体系的基础上 ,从 6 8对引物中筛选出了 4对多态性高、分辨能力强的引物 (即P32M4 6、P4 4M53、P59M4 1和P79M6 1)。分析了P32M4 6引物绘制的我国 2 5个苹果重要品种的AFLP指纹图谱的遗传多样性 ,确定了各供试品种的差异带 ,区分了供试的 2 5个苹果品种。对AFLP分析的关键步骤进行了讨论 ,并对生产上应用AFLP技术检测苹果品种真实性和纯度作了展望。 展开更多
关键词 AFLP dna指纹 苹果鉴定 遗传多样性
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遗传标记及其在作物品种鉴定中的应用 被引量:67
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作者 梁明山 曾宇 +2 位作者 周翔 侯留记 李霞 《植物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期257-265,共9页
本文评述了用于作物品种鉴定的形态标记 (morphologicalmarkers)、细胞标记 (cytologicalmarkers)、生化标记 (biochemicalmarkers)、分子标记 (molecularmarkers)的优缺点。重点评述了分子标记在作物品种鉴定中的应用。文中除对蛋白质... 本文评述了用于作物品种鉴定的形态标记 (morphologicalmarkers)、细胞标记 (cytologicalmarkers)、生化标记 (biochemicalmarkers)、分子标记 (molecularmarkers)的优缺点。重点评述了分子标记在作物品种鉴定中的应用。文中除对蛋白质电泳指纹图谱———同工酶和贮藏蛋白 (包括醇溶性蛋白、清蛋白、谷蛋白、球蛋白等 )电泳产生的指纹图谱的应用外 ,较详细地介绍了近年来DNA指纹图谱技术 ;包括限制片段长度多态性 (restrictionfragmentlengthpolymorphism ,简称RFLP)、随机扩增多态性DNA (randomamplifiedpolymorphicDNA ,简称RAPD)、小卫星DNA(minisatelliteDNA)、微卫星DNA(microsatelliteDNA) ,简单重复序列间扩增 (intersimplesequencerepeats,简称ISSR) ,扩增片段长度多态性 (amplifiedfragmentlengthpolymor phism ,简称AFLP)以及CAPS (cleavedamplifiedpolymorphicsequences)和SNPS (singlenucleotidepolymor phisms)对作物品种鉴定和新品种登记 ,品种纯度和真实性的检验以及品种间亲缘关系的探讨和在分类研究中的贡献等。 展开更多
关键词 品种鉴定 生物指纹 蛋白质电泳 dna指纹 作物
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建立小麦品种DNA指纹的方法研究 被引量:66
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作者 王立新 李云伏 +6 位作者 常利芳 黄岚 李宏博 葛玲玲 刘丽华 姚骥 赵昌平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1738-1740,共3页
建立小麦DNA指纹对遗传资源评价、品种权益保护、种子质量鉴定具有重要的意义。本研究采用15个SSR标记和20个AFLP-SCAR标记,分析了来自我国不同麦区的455个小麦品种,证明用两种分子标记建立小麦DNA指纹可以更加全面地反应品种的遗传多... 建立小麦DNA指纹对遗传资源评价、品种权益保护、种子质量鉴定具有重要的意义。本研究采用15个SSR标记和20个AFLP-SCAR标记,分析了来自我国不同麦区的455个小麦品种,证明用两种分子标记建立小麦DNA指纹可以更加全面地反应品种的遗传多样性。从而,在提出采用SSR标记与AFLP-SCAR标记构建小麦品种DNA指纹的技术路线的基础上,建立了构建DNA指纹的方法模式。按此方法获得的品种指纹代码可以经条形码软件转换为条形码,使为每个品种建立身份证的设想成为可能。 展开更多
关键词 小麦 dna指纹 SSR标记 AFLP-SCAR标记
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比较三种DNA指纹分析方法在玉米品种纯度及真伪鉴定中的应用 被引量:62
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作者 王凤格 赵久然 +2 位作者 郭景伦 佘花娣 陈刚 《分子植物育种》 CAS CSCD 2003年第5期655-661,共7页
本项研究归纳出三种DNA指纹分析方法 ,即特征谱带法、引物组合法和核心引物组合法 ,并比较了这三种方法在玉米品种纯度及真伪鉴定中的应用价值。在玉米基因组上均匀选取 6 2对SSR引物对 6 0个玉米自交系进行分析。 6 2对SSR引物共检测到... 本项研究归纳出三种DNA指纹分析方法 ,即特征谱带法、引物组合法和核心引物组合法 ,并比较了这三种方法在玉米品种纯度及真伪鉴定中的应用价值。在玉米基因组上均匀选取 6 2对SSR引物对 6 0个玉米自交系进行分析。 6 2对SSR引物共检测到 2 38个等位基因变异 ,平均每个位点的等位基因数4 0 8个 ,平均多态性信息量 (PIC) 0 6 12 ,平均标记索引系数 (MI) 2 5 8,评估引物多态性的三个指标并不完全一致。三种方法的比较研究表明 ,特征谱带法仅在固定的材料范围内有效 ,当扩大范围后 ,原来具有特征带的样品往往不再具有特征带 ,且需要筛选大量的引物 ,效率很低 ;引物组合法通过不同引物的有限组合 ,完全可以区分全部材料 ,避免了筛选大量引物的工作 ;核心引物组合法是引物组合法的扩展 ,不同实验室通过使用固定的一套核心引物组合 ,其指纹图谱可以相互比较和整合 ,为玉米DNA指纹图谱分析的标准化奠定基础。 展开更多
关键词 dna指纹 玉米 品种 纯度鉴定 真伪鉴定 特征谱带法 引物组合法 核心引物组合法
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玉米杂交种DNA指纹图谱及其在亲子鉴定中的应用 被引量:60
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作者 李晓辉 李新海 +4 位作者 高文伟 田清震 李明顺 马凤鸣 张世煌 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期386-391,共6页
采用79对SSR引物分析了86个玉米杂交种的72份亲本自交系的遗传多态性,从中筛选出扩增带型清晰、稳定的50对引物用于构建86个杂交种的DNA指纹图谱数据库,进而确定10对核心引物和判别标准用于亲子鉴定研究。结合玉米SSR分子标记检测技术... 采用79对SSR引物分析了86个玉米杂交种的72份亲本自交系的遗传多态性,从中筛选出扩增带型清晰、稳定的50对引物用于构建86个杂交种的DNA指纹图谱数据库,进而确定10对核心引物和判别标准用于亲子鉴定研究。结合玉米SSR分子标记检测技术和单籽粒DNA快速提取方法,DNA指纹数据库和判别标准可有效地用于玉米杂交种的亲子鉴定。 展开更多
关键词 玉米 SSR标记 dna指纹 亲子鉴定
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杏品种的RAPD分析 被引量:38
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作者 吴树敬 陈学森 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期107-111,共5页
实验从S系列(Sangon公司)100个引物中筛选出能稳定扩增的18个引物,用这些引物首次对新世纪与红丰等20个杏品种进行了扩增,均具有多态性。共扩增出218条带,106条具有多态性,多态性比例为48.6%;建立了红丰及新世纪等优新品种的DNA指纹图谱... 实验从S系列(Sangon公司)100个引物中筛选出能稳定扩增的18个引物,用这些引物首次对新世纪与红丰等20个杏品种进行了扩增,均具有多态性。共扩增出218条带,106条具有多态性,多态性比例为48.6%;建立了红丰及新世纪等优新品种的DNA指纹图谱,找到了它们的特异谱带。利用特异谱带结合DNA指纹,可将参试品种鉴别出来。同时利用STATISTIC软件,根据RAPD标记相似系数采用UPGAM聚类策略,对20个杏品种进行了聚类分析。在LD=0.4时划等值线,将参试品种分为7类。 展开更多
关键词 RAPD 特异谱带 dna指纹 品种鉴定
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用SSR探针进行番茄品种的DNA指纹分析 被引量:28
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作者 栾雨时 安利佳 +2 位作者 黄百渠 张文俊 何孟元 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第1期51-53,共3页
用放射性同位素γ-32P-ATP标记人工合成的简单重复序列(GATA)4,与经DraⅠ酶切的8个番茄品种的DNA进行Southern杂交,得到的DNA指纹在品种间差异很大,在品种内单株间无差异。经统计计算,任意两个品... 用放射性同位素γ-32P-ATP标记人工合成的简单重复序列(GATA)4,与经DraⅠ酶切的8个番茄品种的DNA进行Southern杂交,得到的DNA指纹在品种间差异很大,在品种内单株间无差异。经统计计算,任意两个品种间具有完全相同DNA指纹的概率为1.1×10-4,呈现了高度的品种特异性。 展开更多
关键词 番茄 SSR探针 dna指纹 品种鉴定 简单重复序列
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玉米品种DNA指纹数据库构建的标准化规范 被引量:42
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作者 王凤格 赵久然 +6 位作者 戴景瑞 郭景伦 原亚萍 王璐 易红梅 孙世贤 吕波 《分子植物育种》 CAS CSCD 2007年第1期128-132,共5页
为了保证玉米品种DNA指纹库构建的标准化,从建库标记、检测平台、试剂、样品、评估程序、数据整合、模式库、扩展库、随机盲测等九个方面进行了全面的规范:(1)通过对不同分子标记的比较,确定SSR标记作为建库标记;(2)通过对不同DNA指纹... 为了保证玉米品种DNA指纹库构建的标准化,从建库标记、检测平台、试剂、样品、评估程序、数据整合、模式库、扩展库、随机盲测等九个方面进行了全面的规范:(1)通过对不同分子标记的比较,确定SSR标记作为建库标记;(2)通过对不同DNA指纹检测方法的比较,确定毛细管电泳结合多色荧光检测方法作为DNA指纹片段分析方法;(3)规范了DNA、引物、Taq酶等试剂质量,以保证数据的稳定性和可重复性;(4)规范了样品来源、样品类型及分析样品数量;(5)确定评估品种的数量及引物的取舍标准;(6)为解决不同来源DNA指纹数据的有效整合问题,提出了固定一套核心引物、提供标准品种、提供标准DNA、确定引物等位基因BIN、规定对异常带型数据处理方式、规定数据的编码方式等6个解决策略;(7)规范了构建模式库的材料名单、来源及构建方式;(8)规范了构建扩展库的材料来源及构建方式;(9)进行数据库数据随机盲测,以评估入库数据质量。以上规范将为不同单位合作开展大规模的DNA指纹库构建研究奠定基础。 展开更多
关键词 玉米 dna指纹 数据库
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基于荧光检测技术的小麦品种SSR鉴定体系的建立 被引量:41
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作者 郑永胜 张晗 +6 位作者 王东建 孙加梅 王雪梅 段丽丽 李华 王玮 李汝玉 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第19期3725-3735,共11页
【目的】建立基于SSR荧光标记的小麦品种DNA指纹鉴定体系,为中国小麦育成品种鉴定提供高通量技术手段。【方法】收集已定位到小麦21条染色体上的SSR标记引物,通过PCR扩增和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测技术,筛选在中国小麦育成品种中多... 【目的】建立基于SSR荧光标记的小麦品种DNA指纹鉴定体系,为中国小麦育成品种鉴定提供高通量技术手段。【方法】收集已定位到小麦21条染色体上的SSR标记引物,通过PCR扩增和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测技术,筛选在中国小麦育成品种中多态性高的标记,对筛选出的引物5′末端利用6-FAM、HEX、ROX和TAMRA 4种荧光染料之一进行标记,利用DNA分析仪对扩增产物的峰型进行评价并检测不同等位变异的扩增片段大小,选择峰型简单易读、多态性高、较均匀分布到21条染色体上的标记,确定不同位点等位变异的大小及相应的参照品种,建立基于荧光SSR标记的高通量小麦品种鉴定体系。【结果】利用2 438对SSR标记对8份植物学性状差异大的小麦育成品种进行初步筛选,共筛选出260对多态性较高、扩增稳定的SSR引物。利用上述260对引物对48份小麦品种继续进行复筛,选出130对扩增稳定、多态性高、带型好的SSR引物。对这些引物的正向5′末端分别标记6-FAM、HEX、ROX和TAMRA荧光后,利用DNA分析仪进行检测评价,最终选择了42个PCR扩增稳定、峰图简单、多态性高、连锁群分布均匀的SSR荧光标记。根据DNA分析仪检测到的每个标记的不同等位变异大小,为相应位点的不同等位变异进行了命名,并为每个等位变异选取了相应参照品种。根据每个引物标记的荧光和扩增的片段大小范围对42对引物进行合理搭配,在同一毛细管内对多个荧光标记进行检测,提高了DNA指纹数据采集效率,降低了检测成本。利用该体系对1 625份小麦育成品种进行DNA指纹数据采集,在42个位点中共检测到434个等位变异,每个位点的等位变异个数在3—23,平均10.3个;每个位点的PIC值范围为0.240—0.829,平均0.610。利用1 625份小麦育成品种DNA指纹数据,构建了中国小麦育成品种的DNA指纹数据库。【结论】筛选出42对SSR标记引物,� 展开更多
关键词 普通小麦 SSR 荧光标记 品种鉴定 dna指纹
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亲缘关系相近的梅花品种AFLP DNA指纹分析 被引量:19
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作者 明军 张启翔 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期31-35,共5页
该文使用AFLP标记法技术 ,以半同胞家系的‘早凝馨’、‘凝馨’ ,全同胞家系选育出的品种‘美人’梅、‘小美人’、‘俏美人’、‘黑美人’和朱砂型相近梅花品种‘徽州骨红’、‘舞朱砂’、‘小骨里红’共计 9个品种为样本 ,选用 7对引... 该文使用AFLP标记法技术 ,以半同胞家系的‘早凝馨’、‘凝馨’ ,全同胞家系选育出的品种‘美人’梅、‘小美人’、‘俏美人’、‘黑美人’和朱砂型相近梅花品种‘徽州骨红’、‘舞朱砂’、‘小骨里红’共计 9个品种为样本 ,选用 7对引物组合E ACT M CAT、E GA M CTC、E ACT M CCA、E ACT M CAC、E ACT M CAG、E ACC M CAG和E ACT M CTC扩增得到 2 97个多态性位点的条带数据 ,分别选用简单匹配系数和Nei(72 )遗传距离系数 ,进行不加权成对算术平均法聚类分析 ,分别建立了聚类树 .分析结果表明 :AFLPDNA指纹灵敏地鉴别相近品种 ,并与形态学鉴别分类结论相吻合 ,表明DNA指纹鉴定配合形态学鉴定方法具有较高的准确性和有效性 ;聚类分析显示了供试品种间的亲缘关系 ,朱砂型组的 3个供试品种具有比前两个家系更近的亲缘关系 . 展开更多
关键词 AFLP dna指纹 品种鉴定 家系
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记录小麦SSR带型的快捷方法 被引量:30
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作者 王立新 赵昌平 +4 位作者 邱军 李宏博 葛玲玲 孙辉 姚骥 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期164-168,共5页
针对小麦SSR带型识别和记录中因带纹繁多和分布复杂而造成带纹判读和记录困难的特点,提出了根据每对SSR引物生成带型间的差别直接对带型进行编号,以有效简化小麦SSR带型的记录方法。该方法避免了由于错误判断引起的实验误差,并可利用每... 针对小麦SSR带型识别和记录中因带纹繁多和分布复杂而造成带纹判读和记录困难的特点,提出了根据每对SSR引物生成带型间的差别直接对带型进行编号,以有效简化小麦SSR带型的记录方法。该方法避免了由于错误判断引起的实验误差,并可利用每个品种的带型编号,建立品种的DNA指纹以及进行品种基因型比对。 展开更多
关键词 小麦 SSR带型 识别 带型编号 dna指纹
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小麦区试品系DUS测试的分子标记 被引量:34
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作者 王立新 常利芳 +3 位作者 李宏博 季伟 刘丽华 赵昌平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期1114-1125,共12页
为了确定测试小麦(Triticum aestivumL.)区试品系特异性、一致性、稳定性(DUS)的分子标记,采用156个来自我国不同麦区的品种对SSR、EST-SSR和AFLP-SCAR标记的1334对引物进行筛选,根据在染色体上分布均匀、多态性信息指数较高、带型清晰... 为了确定测试小麦(Triticum aestivumL.)区试品系特异性、一致性、稳定性(DUS)的分子标记,采用156个来自我国不同麦区的品种对SSR、EST-SSR和AFLP-SCAR标记的1334对引物进行筛选,根据在染色体上分布均匀、多态性信息指数较高、带型清晰、不同等位变异的带型易于区分及PCR产物稳定的原则,筛选出105对小麦品种DUS测试的分子标记引物,包括63对SSR引物、21对EST-SSR引物和21对AFLP-SCAR引物,可以检测122个位点的754个等位变异,平均每条染色体上被检测位点5.8个,平均每个位点包含7.2个等位变异。根据DUS测试的需求、引物的染色体分布、PIC值大小和带型特点,将105对引物分为21对核心引物、29对一级备用引物和55对二级备用引物。核心引物分辨力较高,可以完成约80%品系的特异性检测,约95%品系的种子纯度检测和约60%品系的一致性、稳定性检测;备用引物用于确定品系DNA位点纯合率和相似品种(系)之间的遗传相似系数,以判断DNA指纹相同或相似的品种(系)之间的相似性和特异性,评价核心标记中具有非纯位点的品系的DNA位点纯合度,同时完成核心引物未能完成的少数品系的种子纯度检测。通过在2006—2007、2007—2008、2008—2009年度对464个冬小麦区试品系DUS测试中的应用,证明105对引物具有很好的代表性和实用性,可以完成90%以上参试品系的DUS检测。 展开更多
关键词 小麦 DUS测试 分子标记 dna指纹
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中国松毛虫属八个种和亚种亲缘关系的DNA指纹证据 被引量:30
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作者 张爱兵 孔祥波 +1 位作者 李典谟 刘友樵 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期236-242,共7页
利用DNA指纹谱方法探讨了中国松毛虫属 8个种和亚种〔马尾松毛虫Dendrolimuspunctatuspunctatus (Walker) ,德昌松毛虫D .punctatustehchangensisTsaietLiu ,文山松毛虫D .punctatuswenshanensisTsaietLiu ,思茅松毛虫D .kikuchiiMatsum... 利用DNA指纹谱方法探讨了中国松毛虫属 8个种和亚种〔马尾松毛虫Dendrolimuspunctatuspunctatus (Walker) ,德昌松毛虫D .punctatustehchangensisTsaietLiu ,文山松毛虫D .punctatuswenshanensisTsaietLiu ,思茅松毛虫D .kikuchiiMatsumura,赤松毛虫D .spectabilisButler,油松毛虫D .tabulaeformisTsaietLiu ,落叶松毛虫D .superans (Butler) ,云南松毛虫D .houiLajonquiere]之间的亲缘关系。 13个随机引物在 8种松毛虫中共检测到 16 8个多态分子标记。分析表明 ,这 8个种间的遗传距离的变化范围为 0 3780~ 0 736 0 ;马尾松毛虫与其亚种德昌松毛虫的遗传距离最近 ,为 0 3780 ,与其另一亚种文山松毛虫以及油松毛虫的遗传距离次之 ,皆为 0 5 2 33;赤松毛虫、落叶松毛虫、云南松毛虫与马尾松毛虫的遗传距离则再次之 ,分别为0 6 36 2 ,0 6 770和 0 6 94 4 ;与马尾松毛虫遗传距离最远的是思茅松毛虫 ,为 0 736 0。 8种松毛虫间具体的亲缘关系为 :(D .superans (D .tabulaeformis (D .p .wenshanensis (D .p .tehchangensis,D .p.punctatus) ) ) ) (D .kikuchii (D .spectabilis,D .houi) )。 展开更多
关键词 松毛虫 松毛虫属 亲缘关系 dna指纹
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大熊猫DNA指纹在野生种群数量调查中的应用 被引量:23
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作者 方盛国 陈冠群 +5 位作者 冯文和 张安居 李绍昌 何光昕 魏辅文 郭健 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第4期246-249,320,共4页
本文用荧光素标记LZF-1基因指纹探针,以四川省冕宁县冶勒野外大熊猫的脱落被毛及尽量新鲜的粪便作样品,进行了DNA指纹检测。1.在相同或不同时间、巢域采集的粪便与被毛样品,显现出相同或不同的DNA指纹图谱,达到个体认... 本文用荧光素标记LZF-1基因指纹探针,以四川省冕宁县冶勒野外大熊猫的脱落被毛及尽量新鲜的粪便作样品,进行了DNA指纹检测。1.在相同或不同时间、巢域采集的粪便与被毛样品,显现出相同或不同的DNA指纹图谱,达到个体认定的目的.表明了大熊猫野外脱落被毛和粪便,能作为DNA指纹分析材料,进行野生种群数量调查.2.根据检测6个被毛和9个粪便样品的结果,认定该生境中有7只大熊猫个体,纠正了有8只和8±2只的记载.3.应用DNA指纹技术及微机个体识别进行大熊猫野外数量调查,准确可靠,节省人力、物力和财力,能获得大熊猫在野外的真实个体数量。 展开更多
关键词 大熊猫 dna指纹 野生种群 数量调查
全文增补中
鸡的DNA指纹与屠宰性能的相关性研究 被引量:16
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作者 王金玉 龚允陈 +1 位作者 陈国宏 陈宽维 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1999年第4期324-328,共5页
利用SR92A系鸡与萧山♀鸡的杂交一代群体,以EA(禽内源性反转录病毒片段)为探针,限制性内切酶为EcORI,探讨DNA指纹与若干屠宰性能之间的相关性。结果表明EAV指纹图谱中,长度约为4kb的条带J与SR92A系×萧山鸡杂交后代75日龄的... 利用SR92A系鸡与萧山♀鸡的杂交一代群体,以EA(禽内源性反转录病毒片段)为探针,限制性内切酶为EcORI,探讨DNA指纹与若干屠宰性能之间的相关性。结果表明EAV指纹图谱中,长度约为4kb的条带J与SR92A系×萧山鸡杂交后代75日龄的活重、屠宰重、半净膛重、爪重、胸肌重、头重、大腿重有显著负相关,无J带的个体与有J带的相比,75日龄活重平均高出280克,屠宰重高出257克,半净膛重高出216克,胸肌重高出16.71克,分别高达28.57%、28.87%、28.76%和54.00%。若在亲本中选择无条带J的个体建立无J带的后代群体,根据算式:△W=(XJ--XJ+)×N×FJ+预测,选择效果和经济效益显著。 展开更多
关键词 dna指纹 遗传标志 屠宰性能
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水稻品种DNA指纹检测技术体系及其应用 被引量:26
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作者 程本义 施勇峰 +2 位作者 沈伟峰 庄杰云 杨仕华 《杂交水稻》 CSCD 北大核心 2008年第1期54-59,共6页
在前期研究工作基础上,初步建立了一套水稻品种DNA指纹检测技术体系,主要内容包括选择标记类型、筛选标记、检测平台、确定标记等位基因、配制标记标准带型对照和记录带型。利用该技术体系对2005—2006年南方水稻区试品种进行了DNA指纹... 在前期研究工作基础上,初步建立了一套水稻品种DNA指纹检测技术体系,主要内容包括选择标记类型、筛选标记、检测平台、确定标记等位基因、配制标记标准带型对照和记录带型。利用该技术体系对2005—2006年南方水稻区试品种进行了DNA指纹鉴定,新发现等位基因8个,构建了442个(次)水稻区试品种×12个首选标记的DNA指纹数据库,并在不同品种间的特异性及同一品种年度间的一致性鉴定方面取得良好的应用效果。对有关评判标准进行了讨论。 展开更多
关键词 水稻 dna指纹 微卫星标记 品种鉴定 区域试验
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水稻新品种测试的标准品种DNA指纹图谱多样性分析 被引量:27
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作者 唐浩 余汉勇 +1 位作者 张新明 魏兴华 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期100-106,112,共8页
以植物新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试指南中选定的49个水稻标准品种为材料,采用农业行业标准(NY/1433-2077)中推荐的24对水稻SSR引物进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明,24对SSR引物在19个籼稻和30个粳稻品种... 以植物新品种特异性、一致性和稳定性(DUS)测试指南中选定的49个水稻标准品种为材料,采用农业行业标准(NY/1433-2077)中推荐的24对水稻SSR引物进行DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。结果表明,24对SSR引物在19个籼稻和30个粳稻品种中分别检测到141和156个等位变异,平均每对引物可以检测到5.88(籼稻)和6.50(粳稻)个等位变异;籼、粳稻类群中24对SSR引物的平均Shannon's多样性指数分别为1.5141(1.0460-1.9959)和1.4389(0.4677-2.4503);经聚类分析后,籼、粳稻群体内品种间的相似系数分别介于0.45-0.81和0.36-0.76,取相似系数0.72为阈值,可将19个籼稻和30个粳稻品种分别分为16类和28类。由此可见,本研究的49个品种的遗传多样性丰富。结合形态性状和基因型聚类分析结果,可将现有的49个水稻DUS测试标准品种减少到46个。 展开更多
关键词 新品种测试 标准品种 dna指纹 多样性分析
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北京、广东、宁夏三地结核分支杆菌DNA指纹的应用研究 被引量:23
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作者 李卫民 王苏民 +5 位作者 裴秀英 刘忠泉 钟球 钱明 赵冰 端木宏谨 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期381-384,共4页
目的 分析“北京家族”结核分支杆菌 ,从分子流行病学角度探讨北京、广东及宁夏三地结核分支杆菌的分布特征。方法 采用Gelcompare 4 .1软件对来自三地的 2 0 6株结核分支杆菌的插入序列IS6 110DNA指纹图谱进行数字化 ,经互联网与世... 目的 分析“北京家族”结核分支杆菌 ,从分子流行病学角度探讨北京、广东及宁夏三地结核分支杆菌的分布特征。方法 采用Gelcompare 4 .1软件对来自三地的 2 0 6株结核分支杆菌的插入序列IS6 110DNA指纹图谱进行数字化 ,经互联网与世界结核分支杆菌DNA指纹库进行相似性比较 ;同时应用该软件对上述菌株行聚类分析 ;构建标准的结核分支杆菌Spoligotyping(间隔区寡核苷酸分型法 )DNA指纹方法 ;用 χ2 检验比较不同组别肺结核病人临床分离菌株成簇率的差别 ,同时计算相对危险度 (OR)。结果  2 0 6株结核分支杆菌的IS6 110DNA指纹图谱与DNA指纹图谱库相比较 ,未发现相同者。 5 6 .8% (117/ 2 0 6 )的结核分支杆菌IS6 110DNA指纹相似值在 1.0 0~ 0 .6 5之间 ,且它们的Spoligotyping指纹图谱均与“北京家族”结核分支杆菌相一致 ;分组统计显示 :男性组与女性组、年龄≥4 2岁组与 <4 2岁组成簇率之间差异有显著性 (P <0 .0 5 ) ,OR值为男性 4 .4 3,95 %CI:0 .94~2 8.76 ;<4 2岁为 5 .0 6 ,95 %CI :1.0 0~ 34.34。其他各组之间差异无显著统计学意义 (P >0 .0 5 )。结论 “北京家族”结核分支杆菌在三地呈较高水平的流行 ;结核分支杆菌在男性和 <4 2岁人群中的传播频率较女性和≥ 4 2岁人群为高 ,且男性和 展开更多
关键词 北京 广东 宁夏 结核分支杆菌 dna指纹 应用 研究
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稻瘟病菌变异菌株的AFLP分析 被引量:10
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作者 何月秋 HeiLEUNG +1 位作者 RobertS.ZEIGLER 唐文华 《菌物系统》 CSCD 北大核心 2002年第3期363-369,共7页
利用94对AFLP引物对3个起始菌株和9个致病性变异菌株进行分析,其中49对引物可以区别出不同菌株类型,辨别变异菌株与其起始菌株的关系,以及起始菌株间的亲缘关系.9个变异菌株中5个菌株的条带数减少1~3条,4个菌株条带数没有明显变化.结果... 利用94对AFLP引物对3个起始菌株和9个致病性变异菌株进行分析,其中49对引物可以区别出不同菌株类型,辨别变异菌株与其起始菌株的关系,以及起始菌株间的亲缘关系.9个变异菌株中5个菌株的条带数减少1~3条,4个菌株条带数没有明显变化.结果还表明,致病性及其他特征变异似乎与条带数缺失多少相关联. 展开更多
关键词 超始菌株 变异菌株 dna指纹 亲缘关系
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用寡核苷酸探针(CAC)_5/(GTG)_5进行人的DNA指纹分析 被引量:21
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作者 蓝翎 张小为 +1 位作者 霍振义 段秉章 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1993年第1期1-6,共6页
在人或动物的基因组中,存在着类似于小卫星DNA的简单衔接重复单位,如(GACA)_4、(GATA)_4、(TCC)_5、(CA)_8和(CAC)_5等,由于这些重复单位在人或动物基因组中出现的数目和频率不同而表现出多态性。本文用人工合成的寡核苷酸探针(CAC)_5/(... 在人或动物的基因组中,存在着类似于小卫星DNA的简单衔接重复单位,如(GACA)_4、(GATA)_4、(TCC)_5、(CA)_8和(CAC)_5等,由于这些重复单位在人或动物基因组中出现的数目和频率不同而表现出多态性。本文用人工合成的寡核苷酸探针(CAC)_5/(GTG)_5,调查了北京地区的50名无关个体,经过统计学处理,计算出无关个体的相关机率是3.8×10^(-10);此外,还对2个家系中的11名成员和1对双胞胎进行了检测,其结果显示子代中的杂交带分别来自父亲和母亲;双胞胎的DNA指纹图完全一致。研究结果表明,(CAC)_5/(GTG)_5探针检出的谱带具有高度的个体特异性(同卵双生子除外),并且谱带在亲代与子代间的传递符合孟德尔遗传规律。 展开更多
关键词 dna指纹 简单衔接重复单位 寡核苷酸探针 限制性片段长度多态性 RFLPS 亲代子代
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